Protein

Genbank accession
QPX48161.1 [GenBank]
Protein name
virulence-associated VriC protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,62
Protein sequence
MAQKTNLNVSPYFDDFDAEKNFYKVLFNPGRPVQARELNNIQSILQNQVESFGSHIFKEGSVVIPGNLTYDPQFNAVKLNPTNFGVNISLYINQFLGKKITGQISGVTGVIQKIEVPDSINNLEYITLYVKYNDSGENFSITPFQNGESLVSSENVVYGNTTIVAGNPFASLISTDATAVGSAVSIDTGIYFVRGTFVNVSKQTIILDYYTNTPSYRVGLKVSEEIITAKEDDSLYDNAKGFTNYAAPGADRFKIGLSLTKKTIDSVDSDVDFIELLRLDAGQVKKLNTNTEYSIIKDYLAQRTYDESGNYSVTPFKVSLHDSLNNRLGNNGLFFKDQKTESGSTPSDDLMCIKLSPGKAYVRGYDIEKISTTILDVPKPRDTQNVDNVNIPFEMGSLLRINNITGSPKQNESVELHSVRRSASGNPSSTTKVGDARVYNFRLTDAAYSSASTNWDLYLYDIQTYTTLILNQALSQSQLPASSFIKGKSSGASGYVVSAGDGTTTVNVRQTSGTFIKGEQIIINGLELYPRSIANITVYNSDDIKQVYQSTSVSGFTTAFIGDSVLSKQLPIGFNASDTVNISAGGVVTSPGKFFNVIKPGSIIRYQTSTGSVENFNRVTSISLTGDSMTVVGVATVTGVCNGAIGVSTNISFSIGAPTIRNLEKGFLYAEVPNSNLSSIDLNDSILTFSAQSTSAKSSSSPIVLSVSDFSLPTGLTTALFQGFDEERYSVHYTDGTTQSLTADQFSLSNNQVTLSNLTSGKTTSSINATFIKNGVQSKEKQYNRSQTVNVIYSKYLESGTGISTSINDGLQFNPYYGLRVQDEEISLNYPDVAKVLAVYESLNTSNPSLDTLSFSSVLNIGGNAIIGENIIGSESGCVARVVTRSTNSVGIVFLNSNRFLTNENVTFEESNIVGQIDSITLGSYNDITNRFKLDKGQKEQYYDYSRIVRNEGETEPSKRILVVFDYFSVPTTDNGDVFTVLSYNKEQFADDVPLIGSRSVRASDTLDFRPRVSVFSGSSSSPFDFSNRNFSSSIKLNLTPNETTIIGYDYYVGRVDKVYLDKNGEFVYVQGTSSSNPKSPVKIDDVMEIATINLPPYLYTPKSATLSLVDNRRYTMRDIGLIENRVKNLERVTSLTLLELSTQTLQIQDSQGFNRFKTGFFVDDFKDYERVNLNFSLLEIDPELQEMRPIISRNSLKNYLAPALNIINEEVDLSTNYALIDSNVQKTGSTVTLKYASEKWIDQPLATQVENVNPFHVISYKGSIKLSPDRDNWVRTVQLPNKTISVTDFVLVERDNTVLGDRTVRVDNGANASRTELSTEFSQTVTETSSSSVRSTSSTRLVEARAEEYMRSRNTEFSITSLKPYTRYYQFLDGNGSVDFIPKLIEIANSESLENYGSSSAFTIGETVVGYDNQNNKIITFRVAMPSHKIGPFNSPTNKFTVNPYSRTESIPDAYSASSKVLNLDTYSISEEAQGLYSGYLVRGAKLVGQTSGAVAYVKDLRLISDNYGDLIGSFFIRDPNTNPVPDVRINTGTKTYKITSSPTNEVAVAGSTTISSAETNYISDGTLELYETTITNTTTVTNTRLTTTNITRVTTNFEQTQFPQQNRGGGKDPLAQTFTVDQDGGFLTEVDLYFYKKDSGNNPLTVEVRTVELGTPTTIVVGNPVTLRPDQIQTSDDASAVTKAVFDYPIYLAPGLEYAIVLLSPESVEYEVFIAEMGKKTIQSRNLPDSEAVVYTQQFAMGSLFKSQNGSVWTADQYQDMKFTLYRANFVTNTPATAFFYNPTLNESNGYIPNLQNNPLTVFPRKVSVGITTATNSTMVGILTTGRKISESTKTYNYGYIVGTGCSVSSVGVTTAGSNYVSDTSVSTYNIIGSGSGLTLNITASAGAITAASIVNPGNGYAVGDVVGIVTSSVSSNSGRDARITITGNNGGIDTLYLSNVQGESFTSDGTANLVYFDSSNNSVSLGNTYITSSTAVGSIYSGNFVKVNHFNHGMYAANNKVAISGVIPNTAPTTLSQSITASSTSISVASTSNFTTFEGKTVNGTNPGYAIIENEIIKYESIGSGTLETITRGQSSTLALPHSVNIPVYKYEFNGVSLQRINTTHNISDTGLDIDNYYIEIDRSSNGVNRSVDNTPSGYPQLSFSSEITSGGSKVFASENIQYDAIIPFYDAATPTSATSLSAKIRTVSGTSISGNEVSFQDLGYEDIQINSLNTLSSSRIVASKVNEDTFLTNLPRNKSFTTALTLSSSNKYVSPQIFLDTSFTDFHSNRINSPISNYQQDGRVNSILDDPHAAIYISNTVRLSQPATSLKVILSAYRHFSADFRVLYSLIRADSSEVEQSFELFPGYNNLTIDNNNDGYPDVIDPANNSGLPDIFVPASNENQFLEYEFSANNLGQFSGYTIKIVMSSTNQAYPPRFKDLRSIAIR
Physico‐chemical
properties
protein length:2431 AA
molecular weight: 265286,07910 Da
isoelectric point:4,96639
aromaticity:0,09543
hydropathy:-0,26162

Domains

Domains [InterPro]
IPR032096
11–81
IPR032096 IPR032096 IPR032096
QPX48161.1
1 2431
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SRM01
[NCBI] 		2781608 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QPX48161.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW015081 [NCBI]
CDS location
range 111568 -> 118863
strand +
CDS
ATGGCACAAAAAACAAATTTAAATGTAAGTCCTTATTTTGATGACTTTGACGCCGAAAAGAATTTTTATAAAGTTCTTTTTAATCCAGGAAGACCTGTACAAGCAAGAGAATTAAATAATATTCAATCAATCTTACAAAATCAAGTTGAATCTTTTGGTAGTCATATTTTTAAAGAGGGATCTGTAGTAATTCCAGGAAACTTAACTTATGATCCACAGTTTAACGCTGTTAAATTAAATCCTACTAATTTTGGTGTAAATATTTCACTTTACATTAATCAATTTTTAGGTAAAAAAATCACAGGACAAATATCTGGGGTCACTGGAGTTATTCAAAAAATTGAAGTACCAGATTCAATTAATAATTTAGAATACATTACATTATATGTAAAATATAATGATTCGGGAGAAAATTTTTCAATTACTCCTTTTCAGAATGGTGAATCATTAGTTTCTAGTGAAAATGTTGTTTATGGAAATACTACTATTGTAGCGGGAAATCCTTTTGCATCACTTATTTCCACTGATGCAACTGCTGTTGGTTCTGCTGTTTCTATTGATACTGGTATTTACTTTGTAAGAGGAACTTTTGTAAATGTTTCAAAACAAACAATCATCTTAGATTACTATACCAATACACCATCTTATAGAGTAGGTCTTAAGGTATCTGAAGAAATCATAACTGCAAAAGAAGATGATTCTCTATATGATAATGCAAAAGGATTCACTAACTATGCTGCTCCAGGAGCAGATAGATTTAAAATAGGTTTATCTTTAACTAAAAAGACAATTGATAGTGTAGATAGTGATGTAGATTTTATTGAACTTCTTAGATTAGATGCTGGACAAGTCAAAAAGTTAAACACAAATACTGAATATTCTATTATTAAAGATTATTTGGCACAAAGAACATATGATGAATCTGGAAATTATTCAGTAACTCCTTTCAAAGTTTCTCTTCACGATTCTTTAAATAATAGACTTGGAAACAACGGATTATTTTTTAAAGACCAAAAAACTGAAAGCGGAAGTACTCCATCTGATGATTTGATGTGTATCAAATTATCTCCAGGTAAAGCATATGTAAGAGGATATGATATTGAAAAAATTTCTACTACAATTTTAGATGTACCAAAACCCAGAGATACACAAAATGTAGACAATGTAAACATTCCATTTGAAATGGGAAGTTTACTGAGAATTAATAATATAACTGGATCTCCAAAACAAAATGAATCTGTAGAACTTCACTCCGTAAGAAGAAGTGCATCTGGAAATCCTAGTTCAACAACTAAAGTTGGAGATGCAAGAGTTTACAATTTTAGATTAACCGATGCTGCTTATTCATCAGCATCTACAAATTGGGATTTATATCTATACGATATTCAAACATATACAACTTTAATTTTAAATCAAGCATTATCACAATCTCAATTACCTGCCTCATCATTTATTAAAGGAAAGAGTAGTGGAGCGAGTGGGTATGTGGTTTCTGCTGGAGATGGAACAACTACAGTTAATGTAAGGCAAACTTCAGGAACTTTTATCAAAGGTGAGCAAATCATCATTAATGGTTTAGAGTTATATCCAAGATCTATTGCAAATATTACAGTATATAATAGTGATGATATCAAACAAGTTTATCAATCTACATCTGTTTCTGGATTTACCACAGCATTTATAGGCGATTCAGTTCTATCTAAACAACTTCCTATTGGGTTTAATGCTTCTGATACTGTTAACATTAGTGCTGGTGGTGTAGTAACTTCTCCAGGAAAGTTTTTTAACGTAATTAAACCTGGAAGTATTATCAGATATCAAACTTCAACAGGGTCTGTAGAAAACTTTAATAGAGTAACTAGTATCAGTCTAACAGGCGACTCAATGACAGTCGTAGGTGTTGCGACTGTAACTGGTGTTTGTAATGGTGCGATTGGTGTTTCCACAAATATATCTTTCAGTATTGGCGCACCTACAATTAGAAACCTTGAAAAGGGATTTTTATATGCTGAAGTTCCAAATTCTAATTTATCATCTATTGACTTAAATGACTCAATTTTAACATTTAGTGCTCAATCAACCAGTGCAAAATCTTCAAGCAGTCCAATTGTTTTGTCAGTTTCTGACTTTTCATTACCAACAGGACTAACAACTGCACTATTTCAAGGATTCGATGAAGAGCGTTACTCAGTACATTATACCGATGGTACTACTCAATCATTAACTGCTGATCAATTTTCTTTATCAAATAATCAAGTTACTCTATCAAATCTCACATCTGGAAAAACTACATCGTCTATTAATGCAACATTTATTAAAAATGGAGTTCAGAGTAAAGAAAAACAATACAATAGAAGTCAAACAGTAAATGTAATTTACTCGAAGTACTTGGAGTCTGGAACTGGAATTAGCACTTCTATCAATGATGGTCTGCAATTTAATCCATACTATGGATTAAGAGTTCAAGATGAAGAGATTTCACTTAATTATCCTGATGTTGCAAAAGTTTTAGCAGTTTATGAATCACTAAACACTTCAAATCCTTCTTTAGACACTTTATCGTTTAGTAGTGTATTGAATATTGGTGGAAATGCAATTATTGGAGAAAATATCATTGGTTCTGAAAGTGGATGTGTAGCAAGAGTTGTAACAAGATCTACAAATAGTGTTGGTATTGTATTCTTAAATTCCAATAGATTTCTTACAAATGAAAATGTTACATTTGAAGAATCAAATATTGTAGGGCAAATTGATTCAATAACTTTAGGAAGTTATAACGATATTACTAATAGATTTAAATTAGACAAAGGACAAAAAGAACAGTATTATGATTATTCTAGAATTGTAAGGAATGAAGGAGAAACTGAACCATCCAAACGAATATTAGTTGTTTTTGATTACTTTAGTGTACCAACTACAGATAATGGTGACGTATTTACAGTTTTAAGTTATAATAAAGAACAATTTGCCGATGATGTACCTCTAATTGGTTCTAGAAGTGTGAGAGCTTCAGATACATTAGACTTTAGACCAAGAGTATCTGTATTTTCTGGATCTAGTTCTTCACCATTTGATTTTTCAAATAGAAACTTTAGTTCTTCTATCAAGTTAAATCTAACACCAAATGAAACTACTATAATTGGATATGATTATTATGTTGGAAGAGTAGACAAAGTTTATCTTGATAAAAACGGAGAATTTGTTTATGTTCAAGGAACTTCATCATCTAATCCAAAATCTCCAGTAAAAATTGATGATGTGATGGAGATTGCAACAATTAATCTTCCACCATATTTGTATACACCAAAAAGTGCAACATTATCTCTTGTAGATAATAGAAGATATACCATGAGAGACATTGGTCTGATTGAAAATAGAGTTAAAAATCTGGAAAGAGTAACTTCTTTAACACTACTTGAATTAAGTACTCAAACTCTTCAAATACAAGATTCTCAAGGATTTAATAGGTTCAAAACTGGATTTTTTGTAGATGATTTTAAAGATTATGAAAGAGTTAACTTAAATTTCTCACTTCTTGAAATTGATCCTGAATTGCAAGAAATGAGACCAATTATTTCTAGAAATAGTCTTAAGAATTACCTTGCTCCTGCACTTAACATAATAAATGAAGAAGTAGATCTATCAACCAATTATGCACTAATAGATTCTAATGTACAGAAAACTGGAAGTACTGTAACTCTTAAATATGCATCTGAAAAATGGATTGATCAACCATTGGCAACACAAGTTGAAAATGTTAATCCATTCCACGTAATTTCATACAAGGGATCAATTAAGTTATCTCCAGACAGAGACAATTGGGTTAGAACAGTACAATTACCAAACAAAACTATATCTGTAACCGATTTTGTTTTAGTCGAGAGAGATAATACTGTTTTAGGAGATAGAACAGTTAGAGTTGATAATGGTGCAAATGCAAGTAGAACAGAACTTTCGACAGAATTTTCTCAAACTGTAACTGAAACTAGCAGTTCTTCTGTTAGAAGCACTAGTTCTACAAGATTAGTAGAAGCACGTGCTGAAGAGTACATGAGATCTAGAAATACTGAGTTTTCTATTACCAGTTTAAAACCATATACTAGATATTATCAATTTTTAGATGGAAATGGATCTGTAGACTTTATTCCAAAACTTATTGAGATTGCTAATAGTGAGTCATTAGAAAATTATGGATCTTCTTCTGCATTTACTATTGGAGAAACTGTTGTTGGATATGACAACCAAAATAATAAAATAATTACATTTAGAGTAGCGATGCCATCTCACAAGATTGGCCCCTTTAATTCTCCAACGAACAAGTTTACAGTAAATCCGTATTCTAGAACTGAATCAATTCCTGATGCATATAGTGCTTCGTCAAAAGTTCTAAATCTTGATACTTATTCAATATCAGAAGAAGCTCAGGGTCTTTATTCTGGATATTTAGTGAGAGGTGCTAAACTTGTTGGACAAACTAGTGGAGCGGTAGCATACGTAAAAGATCTCAGGTTAATATCTGATAACTATGGCGATTTAATTGGATCTTTCTTTATTAGAGATCCAAATACAAATCCAGTACCAGATGTAAGAATTAATACCGGTACTAAGACATATAAAATTACATCAAGTCCAACAAACGAGGTTGCTGTTGCTGGAAGCACTACAATTTCTTCTGCTGAAACTAACTATATTTCAGATGGAACTCTTGAGTTGTATGAGACAACTATTACAAATACAACAACAGTAACTAATACTCGGTTAACTACTACAAACATAACAAGAGTAACAACAAACTTTGAACAAACACAATTCCCCCAACAAAATAGAGGGGGTGGAAAAGATCCTCTTGCTCAAACTTTTACAGTTGATCAAGATGGTGGATTCTTAACAGAAGTTGATTTATATTTTTATAAAAAAGATAGTGGAAATAATCCACTCACTGTTGAAGTCAGAACTGTTGAGTTGGGTACTCCAACAACGATTGTGGTTGGTAATCCAGT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
61621b5bf196ef1b07277205bc468c1771d22f40ccc0d181106abec9ae385467
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7830
Evidence 0,7830
Download PDB

Literature

No literature entries available.