Protein
View in Explore- Genbank accession
- AAK83241.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein and host specificity
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MQIWIHDKSMRKVCALNNEIPGMLPYTNSQWHSYLEYSTSTFDFTIPKFVNGKLHDDLKYINDQMYVSFYYDNSYHVFYTAKIVENDMSFQVTCNNTNLELAMEIARPLADIGGAKSVEWYLQNLDLLGFAGLEVGFNEVSDKTRTITFESQSGTKLEQLHSLMNQFDAEFVFRTDLNRDGTLKKFVIDIYNRPDENHHGIGKVRGDVTLYYQTGLKGVQVTSDKTQLFNAGVFTGANGVNLDSVEFEEKNELGQVEFYSRKGTSFVFAPLSRERYPSTMNPDSADNWTRKDFQTEYKDVESLKAYALRTIKQYAYPLLTYTVDVQSSFLDNYKDINLGDTIKIVDNNFRGGLALEARVSEMIISFDNPTNNSVVFTNFRKLANKPTDALQQRIDEIVSKSLPYHVEIRTTNGTVFKNGIGRSTVKPVLKQGDKIVNATYRFVIDGTIKYSGMTYDMVASEINQPTTLTISAWVDNKEVASEEVTFVNVSDGKQGPKGADGKTPYVHFAYADSADGQKGFSLTQTGSKRYLGVYTDFNQAGSTNPADYTWSDTAGSVSVGGDNLITNSSFPKNLDGWGYYEEGEPNSNLHISTHEFYYNGARKLFRLNNNGKEEVPAASRRFKVKRNTDYSFNILIFATWNIHSVDIYFLGRKANETKTFTKVVNLKTHTGSPSVTQAVKWHLTFNSGECDEGFIRIDNNGTTDGKTSMLFFAELDCYEGTTDRSWQASPEDLKDEIDTKADNALTQAQLNKLSEINSVMKAELEAKASLATVNQWIKAYQDFVNANSADRAQAQKALADASARVVKLENNLNDMSERWNFIDNYMAASNDGLVIGKKDNSSSIMFNPNGRISMFSAGNEVMYISQGVIHIENGIFSKTIQIGRFREEQDFINPDRNVIRYAGGI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 905 AA molecular weight: 101946,47060 Da isoelectric point: 5,42746 aromaticity: 0,11381 hydropathy: -0,48983
Domains
Domains [InterPro]
DC_0002
STR
1–905
STR
1–905
IPR010572
ENZ
142–381
ENZ
142–381
1
905
Architecture
STR 1-905
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage MD4 [NCBI] |
152565 | No lineage information |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAK83241.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
AF348735.1
[NCBI]
CDS location
range 164 -> 2881
strand +
strand +
CDS
ATGCAAATATGGATTCATGATAAAAGTATGCGTAAGGTGTGTGCTTTGAATAATGAAATTCCAGGAATGTTGCCATATACGAACAGTCAATGGCATTCATATCTTGAATACTCAACAAGTACGTTTGACTTCACAATTCCTAAGTTTGTAAATGGAAAACTTCACGATGATTTAAAATATATCAATGATCAGATGTATGTGTCGTTTTACTATGATAATTCTTACCACGTTTTCTATACGGCTAAGATTGTTGAGAATGATATGAGCTTCCAAGTGACTTGTAACAATACCAATCTTGAATTAGCAATGGAAATTGCACGACCACTTGCAGATATTGGCGGTGCCAAAAGTGTTGAGTGGTATCTTCAAAATCTTGATTTACTTGGTTTTGCTGGTCTTGAAGTTGGCTTCAATGAGGTTTCTGATAAAACAAGAACTATCACGTTCGAGTCTCAAAGTGGTACAAAACTAGAACAGCTTCACAGCTTGATGAATCAATTCGATGCAGAGTTTGTTTTTCGTACAGATTTAAACCGAGATGGTACTTTGAAAAAATTTGTCATTGACATTTACAACCGTCCTGACGAAAACCATCACGGTATTGGTAAGGTTCGAGGAGATGTAACCCTTTACTATCAAACAGGTTTGAAAGGCGTTCAAGTTACTAGTGATAAAACGCAACTGTTTAATGCTGGTGTTTTCACTGGTGCAAACGGGGTTAATCTTGATAGCGTTGAGTTTGAAGAAAAAAATGAGTTAGGACAAGTAGAGTTCTATTCTCGAAAGGGCACTAGCTTCGTTTTCGCCCCACTATCAAGGGAACGCTACCCATCTACCATGAATCCAGACAGCGCTGATAACTGGACACGTAAGGATTTTCAAACAGAATACAAGGACGTTGAATCCTTAAAAGCTTACGCCTTGCGTACTATCAAGCAGTATGCTTATCCACTATTGACTTACACAGTAGATGTTCAGTCTAGCTTTCTGGATAACTATAAAGACATCAATCTAGGTGATACCATCAAGATTGTGGATAACAATTTTAGAGGTGGTTTAGCCCTCGAAGCTCGTGTATCTGAAATGATTATCAGCTTTGACAATCCTACAAACAATTCGGTTGTTTTTACTAATTTTAGAAAACTCGCAAACAAGCCAACAGACGCCTTACAACAACGTATCGACGAGATTGTTTCTAAGTCATTGCCATATCATGTAGAGATAAGGACCACAAACGGTACAGTATTTAAAAACGGTATTGGTCGTTCTACTGTTAAACCAGTCTTAAAGCAAGGCGATAAAATTGTTAATGCAACTTATCGATTTGTGATTGATGGCACTATTAAATATTCGGGTATGACTTATGATATGGTAGCGTCAGAGATTAACCAACCAACCACGCTTACTATCTCAGCTTGGGTAGATAATAAAGAAGTAGCTTCAGAAGAAGTTACTTTTGTAAATGTATCAGATGGTAAACAAGGACCTAAAGGTGCTGACGGGAAAACACCTTATGTTCACTTTGCTTATGCCGATAGTGCCGATGGTCAAAAGGGTTTCAGTTTGACACAGACTGGAAGTAAACGCTATTTAGGTGTGTACACCGATTTCAATCAGGCGGGCAGCACTAACCCAGCTGATTATACTTGGAGTGACACGGCTGGCAGTGTTTCGGTTGGTGGTGATAATTTAATCACTAACTCATCTTTCCCAAAAAATCTTGACGGATGGGGTTATTATGAAGAAGGAGAGCCTAATAGCAATCTTCATATAAGTACACATGAATTTTATTACAACGGTGCAAGAAAACTATTTAGACTAAATAATAACGGCAAGGAGGAAGTTCCTGCTGCATCAAGACGTTTTAAAGTTAAACGCAATACAGATTATTCGTTTAATATTCTGATATTTGCAACCTGGAACATCCATAGTGTTGATATCTATTTTTTGGGTCGGAAGGCGAATGAAACTAAGACATTTACTAAAGTGGTCAACTTAAAGACACATACAGGTTCACCATCGGTTACACAAGCTGTTAAATGGCATCTAACATTTAACTCTGGAGAGTGTGATGAAGGGTTCATTCGTATTGATAACAATGGCACTACTGACGGTAAAACTTCTATGCTATTTTTCGCAGAACTAGACTGCTATGAGGGTACTACTGATAGATCGTGGCAAGCGTCACCGGAAGACTTAAAGGACGAGATAGACACTAAAGCTGACAATGCATTAACGCAGGCTCAGCTTAATAAATTAAGTGAAATTAATTCGGTGATGAAAGCAGAGCTCGAAGCAAAAGCATCCCTTGCCACTGTTAATCAATGGATTAAGGCTTATCAAGATTTTGTTAATGCAAACAGCGCAGATCGTGCGCAGGCTCAAAAGGCTTTGGCAGATGCCAGTGCACGAGTAGTGAAACTAGAAAATAACTTAAACGATATGTCAGAGCGTTGGAATTTTATCGATAACTACATGGCAGCATCAAATGATGGTTTGGTTATCGGGAAGAAAGATAACTCCAGCTCTATTATGTTCAATCCAAATGGGCGTATATCAATGTTTTCAGCTGGTAATGAGGTAATGTATATCTCTCAGGGTGTGATTCACATTGAGAACGGTATTTTTTCTAAGACTATTCAAATTGGACGATTCCGAGAAGAACAAGATTTTATTAATCCGGATCGCAACGTCATCCGCTATGCAGGAGGTATTTAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
a31ff16a81359391d8e95f09e732477a14712976fe862d654895c402bfcc8484
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50