Protein

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Genbank accession
QLF81291.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,54
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,90
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVSQREIPSPAGTFTPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTVVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFSETLITKPFSYNMLIFANRLWHFWEAGNEERGIRVEPNTAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDIIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSSLGKLGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKATVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGDISYTPVIELSYIEDTTTGGKYWVVAQNVPTIERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQDTTFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQVETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYTSTVGTTPATARDTVGTNVYNKNVGNLVISPKALDQYKATQVQQGTVYLSNQSEVNAGQTASGFANSAVSPETLHARVALDTRTGLIEIATQAETDTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLTGIARIATQVEFDAGTLDNVISTPLKIKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREANETQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLHSKKSTESSEGIIRVATNTETTAGTSKVLAVSPSGLKYVVQTETTWEATALRRGFVKLTEGALTHSGNKVTGSGVKFNSGTGLYENDDTVLNAANYPKTGYAVSSYEMNKTLQNFLPINATAVNSEKLDGLDSLQFIRRDVDQTVNGSLTLTKQLNLAAPLVSSSTANITGNTILGSLEVTGNSTFKNDVSVSSGKSIKFVGPQSGAGSWDSQATNFAPIFSEINSTVDASYHPIVKQRLGQGTFSLGTLNDGSGDFKIHHISSASGALKSSYWTFNTTGDFAVNSGSISISKNANITGTTTSNGVSTTTLNASALSSLQNVTTSGTIVSTGQVSANNGLVAQKYVRSVGVKPTLASQAPTAETVGFWSVDINDSATFNLFPGYWTMKTKRQVNIDTVQTKPAGVSDEIWNASGWLTETGAFSSPAIRYSNEDGSFGDEVLGTSGQKLRGTWFDYSVRDKEVKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKNAWTTFSMVYTADNPPSAEEVGALPADNATMGNITILDWLRIGNVRIIPDPVTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1350 AA
molecular weight: 146111,76830 Da
isoelectric point:5,63822
aromaticity:0,08074
hydropathy:-0,33348

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1144–1177
IPR048391 IPR048391
QLF81291.1
1 1350
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1143 | ATT 1144-1177 | STR 1178-1236 | ATT 1237-1298 | STR 1299-1332 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_FB
[NCBI] 		2750847 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLF81291.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT682711 [NCBI]
CDS location
range 152312 -> 156364
strand +
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCTGCCTTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCAGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGACGACGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGTGGATATAAGAAAGGGTTTGCAGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTTCTCAACGTGAAATTCCTTCTCCTGCAGGAACCTTTACACCGGGTTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAGTGGATTACCGTAGCATCTCCTACCCGTCAGTTGGCTTCCGGTGAATATATTGCGGTGGATTCCGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCTAACCCTACAGATGGCGATACCGTTGTAATTAAAGATATCGGTGGACGTGTCGGTTATAACGAAATCAAGGTCCAATCTAGTTCTGCGCCTGGCGGCGGTAACCAGAAAATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTTCTCTGAAACCCTGATAACCAAACCATTTTCTTATAACATGCTTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCAGGTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACACGGCCCAGTTCCAATCACAAGCAGGTGATAACGTTCTCCGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAGGGTGATATTATTAAAACCGTTGATATTGATGGTTTAGGAAGTAAATTCCATTTAATCGTCGAAACGTTTGATGCCTCGTCTTCATTAGGTAAGCTTGGTCAGCATAGCATGGAATTCCGTACCTCCGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGTGACCGTCAAACTCGTTTACGCGTAATTCGTGACGATGTTGAGCTCTTGGCTAATGAAAGTGTTATTGTTTTTGGTCCTAATAATACGACGCCGCAGACGATTAATATCACATTACCTACAGGCGTAGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCCACCGTAGGAGATAAAATTGCTTCTTCGGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCGCCGGATACTGAATGGGTGTTGAATGATGTACTGACCTTTAATGGCGATATAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACACCACTACAGGTGGCAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTATAGAACGTGTAGATTCTAAAGATGATTTAACTCGTGCTCGTTTAGGTGTTATTGCCCTTGCGTCGCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAGAAAGAACTTGCAATTACTCCACAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCGACTGAATCTCGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACTACTGCTCAGGTGAACCAGGACACAACCTTCGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCAACCGAAACTCGCCGTGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAACTAACACGGGTACAGATGATACTACAATCATCACTCCTAAGAAGCTACAAGCACGCCAGGGTTCGGAAAGTCTTTCAGGTATTGTAACATATACCTCTACTGTAGGAACCACTCCTGCGACTGCTAGAGACACTGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACGTAGGCAATTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTCTCGACCAGTATAAAGCTACCCAAGTTCAACAGGGTACGGTATATCTTTCTAACCAATCTGAAGTTAACGCAGGTCAAACTGCAAGTGGATTTGCCAACAGTGCTGTTTCTCCGGAAACATTACATGCCCGTGTGGCTCTTGATACTCGTACAGGGTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATACTGGAACAGATTATACTCGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTGACTGGTATTGCTAGAATTGCAACACAGGTAGAATTTGATGCAGGTACGTTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGCGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATTAGAGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACTGCTCGCCTGGCAACCCAGACCGAAGTCAACGTTGGTACTGATGACAAAACTATCATCACTCCTTTGAAATTACACTCTAAAAAATCTACTGAAAGTTCTGAGGGTATTATTCGTGTTGCAACTAATACCGAAACAACCGCAGGAACTTCTAAAGTTTTGGCTGTAAGCCCTTCTGGTTTAAAATATGTAGTACAGACCGAAACCACTTGGGAAGCTACTGCACTTCGTCGTGGATTTGTTAAACTAACCGAAGGTGCTTTAACCCATTCAGGAAATAAAGTTACCGGTTCCGGTGTTAAATTTAACTCAGGCACAGGCCTTTATGAGAACGATGATACTGTTCTGAACGCAGCGAACTACCCTAAAACGGGTTATGCTGTTTCATCTTACGAGATGAATAAAACTTTACAGAACTTTTTACCTATAAATGCTACGGCTGTGAACTCCGAGAAATTGGATGGCCTGGATTCACTTCAGTTCATTCGTAGAGACGTCGACCAAACGGTTAATGGTTCTTTAACCCTGACCAAACAATTGAACCTGGCAGCTCCTCTAGTGTCTTCTAGTACTGCTAATATTACTGGCAATACTATTTTAGGTTCTCTAGAAGTAACTGGAAATTCTACTTTTAAAAATGATGTATCTGTTAGCTCAGGTAAATCTATTAAATTTGTAGGACCCCAGTCTGGCGCAGGTTCTTGGGATTCTCAGGCAACTAATTTTGCACCTATTTTCTCTGAGATAAATTCTACTGTTGATGCTAGTTATCACCCTATTGTTAAGCAACGATTAGGGCAGGGTACTTTCTCTTTAGGTACTTTAAATGACGGTTCCGGCGATTTTAAAATCCATCATATCAGCAGTGCTTCTGGTGCTTTAAAATCTTCCTACTGGACCTTTAATACGACCGGTGATTTTGCTGTTAATAGTGGTTCTATTAGTATTTCCAAGAACGCTAATATCACAGGTACAACTACTTCTAACGGTGTTTCTACAACTACATTAAATGCTTCTGCTCTGTCTTCGTTGCAAAACGTAACTACTTCAGGTACTATCGTTTCCACCGGACAGGTATCGGCAAATAATGGTTTGGTTGCTCAAAAATACGTCCGTTCTGTTGGTGTTAAACCTACATTAGCATCCCAGGCCCCTACTGCAGAAACCGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATTCGGCTACATTTAACCTGTTCCCTGGTTATTGGACGATGAAAACTAAACGTCAGGTTAATATCGATACGGTCCAAACTAAACCTGCCGGTGTTTCTGATGAGATATGGAATGCTTCTGGTTGGTTGACAGAAACGGGTGCATTTAGTTCTCCGGCTATTCGTTATAGTAACGAAGACGGTAGTTTTGGTGACGAAGTTCTCGGTACATCAGGTCAGAAATTACGTGGTACTTGGTTTGATTATTCTGTTCGTGATAAGGAAGTTAAATATCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAATACATTGGATTCATGTTATCAAGATTGGGTGTGCTATCCTACAGGACTGAATGGTGGTACTATTCGTTATACACGTACCTGGCAGAAAAATAAAAACGCATGGACTACGTTCTCTATGGTCTATACGGCAGATAACCCTCCTTCTGCGGAAGAGGTTGGTGCATTGCCTGCTGATAACGCTACAATGGGTAACATTACAATCCTTGATTGGTTACGTATTGGCAACGTTCGTATTATTCCTGACCCGGTCACTAAATCCGTTAAGTTTGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6b62a9490231f338c9e132c4c6fc465d1c65855d60d75cbb15a47b473a3644b6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5273
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequences of eight phages infecting swine Enterotoxigenic Escherichia coli Ferreira,A., Oliveira,H., Silva,D., Almeida,C., Burgan,J., Azered,J. and Oliveira,A. 2020-09-03 — GenBank