Protein

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Genbank accession
QLF88242.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,89
Protein sequence
MTISSTTVKNSYSGNGTLDTFNYTFKVFADADIQVIIRDATATETVKTLTTHYTVTGAGSASGGTIVFTAGNIPSATETVVIRRASPQTQAIDYIANDPFPAESHEEGLDRSMMAIQQLQEEIDRSIKLSRTNTMTSTEFAVGSTDRAGKIFGFDDNGELVVSQELGTFKGDWSASTTYAARDIVKDTSTNNIFLCNTGHTSSGVEPLTTNTDSAKWDLLVDAASATTSQNAAAASAAAALVSENNASTSESNALSYKNDAETAKTAAELAETNAETAQTAAEVAQAAAEAALDTFDDSFLGAKTSDPTVDNDGNALIDGALYFNTTVDLMKVYNLANTTWYQLALTGSNQTNVNTVAADLSGSDTIGTVATNIANVNTTATNIANINTTAGIDTEITNVSGISSAISAVNSNSSNINAVNANSTNINLLAANNTNITNVGGSINNVNTVATNLSDVNSFAETYRISSSAPTTSLDIGDLYFDTTADELKVYKSSGWSAAGSSVNGTSARYTYTISGTPSSVSGADDNSATLAYDAGFADVFVNGVRMSSADITITSGTSVVFASPLTDGDVVDIVAYGTFNVAAIDASNITSGTLNTSRIADASITNAKLATPFSLTLPTISSISPDTIDNAEATITITGSNFTSVPQVEFLNPSTGIWYTASTVTFNNSTSLTVTVTLTVDAQYKIRVENPDGLAILSGTILTVSDAPTWNTAAGDLGTFAGDFSGTLATLSATSDSAITYSEVGSNLTTANVTLNTSTGALTTTDFGGTSTTATTYNFTIRATDAENQTADRSFSLTSSFGATGGGQFN
Physico‐chemical
properties
protein length:812 AA
molecular weight: 83789,92930 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06897
hydropathy:-0,07143

Domains

Domains [InterPro]
DC_0055
ATT
8–137
DC_0055 DC_2093 IPR013783
Coil
Unmapped
102–122
Coil DC_0841
IPR014756
STR
619–699
IPR014756
QLF88242.1
1 812
Architecture
ATT
STR
ATT 8-137 | STR 149-812
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage Greip EXVC021P
[NCBI] 		2736229 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter ubique HTCC1062
[NCBI] 		335992 Bacteria > Proteobacteria > Alphaproteobacteria > Pelagibacterales > Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLF88242.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT375525.1 [NCBI]
CDS location
range 3303 -> 5741
strand -
CDS
ATGACAATATCATCGACAACAGTAAAGAACTCCTACTCTGGTAATGGTACACTAGATACTTTCAACTATACTTTTAAAGTTTTTGCAGACGCAGATATTCAAGTTATTATTAGAGATGCAACAGCAACTGAAACAGTTAAGACATTAACTACTCACTACACAGTTACAGGTGCAGGTTCTGCTTCTGGTGGAACTATTGTATTCACAGCAGGTAACATTCCAAGTGCTACAGAAACTGTTGTTATAAGAAGAGCATCACCACAAACACAAGCAATCGATTATATTGCAAACGATCCATTCCCTGCTGAATCTCACGAAGAAGGATTAGACAGATCTATGATGGCAATTCAACAGTTGCAAGAAGAAATAGATAGATCAATTAAATTATCAAGAACAAACACAATGACTTCAACCGAGTTTGCTGTAGGTTCAACTGATAGAGCTGGTAAAATTTTTGGATTTGATGACAATGGTGAATTAGTTGTATCGCAAGAACTAGGAACTTTTAAAGGTGATTGGTCTGCATCAACTACTTATGCTGCTAGAGATATTGTAAAAGACACATCAACAAATAATATATTTTTATGTAATACTGGTCACACATCATCTGGTGTTGAACCTCTAACAACTAATACAGATAGTGCTAAATGGGATTTATTGGTAGACGCAGCTAGTGCTACAACTTCTCAAAATGCAGCAGCAGCTAGTGCAGCAGCAGCTTTAGTATCAGAAAACAATGCTTCTACTTCAGAAAGCAATGCTTTAAGTTACAAGAATGATGCAGAAACTGCAAAGACAGCAGCAGAATTAGCAGAAACAAATGCCGAAACTGCACAGACAGCAGCAGAGGTTGCTCAAGCAGCAGCAGAAGCTGCATTAGATACTTTTGACGATAGTTTTTTAGGTGCAAAAACTAGTGATCCAACAGTTGATAATGATGGCAACGCATTAATAGATGGAGCATTATATTTTAATACAACAGTTGACTTAATGAAAGTTTACAATCTAGCTAATACTACTTGGTATCAATTAGCTTTAACTGGAAGTAATCAAACTAATGTAAATACTGTAGCTGCAGACTTATCTGGATCAGACACAATAGGAACTGTGGCAACTAACATTGCTAATGTAAACACAACTGCAACTAACATTGCGAACATAAACACAACTGCAGGAATAGATACTGAAATTACAAATGTGTCTGGAATAAGTTCTGCAATATCTGCTGTTAATTCAAATTCAAGCAACATAAATGCAGTTAATGCAAACAGTACAAATATAAATTTATTAGCAGCTAATAATACTAATATTACAAATGTAGGTGGTTCAATAAATAATGTTAATACAGTTGCAACTAATTTATCTGATGTAAATAGTTTTGCAGAAACTTATAGAATTTCATCTTCTGCTCCAACAACTTCTTTAGATATTGGAGATTTATATTTTGATACTACTGCTGATGAATTAAAAGTTTATAAATCTTCTGGATGGAGTGCAGCAGGTTCAAGTGTTAATGGAACTTCTGCTAGATACACTTACACAATTTCTGGTACACCTAGTTCAGTATCTGGTGCAGATGACAATAGTGCAACACTTGCGTATGACGCAGGATTCGCAGATGTGTTTGTTAATGGAGTTAGAATGTCTAGTGCAGATATTACAATTACATCTGGTACTTCAGTTGTCTTTGCTTCACCTTTAACAGATGGAGATGTAGTTGACATTGTTGCTTATGGAACATTTAATGTTGCAGCTATTGATGCTTCTAATATAACAAGTGGAACTTTAAATACTTCTAGAATTGCAGATGCTTCAATTACTAATGCTAAACTTGCAACACCTTTTAGTTTAACATTACCAACTATTAGTTCTATCTCGCCAGACACAATAGATAATGCAGAAGCAACTATTACAATAACAGGTTCAAACTTTACATCAGTTCCTCAAGTAGAATTTTTAAATCCTTCTACTGGTATTTGGTACACAGCTAGTACAGTTACATTTAATAACTCAACATCATTAACAGTTACAGTTACTTTAACAGTTGATGCTCAATATAAAATTAGAGTTGAGAATCCAGATGGATTAGCAATATTGTCTGGAACAATTCTTACAGTTTCAGATGCTCCAACTTGGAATACTGCTGCTGGAGATTTAGGAACTTTTGCAGGAGATTTCTCTGGAACACTTGCAACACTTTCAGCTACATCAGATAGTGCAATAACTTATTCAGAAGTAGGAAGTAATCTTACAACAGCTAATGTTACTTTAAATACTTCAACAGGTGCTTTGACTACAACAGACTTTGGTGGTACAAGCACAACAGCAACAACATACAACTTTACTATAAGAGCAACAGATGCAGAAAACCAAACAGCAGACAGAAGTTTTAGTTTGACATCATCATTTGGTGCAACAGGTGGGGGACAATTTAACTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
001f320de389a69679fe6a152940039c6fbefb8dff519642a7b426b101ae6190
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7754
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50