Protein

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Genbank accession
YAO55072.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,60
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MAITKIILQQMVTMDQNSVTASKYPKYTIVLGNTISSITAAELTSAIESSKASAAAAKQSEINAKQSELNAKDSENEAEISAASSQQSATQSASSATASANSAKAAKTSETNAKASETAAKTSETNAKASETAAKTSETNANSSKTAAAASASAAKTSETNAAASASAAKTSEINAKASETAAANSAKAAKTSETNAAASAKTSETNAAASAQSASDSKASRDEAGTFATQATNAATAARESQTSANNSANIASQAVTTIQGLKDTAVSAASQAETSAQQASTHAGAASSSAAAAKTDANKAKVEADRAKAEADRASANSYTISFSGGAGWFKLATVTMPQSTSTVSIKMVGGKGYNAGSPQQADITELVLRAGNGKPKGLSGSLWRRTTEGFSSMAWINTSGDVYDVYVEIGNYATAVNLQVNYTTNASVVLHSQPQYYATKPEGLTTCTIYDLYNPLLPPPDDGTFLKKAQNLSDLPDKSQARTNLDLDRFRQFVNAGETQVKCADGTKQIFIKNTGDWGAWDEELKRHIALPITQGGTGSLSISEAKTNLQIPSVGAGDWMEIAAPAGVEAGKYYPIVINAQRAGLYLSGFFIDIQTRSSSGEDPMNCCTFNGFIRTGGWSDRKDAGYGYYNRYEPNELALKCILVSSKDSEDNIAVYVEGRAFPVKMRIPQFCTATAVASASTYGKVTFAWGTSNPATDSVGVTTLFDFSLNRAGFYQASAPTGNYYIGNGERIVLSNGMSVGDELTLTTPKITFSDTVAAGNGFIADGTSVSNATFYSRYRVGDTVYGAEFRASENAAQVIVRDPAGTSHQFFNFNLNGTFSPPNGLLTSTGTDWNGQKNTINKFYGIAGSDNAPENAIYGGVHVGFSGNYATQFAGRNSKFWVRSIEAGENKEWLKLITATLAPKIPTDARDGFISDASADTSWAPSNGGGFQSSYAENRIMQSWVDGAGRLYSRFLTTNQPTTSKTVVPWKSAAMLELDNRFTGNNTFIGALESTGDITCARLFSKGTLHTESGGIELYHPSPFIDFHFNKAASNYQARIINDAANQLTFDCQSVRTLRDFTAHGLVRGCNNDAFVAWPVSDPSASHGQIKMAPRFQSRFNSTGSDERGAARVSVWFEEYVGYNHRGVVEVSGYGAQTQYWHFRSDGAIWGSTKGDVAWAGTSDLRYKDNVVDYDGLQSLENIKAMNLIKFTYKDDDRKRERRGVAAQQIMEIDPCYVKKSEGSYIDANGEQVNIEKLVLDTNPLLMDALCAIKVLSAQVGELKEENTALRAGTANREEQVTALESEVSDLKKQIADLTLVVNSLLANRAQ
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 140107,99900 Da
isoelectric point:5,74889
aromaticity:0,08270
hydropathy:-0,37936

Domains

Domains [InterPro]
DC_0608
ATT
2–183
DC_0608 DC_2005 DC_0590
Coil
Unmapped
57–77
Coil DC_0701 Coil DC_1205 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1170–1225
IPR030392
YAO55072.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
STR
ATT 2-183 | STR 184-239 | STR 276-1318
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage vB_CECAV_033
[NCBI] 		3456260 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella typhimurium
[NCBI] 		90371 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAO55072.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PX061015.1 [NCBI]
CDS location
range 85269 -> 89225
strand -
CDS
ATGGCTATAACTAAAATAATTTTACAACAAATGGTCACTATGGACCAAAATAGTGTAACTGCAAGTAAATACCCTAAATACACTATAGTTCTTGGGAATACAATCAGCTCTATTACTGCTGCAGAGTTAACCTCTGCTATAGAGTCTTCTAAAGCATCCGCTGCAGCAGCTAAGCAATCTGAGATTAATGCTAAACAGTCAGAATTAAATGCTAAAGACTCTGAGAATGAAGCAGAAATTTCTGCAGCGTCTTCCCAGCAATCTGCAACTCAGTCTGCTTCTTCTGCTACTGCTTCTGCTAATAGTGCTAAAGCTGCTAAGACTTCTGAGACCAATGCAAAAGCTAGCGAGACAGCTGCAAAAACTTCAGAAACTAACGCAAAAGCTAGTGAAACCGCTGCTAAGACTTCTGAGACCAATGCTAATAGTAGTAAAACTGCTGCGGCTGCTTCCGCATCGGCTGCTAAAACTTCAGAAACTAACGCTGCTGCATCTGCTTCCGCGGCTAAAACTTCTGAAATTAACGCAAAAGCTAGTGAAACTGCTGCTGCTAATAGTGCCAAAGCTGCTAAAACTTCAGAGACTAATGCTGCAGCTTCAGCAAAAACTTCAGAGACTAATGCTGCAGCTTCAGCACAATCCGCATCAGACTCTAAAGCATCTAGAGATGAAGCCGGGACATTTGCTACTCAAGCGACTAATGCTGCTACTGCTGCCAGAGAATCTCAAACATCTGCCAATAATTCAGCAAATATTGCTTCGCAGGCTGTAACAACTATACAAGGATTAAAAGATACTGCTGTTTCGGCCGCTTCTCAAGCAGAAACGTCTGCCCAACAAGCTAGTACACATGCTGGTGCGGCATCCAGTAGTGCTGCCGCAGCGAAGACTGATGCAAATAAAGCAAAGGTTGAGGCAGATAGAGCAAAGGCTGAGGCAGATAGAGCATCCGCCAATTCTTACACCATCTCATTTTCTGGTGGTGCTGGCTGGTTTAAGCTAGCAACAGTTACTATGCCACAATCGACCTCTACAGTATCTATTAAAATGGTTGGTGGTAAAGGGTATAATGCTGGTTCGCCTCAGCAGGCGGATATAACGGAGCTCGTACTAAGAGCTGGTAACGGTAAGCCTAAAGGTTTGTCCGGCTCCCTATGGAGACGTACTACTGAAGGGTTTAGTTCTATGGCGTGGATAAATACATCAGGAGATGTGTATGATGTATATGTAGAAATTGGTAACTATGCTACTGCGGTTAATTTACAAGTAAATTATACCACTAATGCTTCAGTTGTACTGCATTCACAGCCACAATATTATGCTACTAAGCCAGAGGGGCTAACTACTTGTACAATATATGATTTGTATAATCCCCTTTTACCACCTCCAGATGATGGTACTTTCTTAAAGAAAGCTCAGAATCTCTCTGATCTACCTGATAAGTCCCAAGCAAGAACAAATCTTGATTTAGACAGATTTAGACAATTTGTAAATGCTGGAGAAACACAAGTTAAGTGTGCTGATGGAACCAAACAGATTTTTATTAAAAATACTGGAGATTGGGGGGCTTGGGATGAAGAATTAAAAAGACACATAGCTCTACCTATAACTCAGGGTGGTACTGGGAGCTTATCTATATCTGAGGCCAAAACAAATCTTCAGATACCTTCTGTAGGTGCTGGAGATTGGATGGAAATTGCAGCTCCTGCTGGTGTTGAAGCTGGGAAATATTACCCAATTGTAATTAACGCACAACGTGCGGGTTTATATCTTTCTGGTTTCTTTATAGATATACAAACTAGAAGCTCCAGCGGGGAAGATCCTATGAACTGTTGTACGTTTAACGGGTTCATAAGAACAGGTGGTTGGTCGGATAGGAAAGACGCTGGCTATGGATACTATAACAGATATGAACCTAATGAGCTTGCTTTAAAATGCATATTGGTATCCAGTAAGGATTCTGAAGACAATATAGCTGTATATGTAGAAGGTAGAGCATTCCCGGTGAAAATGCGCATACCTCAATTTTGCACAGCTACGGCAGTCGCTTCAGCCTCTACATATGGTAAAGTGACATTTGCTTGGGGTACATCCAATCCTGCCACAGATTCAGTTGGGGTAACCACCCTATTTGATTTCTCTTTAAATAGAGCTGGTTTTTATCAAGCATCAGCTCCTACAGGAAACTATTACATAGGAAATGGTGAGCGTATAGTTCTTTCTAATGGGATGTCCGTAGGGGATGAATTAACCTTAACCACACCTAAGATTACTTTCAGTGACACAGTAGCAGCGGGTAACGGTTTTATTGCGGATGGGACGTCTGTATCCAATGCTACTTTTTATAGTCGTTATCGTGTCGGGGATACTGTTTACGGTGCGGAGTTCCGGGCCAGTGAGAATGCAGCCCAAGTTATTGTCAGAGATCCGGCTGGTACTAGCCATCAATTCTTTAACTTTAACCTCAACGGAACATTCAGTCCCCCAAATGGTTTATTGACTTCCACTGGTACGGACTGGAATGGGCAAAAGAATACTATCAATAAATTCTATGGGATTGCAGGAAGTGACAATGCTCCGGAAAATGCTATATATGGTGGAGTTCATGTAGGATTTAGTGGGAATTATGCTACCCAATTTGCTGGCCGTAACTCCAAGTTTTGGGTAAGAAGTATTGAAGCGGGAGAAAATAAAGAATGGTTAAAGCTTATTACTGCTACATTAGCTCCTAAAATTCCTACGGATGCACGGGATGGTTTCATCAGTGATGCTTCTGCGGATACCTCCTGGGCACCTAGCAACGGCGGGGGTTTCCAGTCTAGTTATGCGGAAAATCGCATTATGCAGAGCTGGGTTGATGGTGCTGGAAGACTCTACAGTAGATTTCTAACAACTAATCAGCCTACAACCTCAAAAACGGTTGTTCCCTGGAAAAGTGCTGCAATGCTGGAGCTGGATAACAGATTTACTGGTAATAACACCTTTATTGGTGCTCTTGAATCGACCGGGGATATAACTTGCGCAAGGTTGTTTAGTAAGGGGACGTTACATACAGAAAGCGGAGGAATTGAGCTTTATCATCCCTCACCGTTTATTGACTTTCACTTTAATAAGGCAGCAAGCAATTACCAGGCAAGGATTATCAACGACGCTGCTAATCAGCTAACTTTTGATTGTCAAAGTGTTCGCACGTTGCGTGACTTTACAGCGCATGGACTTGTAAGGGGTTGTAACAATGATGCATTCGTCGCATGGCCCGTTAGCGATCCGTCTGCCAGCCATGGTCAGATCAAGATGGCGCCTAGGTTCCAATCTCGATTTAATAGCACAGGATCAGACGAACGTGGAGCTGCAAGGGTTTCTGTGTGGTTTGAGGAGTATGTTGGCTATAACCATCGTGGTGTTGTAGAAGTCAGTGGCTATGGTGCTCAGACTCAATACTGGCACTTTAGAAGTGATGGTGCTATCTGGGGTTCTACTAAGGGGGACGTTGCGTGGGCTGGAACTTCTGATTTACGTTATAAAGATAACGTGGTTGATTACGATGGCTTGCAGTCCCTAGAAAACATCAAGGCGATGAACCTGATTAAGTTCACTTACAAGGATGATGATCGCAAGCGTGAGCGTCGAGGTGTTGCAGCACAGCAAATCATGGAAATTGATCCTTGCTATGTCAAAAAGAGCGAAGGCTCTTACATTGACGCCAACGGTGAACAAGTAAACATTGAAAAGCTTGTGTTAGATACAAATCCACTTTTGATGGATGCTCTTTGTGCAATCAAGGTGCTATCTGCCCAAGTAGGGGAGTTGAAAGAGGAAAATACTGCCTTACGTGCTGGCACCGCTAACAGGGAGGAGCAAGTCACAGCTCTAGAATCAGAAGTATCTGATCTTAAAAAGCAAATTGCAGACCTAACATTAGTAGTTAATTCTCTACTAGCAAATAGGGCACAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
307d71bd047fac5191a81b3f797c49c6dc7860215718caad150ddef687cf48ca
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7349
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50