Protein

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Genbank accession
QLF86304.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,97
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,80
Protein sequence
MISSETKILLKRSGVPGRIPSLADLKLGELGINYYDGKVYLRQENDVVGSRIIEPGQGDDIGRTIFVTVNGNDNNSGLNERDSVRTIKKAAELAQFGDGIKVYPGQYIEDNPITFRDLVAVEGMDLRNVLVTPANPEKDLYLVGDGFHATNHSFVSNQDSRDAAAIISFRPLEGTASDRYFDAARLIRDNLNFISGEAVGFLTSGYSGFAAGQRSQDAARAIELNTNFISEESFQYINSPDYRGPAYTNPDINQCRSDLKDILAGWRYDLISDGNSESTGVGLTYYAPVKFTKTTNITDLVYDNTTGLLVIETELSTQSLPGDEIKLRDIQLDCPPYGNSFLIAGFDYDNVSGVGTVTLPFIHDIQAGDTIKLDDLKFDCPPYGAQAYSVSDFVYDETTGGSTVTLSSNHNLKVGDAIELRDMQFDCPAYGGTFSNVVNIEYNNVSGEAILTYADAADLDAGDVVLLYDIKLSCPAYGNAISITGFDYDNFTGITQASFASPHGLRVGDLVKFENLKFSCESYLSDTYNIVGFEYNNLTGEALASFSSDHNLAGGSNVVLDNLTFACNSYFPEGINVTGFNYTNTTGVSTISLDHAHNLQIGDRFQLEDLVFACNSYSFTDIDVTAATYDNVTGFVNITLAAPHGSSVGEFVKLDGIEYSCPGGSGITTTIFPDGTIGDQFEILSVPSPSALIVNVGPSAIPHSYVGGGTATVGITTTVFPDGTQGNEFVVTDLVDSLTLVTNVGVSTIAHTYAGSGKIFVGFTTTVFPDGTQGNVFPVLGVPAANQIALNVGTSTIEHTYVGGGTASNEDTFLNVSGFTYNDADGTGLVTLGSNHNLVVGDSFILEDLKFTCDSYRNTASTFDISDFQYDNVTGLSTVVITSSHDLRVNDTIALYDIEFSCPNGSGITTTIFPDGSVDNFYDVVAVIDPNTIITRVGTSTIPHSYVQGGLLQVGITTNIFPDGTRPSDNFFDVVSVPAPNQILTNVGLSSIAHTYASGGKFYTGITTNIFPQTFEDPNVKVVNAVYDNVTGAVTVTCDKPHGLLATNTVLLQGLEFSCASGGPGGAPGVLLFPRNQETYEVVSVATPTTYTINVGPNSIPHTYVSGGISTPQNIIDAVYNRANGELTVTLNRQHGYVAGDTASVVDLVFSCLSGGEGNAPGELIFPRPTDEFVLLSISGSEFTVNVGESSGLPHTYVNGGSVSYAGTTAQVTSALYNEETGVLTVTTSAPLGAAVDNVVTMQGLNFACNSGGPGNDPGTIIFPRLDVPVFKVSKVISGVTYVINVGTSTLAHTYVSGGFSSLKKKVNDNNLFRVLGVPTPNTVVTNVGVSSIPHTYVSGGNGFVGITTNIFPDGTRPNGSRFEVLSVLSPNKAVINVGVSTIPHFYESGGQVQYGETNERPILAFDYNNLTGGARVTVRGPHGLSAGDSVKFDGMEFECVNSPGITTTIFPDGTAASLNLFPVTGVVNNTVFDCNVGRVPFTHTYIQGGSAFVGITTNIFPDGTQGYNYTVTGVPSSNKVNVNVGVSSIQHNYVRGGALFAGETNERDIVNFSYDNESGLAILTLRQPEDLYTGNLVKLKGLEFDCPDSTAITTNIFPDGSQGFLFPVTERLNPTQFQLNIGRSTIQHNYVRGTGAAFVGITTDIFPDLSTQPTKLFNVVSIPSPNTVAVQVGTSTIPHNYESGGTLSVGINTDIFPGSSVVSPLGDTFVIDAVTSSGEIVINVGTSSITHNYERGGQVLYGQSSGGELQHITGPGVMDATIAAIDFERQMSKYVLNNRPWGSFIAAETGIVNGIDYDNVTGFATVTVPGINAQRGDMVRMSDIQFVCSDEYAGLTTTFFPDNTRPEGQYFEVESRIDENSFETFIGISSIKHNHLRGGNVYRYRQGIENVIYDRASGLASVTSMAHGYKVDDIIEMGDIRFTCPVFTPDYDIENFTYDNTTGLSQVTTTVDNDIQIGDLVRLDDIQLDCPAYGNERVITDFEYNNLNGYSEITVASPHGLQLNPRTPVAITTAVYDNVSGIVTVTTAAPLNIDLSINNGVQLTGLGFTCSNSTTTTNVVGAVYDNTTGVVRITTNAANNAAVSSKVKLQNLIFSCESGGVPSDQAFPSGVDGFDFLVSEVISATEFNAIVGVSTLTHTYVTGGTAQVGITTNIFPSDDTLIYPITNIESSTKFSLQVGPSAFAHTYTGGGDATKVNRYSVKLADIKFDCPAYGNDIGVTNFIYDNTSGNSLVTVDSNHGLNVGDSIKLANLKFQCPPYGNQFNVIAADYDNVTGIITVTTDRDLDGISVDEVLRLRDLQFDCNSGTPYAIQQVTFDPFNGRIATLSLGQNPQVNPGDLIKLEGLLYRNAAGEEVPYPDGRDASYNIFEARSVTQVNASTWEVTVQFNNITDSLVIFIPNGSSYGTLFTGVTGNIFPENVGPEGGFYNVLSLPSPNQFAIQVGTSTIPHTYIRNGEAFSGVTTNFFPSTDPQNSPLGNLFEVVGVPTPTQVRINVGVSSISHIYDSGGQLLVGITTNIFPDGTQGNLFPVVSIGSSTELRVNVGTSSIPHNYISGGLMFVGITTNIFPGDPQNSPLGNIFEVLGKDDDCGKDRFTINVGVSTIPHAYVEGGTVTTGVTTSRFPDGTNGFEFPVESVLDADTFIVNVGPSSISHTYVDGGYSRRLESPINSFLYDNVTGFADVGITSHRLNVGDLVKLRDIKFDCDPYGGEKFINNVVYNNLTGRLNVNTIEPHGLSLNETIKLSGIQMDCPAYGNQIAITGASYSNTTGVIDVTVTQAHNLSIGDSVKLDGLDFVCPGGSGITTTIFPDGTAASYNIYEVVSVPAANSLTVNVGTSTIPHTYTGGGNIFVGITTNIFPGSAQNSPRGSFFEVLDTPSITEFTLNVGVSSIAHGYIRGGFVQTGVTTDIFPDGTQGDYFQVGEIIDEDNFTIDAGISSITHRYNSGGYGAKYVTYQARTPQVVDTSVIRVSGGCKAAEARVDQLAGIVTSIIQNGPSAAPGDVPLNVVAASYNKQTGDLSVTTSGETGVAPVDTVKIENLIFQCSKVSNVIGATYDNTTGKAIITTDDDNGISIGTKIRLEGLNFACNDGSLVYPSDPNTVFDVIVVLGDNRFELDLAKSTKVHTWTGGGVCTTVPTTRTFPDNKVFIYNVKSVLSPTTFTVNVGPSDIDHSYISGGHVSPGLRYQVDNAEYNKITGLLTVTTDVDNQLIANTGVKLNDLQFSCTSGGANNQPGILPFPDGRPANVVAATYNNVTGLLRVTTDKPHQAYADVKVRLEGLEFSCPGGSLIYPSNPNQLLRVTKVEDFYTYEVLLEPSSKVHTYVQGGTSSTGTNHYCVDSVINSRTFTVQMAPNNLTHTYVSGGTVASVFCEQILTGINLRTAKCADDVKKIYLAVVHDVTRGGNMKSVAAARKYYDAVGQYQHIAGGEVNQTVAALDYSLNVVRCVINNVSWGGVPRGYFTSRERAFIPTKSNLDAPLANRSLSRDLLRLADMPPSTTQSVVCIEKPFEKGQYTTNKKFIEAFDYDNVTGIASVTTTQAHRLIKYDAIRLDDIKMRCVGSPRITTNLFPDGTQGDIFEVKQTFQDNPIYPVSDATYNNTTGNLLVESLGSNLELEVGTLVNLRNLRFECSSSGAPGTIVYPTNSDYVYEVKKIINGDTILVNVGVSTLVHTFVPTSTTFNVPQFQELPRKFIAHVGTVGFPHIYEQGGTVWKQEPFQTPESATQLRDVSIQNDPLQFTNSTPNACANVFSAIENTVGVVTTIIDVGFEDSGISVRYPGNDGRGVDSFDQMSSQGVGNIIRGPYIRNCTNFVPKSIGMRMDGFDAEPGDEISNGVQGSSNVDSFTQFNPGGIGCSVSNGTYQQLVSIFTICCDQAIVCDSGAQLDLTNSNSSFGRLGLVARGIGDAKSKCIDRYTGIVAEEAQIEDDTVIIRGVGEKRPYDGQGIFFGELFREVIRIDVTDGGSGYDDENPPVATVDLPTGPSGIKAEVSPTVLDGEVVSIELISNGNQYRDISPTVTIAPPRDPEGRQAKAVAITEPIYYDVDSSSAPVEGTVRVVFKQRLNNTVSVGTTVFFSRLSLQIASSHSFEYIGSGNEINGARPSQGGVPIKANEIVKQEGGSIVYTSTDQAGNFNIGDDFVINQFTGTVTGRSFDQSVLNKVTPLIIALDS
Physico‐chemical
properties
protein length:4168 AA
molecular weight: 444727,77540 Da
isoelectric point:4,52668
aromaticity:0,08973
hydropathy:-0,06898

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QLF86304.1
1 4168
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 181 181 0,9135
Central domain 182 2352 2172 0,0209
C-terminal 2353 4168 1815 0,0021
Legend: N-terminal Central domain C-terminal

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM7
[NCBI] 		1883368 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Mazuvirus > Mazuvirus scam7
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QLF86304.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT586120 [NCBI]
CDS location
range 188445 -> 200951
strand +
CDS
ATGATTTCATCAGAAACCAAGATTTTACTTAAGCGTTCTGGCGTTCCAGGACGTATTCCATCCTTAGCGGACCTAAAACTAGGCGAGTTGGGTATCAACTATTATGACGGTAAGGTATACCTCCGTCAAGAAAATGATGTAGTTGGTTCCCGTATCATCGAGCCTGGTCAAGGTGACGATATTGGTAGGACTATTTTCGTAACCGTAAATGGTAACGACAACAACTCTGGTCTTAACGAGAGAGACTCTGTAAGAACCATCAAAAAAGCCGCTGAGTTAGCTCAGTTTGGCGATGGTATCAAGGTGTATCCTGGTCAGTACATCGAAGACAACCCCATTACATTCCGCGATTTGGTTGCGGTTGAGGGTATGGATCTTCGTAACGTCCTAGTTACACCAGCAAACCCAGAGAAAGATTTATATTTAGTTGGTGACGGTTTCCACGCAACTAACCATTCATTCGTATCAAACCAAGATTCTCGCGATGCTGCCGCGATCATCTCATTCCGCCCTCTAGAAGGAACCGCATCTGATCGCTACTTTGATGCTGCCCGTCTAATCAGGGACAACCTAAACTTCATTTCAGGCGAAGCTGTAGGTTTCTTGACTAGTGGCTATTCAGGCTTTGCTGCTGGTCAAAGATCTCAAGATGCTGCTCGTGCTATTGAACTCAACACAAACTTTATTAGTGAAGAGTCCTTCCAGTATATCAACAGCCCAGATTATAGGGGTCCAGCATACACTAATCCAGATATCAACCAGTGTCGTAGTGACCTAAAGGATATTCTAGCTGGATGGAGATATGACTTAATCTCTGATGGTAACTCCGAGTCAACTGGTGTAGGTCTAACCTACTACGCACCAGTCAAGTTCACCAAGACTACAAATATTACTGACCTAGTTTATGATAACACAACTGGTTTGTTGGTTATTGAGACTGAACTAAGTACTCAATCACTACCTGGTGATGAGATTAAGCTAAGAGATATTCAACTAGATTGCCCTCCTTATGGTAATTCATTCCTAATTGCTGGATTTGATTATGATAATGTAAGTGGTGTTGGTACAGTAACTCTACCTTTCATCCACGATATTCAAGCTGGTGATACAATCAAGCTAGATGATCTCAAGTTTGACTGCCCTCCATATGGCGCTCAAGCATATTCAGTATCTGACTTTGTTTATGATGAGACTACTGGCGGAAGCACAGTAACTCTATCAAGTAACCATAACCTTAAAGTTGGTGATGCAATTGAACTCCGCGATATGCAGTTTGATTGCCCAGCTTATGGTGGTACTTTCTCCAACGTTGTAAACATTGAGTATAACAATGTAAGTGGAGAAGCAATCCTAACTTATGCGGATGCTGCTGACCTAGACGCTGGTGATGTTGTTCTTCTATATGATATCAAGCTATCCTGCCCAGCATACGGCAATGCTATTTCAATCACTGGCTTCGATTACGACAACTTTACTGGTATAACACAAGCTTCTTTCGCATCACCTCACGGTCTACGGGTTGGTGATCTTGTTAAGTTTGAGAACCTTAAGTTTAGCTGTGAGAGCTACTTGAGCGACACTTATAATATCGTTGGATTTGAGTACAACAATCTAACTGGTGAAGCTCTAGCATCATTCTCTTCTGATCACAACCTAGCTGGTGGAAGTAATGTTGTACTAGACAATCTAACCTTTGCTTGTAATAGCTACTTCCCAGAAGGAATCAATGTTACTGGATTTAACTACACCAATACAACTGGCGTAAGTACAATCAGCCTAGATCACGCACATAACTTACAGATTGGTGATCGTTTCCAACTAGAAGACCTAGTATTTGCTTGTAACAGCTACTCATTCACTGATATTGATGTTACCGCAGCAACTTACGATAACGTTACTGGCTTTGTAAACATCACTCTAGCTGCTCCTCACGGCAGTTCTGTTGGTGAGTTCGTCAAGCTAGACGGTATTGAGTACTCTTGCCCTGGTGGTTCTGGTATCACAACTACAATCTTCCCTGATGGAACGATTGGTGATCAGTTTGAGATCCTTTCAGTACCTTCACCTAGTGCTTTGATTGTAAATGTAGGTCCTTCTGCAATCCCACACAGCTATGTTGGTGGAGGAACTGCTACGGTTGGTATTACTACAACAGTATTCCCTGATGGAACTCAAGGTAATGAGTTTGTTGTAACCGACCTAGTTGACTCCCTAACATTGGTAACAAACGTTGGTGTATCTACTATCGCTCACACATATGCTGGTAGTGGTAAGATCTTTGTTGGCTTCACAACAACAGTATTCCCCGATGGAACACAAGGTAATGTATTCCCAGTTCTAGGAGTACCTGCTGCTAATCAAATAGCACTAAATGTTGGTACTAGCACCATCGAACATACTTATGTTGGTGGTGGTACAGCTTCTAATGAAGACACATTCCTAAATGTATCTGGCTTCACCTATAACGATGCCGATGGAACTGGATTAGTAACATTGGGTTCCAACCACAACCTAGTTGTTGGTGATAGTTTCATCCTAGAAGACCTCAAGTTTACTTGTGATAGTTACAGAAATACCGCAAGCACATTTGATATCAGTGACTTCCAGTATGATAATGTAACTGGTCTATCCACCGTTGTTATCACATCATCTCACGATCTACGGGTCAATGATACGATTGCTCTTTATGATATTGAGTTCTCTTGCCCCAATGGTTCTGGTATCACAACTACAATCTTCCCTGATGGAAGCGTAGATAACTTCTATGATGTTGTTGCGGTTATTGACCCCAACACAATCATCACTAGAGTCGGTACCTCCACAATCCCACATTCATATGTTCAGGGTGGTTTGCTTCAGGTTGGTATCACTACTAACATCTTCCCAGATGGAACACGTCCAAGTGATAACTTCTTTGATGTTGTTTCAGTTCCAGCACCTAATCAGATCCTAACTAACGTTGGTTTGAGTTCTATTGCTCATACCTATGCTTCTGGCGGTAAGTTCTACACAGGCATCACAACTAATATCTTCCCCCAGACATTTGAAGATCCTAATGTAAAAGTTGTTAATGCCGTATATGATAATGTAACTGGTGCCGTAACAGTCACCTGTGATAAGCCCCACGGTCTATTAGCTACTAATACAGTACTTCTCCAAGGGCTAGAGTTCTCCTGTGCTTCAGGCGGTCCTGGTGGTGCTCCTGGTGTATTGCTATTCCCACGTAACCAAGAAACTTATGAGGTTGTATCTGTAGCTACTCCTACAACTTACACCATCAATGTTGGTCCAAACAGCATCCCACATACCTATGTTAGTGGTGGTATTTCTACTCCACAAAACATCATTGATGCGGTATACAACAGAGCCAACGGAGAACTAACAGTTACTCTAAACAGACAGCACGGATATGTAGCAGGAGACACTGCTAGTGTTGTTGATTTAGTATTCTCCTGCCTATCTGGTGGAGAAGGTAATGCTCCAGGTGAACTAATCTTCCCTCGTCCTACTGATGAGTTTGTACTACTATCAATCTCTGGTAGTGAGTTTACTGTAAATGTAGGTGAGTCAAGTGGACTACCCCACACCTATGTAAATGGTGGTTCTGTAAGCTATGCTGGAACAACCGCACAAGTAACAAGTGCATTATACAATGAAGAGACTGGTGTTCTAACAGTTACAACTAGTGCTCCATTGGGTGCTGCTGTTGATAACGTAGTCACAATGCAGGGTCTAAACTTTGCTTGTAACTCCGGTGGTCCTGGTAATGACCCAGGCACAATCATCTTCCCACGCCTAGATGTTCCTGTATTCAAAGTATCTAAAGTTATCAGTGGCGTAACTTATGTAATCAACGTCGGTACTTCTACTCTAGCACATACTTATGTGTCTGGTGGATTCTCAAGCCTAAAGAAAAAGGTTAATGATAACAACCTATTCAGAGTATTGGGCGTACCTACTCCCAACACAGTAGTAACTAATGTTGGTGTAAGCTCCATCCCACACACATATGTAAGTGGTGGTAATGGTTTCGTAGGAATTACAACTAACATCTTCCCTGACGGTACACGCCCTAACGGTAGCCGCTTTGAAGTGTTGAGTGTCCTATCACCTAACAAGGCAGTCATCAACGTAGGTGTCTCTACAATCCCACACTTCTATGAGAGTGGTGGTCAGGTTCAGTATGGTGAGACAAATGAGCGTCCCATCCTAGCATTTGATTACAATAACCTAACTGGTGGAGCCAGAGTCACGGTTCGTGGTCCTCACGGTCTATCAGCTGGCGATAGCGTCAAGTTTGATGGTATGGAGTTTGAGTGTGTTAATAGCCCAGGCATTACAACTACAATCTTCCCTGACGGAACAGCAGCAAGTCTTAACCTCTTCCCTGTAACTGGTGTAGTAAACAACACCGTATTTGATTGTAATGTTGGACGGGTTCCTTTCACTCACACATATATTCAGGGTGGTTCTGCTTTCGTAGGAATTACAACTAACATCTTCCCTGACGGCACACAAGGTTATAACTACACTGTTACTGGTGTTCCTTCATCCAATAAGGTCAACGTAAACGTCGGTGTTTCAAGCATCCAACACAACTATGTTCGTGGTGGAGCACTATTTGCTGGCGAAACTAACGAGCGTGATATTGTTAACTTCAGCTATGATAATGAGTCTGGTCTAGCTATTCTAACTCTACGTCAGCCTGAAGATTTATACACAGGCAACCTTGTTAAGTTGAAGGGGCTTGAGTTTGATTGCCCCGATAGTACTGCTATCACTACAAATATCTTCCCTGATGGTTCACAAGGCTTCCTATTCCCAGTCACCGAGAGACTAAATCCAACACAATTCCAGTTGAATATTGGTCGCTCAACAATCCAGCACAACTATGTACGGGGAACTGGCGCAGCATTCGTTGGTATCACTACTGATATCTTCCCTGACCTATCAACACAACCAACAAAACTATTCAATGTTGTTTCTATCCCTTCACCCAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
Signatures of coevolution in a cyanophage population Abebe,J. 1984-06 — GenBank