Protein

Genbank accession
AIX45566.1 [GenBank]
Protein name
collagen triple helix repeat protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MASIQFPANPKVGDTYYDVDTNITYTWEGEYWFATGPGTGIGATGATGAQGNQGSSGEKGEPGTRGIKGDTGSTGSTGPTGPGGFIGLTGATGPQGSPGGATGATGNIGPLGTTGATGPDGASGATGIQGPIGTPGGATGATGLAGPPGNVGATGPLGPNGTPGGATGPLGPVGSTGATGAGATGSDGATGSTGIQGLQGSPGGATGATGIDGLLGPIGATGTTGATGVDGPIGATGTTGATGETGDTGSTGAAGPTGIPGATGFTGPEGATGSKGDEGSTGSTGPQGSPGGATGATGVDGPVGSTGATAATGATGPDGPTGPAGPTGLLGATGATGDDGSTGATGATGFGATGADGATGSTGSTGPDGPLGSTGATGIAGGVSHVWSPDVSILTANNSFLFTHDVDEDIKILKISKFSSTFTNEEALLNSFAIGDSLRLTSGPATFQYTVRANGGLTVSSGVDVFMLLVSDGFLASGSGTLNGSTVVLQRPTSSTFATFNFGVSTINWPTTDGDVTIDYPFLVNNGPRYVAFNQKDLLGRDDEQFFFEPLVSTDLNSFQFQVKTTNFFKSEIEGGYYYSDIDAYVYLTDITELYSDPSNPVTSVGSPWNVQVVGIASAIPGVAGSPGGATGATGPAGPPSGATGATGDLGPIGPGGPTGPVGVNGSPGSPGGATGATGADGPEGATGSTGATGAFVTGSNLVAGIITATTFDGDATSANKIKTNRSTSAAVNYLTFVSDDNTGGAVSETLKTNLNVSFIPSSGDFIASRITASNNFYLGGTEVNSSASELNVLVGVTDFLDEDNMASDSPTAIPSQQSVKRYVDANAFSGITTVSILVGAGSSDVYFASSIVPTTNESIDLGSIDYKFRDLYLSDTTIYTNTGELSVGLNTTAPTAKVVLGPALQTIVQQSTDFDDFKIRIAAQSWGG
Physico‐chemical
properties
protein length:929 AA
molecular weight: 89702,00910 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,06781
hydropathy:-0,09365

Domains

Domains [InterPro]
IPR008160
42–99
IPR008160 IPR008160 IPR008160
IPR050938
42–381
IPR050938
AIX45566.1
1 929
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX45566.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019159 [NCBI]
CDS location
range 13736 -> 16525
strand +
CDS
ATGGCAAGCATTCAATTCCCAGCAAATCCGAAAGTTGGTGATACTTACTACGACGTAGATACAAATATAACTTACACCTGGGAGGGTGAATACTGGTTTGCAACAGGACCAGGCACAGGTATTGGTGCCACTGGAGCAACTGGAGCACAAGGAAATCAAGGTTCTAGTGGTGAAAAGGGTGAGCCAGGAACTCGCGGAATTAAAGGAGATACTGGATCTACTGGTTCTACCGGTCCCACAGGTCCTGGTGGTTTTATTGGATTAACAGGTGCAACTGGTCCTCAAGGTTCTCCCGGTGGTGCTACCGGTGCTACAGGTAATATTGGTCCTTTAGGAACTACTGGTGCAACTGGTCCTGATGGTGCTAGTGGTGCTACAGGTATTCAGGGTCCTATTGGTACTCCAGGTGGTGCAACTGGCGCTACTGGTTTAGCTGGTCCTCCAGGAAATGTTGGTGCTACTGGTCCTCTCGGTCCTAATGGTACTCCAGGTGGTGCTACTGGTCCTCTTGGTCCTGTTGGTTCTACTGGAGCCACTGGTGCTGGTGCTACTGGCTCTGATGGTGCTACTGGTTCTACAGGTATTCAGGGACTACAAGGTTCCCCAGGTGGTGCAACTGGTGCTACTGGTATTGATGGTTTACTAGGTCCTATTGGTGCCACAGGTACTACAGGAGCTACCGGTGTTGATGGTCCTATTGGTGCCACAGGTACTACAGGTGCCACAGGTGAGACAGGTGATACAGGTTCAACCGGTGCTGCTGGTCCTACCGGTATTCCTGGAGCCACTGGTTTCACAGGTCCTGAAGGTGCTACGGGTTCCAAAGGTGATGAAGGTTCTACAGGTAGTACAGGTCCTCAAGGTTCTCCAGGTGGTGCTACTGGTGCTACTGGTGTTGATGGTCCTGTAGGTTCTACAGGTGCCACAGCTGCTACTGGTGCCACTGGTCCTGACGGTCCTACCGGTCCCGCAGGTCCTACAGGTTTATTAGGTGCCACTGGTGCTACTGGTGATGATGGTTCTACCGGAGCCACTGGTGCTACTGGTTTTGGTGCTACAGGTGCTGATGGTGCTACTGGTTCTACAGGTTCTACAGGTCCTGATGGTCCTCTTGGTTCTACTGGTGCCACTGGTATTGCAGGTGGTGTGAGTCATGTATGGTCACCAGATGTTTCTATCCTAACTGCCAACAACTCTTTCCTATTCACCCACGATGTAGACGAAGATATTAAGATCCTAAAGATCTCCAAGTTTAGTTCAACATTCACCAATGAGGAGGCACTACTTAATAGTTTTGCAATCGGTGATTCACTTAGACTAACATCAGGTCCAGCAACATTCCAATATACTGTTAGAGCCAATGGTGGACTCACAGTATCATCTGGTGTTGACGTGTTTATGTTACTCGTCAGTGATGGTTTCTTAGCATCTGGTAGTGGAACACTCAATGGTTCAACAGTTGTTCTTCAACGTCCCACATCATCCACCTTCGCTACATTTAACTTCGGTGTATCCACTATCAACTGGCCTACTACTGATGGTGATGTAACTATTGACTATCCATTCCTAGTAAACAATGGTCCTAGGTATGTTGCATTCAATCAGAAGGATCTACTAGGTAGGGATGATGAGCAGTTCTTCTTTGAACCTTTAGTATCTACAGACCTAAACTCATTCCAGTTCCAGGTTAAGACTACTAACTTCTTCAAATCAGAAATTGAAGGTGGTTACTACTATAGTGATATTGATGCCTATGTGTATCTAACTGATATCACCGAACTATATTCAGATCCAAGTAATCCAGTAACCAGTGTGGGTTCACCTTGGAATGTTCAGGTTGTAGGTATTGCCTCCGCCATTCCTGGTGTTGCTGGTTCTCCAGGTGGTGCAACCGGTGCTACTGGTCCTGCTGGTCCTCCAAGTGGTGCAACTGGTGCTACAGGTGATCTTGGTCCTATTGGTCCCGGTGGTCCTACTGGTCCCGTTGGTGTTAACGGATCCCCAGGTTCACCCGGTGGTGCAACTGGTGCCACTGGTGCTGATGGTCCTGAAGGTGCTACTGGTTCTACAGGTGCAACAGGTGCATTCGTTACTGGTAGTAATCTTGTAGCAGGTATTATCACAGCCACCACATTTGATGGTGATGCCACATCAGCTAATAAGATTAAGACTAACCGATCCACCAGTGCGGCTGTTAACTATCTAACTTTCGTTTCTGATGATAACACTGGTGGTGCCGTTAGTGAAACCCTCAAGACAAACTTGAATGTAAGTTTCATTCCTTCTTCTGGTGATTTTATCGCTAGTAGGATTACAGCAAGTAACAACTTCTACCTAGGTGGTACTGAGGTCAATTCTTCAGCATCTGAACTAAATGTGTTGGTTGGTGTTACTGACTTCTTAGATGAAGATAATATGGCATCCGATAGTCCTACGGCTATCCCATCACAACAATCAGTTAAGAGGTATGTTGACGCTAACGCTTTCTCTGGTATTACTACAGTTAGTATCCTAGTGGGCGCTGGTTCTAGTGATGTATACTTCGCAAGTTCTATTGTTCCAACTACTAATGAGTCTATTGATTTAGGTAGTATTGACTATAAGTTCAGAGACCTCTACCTATCAGACACAACCATATATACTAACACTGGTGAACTTAGTGTAGGTTTGAATACCACAGCACCAACCGCAAAGGTTGTTCTTGGTCCAGCACTACAAACAATTGTTCAACAGTCCACTGATTTTGATGACTTTAAGATCAGAATTGCGGCACAAAGTTGGGGTGGTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
4c0404e8e05cef553e76c5ba7d5a0a0d51bf31030ae8b3988b2f32276844367a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4745
Evidence 0,4745
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank