Protein

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UniProt accession
Q58MY1 [UniProt]
Protein name
Phage tail fiber-like protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MSKRYLSGRVKRLPQDQLKDDRYKYLGLEQAEPNLADPITSPAVPSGQQYQLVAIPGFEGKRYWVPVGGGLIPGAISVYDEGTLVSAASSVTQLNFVGAAVTAQVDVQNPSGHPGIAATITVVPVTIGSNPPVSPIHGELWWEDDIGDLCIYYDDGDTSQWVTVVASGNGGGPTGPAGPPGPTGITGPSGPPGPSGPGGGPGPAGPQGDVGPSGGPGPTGPAGPPGPAGGPPGPQGPQGDAGPTGPTGPPGTGSPGPAGPPGPSGGPGPTGPAGPTGPDGPTGPTGPAGGPPGPPGPSGPPGPSGGDGPAGPSGSPGPPGPSGGPPGPSGGPGPAGPPGPDGPSGPPGPAGSAGAIPAGVVVMWSGAQNAIPSGWVLCDGNNSSPDLRDKFVIGAGSNYAVDNTGGSADAVVVDHSHSASTSVSGAGAHTHSFSASDSHTHSFSGSGSDTFSGSGSHTHSFSGSGSHGHSLSLSDSAHQHTSAIPAQNQVAGNSGSQTIWGSVTNSPTWGATANVSGSADSASVSISGTTGSGTASISGSVSISISGTTGSGTASISGTTGSGGSGVSGSTTISSTGVTGTNKNLPPYYALCYIMKS
Physico‐chemical
properties
protein length:597 AA
molecular weight: 56369,22530 Da
isoelectric point:4,80837
aromaticity:0,04523
hydropathy:-0,34070

Domains

Domains [InterPro]
DC_0835
STR
14–197
DC_0835 DC_0620 DC_0085
IPR050149
Unmapped
171–447
IPR050149 SSF88874
SSF88874
STR
355–485
SSF88874
cd22641
STR
356–440
cd22641
Q58MY1
1 597
Architecture
STR
STR
STR
STR 14-197 | STR 228-294 | STR 330-597
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM2
[NCBI] 		268746 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Salacisavirus > Salacisavirus pssm2
Host Prochlorococcus
[NCBI] 		1218 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae >
Host Prochlorococcus marinus str. NATL1A
[NCBI] 		167555 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AAX44401.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AY939844 [NCBI]
CDS location
range 18953 -> 20746
strand +
CDS
ATGTCTAAGAGATACTTAAGTGGGCGGGTCAAACGATTACCCCAAGATCAATTAAAAGATGATAGGTATAAGTATCTTGGTCTAGAACAGGCAGAACCAAACCTTGCCGATCCAATTACTAGTCCAGCAGTTCCTTCTGGTCAACAGTATCAGTTGGTTGCTATTCCTGGTTTTGAAGGTAAGAGATATTGGGTTCCTGTTGGTGGTGGATTAATTCCAGGTGCGATTAGTGTATATGATGAAGGAACTCTTGTTAGTGCTGCGAGTAGTGTAACTCAACTTAATTTTGTTGGTGCAGCAGTAACAGCACAAGTAGATGTTCAAAATCCTTCGGGACATCCAGGCATCGCTGCAACAATTACAGTTGTACCTGTTACTATTGGTTCTAATCCTCCAGTTAGTCCTATTCATGGAGAATTATGGTGGGAAGATGATATTGGAGACTTATGTATTTACTATGATGATGGTGATACTAGTCAGTGGGTTACTGTAGTTGCTAGTGGAAACGGTGGTGGTCCTACTGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGTCCAACTGGAATAACTGGTCCTTCTGGTCCTCCAGGTCCTTCTGGTCCAGGTGGCGGTCCTGGTCCTGCTGGCCCTCAAGGTGATGTTGGTCCGAGTGGTGGTCCTGGTCCTACTGGACCTGCTGGTCCTCCTGGTCCTGCTGGTGGTCCTCCAGGTCCGCAAGGTCCGCAAGGTGATGCTGGTCCAACAGGTCCAACTGGTCCTCCTGGTACTGGATCTCCTGGTCCTGCAGGTCCTCCTGGTCCAAGTGGAGGTCCTGGTCCAACTGGTCCTGCTGGTCCTACGGGTCCAGACGGTCCTACAGGTCCAACTGGTCCTGCTGGTGGTCCTCCAGGTCCTCCTGGTCCAAGTGGTCCTCCAGGTCCGAGTGGTGGAGATGGTCCTGCTGGTCCAAGTGGTTCACCTGGTCCTCCAGGTCCTAGTGGTGGTCCTCCAGGTCCTAGTGGTGGTCCTGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGTCCAGATGGTCCAAGTGGTCCTCCTGGTCCTGCTGGATCTGCTGGTGCGATACCTGCTGGTGTTGTTGTTATGTGGTCTGGTGCTCAGAATGCTATTCCTAGTGGATGGGTACTTTGCGATGGTAACAATAGCAGTCCAGATTTAAGAGATAAATTTGTTATTGGTGCTGGTAGTAACTACGCTGTAGATAATACAGGTGGTAGTGCTGATGCTGTAGTTGTAGATCACTCTCACTCTGCAAGTACTTCTGTTAGTGGTGCTGGTGCTCATACACACTCCTTCTCTGCTTCTGATTCTCACACTCACTCATTCTCAGGTTCGGGTTCAGATACATTCTCTGGTTCTGGTTCTCATACACACTCCTTCTCTGGTTCTGGTTCTCACGGACACTCTTTGAGTTTAAGTGACTCTGCTCACCAACACACATCTGCTATTCCAGCACAGAATCAAGTCGCTGGTAATTCAGGTTCTCAAACAATTTGGGGTAGTGTTACTAACTCTCCAACTTGGGGTGCAACTGCTAATGTTAGTGGTTCTGCTGATAGTGCAAGTGTTAGTATTTCAGGTACTACAGGATCGGGTACTGCAAGTATATCTGGTTCAGTATCAATCTCAATCTCAGGTACAACTGGTAGTGGAACTGCAAGTATATCTGGTACAACTGGATCTGGTGGATCAGGTGTAAGTGGTAGCACTACAATTAGTTCGACAGGTGTTACAGGAACGAATAAGAATCTTCCTCCTTATTATGCACTATGTTACATTATGAAGTCTTAA
Genbank protein accession
ACY75899.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071092 [NCBI]
CDS location
range 20961 -> 22754
strand +
CDS
ATGTCTAAGAGATACTTAAGTGGGCGGGTCAAACGATTACCCCAAGATCAATTAAAAGATGATAGGTATAAGTATCTTGGTCTAGAACAGGCAGAACCAAACCTTGCCGATCCAATTACTAGTCCAGCAGTTCCTTCTGGTCAACAGTATCAGTTGGTTGCTATTCCTGGTTTTGAAGGTAAGAGATATTGGGTTCCTGTTGGTGGTGGATTAATTCCAGGTGCGATTAGTGTATATGATGAAGGAACTCTTGTTAGTGCTGCGAGTAGTGTAACTCAACTTAATTTTGTTGGTGCAGCAGTAACAGCACAAGTAGATGTTCAAAATCCTTCGGGACATCCAGGCATCGCTGCAACAATTACAGTTGTACCTGTTACTATTGGTTCTAATCCTCCAGTTAGTCCTATTCATGGAGAATTATGGTGGGAAGATGATATTGGAGACTTATGTATTTACTATGATGATGGTGATACTAGTCAGTGGGTTACTGTAGTTGCTAGTGGAAACGGTGGTGGTCCTACTGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGTCCAACTGGAATAACTGGTCCTTCTGGTCCTCCAGGTCCTTCTGGTCCAGGTGGCGGTCCTGGTCCTGCTGGCCCTCAAGGTGATGTTGGTCCGAGTGGTGGTCCTGGTCCTACTGGACCTGCTGGTCCTCCTGGTCCTGCTGGTGGTCCTCCAGGTCCGCAAGGTCCGCAAGGTGATGCTGGTCCAACAGGTCCAACTGGTCCTCCTGGTACTGGATCTCCTGGTCCTGCAGGTCCTCCTGGTCCAAGTGGAGGTCCTGGTCCAACTGGTCCTGCTGGTCCTACGGGTCCAGACGGTCCTACAGGTCCAACTGGTCCTGCTGGTGGTCCTCCAGGTCCTCCTGGTCCAAGTGGTCCTCCAGGTCCGAGTGGTGGAGATGGTCCTGCTGGTCCAAGTGGTTCACCTGGTCCTCCAGGTCCTAGTGGTGGTCCTCCAGGTCCTAGTGGTGGTCCTGGTCCTGCTGGTCCTCCAGGTCCAGATGGTCCAAGTGGTCCTCCTGGTCCTGCTGGATCTGCTGGTGCGATACCTGCTGGTGTTGTTGTTATGTGGTCTGGTGCTCAGAATGCTATTCCTAGTGGATGGGTACTTTGCGATGGTAACAATAGCAGTCCAGATTTAAGAGATAAATTTGTTATTGGTGCTGGTAGTAACTACGCTGTAGATAATACAGGTGGTAGTGCTGATGCTGTAGTTGTAGATCACTCTCACTCTGCAAGTACTTCTGTTAGTGGTGCTGGTGCTCATACACACTCCTTCTCTGCTTCTGATTCTCACACTCACTCATTCTCAGGTTCGGGTTCAGATACATTCTCTGGTTCTGGTTCTCATACACACTCCTTCTCTGGTTCTGGTTCTCACGGACACTCTTTGAGTTTAAGTGACTCTGCTCACCAACACACATCTGCTATTCCAGCACAGAATCAAGTCGCTGGTAATTCAGGTTCTCAAACAATTTGGGGTAGTGTTACTAACTCTCCAACTTGGGGTGCAACTGCTAATGTTAGTGGTTCTGCTGATAGTGCAAGTGTTAGTATTTCAGGTACTACAGGATCGGGTACTGCAAGTATATCTGGTTCAGTATCAATCTCAATCTCAGGTACAACTGGTAGTGGAACTGCAAGTATATCTGGTACAACTGGATCTGGTGGATCAGGTGTAAGTGGTAGCACTACAATTAGTTCGACAGGTGTTACAGGAACGAATAAGAATCTTCCTCCTTATTATGCACTATGTTACATTATGAAGTCTTAA

Genome Context

Genome Context

Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0031012 extracellular matrix Cellular Component IEA:TreeGrafter (UniProt)
GO:0005615 extracellular space Cellular Component IEA:TreeGrafter (UniProt)
GO:0030020 extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength Molecular Function IEA:TreeGrafter (UniProt)
GO:0030198 extracellular matrix organization Biological Process IEA:TreeGrafter (UniProt)

Tertiary structure

PDB ID
4dbdca54674d4207b788fed5884fd14a1a1a5aac06004f55591ed357db74431e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4914
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50