Protein

Genbank accession
CAB5221263.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,81
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSLTSSFQTFAGNGSNTQFTLSNSSANSSNILVIVNGLVQMPDTDYTVSIPNINFTTAPYITSDIEVRYFSDNGAVGYMGSAGFFGSTGYRGSAGETGYDGSRGFTGSQGITGFVGSVGPGGSPGHISGKERFVGDGNTTNYTLVRSIVNADEIFVMINGLTQIPDVDYTVVPATNTISFAIKPYDLADIDIRYFSDAPPGYKGSVGYMGSEGYLGSEGYFGSTGYKGSEGYRGSRGETGYHGSAGTPGGPTGYTGSIGFTGSIGFTGSEGYTGSVGYVGSQSDVIGFTGSVGDIGYSGSAGPAGAPRYSQWFVGDGVKYVYPLDRIVTEPHHILVTINGLVQVPSYDYYLTSGNMFIEFDVTSTPPDASDVEIRYWMEADVGYGYTGSAGLDGQKGDYGDQGEPGQTGFTGSQGDGYTGSAGKDGVDGLPGPVGAPWYSQIEQGDGTKFFWPLNEPVTDPNNIIVSINGLVQIPDIDYYISNGNIAFVDVPPDLSDIEIKYYKIAAVGFDGSMGATGYRGSVGDPGGPTGYTGSQGRVGFVGSSGNNGNRGYAGSMGPVGAPNKSDHYVATGITDTFLLTQPVSNTYHIIVSVNGLVQIPDIDYIITTDMVGDPVIRLVDGAPNTNTDVEIRYFTVSGFVGSTGDTGYKGSVGDPGGPRGYTGSLGYMGSTGYSGSRGYTGSRGIGFDGWVVDPELYLSGYGPILDAYINDPGHYHILLHNVQPDQTPFAAGMVIRIAGCVFEITVVQQSVYFPDHTDLICTLLEKPVTDPYTIPFNSPISIGAISGYTGSFGYTGSIGYQGSQGIQGPAGGPSDVQLFVADGSDRYSLNRTIENSRYIFVMVNGLVQVPEADYILLDNGTTVKFVTNIPNPTADIEIRYFTALAGYQGSAGYAGSGGGGPGATGATGAQGDRGTFGGAFFEFQYSSNSMNGNPGRGRFRLSDNTAPYNTATHFYPNTKDWNNLLIQGYLDVISDTTSPVKGELTITDKANTAAFVLYTFISENVINVGYFDMTIYHIYNSPDFTMYEDQNYYITMTKSGDRGDIGYAGSKGDPGGMGAVGYRGSAGYTGSAGYDGSAGDRGTTGYFGSVGYQGSDGKDGTNGINGFNGSTGPTGFKGSVGFMGSQGETGYRGSDGNGVMGDPGYTGSVGYKGSAGDTGDVGPGGPTGYKGSAGYRGSAGTGYTGSVGDVGFQGSAGDGAQGREGYTGSVGYKGSAGTGYTGSVGHVGYTGSVGDQGATGFGGPGYDGSVGYQGSVGDTGNVGYRGSVGYRGSVAYTGSQGIVGYTGSKGYTGSQGFAGISSGTSLSYKQSALSMPGAYAASVPAAGEFFINASSWALVGGNTYIKIHNRDLNSLESLPMFQEAAGKNYVPALDDIYNVRLVLTSKDNPVDRIVYGLNSPFTTVPNTVTIVGSDAYYELSINPIYVSDNINGTNFLSTRELSLSIEQSGARGYTGSVGFTGSVGYAGSLGYTGSIGYTGSRGFTGSVGFVGSVGYAGSLGYTGSYGYTGSQGYTGSVGYVGSVGYVGSSGYAGSQGYTGSAGYTGSKGYTGSVGYAGSQGYTGSFGYTGSRGDIGPSGGDARAYISSTIPIDANTGTLWFDTDNGYLSFYWLDANVWIGLGTGTLGYTGSQSYTGSVGYVGSVGYVGSIGYTGSIGYTGSQSYTGSVGYAGSLGYTGSIGFTGSVGFVGSVGFVGSWGYWGSFGYTGSIGFTGSVGYAGSRGYTGSIGYTGSIGFTGSQSYTGSVGFVGSWGYWGSVGYTGSVGYTGSVGFVGSVGYAGSQGYTGSVGFVGSVGFVGSEGYWGSFGYTGSIGFTGSVGYAGSVGFVGSVGFVGSQGYTGSQGYTGSVGFVGSIGFVGSEGYWGSFGYTGSIGFTGSQSYTGSVGFVGSEGYWGSFGYTGSIGYTGSQSYTGSVGFVGSAGYIGLDGYTGSFGYTGSQSYTGSVGFVGSEGYWGSFGYTGSIGFTGSQSYAGSVGDVGPTGPTGPTGITGPTGPSGLTGPTGPTGPVGPTGLTGPSGPSGPIGPASAYVTGIQESINVVSYGANGTVNYDVAAHSVYYFTANSGANWTVNFRANTTTTLGTYMSAGQAITSVVFAKQGSTAYYNSATTIDGASITPKWLGAAAPTSGNPASYDVYTYSIIKTGSSTFEVFASVTQAQ
Physico‐chemical
properties
protein length:2157 AA
molecular weight: 219893,12700 Da
isoelectric point:4,42716
aromaticity:0,13676
hydropathy:-0,14636

Domains

Domains [InterPro]
IPR050149
92–1300
IPR050149 IPR008160 IPR008160
IPR008160
200–249
IPR008160 IPR008160 IPR008160
CAB5221263.1
1 2157
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB5221263.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798287 [NCBI]
CDS location
range 76491 -> 82964
strand -
CDS
ATGTCCCTGACCTCAAGTTTCCAGACATTTGCAGGAAATGGTAGCAATACCCAATTTACCCTGTCAAATAGTTCAGCCAATTCATCAAACATCCTCGTAATAGTCAATGGTCTGGTTCAAATGCCAGATACTGATTATACTGTATCAATTCCAAATATTAATTTTACAACTGCTCCGTATATTACTTCTGATATTGAAGTTAGATATTTTAGCGACAACGGTGCTGTTGGTTATATGGGATCTGCAGGATTCTTTGGTTCAACTGGATATAGAGGTTCTGCTGGTGAAACAGGATATGATGGATCAAGAGGTTTTACTGGATCGCAGGGTATTACTGGATTTGTTGGTTCTGTAGGGCCTGGTGGTTCACCGGGACACATATCTGGTAAAGAGCGTTTTGTAGGTGATGGTAATACAACCAATTATACACTAGTTCGTTCAATTGTCAACGCTGATGAAATCTTTGTAATGATTAATGGTCTTACACAGATACCTGATGTTGACTATACAGTCGTCCCTGCAACGAACACAATTTCATTTGCAATTAAGCCATACGATCTCGCTGATATTGATATTAGATATTTTAGTGATGCACCTCCAGGCTACAAAGGTTCTGTAGGTTATATGGGTTCTGAAGGTTACTTAGGTTCCGAAGGTTATTTTGGTTCAACTGGTTACAAAGGTTCTGAAGGCTATCGCGGTTCTCGAGGTGAAACAGGATATCATGGTTCTGCAGGTACTCCAGGTGGTCCAACAGGATATACAGGATCTATTGGTTTCACAGGATCTATTGGTTTCACAGGATCTGAAGGCTATACCGGTTCGGTAGGATATGTTGGATCACAATCCGATGTTATTGGTTTCACAGGTTCGGTTGGTGATATAGGATATTCCGGATCTGCTGGTCCTGCTGGTGCTCCAAGATATAGTCAGTGGTTTGTTGGCGATGGTGTGAAATACGTATATCCATTGGATCGCATTGTAACGGAACCTCATCACATTCTCGTTACAATTAATGGACTTGTTCAGGTTCCAAGCTATGATTATTATCTAACATCTGGCAATATGTTCATTGAGTTTGACGTTACGTCAACACCACCGGATGCATCCGATGTTGAAATAAGATATTGGATGGAAGCAGATGTTGGATACGGGTATACTGGTTCAGCAGGTTTAGATGGACAAAAAGGTGATTATGGTGACCAGGGTGAACCAGGACAAACAGGATTCACAGGTTCACAAGGAGATGGATATACTGGTTCTGCAGGTAAAGATGGCGTTGATGGTTTACCAGGTCCTGTAGGAGCACCATGGTATAGTCAGATTGAACAAGGTGATGGTACAAAATTCTTTTGGCCATTAAATGAGCCTGTAACAGATCCAAATAATATTATTGTTTCAATTAATGGTCTCGTTCAAATTCCAGATATTGATTATTACATTTCGAATGGTAACATTGCGTTTGTTGATGTGCCACCTGATCTTTCTGATATTGAAATCAAGTACTACAAAATTGCAGCTGTAGGTTTTGATGGATCTATGGGTGCAACAGGGTATCGAGGATCTGTTGGTGATCCTGGTGGTCCAACCGGTTACACGGGATCACAGGGTAGAGTTGGTTTTGTTGGATCTTCTGGTAACAATGGTAATCGCGGCTATGCTGGATCAATGGGTCCTGTTGGTGCACCAAATAAAAGTGACCATTATGTCGCGACAGGGATAACAGATACATTCTTATTGACACAACCTGTATCAAATACGTACCATATTATAGTCTCCGTTAACGGTCTCGTTCAAATACCCGATATTGATTACATCATTACAACAGACATGGTTGGTGATCCTGTAATTAGATTAGTTGATGGAGCTCCAAATACAAATACAGATGTAGAAATCAGATACTTTACAGTATCCGGATTTGTTGGATCAACTGGTGATACTGGATATAAAGGTTCAGTTGGTGATCCAGGTGGTCCACGTGGATATACTGGATCGCTTGGCTATATGGGATCTACTGGCTATTCTGGATCTCGTGGCTATACAGGTTCACGTGGTATTGGATTTGATGGGTGGGTTGTTGATCCAGAGTTATATCTTAGTGGCTATGGGCCAATACTTGATGCATATATAAACGATCCTGGCCACTACCATATTTTATTGCATAATGTGCAGCCTGATCAGACGCCTTTTGCTGCTGGGATGGTAATAAGAATTGCTGGTTGTGTATTTGAAATTACAGTTGTTCAACAATCAGTTTATTTTCCTGACCATACAGATCTTATTTGTACTCTATTAGAAAAACCAGTTACTGATCCTTATACAATTCCTTTTAATTCACCAATTAGTATTGGTGCAATTTCTGGGTACACTGGATCGTTTGGTTACACAGGTTCTATTGGTTACCAGGGATCACAAGGTATTCAAGGACCTGCAGGCGGTCCTTCTGATGTTCAATTATTTGTTGCTGATGGTTCTGATCGATACTCTCTCAACAGAACTATTGAGAATTCTAGATATATTTTCGTTATGGTCAATGGTCTTGTTCAAGTACCAGAAGCAGATTATATTTTATTGGATAATGGAACAACAGTAAAATTTGTTACAAATATTCCTAATCCAACAGCTGATATTGAAATTAGATATTTTACTGCATTAGCTGGTTACCAAGGTTCTGCTGGTTATGCAGGATCTGGCGGTGGTGGTCCTGGCGCAACTGGTGCAACTGGTGCTCAGGGTGATCGTGGTACATTTGGCGGTGCTTTCTTTGAGTTTCAATACTCAAGCAATAGCATGAATGGTAATCCTGGAAGAGGTAGATTTAGATTAAGTGATAATACTGCTCCTTATAATACTGCAACACATTTTTATCCAAATACAAAGGATTGGAACAATCTTCTTATTCAAGGTTATCTTGATGTAATTAGTGACACAACATCACCTGTTAAAGGTGAGTTAACAATTACTGATAAAGCAAATACAGCAGCGTTTGTTCTTTACACATTCATTTCAGAAAATGTGATCAATGTTGGCTATTTTGATATGACAATTTATCATATCTACAACTCGCCAGACTTTACGATGTATGAAGATCAAAATTACTATATTACTATGACAAAATCAGGTGATAGAGGTGATATTGGTTATGCTGGATCAAAGGGTGATCCTGGTGGAATGGGTGCAGTTGGTTATCGTGGATCAGCAGGATATACTGGCTCGGCAGGATACGATGGTTCCGCTGGTGACAGAGGGACAACTGGTTACTTTGGTTCTGTTGGTTATCAAGGATCTGATGGTAAGGATGGAACAAACGGAATCAATGGATTCAATGGTTCTACAGGACCTACTGGATTCAAAGGTTCTGTAGGTTTCATGGGCTCACAAGGTGAAACAGGTTACAGAGGATCAGATGGCAATGGTGTGATGGGTGATCCTGGTTATACAGGTTCTGTTGGCTATAAGGGTTCTGCTGGCGACACTGGGGATGTTGGTCCTGGTGGGCCTACTGGCTATAAAGGATCTGCTGGTTATAGAGGGTCAGCAGGAACAGGATACACAGGTTCTGTAGGTGATGTTGGATTCCAAGGATCAGCAGGCGATGGTGCACAAGGAAGAGAAGGTTATACAGGATCAGTAGGATACAAAGGATCAGCAGGGACAGGATACACAGGTTCTGTAGGACACGTAGGTTATACAGGTTCAGTTGGTGATCAAGGTGCTACTGGCTTTGGTGGACCAGGATATGATGGTTCTGTTGGATACCAAGGATCTGTTGGTGATACGGGTAACGTAGGATATCGTGGATCTGTTGGCTATAGAGGTTCTGTTGCATATACAGGATCGCAAGGTATTGTTGGATATACTGGATCCAAAGGATATACAGGTTCACAAGGCTTTGCTGGGATTTCATCAGGCACATCATTGAGCTATAAACAATCTGCTTTATCGATGCCTGGTGCATACGCTGCCTCTGTTCCTGCCGCAGGTGAATTCTTTATCAATGCTTCATCGTGGGCTCTTGTTGGTGGTAACACATACATTAAAATTCATAATAGAGATCTTAATAGTCTTGAATCTCTTCCTATGTTCCAAGAAGCAGCTGGTAAGAACTATGTGCCAGCATTAGACGATATCTACAATGTTAGACTTGTTCTCACTAGCAAAGATAATCCTGTCGATCGTATTGTGTACGGATTGAATAGTCCATTTACAACTGTTCCTAATACTGTAACAATTGTTGGATCAGATGCGTATTATGAATTGAGTATTAATCCAATATATGTTTCAGATAATATCAATGGAACAAACTTCTTGAGCACAAGAGAGCTCAGTCTTTCAATTGAACAGAGTGGTGCAAGAGGATATACAGGTTCTGTTGGTTTCACAGGGTCGGTTGGATATGCAGGATCGTTAGGTTACACAGGATCAATCGGTTATACTGGTTCAAGAGGATTTACCGGATCGGTAGGGTTTGTTGGATCGGTTGGTTATGCAGGATCATTAGGTTATACTGGGTCATATGGATATACAGGCTCTCAGGGTTATACAGGCTCTGTTGGATATGTTGGTTCTGTTGGATATGTAGGATCTTCTGGTTATGCTGGATCACAGGGTTATACAGGCTCGGCAGGGTATACAGGCTCTAAGGGTTATACAGGCTCGGTAGGGTATGCAGGATCACAAGGCTACACGGGTTCGTTTGGATATACAGGTTCACGTGGTGATATTGGACCATCAGGTGGCGATGCAAGAGCATACATTTCAAGTACTATCCCGATAGATGCAAATACAGGAACACTGTGGTTTGACACAGACAATGGTTATCTTTCGTTCTATTGGCTTGATGCTAACGTATGGATTGGTCTTGGAACAGGAACACTAGGATATACCGGATCACAAAGTTATACAGGCTCTGTTGGATACGTTGGATCTGTAGGCTATGTTGGTTCTATTGGTTACACGGGATCAATTGGTTATACAGGATCTCAGAGCTATACAGGTTC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
d0540b8b8f04f2c5c3693b513be5bfdbb751eee6854b2589a09649e8fb599a6b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4052
Evidence 0,4052
Download PDB

Literature

No literature entries available.