Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D7SNU8 [UniProt]
- Protein name
- Structural protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MDINKVSHVSSYQTPQFIESEYPLFNKFIEYYYQSQEKTGLGQNIINNFLQYLDIDKLDISILDGASKLVEPITSTDTTITVESVDPFLEKDGSILVGDEVIYYEETVSSPNIALTPGISYTQVQLKWVLLANNISLFDGVRRVFPLVSQDNPIGPSSPQHLIVKVYGKTLTPVVDYTVSGTNIVYTIAPRTATAADDISTTSVTYLNGFSENTIVQIDDISSAFGDNKTTFELTVNSEKYEPIADEFLLAVYDGRLLVPKVDYFIDGSIFIFNVAPLNGRSLSLYSIEAPIPSFGSGAVGYSRVNDLGNISSVIPSTNGFGYRFDYPPKVSVNSSVGSGASVKTLVDGIKSVSLLSGGAGYSESNPPTVKVQFPTKEGYVEPTLKATVTNGAVSAIDIISSGSGYTFTPRITFEQPGGAVLAPPTIVGGSVSGAITITNGGQGYTTPPLVYIDEPTGLDGIKASFTTTLTDGEITAVNILNAGQGYETVPRISVIDPVGAQVLETVVDGDGRVISVELLFGGSGYTDVPSVYIVDNRQNDVGTYIGGTGATAVAAIFNGQITDINITNFGTGYSADNPPQIVIQKPVDAKASATVGLQEITGFSVLKTGKEYTKAQFLGCARCASGITDYTQDGNAVFSNSTTAAEASTDTSVKCLDALFIKRLLDKYTEQFLPDVPTLDYSKIDVRTSIKTIKDFYSAKGTSFSIAYLFKLLYGETVTVSYPKDQIIKPSAATWSVDTVLRATLVSGLPENIQDGLLEQVADISDPNILAATALIENFISIQTAQDTIYELALSEETIEGTFVVPYKTKLAEPLNTTEGIITVDSTIGWPERNGEFVISSGVGSEVVQYKEKSLNQFIECTRSVNGVVEDWDSATQVSSNFNVFINRGTAQEVVLNIVGVVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLLISKLGGTGTGPELTTWLYNVKKLIEVESIAFGGINNQSATVTCSNPHGLLVGDQVTIYGANPIIYNGSFLVTSRDSTTVFQYQLPQPANVVPQGNILVSIDLNKGKSDSSAVNNAISPYTTNVQNTFFNTTNTYIASTGIPNYNIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPITPVTISTKNLIVPGPIGTWVNGVSIWSYKSDVTKIFGAVTSIAITNAGTGYDAAFPPAITISGGAGTGAGATATVNGSISEITVTAGGSGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGVVSSILVNSGGTGYTSQPSITVVGGGGSGAEGTAAVRGPIQSVAITNGGASYTSNPSIILSSGAGAVAQAIINDGRIISIAIISAGSGYTTAPEVTIQGDGFGAIARATIDVDGENAGKVTGIEIVNRGIGYSQGTTIINLNSVGQGASFLANVFQWTYNLQETTTVDSAKGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFANVNDQILEQDDQLGHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYSDPTNQSSSISRLRTSYRLKANLVYDEVTNPTPVRTDGPLLSEEIAGKFVEDYEYSFSLGDLDQYNGRFCKTPEYPTGRYCYFVTIDATEQGNPVFPYILGPSFNSVVDTWNLSTTAVQQNIPIGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNGLTLENGDILTFDVEDENRDGVISAEETADPDQIFEESPLQLFDYFPKVKLDSKVDIEVETITKFEDASITGFVVENAGINYQVDDRLIFDNTDTGGDGASARISRIKGEEVSAYTFENVSGNNFGVLTTSVPHNLQVTDTVFVDYTPIMDNTNKTFVVRQFKGIENITIAQSGSGYNEDIPPTLVIDGDGVSGKLEAVVTSVGSIDTVNILNSGSGYTSNPRVIISHPQVFKKAEYIVSKIENNENVKVNDIFVNNNKEIFICGKTLDSSGNSVAFVSKLSTTGVKEWEKTLELSTGTNYAEFQKLYVDGDDIWVVGVNRPNILVLDAYNPDIILVKYTQSSNGLSATLQFQKGYSGISGATRADNITCIKKYSDTRYVIGGFTNTNSGSPFDAFIALIDTAGSFAIKRKIASVNDSEKLTDIVVDEGNIYFTLETSNTNTDNNVNVAFGKATVGTNSIQVEYVNEYSNAGYSFLDSSLAIDEFKELYINATLRAKSDNVTRDSVWVGKVDTAGEFVWNYRYLAPGRDVNAVGKCAIDIFGDLNIAFNRVDNTTGLKTVDTVKIGYDGVLKNHTTNEFNEYRIEGITAHSIDVDNSGDVYVFGQTSWNRNEFLLEFTGGATTDTFGNYTPTFVGADATQSLHLDGGVAKIYGRDVATPANWENAYIEFPNNTLGNTLNENWTLEFMLYQNSASTDTHSQDQQTLVAIGDATDATGGLWLYYDRTAAGPSGYLELIVTNNTTSINSSGGAVQSSLTTMFADDTWQFIGLKKEDNLFTVYVNGISVITATVADTSFTSKKLYIGNIAGRNGTTGNWRSDEQGQYFVDNLKLRNRAITPTVPSDVSALPTSSAFGLSYSWTDTSWFDTYNNLHDYIDYSGWGVKVDKNADATRIGDQGIQLNTQLGYVRTAVTPVTGSALTIGSTGFALGSLGLQSLDFDDATTTMSEDTETLTYTKDIWSSRTATIPSPGSQKLIINAVVKDRYYFKVTDTVKIDNIQILTINQAFRFTVGTKLVLNDDSGSFINSGYITKVDNANNKVYLAINNNSWTNDLNTGQLSTSQFDEQSTYGIVGPIPLDINQIDSYTFAEVDNITPGTFTIDLDKYNLDGTYNAAGSQNLDSFAKFKPYSDDDYSVRIDEISGSSTFIVGSVVTISGGDISYNAAYSTATITNLTGVLKITLVANLTKILRVTAVSNSDEVYVITDTRHYLTPGSMLNVDGNPSETVNTVVYDEYDGSFPVDTVISPLEFTYKLPQTAITSPATSASNVSIYIKSPVLKMYYGHQYLFDLSHSSMVGGNLSFSKDPLYKLEYSFNSIERVGTPGVTGQGATTPTVKFKVDEDVVTNISYYFDPSRVGDNDSPIIQGSYLDVVSSPYRGTFQVSGVAGATITRGADQIKFPLQNEPEGNADVSRASYSTSSRRAVGSIDNIRIVSPGGFYTRLPIVDSIQSTRQIERVTINEPGTEYAVGQYTGVSIAGDGEGGFVTITVADGTDAEGGAIPGQVQSVIVTSPGKGYTTATVDIDSVPGILGAGLTGSGAEVTVVIPPFGTAASIFTVGSSVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSVTVTDPGSGYSQAPAVIITGGGGTGAIAQSTIKNGRLDRIEVKDPGLGYSSTPTVELKSSFNYVVNLDLGLLQFSFPHGIAQGSAITLAVVDTGDGAEFPIAAGAVGRLNGVTTYYAISGAANSLEDDQLKFAITPANAALGDALAFTNAGTGRQQVLTTSFGGAATANVITSTFLEGEQVYQGSSFENATAFGFVSTNNGWQVGPRIVKIVDYTGEFTIGESVTGVISKSSGTISSLNIATGVLDVGSITETSGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSINDWKDILIKNVHPASFKVFGELNLNEYGFVPNKETFFQLTKSVELARQATVPNIQSFALVEPVYTAFDNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGERISFPLQIDGSNVVANANQLMIILNGVVQTPDTSFEVQNDSIVFAEPPQPPASVKYVNVTIQPIQVYRFTVTNNSGIFPSTNNTVLGTQSGSRLTVTSVVGDDIFGFVAEGNVGIVTALDNATLTSGAGYTDGTYTEVATTSSGVGTGLTVNITVAAGAVTQVSINGAGVGYASSEVITIAGGTTSATIAVSTISGFNINELISVGATGFTATLTQITPIVNLNLFSFNEQIKNLTGKIAVVEEVNLETGDSVPLADLRYTVGAGTSSIELIDSDALTDTAVPASTFTVGANYQLGAEIVTVSAITVGPNSTTLTVTRGQLGTTATSHQEDLPLYGTDISVTNELALSKTVGTYQSKPGLFDIQLDDVIIGSQSGVVARITSTSAYQDPTTNEFIEQVNISDGSSFFGLLFNRLTSASYPNIILDNIAESQVNIVDFTDNTTNFDSKFPGTEFISNLVIPYDNTTGTFQENEIIRNYKLGYGNVTGVFNSSEDMVTKKLAFDSRVGSGFFQLGQVIRTQDTKGEVIGYNQALSTIYLGKVGRTLSTGEDYHKVTFNNNAQLDTDQSHYGLSSLLLDGTGDYLSIPTSTEFGFGTGAFTIECWIRPSSVTGTQQIFDFRTTAVEVSSELLLVGTNLNYRVNNSTTITGTATLAVDTWYHVAISRNASTTKLFVNGTQDGGDYSDGSNYGTTKPIIIGASYAFGDGFAGHIDEFRVSNTSRYQTTFTAPTGIFQGDANTKLLLHFEGDDTQTYIEDWSGGESFTDNEDFNNDAILKNWNENSTNLPAGFAGKSQRYYDAANLIESNKNFVAKEAVYLLTQQYPSLVIPGGNVNCEDDIRDILTAMIEDLRNGCNSHIWDASALYVDRTANPITISHVDTEVTETVWAYDKVKDILQYIINNTLWSVSGSHGVRQITDTTITDSSTSSFTTIQPSAISYDAATGDMVMTSNDHGLTTANTIAIAAESLTFTCTSDGNERELVHPRVSDTRAYNQVLAITAADTNTFTVNVGASPAEQQYVHTFVSATSGAVTVLDYTTGDCADVYSTIGNLLDILTDTLEQADLGTPVDHLATITKVTTNYEFVGATVNAYLEVPFSTTYHSAASDILYTNRIDVAGRGRFRDASNLINANASVIVDKAAFDMLARYPDLAVDMPRNADGSSTDGTLRCKTDLGLILGAIAKDIYDGGNFFTVQAAKFYIGENDELRHIRLQVWQSVYAHDRLAYYAKQAVTGDLTYDNTDNIIVGDWGITNDAGNCANVQSAIDTLVTTINDIIAPTSEDFNIAGDRLYFNREYIAEEITGLTAAYLTYQVDNTNQVAYTYDVAKCERDIKLLITAIISDLQTGGNNSTVDNMNLYLTANGELNYIEEELLPTVFAFEQIRSLGEKAIRNLLYDSGSTVSGQQYAAIFSDNTAYRD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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 6376 AA molecular weight: 683597,49630 Da isoelectric point: 4,35673 aromaticity: 0,09834 hydropathy: -0,08546
Domains
Domains [InterPro]
DC_0042
ATT
1–435
ATT
1–435
DC_0832
ATT
417–550
ATT
417–550
IPR013320
STR
2258–2432
STR
2258–2432
PF13385
LEC
4162–4305
LEC
4162–4305
DC_0069
STR
4168–4670
STR
4168–4670
IPR006558
LEC
4181–4308
LEC
4181–4308
1
6376
Architecture
ATT 1-550 | ATT 709-1522 | STR 1523-1534 | STR 1631-2937 | ATT 3124-3690 | STR 3778-4066 | STR 4137-4670 | RBD 4671-4998 | STR 5044-5509 | RBD 5579-6375 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-RIM12 [NCBI] |
1278402 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Brizovirus > Brizovirus syn33 |
| Host |
Synechococcus [NCBI] |
1129 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO15361.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349308
[NCBI]
CDS location
range 55773 -> 74903
strand +
strand +
CDS
ATGGATATCAATAAGGTTTCACACGTCTCCTCTTATCAAACTCCTCAGTTCATAGAGAGTGAGTATCCCCTATTCAATAAATTTATTGAATACTATTACCAGTCTCAAGAAAAGACTGGATTAGGTCAAAATATTATCAATAACTTTCTTCAATATCTTGATATTGATAAGTTGGATATTAGTATTCTTGATGGTGCCAGTAAACTTGTCGAACCTATCACTTCAACAGATACGACAATTACCGTTGAGAGTGTAGATCCTTTTCTTGAGAAAGATGGTTCTATTTTAGTTGGTGATGAAGTAATTTATTATGAAGAGACTGTATCTTCTCCAAATATTGCATTAACTCCTGGTATTTCTTATACTCAGGTTCAACTTAAGTGGGTTCTGCTTGCCAACAATATTAGTCTCTTTGACGGTGTACGAAGAGTCTTTCCCTTAGTTTCTCAAGATAATCCTATTGGACCTTCTTCACCACAACACCTTATTGTTAAAGTTTATGGAAAAACTTTAACTCCAGTAGTAGATTACACTGTTAGTGGAACTAACATTGTTTATACAATTGCTCCTAGAACGGCGACAGCGGCTGATGATATTAGTACTACTAGTGTTACATACTTAAATGGTTTTAGTGAGAATACCATTGTACAAATTGATGATATTTCTAGTGCTTTTGGTGATAATAAAACTACTTTTGAACTGACTGTTAATAGTGAGAAGTATGAACCTATTGCAGATGAGTTTTTACTTGCTGTTTATGATGGTAGACTACTTGTTCCTAAGGTAGATTATTTTATTGACGGATCTATCTTTATATTCAATGTAGCACCATTGAATGGTAGATCTCTGTCCTTATATTCCATTGAAGCACCTATTCCATCTTTTGGTTCTGGTGCCGTTGGATATTCCAGAGTAAATGATCTTGGAAATATTAGTTCTGTAATTCCAAGTACAAACGGTTTTGGGTATAGATTTGATTATCCTCCCAAGGTTAGTGTAAATTCTAGTGTAGGTTCTGGTGCTTCTGTAAAGACCCTAGTAGATGGAATCAAGTCAGTTTCATTACTTAGTGGTGGTGCTGGATATAGCGAAAGTAATCCCCCTACTGTAAAAGTACAATTTCCTACAAAAGAAGGATATGTAGAACCTACTTTAAAGGCAACAGTAACTAATGGTGCAGTTAGTGCTATTGACATCATTAGTTCGGGTAGTGGATATACATTTACTCCTAGAATCACTTTTGAACAACCTGGAGGCGCTGTGCTTGCTCCCCCAACCATTGTTGGAGGATCGGTTAGTGGTGCTATTACTATTACTAATGGTGGTCAAGGATATACTACTCCTCCTTTGGTATACATTGATGAACCCACTGGACTTGATGGTATTAAAGCATCATTTACAACTACCTTGACAGATGGTGAAATTACTGCTGTTAATATTTTAAATGCTGGTCAGGGTTATGAAACAGTCCCTAGAATTTCTGTTATTGATCCTGTTGGAGCACAAGTTCTTGAAACTGTAGTTGATGGAGATGGTAGAGTTATTTCTGTCGAACTTCTGTTTGGTGGCAGCGGTTACACAGACGTTCCATCTGTTTATATTGTAGATAATCGTCAGAATGATGTTGGTACTTATATTGGAGGAACAGGTGCTACTGCAGTAGCAGCAATCTTTAATGGACAAATCACTGATATTAACATTACTAACTTTGGTACTGGTTATAGTGCAGATAATCCTCCTCAAATTGTAATCCAAAAACCTGTTGATGCTAAAGCATCTGCAACAGTTGGTTTGCAGGAAATTACAGGTTTTTCTGTTCTTAAAACAGGAAAGGAATATACTAAAGCACAATTCCTTGGTTGTGCCAGATGTGCTTCGGGTATTACTGATTATACGCAAGATGGTAATGCAGTATTCTCTAACAGCACTACAGCAGCAGAGGCATCAACAGATACCTCTGTAAAGTGTCTGGATGCATTGTTTATTAAAAGACTACTCGATAAGTATACTGAGCAGTTCTTACCTGATGTTCCTACACTTGATTATAGTAAGATTGATGTTCGTACATCTATTAAGACTATTAAAGACTTCTATTCTGCAAAGGGTACATCTTTCAGTATTGCATATTTGTTTAAACTTCTTTATGGCGAAACTGTTACAGTTTCATATCCTAAAGATCAAATTATCAAACCATCTGCAGCAACCTGGTCTGTTGATACGGTTTTACGTGCAACATTAGTTAGTGGTCTTCCAGAAAATATTCAAGATGGTCTTCTTGAGCAAGTTGCTGATATTTCAGATCCAAATATTTTAGCAGCAACAGCATTGATTGAAAACTTTATTTCAATTCAAACTGCCCAAGATACAATATATGAACTAGCACTTTCAGAAGAAACAATTGAAGGTACATTTGTAGTTCCATACAAAACAAAACTTGCTGAACCTCTTAATACTACAGAAGGTATCATCACTGTTGACTCTACTATTGGATGGCCAGAAAGAAATGGTGAATTTGTAATTTCGTCAGGTGTTGGTTCTGAAGTTGTTCAGTACAAAGAAAAATCACTAAACCAGTTTATTGAGTGTACTCGTTCTGTTAATGGTGTTGTAGAAGATTGGGATTCTGCCACTCAGGTATCGTCTAATTTTAATGTATTCATTAATAGAGGAACTGCTCAAGAAGTAGTATTGAATATTGTTGGTGTTGTTGATGCTCAACAAACAACACTCACCGATACAGGTTCTTATTACTTACCAGGAGATAAACTGTTAATCTCTAAACTGGGTGGTACTGGAACAGGTCCAGAACTCACAACTTGGTTGTATAATGTTAAAAAGTTGATTGAAGTTGAATCAATCGCTTTTGGTGGAATTAATAATCAATCTGCTACTGTAACTTGCAGCAATCCTCATGGTCTATTGGTCGGAGATCAAGTTACAATTTATGGTGCAAATCCAATCATCTACAACGGATCTTTCCTTGTAACCTCTAGAGACAGTACTACTGTATTTCAGTATCAACTTCCTCAACCTGCAAATGTAGTTCCTCAAGGAAATATCCTTGTTTCCATTGACTTGAACAAAGGTAAGTCGGATAGTTCTGCAGTTAATAATGCAATTAGTCCTTACACAACTAATGTTCAAAATACTTTCTTCAATACTACAAACACTTATATTGCGTCTACAGGTATTCCAAACTACAATATTGGACCTTTCCCTGGATCGGCATTATTACCTGGCAACCAACGTAAATTGAATAGGTTTCCAATCACTCCTGTTACAATCTCAACTAAAAATCTGATTGTACCTGGTCCTATTGGAACATGGGTAAATGGTGTCTCTATTTGGTCCTATAAGTCTGATGTCACTAAAATCTTTGGTGCCGTAACGTCAATTGCTATTACCAATGCTGGAACTGGATATGATGCAGCATTCCCACCAGCAATCACCATTAGTGGTGGTGCAGGAACTGGAGCAGGTGCAACTGCAACTGTTAATGGTTCTATCAGCGAGATTACAGTAACTGCAGGCGGTTCTGGATACACTTCATCCCCATTGGTATCTATTGTTGGTGGAGGCGGTTCTGGAGCGTCAGCAACAGCAATTATTACAAAGGGTGTAGTTTCTAGTATTCTTGTCAATTCTGGAGGAACTGGATATACTTCCCAACCATCTATCACTGTTGTTGGTGGTGGAGGATCTGGTGCTGAAGGTACTGCAGCGGTTCGAGGGCCAATTCAATCAGTCGCCATCACTAATGGTGGGGCATCTTATACATCTAATCCTAGTATTATTCTTAGTTCTGGTGCTGGTGCTGTTGCACAGGCAATTATTAATGATGGACGTATTATTTCAATTGCTATCATTTCGGCAGGTTCTGGATATACTACAGCACCAGAGGTAACTATCCAGGGAGATGGTTTTGGTGCTATTGCTAGAGCAACTATTGATGTTGATGGTGAAAATGCTGGTAAAGTTACTGGAATTGAAATTGTTAATAGAGGTATTGGATATAGTCAAGGTACGACTATTATTAACTTAAACTCTGTTGGTCAAGGTGCTTCTTTCTTAGCAAATGTATTCCAATGGACTTATAATTTGCAAGAGACAACAACCGTTGATAGTGCTAAGGGATCTGTATTTGAAGGATTTAATAATCAGTACGGTGGAGAATATGCACACCTTTCCAATCCTCAAAGACTTAGATACATTCTAGGCGACAATCTATTTGCTAATGTAAATGATCAAATTCTTGAACAGGATGATCAATTAGGACATTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGCAATCCAATTTATGGTCCTTATGGATATTCAGACCCTACCAATCAGTCTTCTTCAATCTCTAGATTGAGAACTTCTTATAGATTAAAGGCAAATTTAGTTTATGATGAGGTTACTAATCCAACTCCTGTTAGAACTGATGGACCTCTGCTATCAGAGGAGATTGCAGGTAAGTTTGTAGAAGATTATGAGTATTCCTTCAGTTTAGGAGATCTTGATCAATATAATGGTAGGTTCTGTAAGACTCCAGAATATCCCACTGGTAGGTATTGCTATTTTGTAACTATTGATGCTACAGAGCAAGGTAATCCAGTATTTCCATATATTCTTGGACCAAGTTTTAACTCGGTTGTTGATACCTGGAATCTTTCTACGACTGCTGTTCAGCAAAATATTCCTATTGGTGTTGTTCGTTATCGCGATCCTTATGAAAATGTAGATATTGATGTTGAGAGAGCACCAAATGCATCTACTAATGGATTGACATTGGAAAATGGAGATATTCTAACTTTCGATGTAGAAGATGAAAATAGAGATGGTGTTATTAGTGCAGAAGAAACTGCAGATCCAGATCAAATATTTGAAGAGTCTCCATTACAACTATTCGATTACTTCCCGAAAGTAAAATTAGACTCCAAGGTTGATATTGAAGTAGAAACTATCACTAAATTTGAAGATGCTTCAATCACGGGATT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Genbank protein accession
AOO16001.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349311
[NCBI]
CDS location
range 55771 -> 74901
strand +
strand +
CDS
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