Protein
- Genbank accession
- YP_010073123.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber protein distal subunit
- RBP type
-
TSPTSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHTGNYNQTGDYTLNGVFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTAHVRFFDNNSRERGIIYAPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGSESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSISSPQILTNKVITNNKFTGDYDIYSMADNVPLSESTTAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYSGDGLDAYLWSFTWSGGIKSSHSISIGLTPGPKDYSILGPSSIALGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFSPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNASTLMFRGNTTGSSSVDNMTISVWGNTFIIPSEGNRKNVMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGNRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFTGHGAGAGGYDIQYVQAAPIFQEIDDDAVSKYYPIVKQKFLNGKSVWSLGTEINSGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVQVGGGEATIARNGNIWSDIWKTFTSAGDITNIHDAIASRVSKEGDTMTGKLTLSAGNDALVLTAGVGASSHIRSDVGGTGNWYIGKGGGDNGLGFYSYITQGGVYITNNGEISLSPQGQGTFNFNRDRLHINGTQWTAHQAGDWGNQWRQEAPIFVDFGNVGNDSYYPIIKGKSAITNEGYISGVDFGMRRITNNWAQGIIRVGNQENGSDPQAIYEFHHNGVLYAPNMVQAGARLSAGGGDPVWTGPCLVIGDNDTGLVHGGDGRINMVANGIHIANWGAGYQSHPGLWDSTGAFWTEVGRAIVSHGHLVQANDSYSTFVRDVYVRSDIRVKKDLVKFENASQKLSKINGYTYMQKRGTDEEGNQKWEPNAGLIAQEVQAILPELVEGDHDGEALLRLNYNGVIGLNTAAINEHTAEIAELKSEIEELKALVKSLLK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1103 AA molecular weight: 118789,93100 Da isoelectric point: 5,63277 aromaticity: 0,09610 hydropathy: -0,34397
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage PE37 [NCBI] |
1837875 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010073123.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054929
[NCBI]
CDS location
range 7479 -> 10790
strand -
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGTGTACTTTTTACTAAAGATGACCAAGGAAATATTATTGATCTGGGTTTTGCTAAAGGCGGTAGTATTGACGGGAATGTTATTCATACAGGCAATTATAACCAAACTGGCGATTATACTTTAAATGGCGTCTTCACTCAGACTGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCCGCCGGGCAGATTATGACTGAAGGCGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACAGCGCATGTTCGTTTTTTCGATAACAATAGTCGCGAACGCGGAATCATTTATGCCCCGGCTAATGATGGTTTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGACTACGCCGCTGGTAGCGAAAGCACTTATGCATTTTCAGGCAGTGGACTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATTTCGTCTCCACAAATTCTGACCAACAAAGTCATTACTAATAATAAATTTACGGGTGATTATGACATCTATTCGATGGCAGACAATGTTCCATTGTCTGAAAGCACTACTGCTATTAATCATCTTCGTGTCATGCGTAATGCCGTTGGTTCTGGTATTTTCCATGAAGTTAAAGATAATGATGGAATAACATGGTATAGTGGAGATGGATTAGACGCTTATCTTTGGTCATTTACTTGGAGCGGCGGAATTAAATCAAGTCACTCAATTTCCATCGGTTTAACACCCGGACCTAAGGATTACTCAATATTAGGACCGTCTAGTATCGCTTTAGGAGATAATGATACTGGATTTAAATGGCATCAAGACGGATATTATTTCAGTGTTAATAATGGAACAAAAACATTTTTATTTAGCCCTAGCGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGGTATTCTACTAATGGAACCGATTTAACTACTCCTCCGACTGAAAACTATGCTCTCGCTACTGTTGTTACATATCATGATAATAACGCGTTTGGAGATGGTCAGACTCTTTTAGGATATTATCAAGGCGGTAACTATCATCATTATTTCCGCGGCAAGGGCACTACAAACATTAATACTCACGGCGGTTTGTTAGTTACTCCAGGCAATATTGACGTTATTGGTGGTTCTGTTAATATCGATGGTAGAAATAATGCTTCTACACTGATGTTTAGAGGTAACACAACTGGTAGTAGTTCAGTTGATAATATGACAATTTCCGTGTGGGGTAATACATTTATTATTCCTAGTGAAGGTAATCGCAAAAATGTCATGGAAATTTCTGATGCAACTAGTTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACTACTGGTGAAGTAGAAATGAACGTTAACGGTTCATTTGAATCATCCGGTGTTACTGCTGGAAATAGAGGAGTTCACACAACAGGCGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCGCTTCGCATTTGGAATGCAGATTATGGAGCTATTTTTAGACGTTCAGAAGGCAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTACGGTGAAGGTAAACATGGTGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACTGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCAGCAAACGGTTATATTAAATTTACTGGTCACGGCGCTGGGGCTGGTGGTTATGATATTCAATATGTTCAAGCAGCTCCTATTTTCCAGGAAATCGATGATGATGCTGTAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTCTAAACGGTAAATCCGTTTGGTCTTTAGGTACTGAAATTAATTCGGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCGGATAACGTTCAAGTCGGTGGCGGTGAAGCTACTATTGCTCGCAATGGTAACATCTGGTCTGATATTTGGAAAACATTTACTTCAGCTGGTGATATAACTAACATTCACGATGCTATTGCCTCCCGTGTGTCTAAAGAAGGCGACACGATGACCGGTAAATTGACTTTATCGGCAGGCAATGATGCTCTTGTTTTAACTGCAGGCGTGGGTGCTTCATCGCACATCCGTAGCGATGTAGGTGGTACAGGTAACTGGTATATAGGCAAAGGTGGCGGCGACAACGGTCTAGGTTTTTACAGTTACATTACACAGGGTGGTGTATACATAACAAATAACGGCGAAATATCGCTTTCTCCTCAAGGTCAAGGAACATTTAATTTTAATAGAGACCGCCTTCATATAAACGGTACACAATGGACTGCGCACCAGGCTGGCGATTGGGGAAACCAATGGCGACAAGAAGCTCCGATATTTGTAGATTTTGGTAATGTTGGTAATGATAGTTATTATCCTATTATTAAAGGAAAATCTGCTATTACGAATGAAGGATACATATCTGGCGTTGATTTTGGTATGCGTCGCATTACTAATAACTGGGCACAAGGTATTATTCGTGTAGGTAACCAGGAAAACGGTTCTGACCCACAAGCTATCTATGAATTCCACCACAATGGAGTTCTGTATGCTCCTAATATGGTTCAAGCTGGAGCAAGATTATCAGCTGGCGGTGGTGACCCGGTGTGGACTGGACCATGTCTTGTTATTGGTGATAATGATACTGGATTAGTTCATGGCGGTGACGGCCGAATCAATATGGTTGCCAATGGTATACATATTGCAAACTGGGGAGCAGGCTATCAATCTCATCCTGGGCTTTGGGATTCAACCGGTGCTTTTTGGACAGAAGTTGGAAGAGCTATCGTTTCTCATGGGCATCTCGTTCAGGCAAATGATAGTTATTCAACGTTTGTCCGTGATGTTTATGTCCGTTCTGATATTCGTGTTAAAAAAGACCTCGTTAAATTTGAAAATGCTTCTCAGAAGCTTTCTAAAATTAACGGTTACACTTATATGCAGAAACGTGGAACGGACGAAGAAGGCAATCAGAAATGGGAACCTAACGCCGGTTTGATAGCTCAAGAAGTTCAAGCTATTTTGCCTGAATTAGTTGAAGGTGACCATGATGGCGAAGCTTTACTTCGTTTGAACTATAACGGTGTAATTGGTTTAAATACAGCTGCAATCAATGAGCATACTGCAGAAATTGCGGAACTTAAATCAGAAATTGAAGAACTTAAAGCATTAGTTAAATCATTGTTAAAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
b2c48001d81f72503c509fa2e17ae47aab5c66b0253c050799e1234e0c050f67
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Genomic characterization of a T4 like phage against E. coli O157:H7 | Hoang Minh,S., Hoang Minh,D., Honjo,K.-I. and Miyamoto,T. | 2020-05 | — | GenBank |