Protein

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Genbank accession
QHR73969.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKSFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLANSNTFNVKQTITANGEILTLRNPASASEAYTAVVARDASNEKVWAIGNLIKGSRDVQIESEQGSTITLGTSVAINKTLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLTGNNTFSGANVFNGFNTIKRDGEVLRLQNSSVSQPLYIKAIDSSGANRWYVGCANGGDDVSLENYKTGGKLTIGSNAAINTTLKITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNASNTFTAKQVINTDGEALTLQGKTTAALYIRGKDYDGTNRWYVGNNSESDTLNVYNYKTGKTLSIGSEVAINATLVIGGQVQPSNFTNFDARYYGKAEADSKYFWSAFRASKTEAAGGVAWDQPSGIYLETKSSGQNRLVLHMASNAKALTPSAQLRFESKNGGMWYRSARDTLGFEVEWSKVYTEAQKPTPSELGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHNHSISWIGQNSQHYSGGGGAYVGSGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHRHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:779 AA
molecular weight: 83245,82230 Da
isoelectric point:8,63111
aromaticity:0,08472
hydropathy:-0,41374

Domains

Domains [InterPro]
DC_1993
STR
101–361
DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 DC_0383
IPR048388
ATT
274–356
IPR048388
DC_0026
STR
306–720
DC_0026
QHR73969.1
1 779
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 101-158 | ATT 159-248 | STR 249-273 | ATT 274-356 | STR 357-381 | ATT 382-467 | STR 468-779
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage allfine
[NCBI] 		2696380 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus allfine
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR73969.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850633.1 [NCBI]
CDS location
range 7751 -> 10090
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTATTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGTCTTTTAAAATCAACGCAAATGGCCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTACCATACTTTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGGTATGCAAGGTTGGCTAACTCAAACACGTTTAACGTCAAGCAGACTATTACAGCAAATGGAGAGATTCTAACACTAAGAAACCCTGCAAGTGCTAGTGAGGCATACACTGCTGTTGTAGCTAGGGATGCTAGTAATGAAAAAGTTTGGGCTATCGGGAACCTAATTAAAGGCAGCCGTGATGTTCAAATTGAGAGTGAACAAGGTTCAACCATTACTCTAGGCACAAGTGTTGCTATTAATAAAACCCTTGCTATTACTGGTCAAGTTCAACCCTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGATATTTTACTCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAACTGGTAATAATACCTTTAGTGGTGCAAATGTGTTTAATGGCTTTAACACAATTAAACGTGATGGTGAAGTGTTAAGGTTGCAAAATTCATCAGTTAGCCAGCCATTGTACATCAAGGCTATTGACTCTTCTGGTGCTAACAGGTGGTATGTTGGATGCGCCAACGGCGGTGATGATGTATCACTAGAGAATTACAAAACTGGTGGTAAACTCACTATTGGTTCAAATGCCGCTATCAATACAACACTAAAAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATACATTCCAGCAGCAACATTAAGTACAATTGCAAGAACTAATGCAAGTAACACGTTCACTGCAAAGCAGGTTATTAACACTGATGGTGAAGCTCTTACGTTACAAGGAAAGACAACCGCAGCACTTTACATTAGAGGTAAGGACTATGATGGAACGAATAGGTGGTATGTTGGTAATAACAGTGAGAGTGACACTCTTAATGTATATAACTATAAAACTGGTAAAACCCTAAGCATTGGTTCCGAAGTAGCAATTAATGCAACCTTAGTAATTGGTGGTCAAGTACAACCTAGCAACTTCACAAACTTTGATGCAAGGTATTACGGTAAAGCCGAAGCCGATTCAAAGTATTTCTGGTCAGCATTCAGAGCTTCGAAGACCGAGGCTGCTGGTGGTGTGGCTTGGGACCAACCCTCAGGAATCTATCTTGAGACAAAATCTAGCGGGCAAAACCGTTTAGTCTTGCACATGGCCTCTAATGCGAAAGCCCTAACACCATCTGCACAATTAAGATTTGAATCGAAAAATGGTGGGATGTGGTACAGGTCAGCCAGAGACACACTTGGCTTTGAGGTTGAATGGTCTAAGGTTTACACTGAAGCTCAGAAACCAACCCCTTCAGAGCTTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCGGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTACCCAGTGGGTATTGTGACATGGTTTAACAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACTCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACACACTCTGTAAGTGGCTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAACCATTCCATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCACAGCACTATTCTGGTGGTGGTGGTGCATACGTTGGTTCAGGGCCGGGTTACACTGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCTGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGGCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTCACTAACCAGTTCTACAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
2ef61660fe4e822f756855ed5df859aa3ac636fb4776583f7b6bf76811cafde6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6896
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank