Protein
View in Explore- Genbank accession
- XYM58459.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPQNTNLNASPYFEDFDPKKNFYKVLFRPGYAVQTRELIQLQSVLQTQLENFGRNIFKQGDLVVPGEVGLNVRLNYVKLSSVSEVAVADDAGNVTYKKYDIKTLVGLKVQGVSSGVVATVVEVDYGSDTQSDTLYVNYLDSGSSGDEETFRQGENLEVIGGVNSPLLVVGTDGVSLPTSIGVTNPDTGESTVIDSPALGYASAVKVEEGIYFANGYFVRNAEQLLVIDKFYDKPSAKVGFTIEETLVTPEQDSSLYDNSRGSSNFSAPGAHRLKITLTLVKYDYFQLTDKNFIQLLLVKEGVIQKQLQATDYSLVEAALARKTFDQSGDYVVDEFPIQVREYYQQNDNLGFYTAGNDGLVNGLTAIDAEKKLIATVGSGKAYVKGYEVKNKETKYLEIDKARDELKRDNETIKTNGLSSFYVTNVYGTIPLNAEGAELTAYPTLYFHSVFNDGSIGLNKTEAAGDPKRTVSRRGQGFTVADGIKTVYCTISDSTKDMDDFDDDAIGDILDKLWFIKTRSDSGSVNTYGYAEVVSFSKVKRPELGNSTYLEITVKGVRSDLDLYLTNNDATDSIAQIRYLYPSEANVQVKANELLRILDYNETVTPVIGVAKPKNIAIQQVSDGFNVDTDKVLSKGKLAGGVEKYNTVFDLSYFAPQFFTRLTLTDFVSSTFTTGKYVTGTLSGAKAVIEGGTDNVYSSTNKLFVLMISGKFIPGETIINEDGDTIKIARNNTVSHFIVTDRGSGYSAGSLFKLDGVVYDQNKIAWVRGGGGTVQSIRIVDRDAVSVEYAKPPTIEVQTNDVINAEDVVKVTPVLFRDTVYTFDPSNVKSVSTAFGSGNKNAFTADVELEKTAFVNTKSITDFTFTGKEGYKYIECNGFSGDATVSLVIGDIVQFADDTGAVYRYCVQYATRPDGVNRSRIYLDRALQANATGASVVVQKPVITNANGTLVFATGDKKISSLIDSSEDSKIVYNFRRDFITTASSGSGNLTFAAQLPFGTQRFVPFSEENFLITVLDPGITIHGLDTNGDFVPNGGSLVMGDVVYVNPEFISITESDSELTAGSVTVNFPENHFGDIDEIRTKAEAYNIANPGSAVTLPDNNFPTLKLTATLQVSKARPRLKTVVRNKRIIVQAGGTTAVPFRGQDYDGENIQITSYSDAFKLRYVYEGSVSSPPTVDSVGGLVSGTDVTSRYIFDDGQRDTYYDISRIVLKPGQTAPTGQMVIAFDYFEHSQGDFCTIDSYLHEAGVPSTEVPFFNSTVNGLISLRDAIDFRPKADDSNIISGYLDKTILSSDGYISFSGTSGIPASTPADDANLTYTVKYNKTQYLDRIDGVFLDTKGNFIVKKGNASLNPSRPESISDAISLYYLYVPAYTDSNRDVRIIPVENKRYTMKDIGKLDSRIERLEYYTSLSVLEQQALNMQISDEVGLDRFKCGFFVDNFETHKGDVNSIDHKVAVDTQQSVLRPQVNEESLGVKEINTRNDQREVDGYVINNGVISLPYTETKLVGNSFATKTINPNPFVVIQYVGDLDISPRVDSWYDRSIVPLITDNNTNLFIPFLAKEDVVDAFSCIYNSFIITWTGAERSFFNINPLATTNSEISQSRVDSATVASSSNISPQNNETPKGVATTNRRGKEIVTSLKYFARSVPVKFTLRRLKPKTEVFVYLEGKNIGRWVAPDSRFSGIPGNSVSAFGTPITTDERGNASGILLIPAGAPPTFATTWTGDVDTVSYDEAGEDIRITTGDKTLRFTSSKTNGSKELVETFAETKFYASGLLPNNPGSIISTQPAYFKANEGLQLVQNNTEQEQKPNPLAQTFKIEGYEGGVFTTGLDLFFSQKSDTVPLRVYLTDVESEKPGKNIIPGTEVVMEPYTFLKVYFTNTVTIFRGETVSGVNSNASGPILKVMDKNDNELAISEDGEITLTNEQVYTIVLSNHNGLDFTPDERLTIPSIIVFNNANNTEIVARIAKDSGVVSAVNITNVGDNYDEASLTIESPSLPGGNNATASAFVSEGKIYNSLLTLGGRGYTEPPSVVIRGTGIGNGGAVIDTEIEITEPAVRMGIAVDAVGSVPSVVATKFKFAYPVYLLNNTEYAVTIETDSQDYFLWASKLGEAEVATSTTVTTNPSLGSVYKSQNTNSWVEDLFEDIKFTLYRAEFDMSKTAHVQLKNTSLGYDAMKIDPLESYAFANANASSSLFKNNNNIIKVTHKNHGFEDGKSYVFFRNLKSTAGFTQGTLNGNLFKVDNAGIDTFTISGIGRAADSVFGGGSTGLIAANKKYERLLAQISYIQTPGTNIDTEVKTTNIIPIDSNTINYTSYSTSSFEKTFLNEEQYFINQKVIASGVNQLMNNLDNSLVYKLSLSTTKSYLSPVIDLSTSSIKISTNRIENGVGDEGRFGKRYQEITFYPVVKFSLANNTDPDSGNTIPITVGQIVEGIGNAANSIDPSASKGEVVRYEASGNTIYVKVKNSSIFRGNERLFFASQMAEGGDLGSYVTDGQGNQVWTPFNVEVTSSGAILENPAFTFGELITATNPSNVTETYDNLISGTVVLWDAPTQTLKLENDRQPINNNYVKESGASVYARAQQIADQPEDIFRVGDIVNAPSIDVGFESFYEIKSMAMTVGVDFVPEDSTLDSSAVAKYVTKEITLDKSATAIDVIITANVTNTKNLKMLYKTKTTSVQSKFDDLEWLLFNDTGYPNEMKNATPQNAISAQKEEQSAYQEFRYSVDTLDEFTSFGIKIAMQTDDPAFVPKIQDIRVVSSR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2758 AA molecular weight: 301621,79920 Da isoelectric point: 4,76711 aromaticity: 0,09826 hydropathy: -0,25062
Domains
Domains [InterPro]
IPR032096
STR
11–68
STR
11–68
IPR032096
STR
202–342
STR
202–342
1
2758
Architecture
STR 11-68 | STR 88-1553 | RBD 1554-1944 | RBD 2002-2758
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM58459.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340854.1
[NCBI]
CDS location
range 80988 -> 89264
strand +
strand +
CDS
ATGCCCCAGAATACTAACTTAAACGCATCACCTTACTTTGAAGATTTCGATCCGAAGAAAAATTTCTACAAGGTTCTGTTTAGACCTGGGTACGCAGTACAGACCAGAGAGTTAATTCAACTCCAGTCTGTACTGCAGACTCAACTAGAAAACTTTGGTAGGAACATCTTCAAGCAAGGTGATCTTGTCGTGCCTGGTGAAGTCGGTCTTAATGTCCGACTTAACTATGTTAAACTGTCTTCTGTTTCCGAAGTTGCTGTTGCTGATGATGCAGGTAACGTAACTTATAAGAAATATGATATCAAGACCCTCGTCGGTCTTAAGGTACAGGGCGTATCCTCTGGGGTGGTTGCGACTGTAGTCGAAGTTGATTATGGTTCAGATACACAATCCGATACCCTCTATGTAAACTACCTTGATAGTGGTTCTTCAGGTGATGAAGAAACCTTCCGTCAGGGTGAGAACCTAGAGGTTATTGGTGGTGTTAATAGTCCACTATTAGTTGTTGGCACAGATGGGGTATCTCTGCCAACATCTATTGGTGTAACAAATCCAGATACAGGTGAATCTACTGTTATTGATAGTCCTGCACTGGGTTATGCTTCTGCTGTCAAGGTAGAAGAAGGTATTTACTTTGCCAATGGTTACTTTGTACGTAATGCAGAGCAACTTTTGGTTATTGACAAATTCTATGACAAACCATCGGCAAAAGTTGGTTTTACAATTGAAGAAACTCTAGTAACACCTGAGCAAGATTCCTCTCTGTATGATAATTCCAGAGGATCATCTAACTTCTCTGCTCCTGGTGCTCACAGACTTAAGATTACACTGACTCTGGTCAAGTACGATTACTTCCAGCTAACTGATAAGAATTTTATTCAGTTGCTACTTGTAAAAGAAGGTGTAATTCAAAAACAACTACAAGCAACTGATTATTCGCTCGTAGAAGCTGCTCTAGCAAGAAAAACATTTGATCAATCTGGAGACTATGTTGTCGATGAGTTCCCTATTCAAGTTAGGGAATATTATCAGCAGAATGACAACCTAGGATTCTATACTGCAGGCAATGATGGTCTAGTTAATGGTCTGACAGCAATCGATGCTGAGAAAAAATTAATTGCGACTGTTGGTTCTGGTAAAGCATATGTAAAAGGTTACGAAGTAAAGAATAAAGAAACTAAGTACCTTGAAATTGATAAAGCAAGAGACGAACTGAAGAGAGATAATGAGACTATTAAAACTAATGGTCTAAGTTCGTTTTATGTTACTAATGTATATGGCACTATTCCACTCAACGCAGAAGGTGCAGAACTAACCGCATATCCAACACTATATTTCCATAGTGTATTCAATGATGGTTCCATTGGTCTGAATAAGACTGAAGCAGCAGGAGATCCTAAGCGTACAGTCTCTAGAAGAGGTCAAGGTTTTACTGTTGCTGACGGTATCAAAACTGTCTACTGTACTATTTCAGATAGTACAAAGGACATGGATGATTTTGATGATGATGCTATCGGTGATATCCTAGACAAATTGTGGTTTATTAAAACTAGAAGTGATAGTGGATCTGTTAACACATATGGTTATGCAGAAGTAGTATCTTTCTCCAAGGTAAAGCGACCAGAACTTGGTAACAGCACATACCTAGAAATTACTGTTAAAGGTGTTCGTTCTGACCTAGATCTATACCTTACTAATAATGATGCAACAGATAGTATTGCACAAATTAGATACCTGTATCCTAGTGAAGCAAATGTTCAGGTTAAAGCAAATGAACTGCTTCGTATTCTAGACTATAATGAAACTGTAACTCCTGTTATTGGTGTTGCGAAACCCAAGAACATTGCTATTCAGCAAGTAAGTGATGGATTCAATGTAGATACAGATAAGGTTCTGTCTAAAGGTAAACTAGCAGGTGGTGTAGAAAAATACAACACCGTCTTTGACCTGTCATATTTTGCTCCTCAGTTCTTTACAAGACTAACTCTTACTGATTTTGTATCAAGTACATTTACTACTGGTAAGTATGTCACTGGCACCCTTAGTGGTGCAAAAGCAGTTATTGAAGGTGGAACAGATAATGTTTATTCTTCTACAAATAAACTATTTGTTTTAATGATTAGTGGTAAGTTCATCCCTGGTGAAACTATCATTAACGAAGATGGCGATACCATAAAAATCGCTAGAAACAACACTGTCTCTCACTTTATTGTTACTGATCGTGGCAGCGGTTATTCTGCAGGATCTTTGTTCAAATTAGATGGTGTCGTTTACGATCAGAATAAGATCGCATGGGTTCGTGGTGGCGGTGGCACAGTCCAGAGCATTAGAATTGTAGATAGAGATGCTGTATCTGTTGAATATGCAAAACCACCTACGATTGAAGTACAAACTAATGATGTTATCAATGCTGAAGATGTAGTAAAAGTAACACCAGTTCTGTTTAGAGATACAGTATATACATTTGATCCTTCTAATGTAAAGTCTGTAAGCACAGCGTTTGGTTCTGGTAATAAAAATGCATTTACTGCTGACGTTGAATTAGAAAAGACTGCTTTTGTTAATACCAAATCAATTACCGACTTTACATTTACAGGTAAAGAAGGTTACAAATATATTGAGTGTAATGGTTTTAGTGGCGATGCTACTGTTTCTCTAGTGATCGGCGATATTGTTCAGTTTGCTGATGACACTGGTGCAGTGTATCGTTATTGTGTGCAGTATGCGACCAGACCTGATGGTGTCAACAGATCCAGAATCTATCTGGATAGAGCACTACAAGCAAATGCAACTGGTGCTAGTGTAGTTGTACAGAAACCTGTTATTACCAATGCTAACGGCACTCTGGTGTTTGCTACAGGTGATAAGAAGATTTCTTCGCTGATTGACTCTAGCGAAGATTCTAAGATTGTTTATAATTTCAGAAGAGACTTTATTACAACAGCATCTTCTGGTTCTGGCAATCTGACGTTTGCTGCACAACTACCATTTGGTACACAAAGATTTGTTCCTTTCTCCGAAGAGAACTTCCTAATTACTGTTCTTGATCCAGGGATTACTATTCATGGTCTAGACACCAACGGCGATTTTGTTCCCAATGGTGGTTCCCTAGTTATGGGAGATGTTGTATACGTTAATCCAGAATTTATTTCTATTACAGAATCTGATTCTGAGTTAACTGCAGGTAGTGTTACTGTTAATTTCCCAGAGAATCATTTCGGTGACATCGATGAGATTAGAACAAAAGCAGAAGCATATAACATTGCTAATCCAGGTTCTGCAGTTACACTTCCAGACAATAACTTCCCAACTCTTAAACTAACTGCTACTCTGCAAGTATCTAAAGCACGTCCTAGACTAAAGACTGTAGTTAGAAACAAGCGCATCATTGTACAAGCAGGTGGAACTACTGCTGTTCCATTTAGAGGTCAGGATTACGATGGCGAAAATATCCAAATCACCTCGTATTCTGACGCATTCAAATTAAGGTATGTATATGAAGGTTCAGTTTCTTCACCTCCAACAGTCGATTCCGTTGGCGGTCTCGTATCGGGTACAGATGTTACCTCCCGATATATTTTCGACGATGGTCAGCGCGACACGTATTATGATATCTCGCGCATAGTTCTGAAACCAGGGCAGACTGCACCTACAGGTCAGATGGTCATTGCATTCGATTACTTCGAGCATTCACAAGGAGACTTCTGTACTATTGACTCCTATCTGCATGAAGCAGGTGTACCTAGTACCGAAGTTCCATTTTTCAACTCTACTGTCAATGGTCTCATCTCTCTAAGAGATGCTATTGACTTTAGACCTAAGGCAGATGATTCTAATATCATCTCTGGTTACTTGGATAAAACTATCCTATCCAGTGATGGCTATATCTCCTTCTCAGGCACCTCTGGAATCCCCGCTAGCACCCCTGCGGATGATGCTAACCTAACATATACGGTCAAGTACAATAAGACCCAGTATCTGGACCGTATCGACGGAGTGTTCCTTGATACTAAAGGCAACTTTATTGTCAAGAAAGGCAATGCTTCTCTCAATCCATCCAGACCAGAATCTATCAGTGATGCTATTTCACTGTACTATCTGTATGTTCCTGCATACACTGACTCTAACAGAGATGTAAGAATCATCCCTGTGGAAAACAAGCGTTACACGATGAAAGACATCGGTAAACTTGATAGCAGAATTGAAAGACTAGAATACTACACTTCGCTGAGTGTTCTGGAACAGCAAGCACTTAACATGCAGATCAGCGATGAAGTTGGTCTTGATCGCTTTAAGTGCGGTTTCTTTGTAGATAATTTTGAGACTCATAAGGGTGATGTAAATTCCATCGACCACAAGGTTGCTGTTGATACTCAGCAATCTGTTCTAAGACCTCAGGTCAATGAAGAAAGTCTAGGTGTAAAAGAAATCAATACCAGAAATGACCAGCGCGAAGTTGATGGATATGTAATCAATAATGGTGTAATCTCTCTTCCATATACTGAGACTAAACTGGTTGGCAATAGTTTTGCTACTAAGACTATCAACCCCAATCCATTTGTTGTTATTCAGTATGTTGGTGATCTTGATATTTCTCCAAGAGTTGACTCTTGGTATGATAGAAGTATTGTTCCTCTAATTACTGACAATAACACTAATCTGTTTATTCCTTTCCTTGCCAAGGAAGATGTTGTTGATGCATTCTCTTGCATCTATAACTCTTTCATCATCACATGGACTGGTGCCGAAAGATCGTTCTTTAACATCAACCCACTTGCTACTACAAATAGTGAAATTTCTCAATCTAGAGTTGATAGTGCAACTGTTGCAAGTTCTTCTAACATTAGTCCTCAAAACAATGAGACACCTAAAGGTGTTGCTACTACCAACAGAAGAGGTAAGGAAATTGTTACCTCCCTCAAGTATTTCGCACGTAGCGTTCCTGTTAAGTTTACACTCCGTAGACTGAAACCAAAGACTGAAGTATTCGTATACCTGGA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
fa0ecf1e42ebad06e378e646e69f782405fba474779eaff9b6a247e753eff628
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50