Genbank accession
XYM58459.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPQNTNLNASPYFEDFDPKKNFYKVLFRPGYAVQTRELIQLQSVLQTQLENFGRNIFKQGDLVVPGEVGLNVRLNYVKLSSVSEVAVADDAGNVTYKKYDIKTLVGLKVQGVSSGVVATVVEVDYGSDTQSDTLYVNYLDSGSSGDEETFRQGENLEVIGGVNSPLLVVGTDGVSLPTSIGVTNPDTGESTVIDSPALGYASAVKVEEGIYFANGYFVRNAEQLLVIDKFYDKPSAKVGFTIEETLVTPEQDSSLYDNSRGSSNFSAPGAHRLKITLTLVKYDYFQLTDKNFIQLLLVKEGVIQKQLQATDYSLVEAALARKTFDQSGDYVVDEFPIQVREYYQQNDNLGFYTAGNDGLVNGLTAIDAEKKLIATVGSGKAYVKGYEVKNKETKYLEIDKARDELKRDNETIKTNGLSSFYVTNVYGTIPLNAEGAELTAYPTLYFHSVFNDGSIGLNKTEAAGDPKRTVSRRGQGFTVADGIKTVYCTISDSTKDMDDFDDDAIGDILDKLWFIKTRSDSGSVNTYGYAEVVSFSKVKRPELGNSTYLEITVKGVRSDLDLYLTNNDATDSIAQIRYLYPSEANVQVKANELLRILDYNETVTPVIGVAKPKNIAIQQVSDGFNVDTDKVLSKGKLAGGVEKYNTVFDLSYFAPQFFTRLTLTDFVSSTFTTGKYVTGTLSGAKAVIEGGTDNVYSSTNKLFVLMISGKFIPGETIINEDGDTIKIARNNTVSHFIVTDRGSGYSAGSLFKLDGVVYDQNKIAWVRGGGGTVQSIRIVDRDAVSVEYAKPPTIEVQTNDVINAEDVVKVTPVLFRDTVYTFDPSNVKSVSTAFGSGNKNAFTADVELEKTAFVNTKSITDFTFTGKEGYKYIECNGFSGDATVSLVIGDIVQFADDTGAVYRYCVQYATRPDGVNRSRIYLDRALQANATGASVVVQKPVITNANGTLVFATGDKKISSLIDSSEDSKIVYNFRRDFITTASSGSGNLTFAAQLPFGTQRFVPFSEENFLITVLDPGITIHGLDTNGDFVPNGGSLVMGDVVYVNPEFISITESDSELTAGSVTVNFPENHFGDIDEIRTKAEAYNIANPGSAVTLPDNNFPTLKLTATLQVSKARPRLKTVVRNKRIIVQAGGTTAVPFRGQDYDGENIQITSYSDAFKLRYVYEGSVSSPPTVDSVGGLVSGTDVTSRYIFDDGQRDTYYDISRIVLKPGQTAPTGQMVIAFDYFEHSQGDFCTIDSYLHEAGVPSTEVPFFNSTVNGLISLRDAIDFRPKADDSNIISGYLDKTILSSDGYISFSGTSGIPASTPADDANLTYTVKYNKTQYLDRIDGVFLDTKGNFIVKKGNASLNPSRPESISDAISLYYLYVPAYTDSNRDVRIIPVENKRYTMKDIGKLDSRIERLEYYTSLSVLEQQALNMQISDEVGLDRFKCGFFVDNFETHKGDVNSIDHKVAVDTQQSVLRPQVNEESLGVKEINTRNDQREVDGYVINNGVISLPYTETKLVGNSFATKTINPNPFVVIQYVGDLDISPRVDSWYDRSIVPLITDNNTNLFIPFLAKEDVVDAFSCIYNSFIITWTGAERSFFNINPLATTNSEISQSRVDSATVASSSNISPQNNETPKGVATTNRRGKEIVTSLKYFARSVPVKFTLRRLKPKTEVFVYLEGKNIGRWVAPDSRFSGIPGNSVSAFGTPITTDERGNASGILLIPAGAPPTFATTWTGDVDTVSYDEAGEDIRITTGDKTLRFTSSKTNGSKELVETFAETKFYASGLLPNNPGSIISTQPAYFKANEGLQLVQNNTEQEQKPNPLAQTFKIEGYEGGVFTTGLDLFFSQKSDTVPLRVYLTDVESEKPGKNIIPGTEVVMEPYTFLKVYFTNTVTIFRGETVSGVNSNASGPILKVMDKNDNELAISEDGEITLTNEQVYTIVLSNHNGLDFTPDERLTIPSIIVFNNANNTEIVARIAKDSGVVSAVNITNVGDNYDEASLTIESPSLPGGNNATASAFVSEGKIYNSLLTLGGRGYTEPPSVVIRGTGIGNGGAVIDTEIEITEPAVRMGIAVDAVGSVPSVVATKFKFAYPVYLLNNTEYAVTIETDSQDYFLWASKLGEAEVATSTTVTTNPSLGSVYKSQNTNSWVEDLFEDIKFTLYRAEFDMSKTAHVQLKNTSLGYDAMKIDPLESYAFANANASSSLFKNNNNIIKVTHKNHGFEDGKSYVFFRNLKSTAGFTQGTLNGNLFKVDNAGIDTFTISGIGRAADSVFGGGSTGLIAANKKYERLLAQISYIQTPGTNIDTEVKTTNIIPIDSNTINYTSYSTSSFEKTFLNEEQYFINQKVIASGVNQLMNNLDNSLVYKLSLSTTKSYLSPVIDLSTSSIKISTNRIENGVGDEGRFGKRYQEITFYPVVKFSLANNTDPDSGNTIPITVGQIVEGIGNAANSIDPSASKGEVVRYEASGNTIYVKVKNSSIFRGNERLFFASQMAEGGDLGSYVTDGQGNQVWTPFNVEVTSSGAILENPAFTFGELITATNPSNVTETYDNLISGTVVLWDAPTQTLKLENDRQPINNNYVKESGASVYARAQQIADQPEDIFRVGDIVNAPSIDVGFESFYEIKSMAMTVGVDFVPEDSTLDSSAVAKYVTKEITLDKSATAIDVIITANVTNTKNLKMLYKTKTTSVQSKFDDLEWLLFNDTGYPNEMKNATPQNAISAQKEEQSAYQEFRYSVDTLDEFTSFGIKIAMQTDDPAFVPKIQDIRVVSSR
Physico‐chemical
properties
protein length:2758 AA
molecular weight: 301621,79920 Da
isoelectric point:4,76711
aromaticity:0,09826
hydropathy:-0,25062

Domains

Domains [InterPro]
IPR032096
STR
11–68
XYM58459.1
1 2758
Architecture
STR
STR
RBD
RBD
STR 11-68 | STR 88-1553 | RBD 1554-1944 | RBD 2002-2758
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-FP1
[NCBI]
3413217 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM58459.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340854.1 [NCBI]
CDS location
range 80988 -> 89264
strand +
CDS
ATGCCCCAGAATACTAACTTAAACGCATCACCTTACTTTGAAGATTTCGATCCGAAGAAAAATTTCTACAAGGTTCTGTTTAGACCTGGGTACGCAGTACAGACCAGAGAGTTAATTCAACTCCAGTCTGTACTGCAGACTCAACTAGAAAACTTTGGTAGGAACATCTTCAAGCAAGGTGATCTTGTCGTGCCTGGTGAAGTCGGTCTTAATGTCCGACTTAACTATGTTAAACTGTCTTCTGTTTCCGAAGTTGCTGTTGCTGATGATGCAGGTAACGTAACTTATAAGAAATATGATATCAAGACCCTCGTCGGTCTTAAGGTACAGGGCGTATCCTCTGGGGTGGTTGCGACTGTAGTCGAAGTTGATTATGGTTCAGATACACAATCCGATACCCTCTATGTAAACTACCTTGATAGTGGTTCTTCAGGTGATGAAGAAACCTTCCGTCAGGGTGAGAACCTAGAGGTTATTGGTGGTGTTAATAGTCCACTATTAGTTGTTGGCACAGATGGGGTATCTCTGCCAACATCTATTGGTGTAACAAATCCAGATACAGGTGAATCTACTGTTATTGATAGTCCTGCACTGGGTTATGCTTCTGCTGTCAAGGTAGAAGAAGGTATTTACTTTGCCAATGGTTACTTTGTACGTAATGCAGAGCAACTTTTGGTTATTGACAAATTCTATGACAAACCATCGGCAAAAGTTGGTTTTACAATTGAAGAAACTCTAGTAACACCTGAGCAAGATTCCTCTCTGTATGATAATTCCAGAGGATCATCTAACTTCTCTGCTCCTGGTGCTCACAGACTTAAGATTACACTGACTCTGGTCAAGTACGATTACTTCCAGCTAACTGATAAGAATTTTATTCAGTTGCTACTTGTAAAAGAAGGTGTAATTCAAAAACAACTACAAGCAACTGATTATTCGCTCGTAGAAGCTGCTCTAGCAAGAAAAACATTTGATCAATCTGGAGACTATGTTGTCGATGAGTTCCCTATTCAAGTTAGGGAATATTATCAGCAGAATGACAACCTAGGATTCTATACTGCAGGCAATGATGGTCTAGTTAATGGTCTGACAGCAATCGATGCTGAGAAAAAATTAATTGCGACTGTTGGTTCTGGTAAAGCATATGTAAAAGGTTACGAAGTAAAGAATAAAGAAACTAAGTACCTTGAAATTGATAAAGCAAGAGACGAACTGAAGAGAGATAATGAGACTATTAAAACTAATGGTCTAAGTTCGTTTTATGTTACTAATGTATATGGCACTATTCCACTCAACGCAGAAGGTGCAGAACTAACCGCATATCCAACACTATATTTCCATAGTGTATTCAATGATGGTTCCATTGGTCTGAATAAGACTGAAGCAGCAGGAGATCCTAAGCGTACAGTCTCTAGAAGAGGTCAAGGTTTTACTGTTGCTGACGGTATCAAAACTGTCTACTGTACTATTTCAGATAGTACAAAGGACATGGATGATTTTGATGATGATGCTATCGGTGATATCCTAGACAAATTGTGGTTTATTAAAACTAGAAGTGATAGTGGATCTGTTAACACATATGGTTATGCAGAAGTAGTATCTTTCTCCAAGGTAAAGCGACCAGAACTTGGTAACAGCACATACCTAGAAATTACTGTTAAAGGTGTTCGTTCTGACCTAGATCTATACCTTACTAATAATGATGCAACAGATAGTATTGCACAAATTAGATACCTGTATCCTAGTGAAGCAAATGTTCAGGTTAAAGCAAATGAACTGCTTCGTATTCTAGACTATAATGAAACTGTAACTCCTGTTATTGGTGTTGCGAAACCCAAGAACATTGCTATTCAGCAAGTAAGTGATGGATTCAATGTAGATACAGATAAGGTTCTGTCTAAAGGTAAACTAGCAGGTGGTGTAGAAAAATACAACACCGTCTTTGACCTGTCATATTTTGCTCCTCAGTTCTTTACAAGACTAACTCTTACTGATTTTGTATCAAGTACATTTACTACTGGTAAGTATGTCACTGGCACCCTTAGTGGTGCAAAAGCAGTTATTGAAGGTGGAACAGATAATGTTTATTCTTCTACAAATAAACTATTTGTTTTAATGATTAGTGGTAAGTTCATCCCTGGTGAAACTATCATTAACGAAGATGGCGATACCATAAAAATCGCTAGAAACAACACTGTCTCTCACTTTATTGTTACTGATCGTGGCAGCGGTTATTCTGCAGGATCTTTGTTCAAATTAGATGGTGTCGTTTACGATCAGAATAAGATCGCATGGGTTCGTGGTGGCGGTGGCACAGTCCAGAGCATTAGAATTGTAGATAGAGATGCTGTATCTGTTGAATATGCAAAACCACCTACGATTGAAGTACAAACTAATGATGTTATCAATGCTGAAGATGTAGTAAAAGTAACACCAGTTCTGTTTAGAGATACAGTATATACATTTGATCCTTCTAATGTAAAGTCTGTAAGCACAGCGTTTGGTTCTGGTAATAAAAATGCATTTACTGCTGACGTTGAATTAGAAAAGACTGCTTTTGTTAATACCAAATCAATTACCGACTTTACATTTACAGGTAAAGAAGGTTACAAATATATTGAGTGTAATGGTTTTAGTGGCGATGCTACTGTTTCTCTAGTGATCGGCGATATTGTTCAGTTTGCTGATGACACTGGTGCAGTGTATCGTTATTGTGTGCAGTATGCGACCAGACCTGATGGTGTCAACAGATCCAGAATCTATCTGGATAGAGCACTACAAGCAAATGCAACTGGTGCTAGTGTAGTTGTACAGAAACCTGTTATTACCAATGCTAACGGCACTCTGGTGTTTGCTACAGGTGATAAGAAGATTTCTTCGCTGATTGACTCTAGCGAAGATTCTAAGATTGTTTATAATTTCAGAAGAGACTTTATTACAACAGCATCTTCTGGTTCTGGCAATCTGACGTTTGCTGCACAACTACCATTTGGTACACAAAGATTTGTTCCTTTCTCCGAAGAGAACTTCCTAATTACTGTTCTTGATCCAGGGATTACTATTCATGGTCTAGACACCAACGGCGATTTTGTTCCCAATGGTGGTTCCCTAGTTATGGGAGATGTTGTATACGTTAATCCAGAATTTATTTCTATTACAGAATCTGATTCTGAGTTAACTGCAGGTAGTGTTACTGTTAATTTCCCAGAGAATCATTTCGGTGACATCGATGAGATTAGAACAAAAGCAGAAGCATATAACATTGCTAATCCAGGTTCTGCAGTTACACTTCCAGACAATAACTTCCCAACTCTTAAACTAACTGCTACTCTGCAAGTATCTAAAGCACGTCCTAGACTAAAGACTGTAGTTAGAAACAAGCGCATCATTGTACAAGCAGGTGGAACTACTGCTGTTCCATTTAGAGGTCAGGATTACGATGGCGAAAATATCCAAATCACCTCGTATTCTGACGCATTCAAATTAAGGTATGTATATGAAGGTTCAGTTTCTTCACCTCCAACAGTCGATTCCGTTGGCGGTCTCGTATCGGGTACAGATGTTACCTCCCGATATATTTTCGACGATGGTCAGCGCGACACGTATTATGATATCTCGCGCATAGTTCTGAAACCAGGGCAGACTGCACCTACAGGTCAGATGGTCATTGCATTCGATTACTTCGAGCATTCACAAGGAGACTTCTGTACTATTGACTCCTATCTGCATGAAGCAGGTGTACCTAGTACCGAAGTTCCATTTTTCAACTCTACTGTCAATGGTCTCATCTCTCTAAGAGATGCTATTGACTTTAGACCTAAGGCAGATGATTCTAATATCATCTCTGGTTACTTGGATAAAACTATCCTATCCAGTGATGGCTATATCTCCTTCTCAGGCACCTCTGGAATCCCCGCTAGCACCCCTGCGGATGATGCTAACCTAACATATACGGTCAAGTACAATAAGACCCAGTATCTGGACCGTATCGACGGAGTGTTCCTTGATACTAAAGGCAACTTTATTGTCAAGAAAGGCAATGCTTCTCTCAATCCATCCAGACCAGAATCTATCAGTGATGCTATTTCACTGTACTATCTGTATGTTCCTGCATACACTGACTCTAACAGAGATGTAAGAATCATCCCTGTGGAAAACAAGCGTTACACGATGAAAGACATCGGTAAACTTGATAGCAGAATTGAAAGACTAGAATACTACACTTCGCTGAGTGTTCTGGAACAGCAAGCACTTAACATGCAGATCAGCGATGAAGTTGGTCTTGATCGCTTTAAGTGCGGTTTCTTTGTAGATAATTTTGAGACTCATAAGGGTGATGTAAATTCCATCGACCACAAGGTTGCTGTTGATACTCAGCAATCTGTTCTAAGACCTCAGGTCAATGAAGAAAGTCTAGGTGTAAAAGAAATCAATACCAGAAATGACCAGCGCGAAGTTGATGGATATGTAATCAATAATGGTGTAATCTCTCTTCCATATACTGAGACTAAACTGGTTGGCAATAGTTTTGCTACTAAGACTATCAACCCCAATCCATTTGTTGTTATTCAGTATGTTGGTGATCTTGATATTTCTCCAAGAGTTGACTCTTGGTATGATAGAAGTATTGTTCCTCTAATTACTGACAATAACACTAATCTGTTTATTCCTTTCCTTGCCAAGGAAGATGTTGTTGATGCATTCTCTTGCATCTATAACTCTTTCATCATCACATGGACTGGTGCCGAAAGATCGTTCTTTAACATCAACCCACTTGCTACTACAAATAGTGAAATTTCTCAATCTAGAGTTGATAGTGCAACTGTTGCAAGTTCTTCTAACATTAGTCCTCAAAACAATGAGACACCTAAAGGTGTTGCTACTACCAACAGAAGAGGTAAGGAAATTGTTACCTCCCTCAAGTATTTCGCACGTAGCGTTCCTGTTAAGTTTACACTCCGTAGACTGAAACCAAAGACTGAAGTATTCGTATACCTGGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fa0ecf1e42ebad06e378e646e69f782405fba474779eaff9b6a247e753eff628
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7706
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50