Protein

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Genbank accession
QIG66630.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSQLNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKAFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLANSNTFNVKQTITANGEILTLRNPASASEAYTAVVARDASSEKVWAIGNLIKGSRDVQIESEQGSTITLGTSVAINKTLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAANNNFTGTNTFNQLSIFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSAGVNRWYIGNSNEGDNVALENYKTGGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNVVNTFSVRQVINSDGEALALKAKTATTLFIRGLSADGTAKWYVGNGDADNNNNLRLFNYKTGKGLTIGSAFEMNATLAITGQVQPSDWSNLDARYYTKSDANSRYMFAYSSGTGTEVGDGDGIAWTARTGLYNVTGESGGSTQLVYHMYQGGSSTPSAQLKFNYRNGGFWYRSARDGYGFENTWAKIYTDQDKPSPSDIGAYTKTETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNTTGAHTHGYTTGAQPSGTRGDWDSDGNRNTVQTGSAGNHSHSVSGTAASNGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:782 AA
molecular weight: 83651,01360 Da
isoelectric point:8,52280
aromaticity:0,08568
hydropathy:-0,43734

Domains

Domains [InterPro]
DC_1993
STR
101–362
DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR051934
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
IPR048388
ATT
275–356
IPR048388 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
QIG66630.1
1 782
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 101-158 | ATT 159-248 | STR 249-274 | ATT 275-356 | STR 357-381 | ATT 382-474 | STR 475-778 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage mio
[NCBI] 		2696419 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus mio
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QIG66630.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850631.1 [NCBI]
CDS location
range 48144 -> 50492
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAATTGAGTCAGTTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGACGACCTTCTCCATGTCAGAGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGCAGCACTATGACTGGTGACTTAGGAATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTGTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGGCTTTTAAAATCAACGCAAATGGCCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTACCATACTTTGAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGGTATGCAAGGTTGGCTAACTCAAACACGTTTAACGTCAAGCAGACTATTACAGCAAATGGGGAGATTCTAACACTAAGAAACCCTGCAAGTGCTAGTGAGGCATACACTGCTGTTGTAGCTAGGGATGCTAGTAGTGAAAAAGTTTGGGCTATCGGGAACCTAATTAAAGGCAGCCGAGATGTTCAAATTGAGAGTGAACAAGGTTCAACCATTACTCTAGGCACAAGTGTTGCTATTAATAAAACCCTTGCTATTACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCCAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGCTAATAATAATTTCACTGGCACTAACACGTTTAACCAACTAAGTATTTTCAAAAAAGATGGTGAGGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAGCCATTGTACATTAAAGCGATTGATAGCGCAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAATGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTGGTGGCAAAATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGTTGTCAATACATTTTCTGTACGACAAGTTATCAACTCTGATGGTGAAGCTCTTGCGTTAAAAGCAAAAACTGCAACGACATTGTTCATTAGAGGGTTATCTGCTGATGGGACAGCTAAGTGGTATGTTGGTAATGGTGATGCTGATAACAATAACAACTTAAGGCTGTTTAACTACAAAACAGGTAAAGGTCTTACCATCGGTTCAGCATTTGAAATGAATGCAACTTTAGCAATCACTGGACAGGTTCAACCTTCAGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATATTATACGAAATCTGACGCAAACTCTAGGTATATGTTTGCTTACTCTTCTGGCACTGGTACAGAGGTAGGTGATGGTGATGGTATCGCTTGGACTGCTAGAACTGGTCTGTATAATGTTACAGGGGAATCTGGTGGTTCAACACAACTAGTCTACCATATGTATCAGGGTGGTAGCTCTACACCATCTGCTCAATTAAAATTTAACTATAGGAATGGTGGTTTTTGGTATAGGTCAGCGAGAGATGGGTATGGATTTGAGAATACTTGGGCTAAAATCTATACAGACCAAGATAAACCATCCCCTTCAGACATCGGTGCATACACTAAAACTGAGACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAATAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTGACGTTAGCTGTTGGTAACTTACCATCACACACACACAGTTTTTCTGCTACTACTTCATCTTTTGACTACGGAACAAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGTGGTTCAACGAACACAACAGGTGCCCATACACATGGTTATACTACTGGTGCGCAACCAAGTGGTACAAGGGGTGATTGGGATTCTGATGGTAACAGGAATACCGTACAAACGGGTAGTGCTGGGAATCACTCACACTCAGTAAGTGGTACTGCTGCATCAAATGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTGAGTGGTAACACTGGAAGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTAACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0637889ee4f7496fba529160c434155e21ff502f38cefb2c8e241b7b71b908a6
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6861
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank