Protein

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Genbank accession
XYM58175.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANFKKVFNFREGVQVDDQTFVVNGSLVGIGTSVPEKFLDVRRDATFTGLTTFTEVVISAGATFETGITSVQIGRFAFNDGIVSAATGVVTFLGDGSQLSDLPTSQWVDVDTGIGVSSVYNGGNVGIATLVPRFQLQIGGDPEPPTSADGVGIRQGNIYMSGVITATRYYGDAANLTNLNADELTAGIVTQARIPRLELDKIPLIPDYKLEQNLQISGILTAGGGFIGSLVGDVEGNVIANSGFSTFNDGEFKGTLTAVASTARTLTGTPDIRVGFVSANIIDAGIALTVSRANMTGDVTVGILTVTGESLRVGTGGSIFNVTDGAIGIGTTLPQSTLVLYQQEGTNLEILTETGAATLNLGGDLGIGQSTAELRQEDLRFELSNYSNGDYIYHLGRELSVGSVNGAFRWLKGDPVDEMMTLTKDGNLGLGITAPGKKLVVTGDTDLDGTLLVTGKSEIADDVIIYGNLTYNALSGVTTAFDLDVSGSLNVTSDIIASGIATFPNVGFLVQNAGVSTFPTLDVTGGLGVAGIATFGTLIIPDNTNLFTNSGISTFADLRVTGDLSLDGNTFNYETTTGITTVNNFNITGFVTFAEAPNFNLNISSGISTLQSLNVQGSLSVGGTATFTSATFDDLVFTNTTGVTTIRSLNVDTDVNVGGALTVVGDAEFQGAVTLPSDLEINFISGISTFFDLDVTNNLYAGGISSIREINTDITFSGTTQQIGTGLTIGTAGAEIDLASVIRFSDVSGKIGFNTAQPSSAIDVGMRTDTSIIFPRMTTTQRDSLEDAAVEGSVIYNTTTNAHQGYDGSSWTSLNYQPPASPGWTALETYTTAGRNALTGMPTGAIIYNTTLSQVEVYNGSNWVAV
Physico‐chemical
properties
protein length:866 AA
molecular weight: 90119,14790 Da
isoelectric point:4,10675
aromaticity:0,07737
hydropathy:0,14942

Domains

Domains [InterPro]
DC_2204
STR
110–189
DC_2204 DC_0326 DC_1884
IPR059888
RBD
751–816
IPR059888
XYM58175.1
1 866
Architecture
STR
STR
STR 110-189 | STR 677-866
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH8
[NCBI] 		3413216 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM58175.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340853 [NCBI]
CDS location
range 21734 -> 24334
strand +
CDS
ATGGCAAATTTCAAGAAGGTATTTAACTTTAGGGAAGGTGTTCAGGTTGATGACCAAACCTTCGTGGTCAATGGTTCCCTAGTTGGTATTGGAACCTCAGTTCCTGAGAAGTTCCTAGATGTTAGGCGAGATGCAACTTTCACGGGTTTAACAACCTTTACGGAAGTTGTTATCTCTGCTGGTGCAACCTTTGAGACTGGTATCACTAGTGTCCAGATTGGACGATTTGCCTTTAACGATGGCATTGTATCTGCTGCAACTGGTGTTGTAACATTCCTGGGAGATGGTTCTCAACTCTCAGATCTACCAACTTCACAATGGGTTGATGTAGACACTGGTATTGGTGTTTCCAGTGTCTATAACGGTGGTAATGTTGGTATTGCAACTTTAGTTCCTAGATTCCAATTACAGATCGGTGGTGATCCTGAACCACCAACAAGTGCTGATGGTGTTGGTATTAGACAGGGCAATATTTACATGTCCGGTGTCATCACCGCGACAAGATATTATGGTGATGCTGCAAACTTAACCAATCTAAATGCAGACGAACTAACAGCTGGTATTGTAACACAAGCAAGGATTCCTAGACTAGAATTAGATAAGATTCCTCTCATCCCAGACTATAAACTAGAGCAGAATCTACAGATCAGTGGCATCTTAACTGCTGGTGGTGGATTTATTGGCAGTCTAGTTGGTGATGTTGAAGGTAACGTAATTGCTAACAGTGGATTCTCTACATTCAACGATGGTGAGTTTAAAGGAACTCTAACTGCTGTCGCATCTACTGCTAGAACTTTAACAGGAACTCCTGATATTAGAGTTGGTTTTGTATCTGCAAACATTATTGATGCCGGTATTGCTCTAACTGTAAGTAGAGCAAATATGACTGGTGATGTTACAGTTGGTATTCTAACTGTAACTGGTGAAAGTCTTAGGGTTGGTACGGGTGGTTCAATCTTTAATGTAACTGATGGTGCGATTGGTATTGGTACAACACTACCACAATCCACACTTGTTTTATATCAGCAAGAAGGTACAAACCTAGAGATTTTAACTGAAACTGGTGCTGCAACTCTAAACCTTGGTGGTGACTTAGGTATTGGTCAAAGTACAGCAGAACTTAGACAAGAAGACTTAAGGTTTGAACTATCAAACTATTCAAATGGTGACTACATTTATCATCTAGGTAGAGAACTTTCTGTTGGCAGTGTCAACGGAGCATTTAGATGGTTAAAAGGTGATCCAGTCGATGAGATGATGACTTTAACCAAGGATGGAAACCTTGGATTAGGAATTACAGCTCCTGGTAAGAAATTAGTCGTAACTGGTGATACTGATCTAGACGGAACACTTCTTGTTACTGGAAAGAGTGAGATTGCTGATGATGTTATCATCTATGGCAACTTAACATATAACGCTCTAAGTGGTGTTACAACTGCCTTTGACTTAGATGTAAGTGGTAGTCTAAACGTAACTAGTGACATCATTGCATCTGGTATTGCTACATTCCCTAATGTTGGATTCCTCGTTCAAAACGCAGGTGTATCTACATTCCCAACTCTAGATGTTACTGGTGGTTTAGGTGTTGCTGGTATTGCAACGTTTGGAACTTTGATTATTCCAGACAATACTAACTTGTTCACTAACAGTGGTATTAGTACATTTGCAGACCTGAGAGTTACTGGAGATCTATCACTTGATGGTAACACATTTAACTATGAAACCACCACTGGTATTACAACAGTAAACAACTTTAATATCACTGGATTTGTTACATTCGCTGAAGCACCAAACTTTAACTTAAATATTAGTAGCGGTATCTCTACACTCCAATCATTAAATGTTCAAGGATCACTAAGTGTTGGTGGTACTGCTACCTTCACTAGTGCAACATTTGATGATTTGGTGTTCACTAATACCACTGGTGTTACGACTATTAGATCACTTAATGTTGATACTGATGTAAATGTTGGTGGTGCTTTAACTGTTGTTGGAGACGCAGAGTTCCAAGGAGCAGTAACTCTTCCCTCTGATCTTGAGATTAATTTTATTTCTGGTATCTCAACATTCTTTGATCTAGATGTAACCAACAATTTATATGCTGGTGGTATCAGTTCAATTCGTGAGATCAATACTGATATTACATTCTCTGGAACAACACAACAGATTGGAACTGGATTAACGATTGGAACTGCTGGTGCTGAAATTGATCTAGCATCAGTAATTAGATTCTCTGATGTTAGTGGAAAGATTGGATTTAATACTGCTCAACCATCTTCTGCTATTGATGTCGGTATGAGAACCGACACCAGTATCATCTTCCCAAGGATGACTACAACTCAGCGAGATTCTTTAGAAGACGCAGCTGTTGAAGGTTCTGTTATCTACAACACTACCACTAATGCACACCAAGGTTATGACGGAAGTTCTTGGACTTCCTTGAATTATCAACCACCTGCATCTCCTGGTTGGACTGCATTAGAAACATACACTACTGCTGGAAGAAATGCCTTAACAGGTATGCCAACGGGTGCAATTATCTACAACACAACATTAAGTCAAGTAGAAGTTTACAACGGATCTAATTGGGTTGCTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6fae4c955e25870718a66668a6081c5dcdbdedbefc55fe04990f6cf873d0b95e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6140
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50