Protein

Genbank accession
ARK07604.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,80
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MIKNMITGSKGGSSKPHTPVEMEDNLISINRIRILLAVSDGEVDPDFSLKDLYFDDVPVMNQDGSLNFQNVKAEFRPGTQTQDYIQGFTDTASEITVARDLTAATPYIISVTNKNLSAIRIKILMPRGVTQEDNGDLTGVRVEYAVDMAVDGAEYKEVLHDVIEGKTMSGYDRSRRIDLPVFNDRVLLRVRRLTDSTSARVTDLIKMQSYAEVVDAKFRYPLTGLVYVEFDSELFPNALPNISIKKKWKIINVPSNYDPISRTYSGSWDGTWKKAWSNNPAFVLYDLITNQRYGLDQRELGIALDKWSIYECAQYCDQMVPDGKGGTEPRYLCDVVIQSQVEAYQLVRDICSIFRGMSFWNGESLSIVIDKPRDASYIFTNDNVVNGEFTYTFASEKSMYTQCNVTFDDEQNMYQQDVEGVFETEAALRFGYNSTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNVKSTTVNFATGLEGMIPTVGDVIVVSDNFWSSALTLNLSGRVMEVSGLQVFTPFKVDARAGDRILVNKPDGKPVGRTIARVSDDGKTLTLNTTFGFDVQPDTIFAIERTDIAQQRYVVTGITKGDGDEEFTYNITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVQPDILPAPQNVKIESYSRVVQGASVETMHVSWDKVEYASLYEMQWRKDNGNWNNTPRTANKETEVEGIYAGNYHVRVRSVAANGSASGWSAIVSAGLTGKVGEPEMPINLTASDNEVFGIRVKWGMPEGSGDTAYIELHQAPNGSDGHPIVDEATLLTLIPFPQYEYWHSILPAGHVVWYKARAVDKIGNVSDWTDFVRGMASDDTSIITDHIKVDIENSDGYKWLQENAIKANDKIHSTAESVIENALANDKDVRRMRVENGKRKAEFLQSLKLIADETEARVTQVTQMSAQFDEKLTAQNSELREVIANSTETISQRIDQLTATFEGEIDGVKQDIKAQITDVNQAITNEAEARASADRALSTQIGDTQSAVNQKLDSWVNADSVGAMYGVKLGLRYNGQEYSAGMALSLVGDGSGVKSQFLFDAGRFAIINNQQSGGFTLPFVVENNQVFINSLLVKNGSIGNAQIADQINSNNWSSGAAGWMINKNGYAEFNQITVRGTVYANAGSFTGNVYATDGWFRGTVYAEKIEGDVAKAVVLGFNGSVHIPAVNYNRHLVIPYVGLHGYTYSGGTWGGGTVWVDSSYGGRLANVQATAMHGGSSGYLLLPAGNATTLSYGGNLNHANAVPVLTILLFKA
Physico‐chemical
properties
protein length:1258 AA
molecular weight: 138805,60090 Da
isoelectric point:4,94604
aromaticity:0,09300
hydropathy:-0,30596

Domains

Domains [InterPro]
IPR053171
3–875
IPR053171 IPR015406
IPR055385
92–216
IPR055385 IPR032876 IPR036116
IPR003961
626–715
IPR003961
IPR013783
626–719
IPR013783
ARK07604.1
1 1258
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Citrobacter phage CF1 DK-2017
[NCBI] 		2267237 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ARK07604.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KY694971.1 [NCBI]
CDS location
range 6523 -> 10299
strand +
CDS
ATGATCAAAAATATGATAACTGGCAGTAAGGGCGGTTCTTCAAAGCCTCATACACCTGTTGAAATGGAAGATAACCTAATTTCAATTAACAGGATCAGAATTCTTTTAGCCGTTTCTGATGGTGAAGTTGATCCAGACTTTTCATTGAAAGATTTATATTTTGATGACGTTCCGGTTATGAATCAGGATGGTTCACTAAACTTTCAGAATGTTAAGGCAGAATTCAGGCCAGGGACGCAAACGCAGGATTATATTCAGGGGTTTACTGATACAGCCAGCGAAATTACAGTTGCTCGCGATCTGACAGCCGCAACGCCTTATATTATTTCTGTTACCAATAAAAACCTTTCTGCGATCCGTATTAAAATTTTAATGCCTCGCGGGGTTACTCAGGAAGATAACGGAGATCTAACAGGTGTTCGCGTTGAATATGCTGTTGATATGGCTGTTGATGGTGCTGAATATAAAGAGGTTTTGCATGATGTAATTGAAGGTAAAACAATGAGCGGTTACGACAGAAGCCGCCGAATTGATTTACCTGTTTTCAATGATCGTGTTTTATTGCGCGTCCGTCGCCTGACAGATAGCACGTCAGCAAGGGTAACGGATCTGATTAAAATGCAAAGCTATGCTGAAGTTGTAGACGCTAAATTTCGTTACCCCCTGACTGGTTTAGTATATGTTGAGTTTGACAGCGAATTATTCCCTAATGCGTTGCCGAATATCAGCATTAAGAAAAAATGGAAAATCATTAATGTTCCGTCAAATTATGATCCTATTTCCCGTACTTACTCAGGGTCATGGGATGGAACCTGGAAAAAGGCATGGAGTAATAACCCTGCTTTTGTTCTGTATGATTTGATTACCAATCAGCGTTACGGACTCGATCAAAGAGAGTTAGGCATCGCGCTTGATAAATGGAGCATTTACGAATGTGCGCAGTATTGCGATCAGATGGTTCCAGACGGTAAAGGCGGAACAGAGCCGCGTTATCTTTGCGATGTTGTGATCCAGAGCCAGGTAGAAGCATATCAGCTTGTGCGTGATATTTGCTCAATCTTCCGTGGCATGAGCTTTTGGAATGGTGAGAGCCTTTCAATCGTGATCGATAAGCCTCGCGATGCGTCATACATCTTTACTAATGACAACGTGGTTAACGGTGAATTCACTTACACGTTTGCCAGCGAAAAAAGCATGTACACGCAATGCAACGTGACTTTCGACGACGAACAAAACATGTATCAACAGGATGTTGAGGGAGTTTTCGAAACGGAGGCGGCGTTACGTTTTGGCTATAACAGCACGTCAATAACTGCCATTGGATGCACTCGACGCAGTGAGGCTAATCGCCGTGGACGCTGGATTTTAAAAACCAACGTCAAGAGCACAACGGTAAACTTTGCTACAGGTCTGGAAGGTATGATCCCAACCGTAGGCGATGTGATTGTTGTATCGGATAACTTTTGGTCAAGCGCTCTAACGCTGAATCTATCAGGTCGCGTGATGGAGGTTAGCGGGTTGCAGGTGTTCACGCCGTTTAAGGTTGACGCAAGAGCAGGTGATCGCATTCTGGTAAATAAGCCCGATGGTAAGCCAGTTGGTCGAACCATTGCGCGTGTAAGTGATGACGGTAAAACGCTAACGCTAAACACGACATTTGGCTTTGACGTTCAGCCAGATACCATTTTTGCAATTGAGCGAACCGATATTGCACAGCAACGATATGTTGTAACCGGAATCACTAAGGGTGACGGTGATGAAGAATTTACCTACAACATAACGGCTGTTGAATACGATCCTAACAAATACGATGAAATTGATTATGGCGTAAACATTGATGACCGTCCGACTTCAATCGTGCAGCCTGACATTTTGCCAGCGCCGCAAAACGTCAAGATCGAATCTTATTCGCGAGTTGTCCAGGGCGCGAGCGTGGAAACAATGCACGTTTCATGGGATAAGGTTGAATATGCAAGCCTTTATGAAATGCAGTGGAGAAAAGACAATGGCAACTGGAACAACACGCCGCGCACAGCAAACAAGGAAACGGAAGTTGAAGGAATTTATGCCGGAAACTATCACGTAAGGGTTAGATCTGTTGCAGCGAATGGTTCAGCGTCTGGATGGTCAGCCATTGTAAGCGCCGGATTAACTGGCAAGGTTGGCGAACCGGAAATGCCAATTAACCTTACTGCGTCTGACAATGAAGTTTTCGGAATTCGCGTAAAATGGGGTATGCCAGAAGGAAGCGGAGACACGGCATATATTGAGTTACATCAAGCGCCAAACGGTTCTGATGGTCATCCTATTGTTGATGAAGCAACGCTCTTAACGCTGATACCGTTCCCGCAATATGAGTATTGGCATTCAATATTGCCAGCGGGTCATGTTGTCTGGTACAAGGCAAGGGCTGTTGACAAAATCGGGAATGTTTCTGATTGGACTGATTTTGTGCGCGGCATGGCTTCCGACGATACGAGCATTATCACGGATCATATTAAGGTCGATATTGAAAATTCTGATGGCTATAAGTGGTTACAGGAAAACGCAATAAAGGCCAATGATAAGATCCACAGCACAGCGGAATCAGTGATTGAAAACGCATTGGCGAATGATAAAGATGTGCGACGTATGCGAGTTGAAAACGGCAAGCGTAAAGCAGAGTTCTTGCAATCGCTGAAACTCATTGCAGATGAAACAGAAGCAAGGGTAACGCAGGTCACTCAAATGAGTGCGCAATTTGACGAGAAATTAACGGCTCAAAATAGCGAATTGAGAGAGGTAATTGCTAACAGCACTGAAACCATTAGCCAAAGGATTGATCAGCTTACAGCTACGTTTGAGGGCGAAATTGACGGTGTTAAGCAGGATATCAAAGCACAGATAACTGATGTTAACCAGGCAATCACCAATGAAGCGGAAGCGCGAGCGTCAGCGGATAGGGCGTTATCAACTCAAATTGGTGATACCCAATCAGCGGTTAACCAGAAACTTGATTCTTGGGTTAATGCCGATAGCGTAGGCGCGATGTACGGCGTTAAGTTGGGGTTACGTTACAACGGGCAGGAATATAGCGCGGGTATGGCTCTTTCCCTTGTTGGTGACGGATCAGGAGTTAAATCACAATTCCTGTTTGATGCTGGACGATTTGCGATAATAAACAACCAACAGAGCGGAGGTTTTACACTACCGTTTGTTGTTGAGAATAATCAGGTGTTTATCAACAGCTTACTTGTGAAAAATGGCTCTATTGGTAATGCTCAGATTGCGGATCAGATTAACTCTAACAACTGGAGCAGCGGCGCGGCTGGATGGATGATTAATAAGAATGGTTATGCTGAATTTAACCAGATAACGGTAAGGGGTACAGTGTACGCAAACGCCGGATCATTCACTGGTAACGTTTACGCTACTGATGGTTGGTTTAGGGGTACTGTTTACGCTGAAAAAATCGAGGGCGACGTTGCAAAGGCTGTTGTGCTTGGGTTTAACGGATCGGTTCACATTCCGGCAGTAAACTACAACAGACACCTTGTGATTCCTTATGTTGGTTTGCATGGCTATACCTATTCAGGTGGTACGTGGGGCGGTGGTACTGTTTGGGTTGATTCATCATATGGCGGTCGCTTGGCTAACGTTCAAGCTACGGCTATGCATGGCGGTTCAAGTGGATACCTTCTGTTACCAGCGGGTAACGCAACAACGCTTTCATATGGTGGCAACCTGAACCACGCTAACGCGGTTCCAGTATTAACAATACTGCTATTCAAAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
96042cb8e990b7676995588e6d9385546b498279857374d2b699af2a2734f381
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7491
Evidence 0,7491
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of Lytic Bacteriophage CF1 Infecting Citrobacter freundii Isolates Kim,D. 2020-06 — GenBank