Phage RBP Database

Genbank accession

QDH50497.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

TF

Evidence Phold

Probability 1,00

Protein sequence

MAVDRVKFQEIVASQLPRYVREDFPLLSDFLEQYYVSQEYQSGPVDIINNIDQYVKVEELYDIVESTTLAEILDYNDRFVTVVSTEGFSETNGIIQIDNEIIFYETKTDTEFQNCRRGFSGITTYVTTGAPDELTFSQTEADTHLLGTEVVNLNVLFLKQFFKKIKGQFTPGFADRNFYSGLNSKNFIYNSDSFYSSKGTDQSFEILFRALYGEDVEILKPSQFLLTPSNANYRVTQDFVVEKLQGDPLDLQNLTIFQKRTNARGSVTNVQQIPYDDYQFYQISIDAGFARDTDVTGSIFGEFEPNPLTKLLTSVSFGSTVLDVDSTVDFPEYGKLVVNDVDGNAIGVAYSGKTTNQFFNVSGLTNSLNKKSDVKLDSFSYAYVGIDTSQEIRVRFTSTLKDFVQNDPTYYFKKNDTIEIKSFGYEAPGKKANNYVLNVQTKFKIAESSVIDADAFVYNFKLYNDHFFQEGYELRYENEDGTVSNLGTVTRIVSENEINVRFGQQINLSGTFYLENQLLKGSSTSHSYIKNFVANVQNTYAKFNGDVLISSNSLPKYNDIETNTYDKKVTFSASLLSTDILPLPTNPTSLPDHGFYTGDSVYFQSAGNGFDGVTTGSYFVYRVNESEIKLARSNADLTRESYITFNGSVVNASLSYLDFYGKTIQPQGIYRKILSPTNRKRIEKTTSGYTGIFVNGLELLNYKSSSSVYYGDILDFTMTSGGTGYDIINPPVVKIVDEVGTGATGVANVKGQLVKLDVTDPGMGYYAPPTITIKGGNGSGAQAEPRMTSIKLENSFVANFPSDVNLTTDEITFETDHKFLDGESVIYEPRNTSGIVGLNTGGEYFVFVTGQKSIQLHTTKGDVFAGINTVDLAGYGDGVQYLVAKELKQVVSSVVVTNPGVGYENKKRTISTAGINTVSDRVEILNHGYKSKEVVRYTRGTPRVEGLSEDKDYFVKKINDDAFALTEVGTGSVERDYYYDRGICINFTKQGVGSFNYPPITVEVEGAAASFDKTFVEDFQELYIIESPIEENIITPVSVLAWTDTEAEITNPYYVLVSADANWLISDDPFIGNILLYEAKLQPVFRGEILSIDLTNGGVGYGASTIVDFRRQPEITFESGSKAKLTPIINNGKIVEVIVNSGGSGYNAPPDLNIVSETGNFAILVPIINNGEIESVYVQKGGAGYVTGKTTIDVIPAGSGAKTQANIRGWNINLFERNFSNFKDDDCIIEENISNKSLQYAAVYAPRPLRESLNSLNGFGEDNIKYGIFDLTLSVGGEEIDSLYHSPIVGWAYDGNPIYGPYGFDNIDGTGNIRRMVTSYKLKNTPVNRPSYNAFPNGFFVDDYIYAGDGDLDEHNGRFCVTPDYPNGVYAYFCTISDTVDSSGPFNNYRRPLFPYVIGNDYNSLPIPFNFKSASNQTHYNIVGDGWFRNTKNYFTNGGNSQYDYIYNSDKLRNQSLDITATSSGSVDGMAILDPGDGYKIGDRVELNSTNTGGRNANFRVSQLKGKNVNSVSLATTSYENVEFTSTGSANGFVGITSAPHNFLPLDTIFIDGLSSYYKGFAGSYSVGVSSERWYVSLGIGTDTVTGIVTYVYMNGPFGEDSIRANDILRIEREKLKVLNIDEKSGRVRVLRGVDGTLAVAHSAGTIVRDDPRKLRFLSTGINTQRNLTINKQLYFTPNEAVGVGTSTVGTATTITFSNPGVGLTQVRVDQQQIYLPDHKLSLNTPMTYYTNGGTSIACWSGITSTPTFNLDETRNIFAVPLSKDIIGIATQRVGVNSVGQYVGINTEKGGLLYFESAVGLGSYHSFNTNITSVIKGRVSKNVVTVSTAQTHGMKRGDIITIDVNPTTTTTIQVKYDDFNRRIVFDPDTIEPAGINTNNNTFIVPENKYFTGDKVIYTSGDPSENLTASGMYYVYSYMNNKIKLVEYLSELSSENPTFVNVGSATTGTLSKINPGVRAQKNQYIKFDLSDTSLSFVDKGITYSAFDMFIYSDSQEVNEFWTTRTDRNFEVTKSGVVGVDTTANLTLFMSDNIPNNLYYGFSPDNLDIIPPVKLRLFKDDTVINNNSINLTKNKFDGIYNVVGVTSDTFEYNIPFDYDTVVSYGTTNATMKYDTSSLTANGPINKINALNKGVGYKSLPGFSSVTSKNGTGALIQPSSTTIGSVLGTKFNYIGFGYPSDKTLNVVGNLPQVLRVDPLGSFESIGISSGGVNYSQAPDLIVIDGFTNQVITDIELDYELGDNEVNIIENTKSLNNVPPTFIPTQNTNGFSISSVSYNSTNKIVRLTFSKQFSEVKDWPFKVGEKVIVENVAIGFNTTGRGYNSEDYNYSLFEVTALDSQIGGANAYIEYNLTDYLAPGEFPGQVTSSISGSVTPESFFPIFDSKLVTTNFFEGERVTNIGYVGRVERFDATSGYLFVSSEDDFEVGTILESQSSGNKANIISNIDFDSTIRLGVGATFVDGWQTNSGFLNDNLQVIPNNEYYQNFSYSLKSRVPYETWDDAVSSLNHTAGFEKFADLVIDNNAAGIASAVDFQIETVVDLIGEGMLNCFPDFDGATELTLDINGGKTISNEIVFENKILVDYFESRGNRVLKIDDFSGEFNSNPRETKYSIVDFFDNKYAWNKFFTLVQDRELRSRKQFGVVTVLQDGTTGYVNQYGTIDTGKSLGSFDYIGAGTSEWGLTFFPNLFEYNNYDISYFTFSGVESLTSVGSTQVGDIVSIASSSVTVPVSTTTTLVKVPTVSRSAKLHVQLEDAEDNYFYTELNVLHDGTNVQLLQYGDVDSTEGISSGFGTYTANISGGFIDVNIVPTVGTAVTANIISIETNITAVGVNTTEMSVTNLSSYYKSISASGSPVANEIAAYEDPFAGEYFMVTVHDTTNNEYEMFECHVLDSNNQNIVKYGRIGTNSGLGTVGAVTSGTSVSLVFTPNPSIDVAVRTFGIGLKNFNNIVGIASISALQNNILFSDYGTYTGTEFDKKRAFNLKHNTLPIFQRAFLGNDSSIVNLSTNQVTIPDHFFVTGEKVNYSYENSQLSTANAIGIATTTVSGVSTDKLPSELYIIKYSNKSVGFAKSATDALAGSPIALDLTSVGVGTFHKLTATNQNARALVAVDNMIQAPVTEVNVSTRLDQNVVFDVDFDVVGIQSFKANDIIKIDSEIMLLQDVGVGATNKFRVLRGQMGTGVATHNIGTSVELLGGNYNIVDNTLHFVEAPFGATPLSTTTQGPDNIDWSGITTYSTFQGRTFMRSGITDDSVDTYSTNYTFDNIQSQFNGQTKFFSLVQNGNNVTGFATNQAIILNSNILQEPQGAQNTTGDFTLLETAGITSITYLGDSVSSESDPNMATIPRGGTIISVASTPGLGYQPLISAGASCFVSGGGTITSVEIGNPGSGYRVGVQTVNVGYAVSSTGITTVVNIGTATVQNGQVVAITTSYFGANLDQNNPPLIVIDAPLPYSNIPLVYADGQTGMGTGARVDITVGQGSSVVNFDIVSGGFGYGDGEVLRLSIGGTTGIQTDTSYTYDEFQLTVSTTYRDTFNGFTVGELDVFDKLDTLFDGVEKRFPLTIAGAGFAIETADGSDINIAQCLIVTINDILQVPNQSYKFNGGSIIEFTEAPKKGDTSKIIFYKGTPDVDVVLVDILETVKVGDTLQLKNDSTKGQGFGLYQEPRTVVGITTLDTVRTFPYDGPGITTNQALVRPLTWCKQTDDITINGDFVTKDRVEYEPSIYPAAYLTSYVGTSSAVAYTDTVRPFFNSTNETSLLDYQDRIVIIDQSPIASAIATASTGSGVDPEYNNGPIINLVGDGSDLFKREVTVNGVRIVSAGTTGGQIAVPDVWVEKVARMVELFTDVNGAGINETSQRNLIKTLSGDSGTYHAGKPTIQRVARGAGADYTPNFLTDQGIIDWNLTNLFDTTVQNDMVWYLNSTGSGYGDGDQDAQEVIEHVFHTLHMHGLPADTIKLYSYLASDWQTGDLYAAMEEAYDGGFWDSSGYGGNTWKTDADAFEVAAKEYLYLLNFCMFEYTSLWENGSLSPEWSDSMRTQAGIQANNPLGYAFHNTYIAPVISKPSLVTIRSIFQDGNTPAQDDPSLAGASGYVVDNDYGGIITSFTVSNVGAGYSYLTTPSVSVSLPDNPNGTRATGIASVTGDGVVSISVSNAGTGYTQAPSVLIQQPSVRREQIGVSSYFGDLGQIVGYAQSTGALGTLELYIPENSYMRDPNIVGTAVTISQLNTGDYFVVNLSNFGLSTSTSDNIYQVSAAYNSTVDLTSVGLGTTAIRRVEVANVGFGTTVAGFIRGRNLGEYTWGKIQFLNRATTDALEFTPNSYTGITSSPLVQRFRPLKFNNYQT

Physico‐chemical properties

protein length:	4337 AA
molecular weight:	472778,81220 Da
isoelectric point:	4,56044
aromaticity:	0,11137
hydropathy:	-0,19043

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_1555	ATT	DC_1555	7	224	Novel HMM	DC_1555	N-terminal	Low	Positional only	41 proteins / 41 hits
DC_0695	ATT	DC_0695	597	1058	Novel HMM	DC_0695	N-terminal	Low	Positional only	54 proteins / 54 hits
DC_0146	STR	DC_0146	1087	1468	Novel HMM	DC_0146	Central	Low	Positional only	81 proteins / 81 hits
IPR025924	STR	DC_0819	1280	1377	InterPro cluster	YHYH domain	Central	Low	Positional only	112 proteins / 112 hits
DC_2171	RBD	DC_2171	1484	1864	Novel HMM	DC_2171	C-terminal	Low	Positional only	10 proteins / 10 hits
DC_2014	ATT	DC_2014	3094	3205	Novel HMM	DC_2014	N-terminal	Low	Positional only	17 proteins / 17 hits
DC_0146	STR	DC_0146	3333	4083	Novel HMM	DC_0146	Central	Low	Positional only	81 proteins / 81 hits
DC_0695	ATT	DC_0695	4011	4336	Novel HMM	DC_0695	N-terminal	Low	Positional only	54 proteins / 54 hits

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Synechococcus phage S-B43 [NCBI]	2484638	Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host	Synechococcus sp. MW02 [NCBI]	1620844	Cyanobacteriota > Cyanophyceae > Synechococcales > Synechococcaceae > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

QDH50497.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

MN018232.1 [NCBI]

CDS location

range 34716 -> 47729
strand -

CDS

ATGGCAGTAGATAGAGTCAAATTCCAGGAAATTGTAGCTAGTCAACTTCCCAGATACGTTAGAGAAGACTTTCCTCTCCTATCGGATTTTTTAGAGCAGTATTACGTATCACAAGAATACCAAAGTGGTCCTGTTGATATCATCAACAATATTGACCAGTATGTAAAGGTAGAAGAATTATACGATATTGTCGAATCAACGACTCTTGCCGAAATTTTAGATTATAATGATAGATTTGTTACTGTAGTATCGACAGAAGGTTTCTCTGAGACTAACGGTATCATTCAGATTGATAATGAAATTATATTCTACGAAACAAAGACTGACACTGAGTTTCAGAACTGTAGAAGAGGATTCAGTGGTATCACCACCTATGTCACCACAGGTGCACCAGATGAATTAACATTCTCTCAGACTGAAGCAGATACTCATTTACTTGGAACAGAAGTTGTCAACCTGAACGTTCTTTTCCTCAAACAGTTCTTTAAGAAGATTAAGGGACAGTTTACTCCTGGTTTTGCTGATCGCAACTTTTATAGTGGATTAAACTCCAAAAACTTTATCTACAACTCAGATAGTTTTTATTCTTCAAAGGGTACTGATCAGTCCTTTGAAATCTTGTTTAGAGCACTGTATGGTGAAGATGTAGAGATTCTCAAACCATCACAGTTCCTTCTGACTCCCTCTAATGCAAACTATAGAGTAACTCAAGACTTTGTAGTTGAGAAACTTCAGGGTGATCCATTAGATCTTCAGAACCTTACAATCTTCCAAAAGAGAACGAATGCAAGAGGATCTGTAACTAATGTACAACAGATTCCTTATGATGATTATCAATTCTATCAGATTAGTATTGATGCTGGATTTGCAAGAGATACTGACGTAACAGGTTCTATTTTTGGTGAGTTTGAACCTAACCCCCTTACAAAACTCCTTACCTCTGTAAGTTTTGGTTCAACGGTTCTTGATGTTGATTCAACCGTTGACTTTCCTGAATATGGTAAATTAGTCGTCAATGATGTTGATGGTAATGCGATTGGTGTTGCATATAGTGGAAAGACCACAAACCAGTTCTTTAACGTATCTGGTCTGACCAATTCATTGAATAAGAAGTCTGACGTTAAGTTAGATTCTTTCTCATATGCCTATGTTGGTATTGATACCTCACAAGAAATCAGGGTTAGATTTACATCTACCCTGAAGGATTTTGTACAGAACGATCCAACATATTACTTCAAAAAGAATGACACTATTGAGATTAAATCATTTGGATATGAGGCACCTGGAAAGAAAGCAAATAACTATGTCCTTAACGTCCAAACAAAATTTAAAATTGCTGAAAGTTCTGTAATTGATGCTGATGCATTCGTATATAACTTTAAACTTTATAATGATCACTTCTTCCAAGAGGGGTATGAACTCAGATATGAAAACGAAGATGGCACTGTATCAAACCTCGGAACAGTCACTAGAATTGTATCAGAGAATGAGATTAATGTAAGGTTCGGACAACAGATCAATCTTTCAGGTACATTCTATCTTGAGAATCAATTACTCAAGGGTTCGTCTACAAGTCATTCTTATATCAAGAATTTTGTTGCCAATGTACAGAATACATATGCAAAGTTTAATGGTGATGTTCTTATATCATCTAACTCATTACCAAAATATAATGACATTGAGACAAATACTTACGATAAGAAAGTAACTTTCTCTGCATCATTACTGAGCACCGACATTTTACCATTACCAACTAACCCAACATCATTACCCGATCACGGTTTCTACACAGGTGACTCAGTATATTTCCAATCTGCAGGTAATGGTTTTGATGGAGTTACCACTGGTTCTTACTTTGTCTACAGAGTAAATGAAAGTGAAATCAAACTTGCAAGAAGTAATGCAGACCTTACAAGAGAATCATATATTACATTTAATGGGTCTGTAGTAAATGCTTCTTTAAGTTACCTTGATTTTTATGGTAAAACGATTCAACCACAGGGTATCTACAGAAAGATTCTAAGTCCTACTAATAGAAAGAGAATAGAGAAAACAACTTCAGGATATACAGGTATTTTTGTTAATGGTCTTGAGTTGTTAAACTATAAGTCATCCAGTAGTGTTTATTATGGTGATATTCTTGACTTCACTATGACAAGTGGTGGAACTGGATACGATATTATCAATCCACCAGTAGTAAAGATTGTCGATGAGGTAGGAACTGGTGCAACAGGTGTTGCTAACGTAAAAGGTCAACTTGTAAAGCTTGATGTTACTGACCCTGGTATGGGTTATTATGCACCACCAACGATTACAATCAAGGGTGGTAATGGTTCTGGTGCACAGGCAGAACCAAGAATGACTTCAATCAAACTTGAAAATTCTTTCGTCGCCAATTTCCCAAGTGATGTAAATCTCACAACAGATGAGATTACATTTGAGACCGATCACAAATTCTTAGATGGTGAAAGTGTAATCTATGAACCAAGAAATACATCTGGTATTGTTGGACTGAATACTGGTGGTGAGTATTTTGTATTTGTAACTGGCCAAAAGAGTATTCAACTTCATACCACAAAAGGAGATGTATTTGCAGGTATCAACACTGTTGATTTAGCAGGTTATGGTGATGGTGTGCAATATCTTGTTGCAAAAGAACTTAAGCAGGTTGTATCAAGTGTTGTAGTTACTAATCCTGGTGTAGGTTACGAAAACAAAAAGAGAACTATTTCAACAGCTGGTATCAATACAGTATCAGATAGAGTTGAAATTTTAAATCACGGTTATAAATCGAAAGAAGTTGTAAGATATACAAGAGGAACTCCAAGAGTTGAGGGTCTGAGTGAAGATAAAGATTATTTTGTTAAAAAGATTAATGATGATGCATTTGCACTGACAGAAGTTGGTACTGGATCTGTAGAAAGAGACTATTATTATGATAGAGGAATCTGTATTAACTTCACAAAACAGGGCGTAGGTTCATTTAACTATCCACCAATCACTGTTGAAGTAGAAGGTGCAGCAGCATCGTTCGATAAGACCTTTGTCGAGGACTTCCAAGAACTTTATATTATTGAATCACCAATTGAAGAGAATATTATCACTCCTGTATCAGTACTTGCATGGACTGATACTGAAGCAGAGATCACAAATCCATACTATGTTTTGGTTAGTGCTGATGCAAACTGGTTGATTAGTGATGATCCATTCATCGGTAATATTCTTCTTTATGAAGCAAAACTACAACCTGTCTTTAGAGGAGAGATCTTAAGTATTGACTTGACCAATGGTGGTGTTGGTTATGGTGCATCAACTATTGTTGATTTTAGAAGACAACCCGAAATCACCTTTGAGTCTGGTTCAAAAGCAAAACTAACACCAATTATCAACAATGGTAAGATTGTTGAGGTTATTGTAAACTCAGGTGGTTCTGGTTACAATGCACCACCTGATCTCAACATTGTAAGTGAGACAGGTAATTTTGCAATCTTAGTGCCAATCATTAATAATGGTGAGATAGAAAGTGTCTATGTTCAAAAAGGTGGTGCAGGATATGTTACTGGTAAGACCACAATTGATGTAATACCTGCTGGATCTGGTGCAAAAACTCAGGCAAATATTAGAGGATGGAATATCAACCTATTTGAAAGAAACTTTTCCAACTTTAAAGATGATGACTGCATTATTGAGGAGAACATTTCAAACAAGTCACTTCAGTATGCAGCAGTTTATGCACCTAGACCATTAAGAGAGTCACTAAACTCATTAAATGGTTTTGGGGAGGACAATATCAAATATGGTATTTTTGACTTAACTTTAAGTGTTGGTGGAGAAGAAATTGATAGTTTGTATCACTCACCAATCGTAGGTTGGGCGTACGATGGTAATCCAATCTATGGTCCATACGGTTTCGATAATATCGATGGAACTGGTAACATTCGTAGAATGGTTACAAGTTACAAACTCAAGAATACTCCTGTCAATAGACCTTCATACAATGCATTCCCTAACGGATTCTTTGTAGATGACTATATCTATGCTGGTGACGGTGATCTTGATGAACACAATGGTCGTTTCTGTGTAACACCAGATTATCCAAACGGTGTATATGCATACTTCTGTACTATCTCTGATACTGTAGATTCTTCTGGTCCATTTAATAACTACAGAAGACCATTGTTCCCATATGTAATTGGAAACGATTATAATTCCTTACCAATTCCATTCAACTTCAAGTCAGCGTCTAATCAAACTCATTACAATATTGTGGGAGATGGGTGGTTTAGAAATACTAAGAACTATTTCACAAATGGCGGAAATAGTCAATATGATTACATTTACAATTCAGACAAACTTAGAAATCAGTCTTTAGACATTACTGCAACATCATCAGGTAGTGTTGATGGTATGGCTATTTTGGATCCAGGTGATGGATACAAGATTGGTGATAGGGTTGAACTCAATTCAACTAATACTGGCGGTAGAAATGCAAACTTTAGAGTATCTCAACTTAAGGGTAAGAATGTAAACAGTGTAAGTCTTGCCACTACATCTTATGAAAATGTGGAGTTTACAAGTACAGGAAGTGCTAATGGGTTTGTTGGTATTACTTCAGCTCCACACAACTTCTTACCATTAGATACAATTTTCATTGATGGGTTATCTTCATACTACAAAGGATTCGCTGGGTCGTATTCGGTCGGTGTATCAAGTGAAAGATGGTATGTATCACTAGGAATAGGAACTGATACTGTCACTGGTATTGTGACCTACGTTTATATGAATGGTCCTTTCGGTGAGGATTCGATTAGAGCAAATGATATTCTCAGAATTGAAAGAGAAAAATTAAAAGTTCTCAACATTGATGAAAAATCTGGTAGAGTCAGAGTTCTTAGAGGTGTTGATGGAACACTTGCAGTTGCCCACTCTGCAGGTACTATTGTTAGAGATGATCCTAGAAAACTCAGATTCCTCTCAACAGGTATCAATACTCAGAGAAA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Genome Context

Title	Authors	Date	PMID	Source
Isolation, characterization and genome sequencing of the novel cyanophage S-B43 from the Bohai Sea, China	Wang,M.	2020-10	—	GenBank

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Literature