Protein

View in Explore
Genbank accession
XLL17571.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,86
Protein sequence
MSSTDNSKATSIETNQYIKNPKYTTKEAIDKFVHLLILGRYTEKDLSDALNYCLIRSTESFDSIDSIKKAIEELKKDSEAFKIFQDNANKLLDAIQDINKEQNTEINKINEFLKTVVTLDTEQTITGTKTFNKIYVPNPTENRQAANAQYVMDYVRNQLNLTIGDLNNLKTESKDLIVNAVNEVLDNLNAYKETINETTINQLIDTKLNPLIERITTIESTVDYTKELVEANNQTVEDLNTKVVDNTSDITDINARLEEAVFYSRINDTRKTIQLKNYDSISGLSTTGVGFNIAMVSKWDKVDLGSAQIPINLNGSETRPTYNDSKEIALMDDVNTKADASNVYNKSEIDSKLDLKANSNSVYNKEDSDARFVSLTENQNIQGNKTIEGIWTYNGELSDPKQLATTEYSKNYSETYTNQKVGDLTSLKTEAKDTAVAAINELFDKIGSGSTDGPVDTYTKREIDSKLDLKADASGVYNKSEIDHKFENITIDDINYAKLGEENTFIQEQNIKQVNISDEPTLDTHVITLKYFKDNSGGSISPGDYVTKTEFTSGINNKADKIHTHVVADITDLNLDILATKEETYTKQEIDNKIDAIVPPEIDLTHYVKKDTANIFTKANTFTEAPSVEVDATLDNHVIRKKQFDNNIKEINDKVKSVVGDLNSLNNEVSKDNLVNAINSVDDKFKTTAKTNESNTFTGDQTYLNNILLESVPSERNHAVNLGYILDNPGGIKLPDHTALTQNSVTEITFGYANPVAYSAQTLKNVFLKDIVGNEYKAIMADETSFTANPSKEMVVILSRTDYTKNIDVKFAITKTVDELKQYELKEGEVRVILSYDVISVYSSGYGYGAMFARNANKKDGDLIYDYYLGSQNDITNNRKVSIKIDKLGINTPDIVSISMTTNGSEKLTVKTDTLDPVENTYESADMTYTHNPVSKIVGDVLYSNISQAIKSIHLLENNICSLKPADMELQLVRLKEFKQTINNMLQSMFDESPVALENGDYIDVSFSGSASYGTGYCGYVNIKDTIRNITYKAYKVSSNAFDTTSGTKVIAVLTSDNSKTNVTYSDSVSTLESYEVAENEILLEISFSTAKQYSAKYGYGAMLEYWGSVSDLCYDYYMGSNLDMDCPFKITLLKLGSSVKADTIQIGAPTFAGSLVMHLRKNSNDIIDFLVSTGVKVTGRDGAESGSVYDLVDKTLKPLKVLTSDAHQEINGITNFNNKAYLNIDSNKITDNKQIINKEYLDGSIETTTKDIINGTPIIPFTNIKGKNTKNIRLKIYAKTDSSSYSTGDTVAVSNLKVKLKGDTEFLKPIGVEVTDRSNQKVGLNLTGDDTVYKDDSAITETKPSGFNISSIDLSSGSNAVATVKTNGAYDYSGTYEICNPFREYNKKYCLFLSSDGLKNPYYQVDISSSKEVENIQLQLYGTSATNTFLYSKDCIIEIYTDDTLIRSFNIKNKNDNTNKPINIKLDFKDGVSLIPIEEAVSNLKNIIDNNSSILSGNGKPNFSINPDKIGSLYSDITNKAVYMCIDNTFGANKWVNIVTGDEIKPNLRKIEITCNVNLRSGQYGGCMSGVKIGFDNGYASTKQIVPGLNSGQILLSLDGLGNLSGYSEVSSLTPSGQDIKVDVDTTGIYNDPAYHCVTNIFKEYFSSPNQCSLWNDASVKQLKITLLSEKIPTKILYVGNGYYGQTSVSDVKAVWYYVNDSGDKIEGSIDNDLEISNNDSETNDSSYIYAFNIN
Physico‐chemical
properties
protein length:1736 AA
molecular weight: 192586,41900 Da
isoelectric point:4,79860
aromaticity:0,08122
hydropathy:-0,45657

Domains

Domains [InterPro]
DC_0608
ATT
1–379
DC_0608 DC_0608
Coil
Unmapped
181–201
Coil Coil
XLL17571.1
1 1736
Architecture
ATT
ATT
ATT 1-379 | ATT 451-1736
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Campylobacter phage CC_R7
[NCBI] 		3384961 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Campylobacter coli
[NCBI] 		195 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Campylobacterota > Epsilonproteobacteria > Campylobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLL17571.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ092953.1 [NCBI]
CDS location
range 152992 -> 158202
strand +
CDS
ATGTCCAGCACTGATAATTCTAAAGCTACAAGTATTGAAACAAATCAATATATAAAAAATCCAAAATATACCACAAAAGAAGCTATTGATAAATTTGTTCACCTATTGATCCTGGGCAGATACACTGAAAAAGATTTATCAGATGCTTTGAACTATTGCTTAATTCGCAGCACAGAAAGTTTTGATAGTATAGATTCTATAAAAAAAGCTATAGAAGAACTTAAGAAAGATTCTGAAGCTTTTAAAATATTTCAAGATAATGCAAATAAACTTTTAGATGCTATTCAAGATATTAACAAAGAACAAAATACAGAAATCAATAAAATTAACGAATTCTTAAAAACAGTAGTAACTTTAGATACTGAACAAACTATTACAGGAACTAAAACATTTAATAAAATTTACGTTCCAAATCCAACTGAAAATAGACAAGCTGCCAATGCTCAGTATGTTATGGATTATGTTAGAAATCAATTAAATTTAACTATTGGCGATTTAAATAATTTAAAAACTGAATCTAAAGATTTAATTGTTAATGCTGTTAACGAAGTTCTTGACAATTTAAATGCTTATAAAGAAACTATAAATGAAACTACTATTAATCAATTGATTGATACTAAGTTAAATCCATTAATAGAAAGAATCACGACAATTGAATCTACTGTAGATTACACTAAAGAATTGGTAGAAGCTAATAATCAAACTGTTGAAGATTTAAATACAAAAGTAGTTGATAATACTAGTGATATAACAGACATCAATGCAAGACTTGAAGAAGCTGTTTTCTATAGTAGAATTAATGACACTCGTAAAACTATACAACTTAAAAATTATGACAGCATTTCTGGGTTAAGCACCACCGGTGTAGGATTCAACATTGCTATGGTTTCTAAATGGGATAAAGTAGATTTAGGATCTGCGCAAATTCCTATTAACTTAAATGGGTCAGAAACCAGACCAACTTATAACGATTCTAAAGAAATAGCTTTAATGGATGATGTTAATACTAAAGCGGATGCTAGCAATGTTTATAATAAATCTGAAATTGATTCAAAACTTGATCTTAAAGCAAACTCAAATTCAGTTTACAATAAAGAAGATTCTGATGCTAGATTTGTTAGTTTAACTGAGAATCAAAACATTCAAGGTAATAAAACAATTGAAGGTATTTGGACATATAACGGAGAGTTATCTGATCCAAAACAACTAGCAACTACAGAGTATTCAAAAAATTATTCTGAAACATATACCAATCAAAAAGTCGGAGATTTAACAAGTCTTAAAACAGAAGCTAAAGATACAGCAGTGGCTGCTATCAACGAATTATTTGATAAGATTGGATCTGGGAGCACAGATGGTCCAGTCGATACTTATACAAAACGAGAAATTGATTCAAAACTTGATCTTAAAGCAGATGCTAGCGGTGTCTATAACAAATCAGAGATTGATCATAAATTTGAAAACATAACTATTGATGATATTAATTATGCGAAGTTAGGTGAGGAAAATACTTTTATTCAAGAACAAAACATAAAACAAGTAAATATAAGTGATGAACCTACATTAGATACTCATGTAATTACTTTAAAATATTTTAAAGATAATTCTGGTGGTAGTATTTCTCCAGGTGATTATGTAACCAAGACTGAATTTACAAGTGGTATTAATAACAAAGCTGATAAAATTCATACACATGTTGTAGCTGATATAACAGATTTAAATTTAGATATACTTGCTACAAAAGAAGAAACATATACTAAACAAGAAATAGATAATAAAATAGATGCAATAGTACCACCTGAAATTGACTTAACTCATTATGTAAAGAAAGATACAGCTAATATTTTTACAAAAGCTAATACTTTTACAGAAGCACCTTCGGTAGAAGTAGATGCAACACTAGATAATCATGTTATTAGAAAAAAACAATTTGACAATAACATAAAAGAAATAAATGATAAAGTTAAATCTGTTGTTGGTGATTTAAATTCATTAAATAATGAAGTTTCTAAAGATAATTTAGTTAATGCTATAAATAGTGTGGATGATAAGTTCAAAACAACAGCTAAAACTAATGAATCAAATACATTTACAGGGGATCAAACTTATTTAAACAATATTTTACTAGAATCTGTTCCTTCTGAAAGAAATCATGCAGTTAATTTGGGATATATTTTAGATAATCCTGGAGGTATAAAACTCCCTGACCATACTGCACTTACACAGAATTCTGTTACAGAAATAACTTTTGGATATGCAAATCCCGTAGCTTACTCTGCACAAACATTAAAAAATGTATTCCTAAAAGATATAGTAGGTAATGAATATAAAGCTATTATGGCAGATGAAACATCATTTACAGCAAATCCTTCAAAAGAAATGGTTGTTATACTTTCTAGAACTGATTATACAAAAAATATAGATGTTAAGTTTGCCATAACTAAAACAGTTGATGAGCTTAAACAATATGAGCTTAAAGAAGGAGAAGTTAGAGTTATACTATCTTATGATGTTATATCTGTTTATTCTAGTGGATATGGTTATGGAGCTATGTTTGCTAGAAACGCTAATAAAAAAGACGGCGATTTAATATATGATTATTATTTGGGAAGTCAAAATGATATAACAAATAATAGAAAAGTATCTATAAAAATAGATAAACTTGGCATTAATACTCCGGATATTGTAAGTATATCTATGACCACAAATGGTTCTGAAAAATTAACAGTGAAAACAGATACACTAGATCCTGTGGAAAATACATACGAATCTGCAGATATGACTTATACTCATAATCCTGTCAGTAAAATTGTAGGAGATGTTCTTTATAGTAATATATCTCAAGCAATTAAATCAATACATTTATTAGAAAATAATATATGTTCTTTAAAACCCGCAGATATGGAGTTACAACTTGTAAGACTTAAAGAATTTAAACAAACAATAAACAATATGTTGCAATCTATGTTTGATGAGAGTCCTGTAGCACTAGAAAATGGAGATTACATAGATGTTTCATTTAGTGGTAGTGCAAGCTATGGAACAGGATATTGTGGGTATGTTAATATAAAAGATACTATAAGAAATATTACATATAAAGCTTATAAAGTATCTTCAAATGCTTTTGATACAACTAGTGGGACTAAAGTTATTGCAGTTCTCACTTCTGATAATAGTAAAACAAATGTAACTTATTCTGATAGTGTATCAACATTAGAATCTTATGAAGTAGCAGAAAATGAGATATTATTAGAAATATCATTTTCAACTGCTAAGCAGTATTCTGCTAAATACGGGTATGGAGCTATGTTAGAGTATTGGGGTTCTGTATCTGATTTATGTTATGATTATTATATGGGTTCAAATCTAGACATGGATTGTCCATTTAAAATAACACTACTAAAACTAGGAAGCTCTGTTAAAGCAGATACTATACAAATAGGTGCGCCTACTTTTGCAGGATCATTAGTAATGCACTTAAGAAAAAATTCAAACGATATTATTGATTTTCTTGTATCTACAGGTGTGAAAGTAACAGGAAGAGATGGTGCTGAAAGTGGATCAGTATATGATTTAGTTGATAAAACTCTAAAACCTTTAAAAGTATTAACATCCGATGCTCATCAAGAAATAAATGGTATAACTAATTTCAATAACAAAGCTTATCTAAATATAGATAGTAATAAAATTACAGATAATAAGCAAATCATAAACAAAGAATATCTTGATGGAAGTATAGAGACTACAACTAAAGATATTATAAATGGAACTCCTATAATACCTTTTACAAATATTAAAGGTAAGAATACTAAAAATATAAGACTTAAAATATATGCAAAAACTGATAGCTCTAGTTACTCTACTGGAGATACAGTTGCAGTAAGTAATCTTAAAGTTAAGCTTAAAGGAGATACTGAGTTTCTTAAACCTATTGGAGTTGAAGTTACTGACAGAAGTAATCAAAAAGTAGGATTAAACTTAACAGGAGATGACACTGTATATAAGGATGATAGTGCTATTACAGAAACAAAACCTTCAGGATTTAATATATCAAGTATTGATTTATCTAGTGGTAGTAATGCCGTAGCTACAGTAAAAACAAATGGTGCATACGATTATAGTGGAACATATGAGATTTGTAATCCTTTCAGAGAGTATAATAAAAAATATTGCTTATTTTTAAGTTCTGATGGATTAAAAAATCCTTATTACCAAGTTGATATAAGTAGCTCTAAAGAAGTAGAAAATATACAATTACAATTATATGGAACAAGTGCTACAAATACTTTTTTATATTCTAAAGACTGTATAATAGAAATATACACTGATGATACACTTATAAGGTCGTTTAATATAAAAAATAAAAACGATAATACAAATAAACCTATTAATATTAAACTAGATTTTAAAGATGGAGTTTCTTTAATTCCTATAGAAGAGGCTGTATCTAATTTAAAAAATATTATAGATAATAACTCATCTATTTTATCTGGAAATGGAAAACCCAATTTTTCAATAAACCCTGACAAAATAGGTTCATTATACTCTGATATAACTAATAAAGCTGTATATATGTGTATAGACAATACTTTTGGTGCTAATAAATGGGTGAATATAGTAACAGGGGATGAAATTAAACCAAACCTTAGAAAAATAGAAATCACTTGTAATGTAAACTTAAGAAGTGGTCAATACGGTGGTTGTATGAGCGGTGTTAAAATAGGATTTGATAACGGGTATGCTTCTACAAAACAAATAGTTCCAGGGTTAAATAGCGGTCAAATATTACTATCTCTAGATGGGTTGGGTAATCTTTCTGGATATTCTGAAGTTAGTTCTTTAACTCCTAGCGGTCAAGATATAAAAGTTGATGTGGATACTACTGGGATATATAATGATCCTGCATATCATTGCGTTACTAATATATTTAAAGAGTATTTTAGCAGTCCTAATCAATGTTCGCTATGGAATGATGCTAGTGTTAAACAACTTAAAATAACTTTACTGTCTGAAAAGATTCCTACCAAAATATTATATGTAGGAAATGGATATTATGGTCAAACATCTGTTTCTGATGTAAAAGCTGTATGGTATTATGTAAATGATAGTGGAGACAAAATAGAAGGCAGTATAGATAACGATTTGGAAATAAGTAATAATGACTCTGAAACAAACGATAGTTCTTATATATATGCGTTCAATATAAATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
620b91273703b0aadc8be2056ac8a2f6fd2f53af6de3f08b1a133d45c3724af0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4140
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50