Protein

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Genbank accession
WLW37037.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWSSLRYERPIESTSNTANTLVQRDADGNFAAGTITSTLIGNASTASRLASTRQITLAQDVTGTGLFDGSANLNINASLELISSLPHYDGTVTPTAEYTKVTVDAKGRIINASNPTTLADYNLNGTVEGQSAQPYDLDLVAVAGLTTTGLISRTSGGNMATRTITGTATRIAINDGGGISGNPTIDLITTAVVAGDYNTESLTSVSALGGNNEPFGTETVNAAKFTVDAYGRLTSATNVPIATATEGSKYAIYNAGTAYSRYDIIENASKVYQAITSINAGAGAPTHSSGDTGGWRYLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDGNGHVTIAALGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGEVDINVRSYFSDPDITLDGAVAQTLDKTGDGNLTFQTTQNSASARSLSILATNAGSGTSNVIVTAEDTVQISASNAAAAGVTTTGKILIEDLKVYDNYIASGNATINIDPGDSGDNTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIITLGGDTAPSADDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNTSEVFTGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLVDIDSTLRVHSTSRFDDNMVIQGASKTLQLNNGSGTTKVEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTDKFNVVATSGNTSIAGTLGVTGGTTLTGALDLNNTLNVSGLVYFENVDEPTIALNSGTGLYEIGSSDYGSFRFDGGGYVEGDTLYNSDVYINGQIIQKEDTTANYNRQNYLEVRYKLRSGTRAVYTPSYATHDTSNLRVYGGAGIATTLHVGGTGSGEGLFVGKEYSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNTEINGTLDVDADFAVRNGTTDKFTVDNVTGNTVIEGTLNGKGAADFDSTLNVDGNTTLGGTLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKFTVASSSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGASGIVTLTNNTDQTLTGNYGADGALRLTGGAAIQRNLAVGGNMRVYGDFEISGSTTQSGNTGFSGRVSITNTSDATSFSDNSVALTTDGGLRVSKNAWVGGDFYVWDDANSRNAFYVDTSTGDATLHNTLTVGGDLVVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQYTFLVDATNNSEIHTGTDAALRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTAKINNLNADLLDSMTTASAATPTTVVNRDSSGDFAANIITVASGTGAGAGIQGNALTADTLKTARTITIDGVVDGSVSFNGSADVTISTVYNDADITALAAMAGTGFVTRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVSGDPTINVASASTNSANNLVLRDASGNFAANEITADLVGNVTGNVTGNVVGNVTGQTSDISNHDTDALTEGSTNLYFTNERVDDRIDALFVASTGITKVYDDAAGTYTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSVGGELSVTQADIDTDNVTEGSTNIFYTEARFDASLAGKTTTDLAEGTNLYFTDARADARIAAATTDDLTEGSTNQYYTEARVQDKLDNAYEQLRAMLNNLAAATTLVLNLSGDPTPGDVTALDAGTLVGGTGYNTATAVATTSSGSGAGLTVDITASGGVITAVAINADGSGYAVGDTITITGGGGDATIDVSAVVEMAVGDTVTGGTSGTTGVITAVGATSVTVDNVDGFFKKTETVSAGDVSTLTIQSFG
Physico‐chemical
properties
protein length:1915 AA
molecular weight: 196431,44360 Da
isoelectric point:4,13739
aromaticity:0,06319
hydropathy:-0,15875

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607 Coil
WLW37037.1
1 1915
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-242 | STR 334-1553 | RBD 1675-1915
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-MS29
[NCBI] 		3038209 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. MW02
[NCBI] 		1620844 Cyanobacteriota > Cyanophyceae > Synechococcales > Synechococcaceae > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WLW37037.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ504980 [NCBI]
CDS location
range 51558 -> 57305
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAACTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAACCCCACACTTGCTCAAGGCGAATTAGGGATCGAGCTAGACACGGGTCGTATTAAGATCGGTGATGGTGTTACTGCTTGGAGCTCTCTACGTTATGAGAGACCCATCGAATCAACATCTAACACTGCAAATACTCTTGTGCAGCGTGATGCTGACGGCAACTTTGCCGCTGGCACTATTACTTCAACTCTTATCGGTAATGCTTCTACCGCTTCTAGACTTGCTTCTACCAGACAGATTACTCTTGCACAAGACGTTACTGGCACTGGTCTGTTTGATGGATCGGCAAACCTGAATATCAATGCTTCCCTTGAATTGATTTCTTCCTTGCCTCATTATGATGGCACGGTTACACCAACTGCAGAATACACAAAAGTAACAGTTGATGCAAAGGGTCGTATCATCAATGCTTCAAACCCAACAACTCTTGCAGATTATAATCTTAATGGCACAGTAGAAGGTCAATCTGCACAACCCTATGACCTCGACCTAGTTGCTGTTGCAGGTCTTACCACTACTGGTTTGATTTCTAGGACTTCTGGCGGCAATATGGCTACCAGGACAATTACTGGCACAGCAACTCGAATTGCAATCAACGATGGTGGTGGTATCAGTGGTAATCCCACCATTGATCTAATTACCACAGCTGTTGTTGCTGGTGACTATAATACTGAGTCTCTGACATCTGTATCTGCTCTAGGTGGTAACAACGAACCTTTTGGCACAGAAACTGTAAACGCTGCTAAATTTACAGTTGATGCTTATGGTAGACTAACAAGTGCTACTAATGTGCCTATTGCTACTGCTACTGAAGGTAGTAAGTATGCTATCTATAATGCAGGCACTGCATATTCTAGATATGATATTATCGAGAATGCATCGAAAGTTTATCAAGCAATTACATCGATTAACGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGCGGCGATACTGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGCGGCAACCGAGCAGAAGGGACTGGCTAGCTTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACGGCAACGGGCACGTTACCATCGCTGCACTAGGTGTAGATAATACACAACTACAAAATAATAGAGTCTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAGCTTGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTTAAAGTTAATGACACGAGCGGTAATCTTCTGTTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAAGTTGATATTAACGTACGCTCGTATTTCAGCGATCCTGACATCACTCTTGACGGTGCTGTTGCTCAGACACTGGATAAAACTGGGGATGGCAACTTAACTTTCCAAACAACTCAGAATAGCGCATCTGCTAGAAGTCTGAGTATTCTTGCAACAAACGCTGGATCTGGCACTAGCAATGTTATTGTTACTGCTGAAGATACTGTGCAGATCAGTGCGTCGAATGCAGCTGCAGCAGGTGTTACTACAACAGGCAAAATCCTGATCGAAGATCTTAAGGTCTATGACAATTATATTGCTTCTGGCAACGCTACTATCAATATTGATCCTGGCGATAGTGGTGACAACACTGGCACCGTACGGGTCTGGGGCGATCTACAAGTGGACGGCACCACTACGACAGTCAATTCGACGACGTTACAAGTCGATGACCCCATCATTACTCTCGGTGGTGATACTGCTCCAAGTGCTGACGATAATCTGGATAGGGGTGTTGAATTCCGCTATTATGACACTCAGGCACGTCTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGTGGTTATCGTTTCCTTCACGCTGCTACAAATACTTCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACCACTAACACCAATTCTACTTCCAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAGGACGTTAACATCGGTGGTCTGGTTGACATCGACAGCACTCTGCGTGTCCACAGCACCTCTCGCTTCGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCCAAGACACTGCAACTCAACAATGGCAGCGGCACCACTAAGGTAGAATTCCAATCCACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATTCTTGATGTAACTGGTAACTTTAACGTTAATACAGATAAATTCAATGTTGTTGCTACTTCTGGTAATACCAGTATTGCTGGCACTCTGGGTGTTACTGGAGGAACTACTCTAACAGGTGCTCTGGATCTCAATAACACTCTGAATGTTTCTGGTCTTGTTTACTTTGAGAATGTTGACGAACCAACCATTGCCCTGAATAGCGGCACTGGTCTTTATGAGATTGGTAGTAGTGACTATGGTTCGTTTAGATTCGATGGTGGCGGTTATGTAGAGGGAGATACACTCTATAACTCTGACGTTTATATCAACGGTCAGATCATTCAGAAAGAAGACACGACAGCCAACTATAACAGACAAAACTACTTGGAAGTCCGTTACAAGTTGCGCTCAGGCACCAGAGCAGTCTATACACCTTCTTATGCAACACACGATACCTCCAACTTGAGAGTTTATGGTGGTGCTGGTATCGCTACTACTCTGCATGTTGGTGGCACAGGTTCTGGCGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGGAGTACAGTGGAGACACTGTTAAGTTCTCTGTTCTTGGTGCATCTGGTAACACCGATATTCAAGGCACACTCGACGTTGCTGGTAATACTGAGATCAATGGCACTCTGGATGTTGATGCAGACTTCGCTGTCAGAAACGGCACAACCGATAAGTTTACTGTCGATAACGTAACTGGCAACACTGTTATTGAAGGCACTCTGAATGGTAAGGGTGCAGCAGACTTTGATAGCACTCTGAATGTTGATGGCAATACTACTCTAGGTGGCACTCTGACAGTTACTGGCACGACAGAATTCAACAATACTGTTGATGTTGACGCTAACTTTGCAGTTAGAAGTGGCAGCACAGACAAGTTTACTGTTGCTTCTTCCTCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCCAACGAAGTCTTCTCTATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGTAATACGAATATCATCGGCACCCTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATCAACGATACTCTGGGTGCATCGGGTATTGTTACACTCACTAATAACACTGATCAGACTCTGACAGGTAACTACGGTGCTGACGGTGCTCTGAGACTGACAGGTGGTGCTGCAATCCAAAGAAACCTCGCTGTTGGTGGCAACATGCGTGTCTATGGTGACTTTGAAATCTCTGGTAGCACAACTCAGTCTGGTAACACTGGTTTCAGTGGTCGTGTTTCGATTACCAATACTTCAGATGCTACATCATTCTCTGATAACTCTGTCGCTCTTACAACCGATGGCGGTTTGAGAGTAAGCAAGAATGCATGGGTTGGTGGCGATTTCTATGTTTGGGATGATGCAAACTCTAGAAATGCATTCTATGTTGATACAAGCACTGGCGATGCAACCCTACACAATACACTTACTGTTGGCGGAGATCTCGTAGTAAATGGCACAACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTCTGGGTGGTGACACAGCACCCGCGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGTTTCTTTGGATTCGACAGATCGTCCTCCCAATACACATTCCTAGTCGATGCAACCAACAATTCTGAGATTCATACTGGCACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGCTCTGGGACATCTCTTGATGTTGATGCCAATGCCAATATTGATGGGACCCTGACTGTAGATGGTCAGATTATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTCCTGCCCTGGTTATTCCTACCACTGCTAAGATCAACAACTTGAATGCTGACCTTCTGGATAGCATGACAACTGCTTCGGCAGCAACCCCCACAACTGTTGTTAATAGAGATTCGAGTGGAGACTTCGCGGCTAACATCATTACTGTTGCTTCTGGCACTGGCGCTGGCGCTGGTATTCAGGGTAACGCTCTCACTGCAGACACTCTTAAGACTGCAAGGACAATCACAATCGACGGAGTTGTCGATGGCAGCGTTTCCTTCAATGGATCTGCCGACGTAACTATCAGCACCGTCTATAACGATGCAGACATCACTGCACTCGCTGCAATGGCAGGCACTGGTTTCGTTACTAGGACTGCTGCTAATACCTATGCACAGCGCACTCTGCAGGTCACAGCATCGTCTGGTATTACTCTAACCAATGCTGATGGTGTTTCTGGCGATCCTACGATCAACGTTGCTTCTGCAAGCACCAACTCTGCAAATAACCTCGTCCTTCGTGATGCTTCTGGTAACTTTGCTGCAAACGAAATCACTGCTGATTTGGTTGGTAATGTCACAGGTAACGTTACTGGTAATGTGGTTGGTAATGTTACAGGTCAAACCTCTGACATCAGCAACCATGATACAGATGCTCTTACAGAGGGTAGCACCAATCTTTACTTCACAAATGAGCGTGTTGATGACAGAATCGATGCACTGTTTGTTGCAAGCACTGGTATCACTAAGGTATATGATGATGCTGCAGGCACCTACACGCTGTCTGTAACTCAGGCAGACATTGATACTGACAATGTAACCGAAGGTAGCACAAACCTCTTTACAACTGCTGCTCGCACCCGCACCCACTTCACCTATGGCACGGGTATTGAATTGAGTGTTGGTGGTGAATTGAGTGTCACTCAGGCAGATATCGATACTGATAATGTCACTGAGGGTAGCACTAATATCTTCTACACTGAAGCACGTTTTGATGCAAGTCTTGCTGGTAAGACTACTACTGATCTGGCAGAAGGCACTAACCTTTACTTCACAGATGCTCGTGCTGATGCTCGTATCGCAGCAGCAACTACAGATGATCTGACTGAAGGATCTACCAATCAGTATTATACTGAGGCAAGAGTCCAAGACAAACTCGATAATGCATATGAGCAGCTGAGAGCAATGCTTAACAACCTTGCAGCTGCTACAACTCTTGTCTTGAATCTGTCTGGTGATCCTACTCCTGGTGATGTAACTGCTTTGGATGCAGGCACTCTCGTTGGTGGCACTGGATATAACACTGCAACCGCAGTTGCTACCACATCTAGTGGTAGTGGCGCAGGTCTAACAGTTGACATTACTGCTTCTGGTGGTGTTATTACTGCTGTTGCGATCAACGCCGATGGATCTGGTTATGCTGTTGGTGATACCATCACCATCACTGGTGGCGGTGGTGATGCAACTATTGATGTTTCTGCTGTTGTTGAGATGGCAGTTGGTGATACCGTCACTGGCGGCACCTCTGGCACTACAGGCGTTATTACTGCTGTCGGTGCAACTTCTGTAACTGTAGACAATGTTGATGGATTCTTCAAGAAGACTGAAACTGTATCTGCAGGTGATGTTTCTACACTTACTATCCAATCATTCGGTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4d84cdb2ae641f982e8489438cdf6841f60ba87d8b55f653a47350f1fa070790
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5341
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50