Protein

Genbank accession
QNI21286.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTDSSEITIGDILKTFKINSNGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNNFSIRQAIVTDGEQLTLKKATNAGASYIQGRDANNQQTWYVGQGNANSTNVYLYNHATGAMLTLDATAAFNKSLRITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFTGANTFRTMSIISNAAAITLQCASANESLYLLAKDYQGGNLWYVGKGSSGDGVTIYNYTTNTSLVLDAAGVSANKNVRITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNAQNTFNGVQKVVTDNEALIVKNSTQNRPLYIRGVDTANVSRWWVGVGGADSNDVTLNNSFSGTQLVLGNSSAYINKTLSLAGQIQPSDWSNLDARYYTQSTANSRYMLAYSSGSGTEVGESDGIVWNAKTGLYNVYNKSGGSTQLVYHMYQGSSSTPSAQFKFIYRNGGIFYRTARDGYGFEQAWAKIYTDQDKPTPSEIGAYTKAETDQKIAEAISDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGNHAHDRGNMEISGVFGWFRSDNGAFYTASGAFVMGGSQASHGFTGSNFTYGAPVDFHASRTWTGVTNTTGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:752 AA
molecular weight: 80725,85470 Da
isoelectric point:8,48380
aromaticity:0,10505
hydropathy:-0,34495

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:6.20.80.10
119–180
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246
IPR048388
120–209
IPR048388 IPR048388 IPR048388
QNI21286.1
1 752
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage SME50
[NCBI] 		2762556 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QNI21286.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT887289.1 [NCBI]
CDS location
range 1 -> 2259
strand +
CDS
ATGACCTATCAAGACTTCTTAGCTTCTTTCAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGGAGCACTATGACGGGGGATTTAGGTATTGTCAAGTTACTTTACGGTGGTAAGGCTGTATTTGACCCAACAGATTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATATTTTAAAGACTTTTAAAATTAACTCAAATGGTCTTAAACTCACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCGGCAACTGTTTATCATACTTTGAATAAACCAAGCCCTAATGAACTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGCTTGCTGTCACAAATAACTTCAGCATTAGGCAAGCAATCGTAACTGATGGTGAGCAGTTAACTCTTAAGAAGGCAACCAATGCAGGTGCTTCATATATTCAAGGTAGAGATGCTAATAATCAGCAAACTTGGTATGTTGGACAGGGAAATGCAAACAGTACTAATGTTTATTTGTACAATCATGCTACTGGTGCAATGTTAACCCTTGATGCAACAGCAGCATTTAATAAGTCACTTAGAATCACTGGTCAAGTCCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTCGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGTAATAACACTTTTACAGGTGCTAATACATTTAGGACTATGAGTATTATCTCAAATGCTGCTGCTATCACACTACAATGTGCATCAGCAAATGAATCTCTGTATCTACTTGCAAAAGATTATCAAGGTGGTAACTTATGGTATGTTGGTAAAGGTAGCTCAGGTGATGGTGTCACTATCTACAACTATACCACTAACACCTCTTTGGTCTTAGATGCTGCTGGAGTATCAGCAAATAAAAATGTCAGAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCTACTTTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCACAAAATACTTTTAATGGTGTGCAGAAAGTTGTTACGGATAATGAAGCCCTAATTGTGAAAAACTCCACTCAGAACAGACCATTGTATATTCGTGGTGTGGATACTGCTAATGTTTCAAGGTGGTGGGTGGGTGTTGGTGGTGCAGACAGCAATGATGTGACACTGAATAATAGCTTCTCTGGCACTCAGTTAGTTTTAGGTAACTCTTCTGCTTATATCAATAAGACACTGTCTCTAGCTGGACAGATTCAACCTTCAGATTGGTCTAACTTAGATGCTAGATACTATACCCAATCTACCGCAAACTCTAGGTATATGCTTGCTTACTCTTCTGGCAGTGGTACAGAGGTGGGTGAGAGTGATGGTATTGTTTGGAATGCTAAAACTGGTCTGTATAATGTGTATAATAAATCTGGTGGCTCAACACAGTTAGTCTACCATATGTATCAGGGTTCAAGTTCTACACCATCTGCACAGTTTAAGTTTATCTACAGGAATGGTGGTATTTTTTACAGGACAGCACGAGATGGGTATGGTTTTGAGCAGGCATGGGCTAAAATCTATACAGACCAAGATAAACCAACCCCTTCAGAAATTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCAGAAGCAATTAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAATAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACACTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCATAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCATTTGATTATGGTACTAAGACGACAAATACGACTGGCAACCATGCTCATGATAGAGGTAACATGGAAATTTCTGGTGTGTTTGGTTGGTTCAGAAGTGATAACGGTGCATTCTACACTGCTAGTGGTGCATTTGTGATGGGTGGTAGTCAGGCTTCGCATGGCTTCACAGGCTCTAACTTCACTTATGGTGCGCCTGTTGATTTCCACGCGTCAAGAACTTGGACAGGTGTAACCAACACGACTGGTAACCACGCCCACAGTGTAGGTATTGGCGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACAGGTGGTACTGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGCTAATGGCTTGGGTAAGGACTGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
c00f06bf25f0d9d6263da932de1264e5152b9426f29dfb51ef88e4198f77b2f3
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6936
Evidence 0,6936
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of Escherichia phage SME50 Lee,S. and Kim,M. 2015-04-30 — GenBank