Protein

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Genbank accession
QIN95621.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,73
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYSVLSDGVNVGFFIEENTVQQYDATRGYKKNFAVINDNRIWVAQRDIPAPAGAFTPQYWLATRTDPKWETVASPTRQLNSGEFIAVDSAASFTTFTLPANPVDGDTIVIKDIGGNVGYNEIKIQSSNVPGAGNQKIVRFGNQYSEVLITKPFSYNMLIFSNRLWQFWEAGNEERGIRIEPSTGRFHAQAGDFIMRRYTTGAPITFILPKYANQGDIVKSVDIDGMGPTFHLMVETFDTSSSLGKAGQHQMEFRTTGDGFFVYNAAEKLWHVWDGDNKTRLRIIRDSVKLLPNESIIVFGEDNSTPATINIDLPTDVLQGDIVKIALNYLRKSQTVNIRAAVGDKIASDIKLLQFPKRSEYPPDTTWVLVDSLTFNGNISYTPVIELSYAEDKVSGKSYWVVAQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALANQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVAKENQRGIARIATTAQVNQNSDFAFVDDVIISPKKLNERTATETRRGLAELATQQETDAGVDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTYVSTTGATPAASRELNGTNVYNKNTVNLVVSPKALDQYKATYTQQGAVILAVESEVIAGTSQSDWANAVVTPEMLHRKTALDSRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKASETLSGIAEIATQSEFDTGTDDTRISTPLKIKNRFNNTARTSVNALSGLVETGTLWDHYSLNILEANETQRGTARLATQGEVNTGTDDKTIVTPLKLMSKKATENAEGIVRIATNAEATAGTSKVLAISPSALKYIAQTETTWESSETLRGFVRLSSGAATSAATTTTGAGFTYANGVYTPDPSKLVSYAKSGYAVSPYELNRVLQNFLPINAMAVNAEKLDSLDSTQFIRRDIAQTVEGALTLTKQTNISAPVVSTSTAVFTDVTAGTSTFGTVNVVNGTNKWKITAPSTGTTMTIGDTTNVLTLNTASGNVAVLNNLSAGNDVQAKNNYVLNGRTIATTTGEASGATLSLGDNSQNLVLKTLDAGNIIANGGGAFKVLTEKNAVEIVDRNFVNQAGDTMSGVLRVNAPVRVFGTKPSLIAQAPTADTVGFWSVDINDEATYSQFPGYWTMKLKRQVNIDTVQTKPAGVTDEVWNASGWLTENGTFASPAIRYRNDDGTLGDEVLGSSGQKLRGTWFDYSVRDKQIKYPGTLTQFGNTLDSCYQDWVCYPTGLNGGTIRYTRTWQKNKSAWTTFAMVYTADNPPSAEDVGALPADNTTMGNLTILDWLRIGNVRIIPDPTTKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1318 AA
molecular weight: 142946,12240 Da
isoelectric point:5,36579
aromaticity:0,07815
hydropathy:-0,29090

Domains

Domains [InterPro]
DC_1946
ATT
1–208
DC_1946 DC_1209
IPR048391
ATT
1112–1145
IPR048391 IPR048391
QIN95621.1
1 1318
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-208 | STR 349-1111 | ATT 1112-1145 | STR 1146-1204 | ATT 1205-1266 | STR 1267-1299 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage MN01
[NCBI] 		2711182 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QIN95621.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT129652 [NCBI]
CDS location
range 143000 -> 146956
strand -
CDS
ATGGCCGATATTTTAAAACCAGCATTCAGAGCAACATCCGGTCTCGATGCTGCTGGTGAGAAAGTCATTAATGTCGCAAAAGCTGATTACTCAGTTTTATCAGACGGCGTTAACGTAGGTTTCTTTATAGAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATGCAACACGCGGATACAAAAAGAACTTTGCAGTTATTAATGATAACCGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATTCCGGCCCCTGCTGGAGCATTTACGCCTCAGTATTGGTTGGCAACTCGTACTGACCCTAAATGGGAAACTGTTGCATCTCCAACCCGTCAGCTTAACTCGGGGGAATTTATCGCAGTCGACTCAGCTGCAAGCTTTACCACATTTACATTGCCTGCAAACCCGGTTGACGGCGATACCATCGTTATTAAAGATATTGGTGGGAACGTTGGTTATAATGAAATTAAAATCCAGTCAAGCAACGTACCAGGGGCAGGTAACCAAAAGATTGTTCGCTTTGGTAATCAGTATTCAGAAGTTTTAATTACCAAACCGTTCTCTTATAACATGCTTATCTTTTCAAACCGCTTATGGCAATTTTGGGAAGCAGGTAACGAAGAACGTGGTATCAGAATAGAACCGTCGACCGGACGTTTCCATGCACAAGCTGGCGACTTTATTATGCGTCGTTATACAACTGGTGCACCGATTACTTTCATTCTTCCTAAGTATGCAAACCAGGGTGATATTGTCAAATCTGTTGATATCGATGGCATGGGGCCAACGTTCCACCTGATGGTTGAAACCTTTGACACCAGTTCCAGTCTTGGTAAAGCTGGTCAGCATCAAATGGAATTCCGTACCACAGGTGATGGTTTCTTCGTTTATAATGCTGCAGAAAAACTCTGGCATGTCTGGGACGGTGATAATAAAACTCGTCTGCGTATTATTCGCGATAGTGTTAAACTTTTACCAAACGAAAGCATCATTGTATTTGGCGAAGATAACTCAACTCCGGCAACGATTAATATCGATTTACCAACTGATGTTTTACAAGGTGACATCGTTAAGATTGCACTGAACTATCTCCGTAAATCACAGACTGTTAATATAAGAGCTGCTGTTGGCGATAAGATTGCATCTGACATTAAATTACTGCAATTCCCTAAACGTTCCGAGTATCCACCGGATACAACTTGGGTGTTGGTTGATTCATTGACCTTTAACGGTAATATCAGTTATACTCCGGTTATTGAATTGTCATATGCAGAAGATAAAGTATCTGGAAAAAGTTATTGGGTTGTCGCTCAGAACGTTCCGACTGTCGAACGAGTTGACTCATTAAATGATTCCACGCGTGCACGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAACCAGACTCAGGCAAACGTTGACCATGAAAATAACCCAGAGAAAGAACTCGCAATTACCCCTCAGACTTTAGCCAACCGTGTTGCTAAAGAGAACCAACGAGGCATTGCCAGAATCGCAACGACTGCCCAAGTAAATCAGAACAGTGATTTTGCATTTGTTGATGATGTAATTATTTCTCCGAAAAAACTCAATGAACGTACGGCAACAGAAACGAGACGTGGGCTCGCAGAACTCGCCACACAGCAAGAAACTGATGCAGGTGTAGATGATACCACAATTATAACTCCAAAGAAACTGCAAGCTCGTCAGGGTTCAGAATCGCTATCCGGCATTGTAACTTACGTTTCAACGACTGGTGCAACTCCTGCTGCTTCGCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAATACGGTTAATCTGGTTGTTTCTCCGAAAGCTCTTGACCAGTACAAAGCTACTTACACTCAGCAAGGCGCGGTTATTCTTGCGGTTGAAAGTGAAGTAATCGCCGGTACTTCTCAATCTGACTGGGCAAACGCAGTCGTTACTCCAGAAATGTTGCATCGCAAAACTGCTCTTGATTCCCGTATTGGTTTAATCGAGATTGCTACTCAGGCGGAAACAAATGCAGGAACTGATTATACCAGAGCTGTAACTCCTAAAACGTTAAATGACCGTAAAGCATCAGAAACATTATCCGGCATAGCCGAGATTGCTACGCAATCAGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCAACTCCATTAAAAATTAAAAATAGATTTAATAATACTGCTCGTACTTCTGTTAATGCATTAAGTGGTTTAGTAGAAACAGGGACGCTCTGGGACCATTATAGCCTGAATATTCTTGAAGCAAATGAGACTCAACGTGGTACAGCAAGATTAGCAACTCAGGGCGAAGTCAATACCGGCACTGACGATAAAACAATCGTTACCCCGCTTAAATTGATGTCGAAAAAAGCTACTGAAAATGCCGAAGGTATTGTTCGCATTGCGACAAACGCCGAAGCAACCGCTGGTACATCAAAAGTCTTGGCCATTAGTCCGTCTGCGCTGAAATATATTGCACAAACGGAAACCACCTGGGAATCATCTGAAACACTGCGAGGATTTGTTCGTTTATCTTCTGGTGCAGCTACTTCGGCCGCAACTACAACGACAGGTGCAGGATTTACATATGCAAATGGTGTGTATACTCCGGACCCAAGTAAACTGGTTAGCTATGCAAAATCTGGATATGCAGTTTCGCCTTACGAATTAAACCGCGTATTGCAAAACTTCTTACCGATAAATGCGATGGCTGTTAATGCTGAAAAACTTGATAGTCTCGATTCGACCCAATTTATTCGTCGTGATATTGCCCAGACTGTTGAAGGTGCATTAACTCTCACTAAACAGACAAATATCTCTGCTCCGGTTGTATCGACGAGCACTGCAGTGTTTACTGATGTAACGGCTGGCACTTCGACGTTCGGGACTGTGAATGTTGTTAACGGAACTAACAAGTGGAAAATCACTGCTCCTTCCACTGGAACGACAATGACTATCGGCGATACGACTAACGTATTGACATTAAACACCGCCTCGGGTAATGTTGCTGTATTGAACAACCTCAGCGCCGGAAACGATGTTCAAGCCAAAAATAATTACGTTCTAAATGGTCGTACTATTGCAACCACAACAGGTGAAGCTTCTGGCGCAACTTTGTCTCTGGGTGATAACTCACAGAATTTAGTGCTCAAAACTCTTGATGCTGGCAATATCATAGCAAATGGTGGCGGTGCATTTAAAGTTCTGACCGAGAAAAACGCAGTAGAAATTGTTGATAGAAACTTTGTTAACCAGGCTGGTGATACAATGTCTGGTGTACTCCGTGTGAATGCTCCGGTCCGTGTATTTGGTACGAAACCGAGTCTTATTGCACAAGCTCCGACTGCTGATACTGTTGGCTTCTGGTCTGTCGATATCAATGATGAAGCGACTTATAGCCAGTTCCCTGGTTATTGGACAATGAAGTTAAAACGTCAAGTAAACATTGATACGGTTCAAACTAAACCTGCTGGGGTAACTGATGAAGTTTGGAATGCTTCTGGTTGGTTAACTGAAAACGGAACTTTCGCCTCGCCTGCTATTCGTTATCGTAATGATGATGGTACACTTGGTGATGAAGTATTAGGTAGCTCTGGACAGAAACTACGCGGAACATGGTTTGACTATTCAGTTCGTGACAAACAAATTAAATATCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACGCTGGATTCATGTTATCAAGATTGGGTTTGCTATCCAACTGGATTGAACGGTGGTACTATTCGTTATACTCGTACATGGCAGAAAAATAAATCCGCATGGACGACTTTCGCAATGGTTTACACCGCGGATAACCCTCCGTCTGCAGAGGATGTTGGTGCATTACCGGCTGACAACACAACGATGGGGAACTTAACCATTCTCGATTGGTTACGTATCGGTAACGTACGTATCATCCCAGACCCGACCACTAAATCCGTTAAGTTTGAATGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
ff0d179424d672880c4d42bcb43e34c03e936136dbdf8f3e11a2151cadcd0281
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5433
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50