Protein

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Genbank accession
YP_009288258.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNAENDARYARLEVLNTFKSRQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQDPSGTNKWYVGFNTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDWSNLDDRYFTQTLANQRFAQLAGNNTFNGTNTFNQLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGVNRWYIGNSNEGDNVALENYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTLAKINAKNTFSQGQIIKADGEGIRLQGVNDTGGLFLQGYTSDGAKKWFMGTNASGNFTIREMVLGTELSLRENYIQFNKNVTITGQVQPSDWTNLDKRYYTGSASNARYMYAGKTGEGDNDAAIAWDAKTGLYNVKTGATSSNLLLQLYQGSESSTPSAQLRFKWANGGMWYRTSRDGVGFEKSWAMVYTTAQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHSHSISWIGQNSQHYSGGGGGYIGTGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:777 AA
molecular weight: 83316,98390 Da
isoelectric point:8,90046
aromaticity:0,08752
hydropathy:-0,44775

Domains

Domains [InterPro]
DC_1566
STR
60–777
DC_1566
G3DSA:6.20.80.10
STR
157–217
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
159–246
IPR048388 IPR048388 IPR051934
YP_009288258.1
1 777
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 60-158 | ATT 159-246 | STR 247-272 | ATT 273-354 | STR 355-379 | ATT 380-470 | STR 471-777
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_Alf5
[NCBI] 		1873990 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009288258.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_031082 [NCBI]
CDS location
range 50363 -> 52696
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGACGACCTCCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCGTCTTTTAAACTAGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGCTGAGAATGATGCTAGATATGCTAGATTAGAAGTACTAAATACTTTTAAGTCTAGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTGTTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGCCCTTCTCTCTATGTTAGAGGTCAAGACCCATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAATACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAGGTTAAACCTTCAGACTGGTCTAACCTAGATGATAGATACTTTACCCAAACATTGGCTAATCAAAGATTTGCACAGTTGGCTGGTAATAACACTTTTAACGGCACTAATACATTCAACCAACTGAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAAGCAATTGATAGCACAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAACGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGCACTCTTGCAAAAATTAATGCTAAGAATACTTTTTCTCAAGGTCAGATTATTAAGGCTGATGGAGAGGGTATTAGGCTTCAAGGGGTAAATGATACTGGTGGTTTGTTCTTGCAAGGTTATACTTCTGATGGTGCTAAAAAGTGGTTTATGGGTACTAATGCTTCAGGAAACTTTACTATCAGGGAGATGGTGTTAGGTACTGAACTGTCTCTTAGAGAGAACTATATCCAGTTTAATAAGAATGTAACAATCACTGGGCAGGTTCAACCATCAGACTGGACTAACCTAGATAAAAGGTACTATACCGGTTCAGCATCAAACGCCAGATACATGTATGCAGGAAAAACTGGTGAAGGTGATAATGATGCTGCTATTGCTTGGGATGCTAAGACAGGGCTGTATAATGTCAAGACTGGAGCTACATCATCAAATCTTTTACTTCAGTTATATCAGGGGTCTGAGTCATCTACACCGTCTGCGCAGCTAAGATTTAAATGGGCGAATGGTGGTATGTGGTATAGGACATCAAGAGATGGTGTTGGCTTTGAGAAAAGTTGGGCTATGGTGTACACAACTGCACAGAAGCCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGATTCAACAGACCTTAATAAAATCTACCCTGTTGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAACGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTTAACAATGGTGTAGGTAGAACAATCAGGATTGCAGCAGCTAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACACACAGTTTTTCTGCTACTACTTCGTCTTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACACACTCTGTAAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAGCCACTCTATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCACAGCACTATTCCGGTGGTGGTGGTGGTTACATTGGTACAGGGCCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGGACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
57979da21ec843c4744db9e12da5397e1387dd196409143e356dbe5110d9e8fa
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3097
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome of Escherichia coli bacteriophage vB_EcoM_Alf5 Truncaite,L., Alijosius,L., Zajanckauskaite,A., Simoliunas,E. and Meskys,R. 2008-06 — GenBank