Protein

Genbank accession
AXY85477.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,79
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MIKNMITGSKGGSSKPHTPVEMEDNLISINRIRILLAVSDGEVDPDFSLKDLYFDDVPVMNQDGSLNFQNVKAEFRPGTQTQDYIQGFTDTASEITVARDLTAATPYIISVTNKNLSAIRIKILMPRGVTQEDNGDLTGVRVEYAVDMAVDGAEYKEVLHDVIEGKTMSGYDRSRRIDLPDFNDRVLLRVRRLTDSTSARVTDLIKMQSYAEVVDAKFRYPLTGLVYVEFDSELFPNALPNISIKKKWKIINVPSNYDPISRTYSGSWDGTWKKAWSNNPAFVLYDLITNQRYGLDQRELGIALDKWSIYECAQYCDQMVPDGKGGTEPRYLCDVVIQSQVEAYQLVRDICSIFRGMSFWNGESLSIVIDKPRDASYIFTNDNVVNGEFTYTFASEKSMYTQCNVTFDDEQNMYQQDVEGVFETEAALRFGYNSTSITAIGCTRRSEANRRGRWILKTNVKSTTVNFATGLEGMIPTVGDVIVVSDNFWSSALTLNLSGRLMEVNGLQVFTPFKVDARAGDRILVNKPDGKPVGRTIARVSDDGKTLTLNTTFGFDVQPDTIFAIERTDIAQQRYVVTGITKGDGDEEFTYNITAVEYDPNKYDEIDYGVNIDDRPTSIVQPDILPAPQNVKIESYSRVVQGASVETMHVSWDKVEYASLYEMQWRKDNGNWNNTPRTANKETEVEGIYAGNYHVRVRSVAANGSASGWSAIVSAGLTGKVGEPERPINLTASDNEVFGIRVKWGMPEGSGDTAYIELHQAPNGADGHPIVDEATLLTLVPFPQYEYWHSILPAGHVVWYKARAVDKIGNVSDWTDFVRGMASDDTSIITDHIKVDIENSDGYKWLQENAIKANDKIHSTAESVIENALANDKDVRRMRVENGKRKAEFLQSLKLIADETEARVTQVTQMSAQFDEKLTAQNSELREVIANSTETISQRIDQLTATFESEIDGVKQDIKAQITDVNQAITNEAEARASADRALSTQIGDTQSAVNQKLDSWVNGTSVGAMYGVKLGIRYNGQEYSAGMALSLVADGGGVKSQFLFDAGRFAIINNAQSGGFTLPFVVENNQVFINSLLVKNGSIGNAQIADQINSNNWQSGAAGWMINKNGYAEFNQITVRGTVYANAGSFTGNVYATDGWFRGTVYAEKIEGDVAKAVVLPFNGSVHIPAVNYNRHLVIPYVGIHGYTYSGGAWGGGTVWVDSTYGGRLANVQATAMHGGSSGYVLLPAGNATTLSYSGNLNHANAVPILTVLLFKA
Physico‐chemical
properties
protein length:1258 AA
molecular weight: 138867,65390 Da
isoelectric point:4,96565
aromaticity:0,09300
hydropathy:-0,31129

Domains

Domains [InterPro]
IPR053171
3–875
IPR053171 IPR015406
IPR055385
92–216
IPR055385 IPR032876 IPR036116
IPR013783
626–719
IPR013783
IPR003961
626–715
IPR003961
AXY85477.1
1 1258
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Citrobacter phage Sazh
[NCBI] 		2315629 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXY85477.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH729819 [NCBI]
CDS location
range 25433 -> 29209
strand +
CDS
ATGATCAAAAATATGATAACTGGCAGTAAGGGCGGTTCTTCAAAGCCTCATACACCTGTTGAAATGGAAGATAACCTAATTTCAATTAACAGGATCAGAATTCTTTTAGCCGTTTCTGATGGTGAAGTTGATCCAGACTTTTCATTGAAAGATTTATATTTTGATGACGTTCCGGTTATGAATCAGGATGGTTCACTAAACTTTCAGAATGTTAAAGCAGAATTCAGACCAGGGACGCAAACGCAGGATTATATTCAGGGGTTTACTGATACAGCCAGCGAAATTACAGTTGCTCGCGATCTGACAGCCGCAACGCCTTATATTATTTCTGTTACCAATAAAAACCTTTCTGCGATCCGTATTAAAATTTTAATGCCTCGAGGGGTTACTCAGGAAGATAACGGAGATCTAACAGGTGTTCGAGTTGAATATGCTGTTGATATGGCTGTTGATGGTGCTGAATATAAAGAGGTTTTGCATGATGTAATTGAAGGTAAAACAATGAGCGGTTACGACAGAAGCCGCAGAATTGATTTACCTGATTTCAATGATCGTGTTTTATTGCGCGTCCGTCGCCTTACAGATAGCACGTCAGCAAGGGTAACGGATCTGATTAAAATGCAAAGCTATGCGGAAGTTGTAGACGCTAAATTTCGTTATCCACTGACTGGTTTAGTATATGTTGAGTTTGACAGTGAATTATTCCCTAATGCGTTGCCGAATATCAGCATTAAGAAAAAATGGAAAATCATTAATGTTCCGTCAAATTATGATCCTATTTCCCGCACTTACTCAGGGTCATGGGATGGAACCTGGAAAAAGGCATGGAGTAATAACCCTGCTTTTGTTCTGTATGATTTGATTACCAATCAGCGTTACGGACTCGATCAAAGAGAATTAGGCATAGCTCTTGATAAATGGAGCATTTACGAATGTGCGCAGTATTGCGATCAGATGGTTCCAGACGGTAAAGGCGGAACAGAGCCGCGCTATCTTTGCGACGTTGTGATCCAGAGCCAGGTAGAAGCGTATCAGCTTGTGCGTGATATTTGTTCAATCTTCCGTGGCATGAGCTTTTGGAATGGTGAGAGCCTTTCAATCGTGATCGATAAGCCTCGCGATGCGTCATACATCTTTACTAATGACAACGTTGTTAACGGTGAATTCACTTACACGTTTGCCAGCGAAAAAAGCATGTACACACAATGCAACGTGACTTTCGACGACGAACAAAACATGTATCAACAGGATGTTGAGGGGGTTTTCGAAACGGAGGCGGCGTTACGATTTGGCTATAACAGCACGTCAATTACTGCGATTGGATGCACACGACGCAGCGAAGCCAACCGCCGTGGACGCTGGATTTTAAAAACCAACGTCAAGAGCACAACTGTAAACTTTGCTACAGGTCTGGAAGGTATGATCCCAACCGTAGGAGATGTGATTGTTGTATCTGATAACTTTTGGTCAAGTGCTCTAACGCTGAATCTATCAGGTCGCTTGATGGAGGTTAACGGGTTGCAGGTGTTCACGCCGTTTAAGGTTGACGCAAGAGCAGGTGATCGCATTCTGGTAAATAAGCCAGATGGTAAGCCAGTTGGTCGAACCATTGCGCGTGTAAGTGATGACGGTAAAACGCTAACGCTAAACACGACATTTGGCTTTGACGTTCAGCCGGATACCATTTTTGCAATTGAGCGAACAGATATTGCACAGCAACGATATGTTGTAACCGGAATCACTAAGGGTGACGGTGATGAAGAATTTACCTACAACATAACGGCTGTTGAATACGATCCTAACAAATACGATGAAATTGATTATGGCGTAAACATTGATGACCGTCCGACTTCAATCGTGCAGCCTGACATTTTGCCAGCACCGCAAAACGTCAAGATCGAATCTTATTCGCGAGTTGTCCAGGGCGCGAGCGTGGAAACAATGCATGTTTCATGGGATAAGGTTGAATATGCAAGCCTTTATGAAATGCAGTGGAGAAAAGACAATGGCAACTGGAACAACACGCCGCGCACAGCCAACAAGGAAACGGAAGTTGAAGGAATTTACGCGGGTAACTATCACGTAAGGGTTAGATCTGTTGCAGCTAATGGTTCAGCGTCTGGATGGTCAGCCATTGTAAGCGCCGGATTAACTGGCAAGGTTGGCGAACCGGAAAGGCCAATTAACCTTACTGCGTCTGACAATGAAGTTTTCGGAATTCGCGTAAAATGGGGTATGCCGGAGGGAAGCGGAGACACGGCCTATATAGAGTTGCATCAAGCGCCAAACGGTGCTGATGGTCATCCTATAGTTGACGAAGCAACGCTATTAACGCTTGTTCCGTTCCCACAATATGAGTATTGGCATTCAATACTGCCAGCGGGTCATGTTGTCTGGTACAAGGCAAGGGCAGTTGACAAAATCGGTAACGTTTCTGATTGGACTGATTTTGTGCGCGGCATGGCTTCCGACGATACGAGCATTATCACGGATCATATTAAGGTCGATATTGAAAATTCTGATGGCTATAAGTGGTTGCAGGAAAACGCAATAAAGGCCAATGATAAGATCCACAGCACAGCGGAATCAGTGATTGAAAACGCATTGGCGAATGATAAAGATGTGCGACGTATGCGAGTTGAAAACGGCAAGCGCAAAGCGGAGTTCTTGCAATCGCTGAAACTCATTGCAGACGAAACAGAAGCAAGGGTAACGCAGGTCACTCAAATGAGTGCGCAATTTGACGAGAAATTAACGGCTCAAAATAGCGAATTGAGAGAGGTAATTGCTAACAGCACTGAAACCATTAGCCAAAGGATTGATCAGCTTACAGCTACGTTTGAGAGCGAAATTGATGGTGTTAAGCAGGATATCAAAGCACAGATAACTGATGTTAACCAGGCAATCACCAATGAAGCGGAAGCGCGAGCGTCAGCGGATAGGGCGTTATCAACTCAAATTGGTGATACCCAATCAGCGGTTAACCAGAAACTTGATTCATGGGTTAACGGAACAAGCGTTGGTGCGATGTACGGCGTTAAGTTGGGGATCAGGTATAACGGGCAGGAATATAGCGCAGGCATGGCGCTTTCTCTTGTCGCTGATGGTGGCGGAGTTAAATCACAATTCCTGTTTGATGCTGGACGATTTGCGATCATCAATAATGCTCAAAGCGGAGGTTTTACACTACCGTTTGTTGTTGAGAATAATCAGGTGTTTATTAACAGCTTACTTGTGAAAAATGGCTCTATTGGTAACGCTCAGATTGCGGATCAGATTAACTCTAACAACTGGCAGAGCGGAGCGGCTGGATGGATGATTAATAAGAATGGTTATGCTGAATTTAACCAGATAACGGTAAGGGGTACTGTGTACGCAAACGCCGGATCATTCACTGGTAACGTTTACGCTACTGATGGTTGGTTTAGGGGTACTGTTTACGCTGAAAAAATCGAGGGTGACGTTGCGAAGGCTGTTGTCCTTCCGTTTAACGGATCGGTTCACATTCCGGCGGTTAACTACAACAGACATCTTGTGATCCCTTATGTTGGTATTCACGGGTACACATATTCAGGTGGTGCATGGGGCGGCGGTACTGTTTGGGTTGATTCAACATATGGTGGTCGCCTTGCTAACGTTCAGGCAACTGCAATGCATGGCGGATCAAGTGGTTATGTTCTGTTGCCAGCAGGTAACGCAACCACTCTTTCATATAGTGGAAATCTAAACCACGCAAACGCAGTACCGATCTTAACAGTTCTGCTATTCAAAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
904f63f9fda554f4de5b94b255bf80867e1752b46b2a8154446a1d33f57fce4b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7497
Evidence 0,7497
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of Citrobacter freundii Siphophage Sazh Crossland,W.L., Shaw,J.P., O'Leary,C., Gill,J. and Liu,M. 2019 31831614 GenBank