Protein
- Genbank accession
- AVP40516.1 [GenBank]
- Protein name
- putative tail tubular protein A
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MILEGVYPSFLKGVSQQTPQERSDGQLGAQLNLLSDAVTGLRRRGGVKFQTKLAGIPNSSYIRLIDINGVNYIMIVDTVTGTLKIYNFEGSLLKAHQTDYLKASNGKASIRSTVSRNNCFVLNTEQVITKTPTGGTNPIPNPSTMGYISIRSGQFSKMYSVDIKSGSYTLNFGVGTSGSEAWQATPEWVATEMESRIKADATLNARYDVVREGSTVALKAKSDTDTNLLVIESGTGSTYIQTSNSSRVQGKQDIIANLPNILDKYIIAVGTVGNSAYYQYNADSSTWKECGVYEEPYKFTNEPIYWYFDDTDTIQVKSLDIQPRAAGDDDNNPLPKFVDFSITGINAYQSRLVLLSGSYVNMSATADFNVYMRTTVEELQDDDPIEVSSTALSAAQFEYAVPYNKDLVLLAQNQQAVIPANSTVLTPKTAVIYPSSKANISMASEPQVVSRSLYYTYQRGTDYYQVGEMIPNAYSDAQYYAQNLADHIPLYATGVCTSITGSTTDNMAVFSSDQKELLIHQYLWAGEDRPLMSFHKWELPYDVLHVQFLQEYLVLFMDVGDDLVVGTINVQLNQLDNKPIPFLDIYQYVDIVDGEGTLPEFLPEGELVAAVYSSETMRHAMVQYEIEGTKIKCQFNGRIYLGVPYESSLTLTPPFVKDSRGRVVTGSNSIVVDLTMTFKGTGEFEYHVSDAYGDVFDGETSAQAWSEAQLGYTRVNTVSDVKFTCGTLLSSTEFSLRTTGTTELNIISTGYNIRVPNRGRRRL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 763 AA molecular weight: 84449,66620 Da isoelectric point: 4,80877 aromaticity: 0,10223 hydropathy: -0,24260
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
7–761
7–761
1
763
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage vB_AbaP_D2 [NCBI] |
2126803 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AVP40516.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH042230
[NCBI]
CDS location
range 34169 -> 36460
strand +
strand +
CDS
ATGATTCTTGAGGGAGTGTACCCGTCATTCTTGAAAGGTGTATCACAGCAAACACCTCAAGAGCGTAGTGACGGACAATTAGGCGCACAGCTTAATTTATTATCTGATGCTGTAACAGGTTTACGTAGACGTGGTGGGGTTAAATTCCAAACCAAGTTAGCAGGTATTCCTAATAGTAGTTATATACGTTTAATTGACATCAATGGTGTTAATTACATTATGATCGTAGATACGGTTACAGGTACTTTAAAGATTTATAATTTTGAGGGTTCCTTACTTAAAGCACATCAAACAGATTATCTTAAAGCCTCCAATGGTAAGGCTAGTATCCGTAGTACAGTCTCACGTAATAATTGCTTTGTATTAAATACCGAGCAAGTTATTACTAAGACACCTACAGGTGGTACTAACCCAATACCTAATCCAAGTACTATGGGTTATATTAGTATTCGTTCTGGTCAGTTCTCTAAGATGTATTCGGTAGACATCAAGTCAGGTTCTTATACCTTGAACTTTGGTGTAGGTACGTCTGGTAGTGAGGCATGGCAGGCTACTCCTGAATGGGTAGCTACTGAGATGGAGAGTAGGATTAAAGCAGACGCTACTCTTAACGCACGTTATGATGTTGTACGAGAAGGTAGCACAGTTGCACTTAAAGCTAAATCTGATACAGATACAAACTTACTAGTGATTGAGTCTGGTACAGGTAGTACCTATATTCAGACGAGTAATTCTAGTCGTGTACAGGGTAAGCAAGACATTATTGCTAATCTACCTAATATCTTAGATAAGTATATTATTGCAGTAGGTACAGTAGGTAATTCGGCTTATTATCAATATAATGCGGACTCTAGCACTTGGAAAGAGTGTGGTGTATATGAAGAACCTTATAAGTTCACTAACGAACCTATTTACTGGTACTTTGATGATACGGATACTATCCAAGTTAAAAGCCTAGATATTCAACCGCGTGCAGCAGGTGATGATGATAATAACCCATTACCTAAGTTTGTGGATTTCAGTATTACAGGTATTAATGCATACCAATCACGCTTAGTACTGCTTAGTGGTTCATACGTTAATATGAGTGCTACAGCAGACTTTAATGTCTATATGCGTACTACTGTAGAGGAATTACAGGATGATGATCCAATTGAGGTGTCTAGTACTGCTTTAAGTGCTGCACAGTTTGAATATGCTGTTCCGTATAATAAAGATTTAGTTTTATTAGCTCAGAACCAACAAGCTGTTATCCCAGCCAATAGTACTGTACTTACACCTAAGACGGCTGTTATCTACCCAAGTTCAAAAGCTAACATTAGTATGGCTAGTGAACCACAGGTTGTATCCCGTAGTTTGTATTATACATATCAACGTGGTACAGATTATTATCAAGTTGGTGAGATGATTCCTAATGCTTATTCAGATGCTCAGTACTATGCTCAGAACTTAGCAGACCATATTCCGCTATATGCTACAGGTGTCTGTACTTCAATCACAGGTAGTACTACAGATAATATGGCAGTGTTCAGTTCTGATCAGAAAGAGTTACTTATACATCAATATTTATGGGCAGGTGAAGACCGTCCGTTAATGAGCTTCCATAAATGGGAATTACCTTATGATGTACTTCACGTACAATTTCTACAAGAGTATTTAGTATTGTTTATGGATGTTGGTGATGATTTAGTGGTTGGTACTATTAACGTACAGTTAAACCAACTAGACAATAAACCTATTCCATTCTTGGACATTTACCAATATGTAGATATTGTAGACGGGGAAGGTACACTACCTGAGTTCCTACCAGAAGGTGAGTTAGTAGCTGCGGTATACAGTTCTGAGACTATGCGTCATGCTATGGTTCAATATGAAATCGAAGGTACTAAGATTAAGTGTCAATTCAATGGACGTATTTATCTAGGTGTACCTTATGAAAGTTCACTCACACTAACACCTCCTTTTGTTAAAGATAGTAGAGGTCGAGTAGTTACTGGTAGTAACAGTATAGTTGTCGATCTTACAATGACATTCAAGGGCACAGGTGAGTTTGAGTACCATGTTTCTGATGCTTATGGTGATGTGTTTGATGGTGAAACGTCTGCACAAGCTTGGTCGGAAGCACAACTAGGGTATACGAGAGTAAACACAGTAAGTGATGTTAAGTTCACATGTGGTACGCTATTAAGTTCAACAGAGTTTAGTCTTAGGACCACAGGTACGACGGAACTAAATATTATTAGCACTGGTTATAATATCCGTGTACCAAACAGAGGACGGAGACGTTTATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
8e5f6f92f8e3089706edd17141ac75cef4e34e74ff1f9e2a40f03f3657d6719f
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Characterization of Acinetobacter baumannii bacteriophage vB_AbaP_D2 | Yuan,Y. | — | — | GenBank |