Protein
- Genbank accession
- AOO12220.1 [GenBank]
- Protein name
- putative short tail fiber
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MPYQFSASPLYVEEGQSIQFRYEAPPLFNDITQVKIEIGELTVFWIIETKLEDFEPDPFFLRNVDDAEPDTLLTYAATTDPDNGVAYTGLASDPDPLREGEEVITITGLDPGTQAPLIVSSNVIDVNDWSYRLRLYNEGSSSYGAWGAWTRALNNTVSNLDQIQVRLVSSSSPSDTKNVVVTVGTGSATWDVTTGAIPVNTPNPAPDFGSLNNLPLGQLVYSDIAQILGLTTSAIISVDNGADIAVSNFNTTFTNADGYEVLNNISSVWGNNLTVSNGQYVQLRGTSSATPTATINFSVTVGDGAGISVWQITSGQGIDDNPTNFVFQDLVGQIPGQTGLRSETASGSSTSVAGRNVALVGGLDAGLFVPVTVRPADTNIVPKISINGGSSGLINNVTVQNGDTIELVVDNSTDITNPVIPGQGVVTVGINVGNRFIQTWTVANWTGPDTIPAFTPINQVINRTPGGASIIGPIGLTDFNLPITISATNPESFNEFNFATNENIGDVLFSINGDSATVGPRTVNPDPGGDPVFITIIMQQPGNADLDPVQGLSNYGQTVITFGDASPFQLRSINYAVKPIPPAYLGVWYSEKNAYFDDTAWAAAGEDPNNARDYYRAPKFDGYSIGTVVPITKETPLNDGNFGYGDIEERYPGFLPCDGATFAAADYPWLWEAIGNTYGGNGAYIPATKSYTGNFNVPDYRNVRMVGAGIVDSNRGSSSFVPVTSAGGSFELTGSTGGYWYVDDVDVAGPDPLEQVVAPAGSSDGIESEYFTLGTPRTFGTEELEADVEFTVTGEVVANIGPVSDVSVRPPQHEHELISGQIDSDDGDPLIPWGTRAYYGTSASGSQNWSGRPDSDTDAVDDGYWEDAGFWNFGNFESEVENSGRGSLLDLLPGRGSSSVAFGNYWGSPFSEISSLSDDYFTKNGSPGNGDCGVIDTEATRARIDNYLSIYTGTLNHSHLLGTDPVTNPQTDFSYGNVNSDATAFRQGLATFNSTFALKFTQNASTDGGAGVDIELNPATFSWNNTSKPIPTAAMNPQRKVPIIAPFHKVKYIIKAY
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1057 AA molecular weight: 112563,03230 Da isoelectric point: 4,06424 aromaticity: 0,10123 hydropathy: -0,21391
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Cyanophage S-RIM44 [NCBI] |
1278485 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO12220.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349294
[NCBI]
CDS location
range 41951 -> 45124
strand +
strand +
CDS
ATGCCATATCAGTTTAGTGCCAGTCCGCTGTATGTTGAAGAGGGACAGTCTATCCAGTTTCGTTACGAAGCTCCTCCTCTGTTCAACGATATTACTCAAGTCAAGATTGAGATTGGCGAGCTTACTGTCTTCTGGATTATTGAGACTAAACTAGAAGATTTTGAACCTGATCCGTTCTTCCTTAGAAATGTTGATGATGCAGAACCCGATACTCTATTAACATATGCAGCAACAACAGATCCTGATAATGGTGTTGCATATACTGGACTAGCAAGTGATCCTGATCCACTAAGAGAAGGTGAAGAAGTTATTACAATCACTGGTCTTGATCCTGGAACACAGGCACCATTGATTGTTAGTTCCAATGTTATTGATGTAAACGACTGGTCTTATCGTCTAAGACTATACAACGAAGGATCCAGTAGTTATGGTGCTTGGGGTGCATGGACTAGAGCACTTAACAATACCGTATCTAATCTTGACCAGATTCAGGTCAGACTAGTATCTTCTTCTTCACCATCAGACACAAAGAATGTTGTTGTTACTGTTGGAACAGGTTCTGCTACTTGGGATGTTACAACTGGTGCAATTCCAGTCAACACACCAAATCCAGCACCAGATTTTGGTTCGCTAAACAATCTACCACTAGGACAACTTGTATACAGTGATATTGCACAAATTCTAGGATTAACTACTTCTGCTATCATTAGTGTTGATAATGGTGCAGATATTGCAGTATCTAATTTTAATACTACATTTACTAATGCTGATGGATATGAAGTTCTGAATAATATTTCAAGTGTTTGGGGCAACAACCTGACAGTAAGTAATGGTCAGTATGTTCAGTTAAGGGGCACATCATCAGCAACACCAACAGCAACTATTAACTTCAGTGTTACTGTTGGTGATGGTGCTGGTATTTCTGTATGGCAGATTACATCTGGACAAGGTATTGATGATAATCCAACTAATTTTGTATTCCAAGATCTAGTTGGTCAGATTCCTGGACAAACTGGTCTTAGATCAGAAACTGCATCAGGTTCTTCTACATCAGTTGCTGGCAGAAATGTAGCACTGGTTGGTGGACTTGACGCTGGACTATTTGTTCCTGTTACAGTCAGACCTGCTGATACTAATATTGTTCCTAAGATTAGTATTAATGGTGGTTCTTCTGGTCTCATCAACAATGTCACAGTTCAGAATGGTGATACTATCGAACTGGTTGTTGATAACTCTACAGATATCACTAACCCTGTAATTCCTGGTCAAGGTGTTGTTACTGTTGGTATTAACGTAGGAAACAGATTTATTCAGACATGGACTGTAGCAAACTGGACTGGTCCAGATACTATTCCAGCATTCACACCTATCAACCAAGTTATCAATAGAACTCCTGGTGGTGCTAGTATCATTGGTCCTATTGGATTGACTGACTTCAATCTACCAATCACTATTAGTGCAACAAATCCTGAATCATTTAATGAATTTAACTTTGCTACCAATGAGAACATTGGTGATGTTCTATTCTCAATCAATGGTGATTCAGCAACTGTAGGACCACGAACAGTTAATCCTGATCCTGGTGGTGATCCTGTATTCATTACCATTATTATGCAACAACCTGGAAATGCAGATCTTGATCCTGTTCAAGGACTCTCCAATTATGGTCAGACAGTGATCACATTTGGTGATGCATCTCCATTTCAGTTGAGATCTATCAACTATGCTGTTAAACCTATCCCTCCTGCATATCTTGGTGTGTGGTATTCTGAGAAGAATGCATATTTTGATGATACAGCATGGGCAGCAGCAGGAGAAGATCCTAACAATGCTAGAGATTACTATAGAGCACCTAAGTTTGATGGTTACTCTATTGGAACTGTTGTTCCCATCACTAAAGAAACACCACTAAATGATGGTAACTTTGGTTATGGTGATATTGAAGAAAGATATCCAGGATTCTTACCATGTGATGGAGCAACCTTTGCTGCAGCAGATTATCCTTGGTTGTGGGAAGCAATTGGTAACACATATGGTGGCAATGGTGCATATATTCCTGCAACTAAATCCTACACTGGAAACTTCAATGTTCCAGACTATCGTAATGTTAGAATGGTAGGTGCTGGTATCGTTGACTCTAATAGAGGATCATCTTCTTTTGTTCCTGTAACAAGTGCTGGTGGTTCATTTGAACTGACTGGATCAACTGGTGGTTACTGGTATGTTGATGATGTTGATGTTGCTGGTCCAGATCCACTAGAACAAGTTGTTGCACCTGCTGGATCTAGTGATGGTATAGAATCAGAATACTTTACACTAGGAACTCCAAGAACATTTGGAACTGAAGAACTAGAGGCAGATGTTGAATTCACTGTCACTGGTGAAGTTGTTGCTAACATTGGTCCTGTTAGTGATGTTTCTGTTCGTCCTCCACAGCATGAACATGAATTGATTAGTGGACAAATTGATAGTGATGATGGTGATCCACTCATTCCATGGGGCACTAGAGCATACTATGGCACATCTGCTAGTGGTTCACAAAACTGGAGTGGAAGACCTGATAGTGATACAGATGCTGTTGATGATGGTTACTGGGAAGATGCAGGATTCTGGAACTTTGGCAACTTTGAGTCAGAAGTTGAAAACTCTGGTAGAGGATCACTTTTAGATCTGTTGCCTGGTAGAGGTAGCAGTAGCGTAGCATTTGGTAACTACTGGGGTTCACCATTCTCGGAGATCAGTAGTCTAAGTGATGACTACTTCACTAAAAATGGTAGTCCAGGTAATGGTGACTGTGGAGTTATTGACACAGAAGCAACTCGTGCTAGAATAGATAACTATCTGTCTATCTACACTGGCACACTAAATCACTCTCACTTACTAGGAACTGATCCTGTTACTAATCCACAAACTGACTTTAGTTATGGTAACGTCAACTCAGACGCTACTGCATTCAGACAAGGACTAGCAACATTCAACTCTACATTCGCACTTAAGTTTACTCAGAATGCATCGACAGATGGTGGAGCAGGTGTTGATATTGAGCTCAATCCAGCGACATTCTCATGGAACAATACCAGCAAACCAATTCCTACTGCTGCTATGAATCCACAGCGCAAGGTTCCTATCATTGCACCATTCCACAAAGTTAAATATATAATTAAGGCATACTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
b954de478cb56d553e7ea07be6b38c57e66565447ed89f13ceeeb6374c21cbf2
Literature
No literature entries available.