Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D8KPT6 [UniProt]
- Protein name
- Baseplate wedge initiator
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MIDTSFQKVQVNQVIFSQLPSFVQEENPLFVDFLKTYYLGEEYQGGNIDITQNFNDYQKVETFSGNENLVGFTTCTSKVNFFDSTIEVVSTDGWPEKYGLLKINDEIISYTGKTKTSFTGCLRGFSGVESLHSKSDPEQLVFSKTFAATHKIQTQVINLSNLFLQEFWQNLKNLFLPGFEDRKIINPVDKANFLRQAKDLFASKGTSNAIEILFRVLYGKDSEVIKPIDYLFAPSDADYIKTTDVVAELISGDPTKIAGQELRQTGDNFTSASIFDVKFASRNNRSYYQISLSKETLKGNFKITGSSSLTNNVSIGDTVLTVDSTLGFEDSGEIYVGAGLTVGIVTYTNKSSTQFFDVVGLSSSYSDGQFVRSSNTVFSYENGDISKPVVFRLTAVATGSPLQDVGYLVKNDILKGKTLGNLSLASNQRLNTWVHNIKTTTDVSKDIRTNISNIDIVTNTVNTKDPHLLKFGDPITLVDLTSNIPQNVEGTVSQVVSANVFQLNIISGTIDVGRTYKVRSNTIFASHNDSNVKVDEFVAEVQNTYIDKTDENVYVASGSLPAYKIYATNRKKTFFNSDINSDTGSINIVSHGFITGDLIKYSPVSVGQSALPGLSTNTDYIVSKVDSDNIKLSRSSSDAVNKRYINIQPNDVINHQVLPTELFKKDIKHQNFLRRFPKTPTLNKFKEVFLNEPIGMFKNGVEIVSNRSGDFIRYGIVKNIEVQNGGSNFDLVSPPNINISDSVGTGATAYAIIENGKFEGIEVVSAGYDIKKTPNVVITGGNGNGATAVARLKESKTTRTFNAESDVNITIHAVTFVDRHLFDNGESVYYKKADDYDPIGGLVDNSLYYLNVVDDFTVKFMSSYEDAVAGINPIVLTSKSTGTNSLQSTKIRKVLGSIVVTDPGSGYSNRRLEVSSSPYPSTDYTTVDDIVSGINTANNYVYFKQHGFNDGDLIEYHSSGPISGLSTTQNYQVLKLDEDRFRVCSAGIGTTSSNLNYRKLDYVKFDNNGTSTHTFKYPDIHVSVETISGVANTAYSQPRVRPLCRGEIVQCPLIAPGVGYGSSDVINVHRRPNVQVSNGSNGVLDVFVDNGKIVQCFIVNAGGGYVTPPEVIINGDGKYAKIITNITDGKISSVTIVDTGKGYTSQNTTISLRSPGFGAKLEANVDKWDIDIFSKYRNSISENDDGLILPSQNDDYGAKFVHAYAGRKLRFDFNDNIQNDFSERPTVNHSPILGWAYDGSPIYGPYGHGFKTGGAIRRMIPGYTLVSKGNRPPVSLFPLGYFINDYIFTNDGDLDEFNGRFCKTPEYPDGVYAYFCTIQATNSSKFPFVNTREPAFPYVLNNFKYKKDSFNQDPSSIQSLPILNSGDLIRNTYNYKFGFANSNYDYLTTNQVDETQLIVRTTVESGISTINIVSPGENYKVNDKIRFNNLNSGGSESTAKVKTLVGSGLSSLSYEREVVSDIEFLYGDRNVVGVATTAHNLSNNDLVIVGGIGTGELKFIQGPRTIAVSSITGVLQQNLGPVSDTGITTTILLSVPSSDSDSIDVDDIISIGTDERVIVLEKLPFDGRYRISRPPGYAGTHFSGELVHVDQRKFSYDVGINTDLKTQQNRKIVFNPVSSIGIGTTVIVKSIAGIGTTTAIRVKSLNDIILEGHELPPEGSDADNTITINSHGFRTGQRLTYNIGRAGIALTVSNSVSLSNPFQLVDGQYVYAVNKGTNLLGITTTITGIGTTSASLYFTGITTTGTEHFFKESNKDYTGHVERYDVTVVTNFEHTLKSRDNVKIDISPNTTVSKTIEFNTIARKTLVDGYYVSAASTFIGVGATNSVITITDHEFVPGQKLLYEAGSSEISPLVNNGEYFAQVINDNQFRLSTNYKDATSFGGNFIGITTFGVGVHKFSAINPHIVATRGQTIGFAVSDNSLNDLKLEFYEDENFVTKYDGAGVSTEITRSTAVPGSNGSLVNLKLTENVPTPLYYKLEPTNLDGTSVSKRDANPDNTVAAGSKIIINNSVYSGTFSISTTGTNTFQYQVDKKPESEIYTSSGINTFRYITDSKTARGGINEIKVTFGGVKYRRNPGISTIITDTGKNAILRIYDDSIGRPANTEMLSVGYEYPSDRSLQPSVDLPTIVTISNNFALNSVGVTSGGKNYINAPELIVPGAEDIDLTAVLSGTSVGEVIVNRSGKGFNEVPNPPRIIPVRNSNGIGIVSTSSNGETNTLILAQPLNGWTPNTFPFSINDRIFVEGVGTAQTVFATTGGYNSENYNYSFFTVNSISPLTSKLTYSIAGLGTTGGTYDPDTSAGRVIKQSDLPTFTGGLNPEPFFEGEKITFGSNGTGFVLDQDGYDNVTNTLRLRSLSTPIRNGDVIRGTLSRAVGTVRNFEAYSDFFNTNFGAEKEKGFQKNTGKLNDDFQKLEDSDYYQNFSYSIKSEVPIETWKSAVDSIVHPTGYKNFSDLVVKSQSTAGFARSLDLKPENLVSDTSLLVSIDNEKSFFTRDDFDLAGETLITEDISKFIDLRNRKIASFINVISNKVDIIDDIAPQFTGIGTTTSAEIVGLSSFRLTSSNEVLFTKIFDPSDTDVVSLGSSVIRINNHNFQTGERIKYDPGGAYGNNRIGIDTTSNVLGGISTDKMPAEVFAIKLNNNFFSVAGVSTAADLNDPLVIIGVGTGTEHSFDVLRPDDRVIIEIDEIIQPPLFRKRIDIELAEAVGIGSTTIKVVGVTSMSASDLINIDNEILEITNIGIGSTNSINVNRGVLGTVAAAHTIGAACTARGGSFHIVKDVIHFVTPPYGPTGFSTLSPGIGTQSSFQGRLFNRKNPTTNFIFDDISPDFIGIGKTYTLLQEGQPVSGIVTTISGPEVVNQGIILIDNITQRPTIDFNMIQAQDPGIGGSIIFTGSNRDNLPKGGIVNEFTIGIGSGYQPLVAAAATAVVNGAGSIESVVVTGGGSGYRSGPVPIQVLNPLGIGSTAVLQGTIGAAGTVTGITTVSGGSGYASTTPPIIVIGIDTGYSNMSYTGGSGNGFKASVVVGSGGSIIDLQVTDFGIGYKNNEVLTVAGIPSDAVGAAFSSHTITINSLKFDKFAGFSFGQLLELDDFSNLFNGVRDTFTLTRTTLDKRIININTEESNVYVANNLLIFLNDVLQQPGQAYQFEGGTQVTFTEPPKAGSKLQILFFRGSNEDIDDGDPFSTIKIGDFLQLQRKDASLQQNQRPIIGISGVSQTETILYAGKGINDDPKFTRSLSWTKQKQDFNVDGQSLSKARANDRAQIQPTASIIVDVGVGSEIIYVDNAFPLFSAYDNRSIPNQVPIGGVQLLRYNDIERADGVVSVSAGGTVSIGTVTDPGRGYQSVPKVAFASTIEQIREIGKTWTKRSSYIDVEYQSIDRNSFGLFVAVGSTTGINTSTDAITWRDSGNSTIFGDLNGVVGMTTHTVIVGASGTVGYSTDGRNYQPSKLFRRRNVFPLILFDDITVTQDFNDVTFGQSVGVAVGAAGTIAFTNAGAAGFGTAFEVTQKYSSINLNGVGANQNVFVAVGENGTILRSNNGESWTGVSTSSVTTNLNHVHYANGQWIAVGVAGTIVRSSDNGLTWNIVSAGSTFDLNRVGYANSVWVAIGQSGMVLNSVDTNTWYKKFVGVGTDFNGLAFGDNKLVTVGLSSNIYSSQFETVSAAGTATVSAAGTISAININEGGFGYNPYNPVEVIIEYEPIVRETITSVEVEGDYGDVVSVASSTTGIGTDSPMLIFELDSDSFLDQAAFGDISKSGIGSNQYFVITNSVTGAPTTSITDTGSSIGVGKSFLDNVYFVSQRDFSNSGIVTVFCNVESIAGIGTTDFAPRIGKYSWGRLFNYQRDRLNPKSFPAEIGNGIAGLSTSSTATRRSQIAENYNDLDQTS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 3884 AA molecular weight: 419186,80830 Da isoelectric point: 5,07489 aromaticity: 0,09423 hydropathy: -0,16861
Domains
Domains [InterPro]
DC_1555
ATT
8–258
ATT
8–258
IPR025924
STR
1227–1321
STR
1227–1321
1
3884
Architecture
ATT 8-258 | ATT 281-376 | ATT 410-891 | STR 1062-1405 | ATT 2685-2777 | STR 2822-3800 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-CAM9 [NCBI] |
1883369 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Kanaloavirus > Kanaloavirus scam9 |
| Host |
Synechococcus sp. [NCBI] |
1131 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV60219.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686204
[NCBI]
CDS location
range 52869 -> 64523
strand +
strand +
CDS
ATGATCGACACTAGTTTCCAGAAAGTACAAGTCAATCAGGTAATTTTTAGTCAATTACCATCTTTCGTACAAGAAGAAAATCCTTTATTTGTCGATTTTTTAAAAACTTACTACCTTGGTGAAGAATATCAAGGTGGTAATATTGATATCACTCAAAATTTTAATGATTATCAAAAAGTAGAGACTTTTAGTGGTAACGAAAATCTAGTTGGTTTTACTACTTGCACTTCAAAAGTTAACTTTTTTGATTCTACTATTGAAGTGGTTTCTACTGATGGTTGGCCAGAAAAATATGGATTGTTAAAAATAAATGATGAGATCATTTCTTATACTGGAAAGACTAAAACGTCGTTTACAGGGTGCCTGAGGGGGTTCTCAGGAGTAGAATCTCTTCACTCCAAGTCGGACCCAGAACAACTAGTATTTTCAAAAACTTTTGCAGCTACTCATAAAATTCAAACTCAAGTAATTAATTTAAGTAATCTCTTTCTCCAAGAGTTTTGGCAAAATTTAAAAAACTTATTTTTACCTGGATTTGAAGATAGAAAAATTATCAACCCAGTTGATAAAGCTAACTTTTTAAGACAGGCTAAAGATCTTTTTGCATCAAAAGGAACTAGTAATGCTATTGAGATTCTTTTCAGGGTTCTTTATGGTAAGGACAGTGAGGTTATTAAACCCATTGATTATCTTTTTGCTCCTTCTGATGCCGATTATATAAAAACTACAGATGTTGTAGCAGAATTGATCAGTGGTGATCCCACTAAAATTGCAGGTCAAGAACTACGTCAAACTGGAGATAATTTTACATCTGCATCAATTTTTGATGTGAAATTTGCTTCAAGAAATAATAGATCTTATTATCAAATAAGTCTTAGTAAAGAGACTCTTAAGGGTAATTTTAAAATTACAGGTAGTTCATCTTTAACCAATAATGTTTCTATTGGTGATACTGTTTTAACAGTTGACTCAACTCTTGGTTTTGAAGATAGTGGTGAAATTTATGTTGGAGCTGGATTAACTGTTGGAATTGTTACTTATACAAATAAATCTTCTACTCAATTTTTTGATGTAGTTGGTCTTTCTTCTTCATATTCAGATGGTCAATTTGTAAGATCTTCCAATACTGTATTTTCTTATGAAAATGGAGATATTTCCAAACCAGTAGTCTTTAGACTTACTGCAGTTGCAACTGGATCACCGTTGCAAGATGTTGGTTACTTGGTTAAAAATGATATCTTAAAAGGTAAAACTCTAGGTAATCTAAGTTTAGCTTCTAACCAGAGACTTAATACATGGGTTCATAACATTAAAACCACAACTGATGTTTCTAAAGATATTAGAACAAATATATCAAACATTGACATTGTAACAAATACAGTAAACACAAAAGATCCTCATCTTTTAAAGTTTGGGGATCCTATCACGTTAGTAGATTTAACTTCAAACATTCCGCAAAATGTGGAAGGTACAGTATCTCAAGTAGTGTCTGCAAACGTTTTTCAACTTAATATAATTTCAGGGACAATTGATGTTGGAAGAACTTATAAAGTAAGGTCTAACACTATTTTTGCATCTCATAATGATTCTAATGTAAAAGTTGATGAGTTTGTTGCTGAAGTTCAAAATACTTATATTGATAAAACTGATGAGAATGTATATGTAGCTTCTGGTAGCCTTCCTGCATATAAAATATATGCAACAAATAGAAAGAAAACTTTCTTTAATAGTGATATTAATAGCGACACTGGTTCTATTAATATTGTAAGTCATGGATTTATAACTGGTGATCTTATTAAATATTCACCAGTTTCAGTAGGACAAAGTGCTCTACCTGGTTTATCTACAAATACTGATTATATTGTAAGTAAAGTTGATAGTGATAATATTAAATTATCTAGAAGTAGTAGTGATGCTGTCAACAAAAGATACATTAATATACAACCTAATGATGTAATAAATCATCAAGTTTTGCCTACAGAATTGTTTAAGAAGGATATTAAACATCAAAACTTTTTAAGAAGATTTCCAAAAACTCCAACTCTTAATAAATTCAAAGAAGTATTTTTAAACGAGCCAATTGGTATGTTTAAAAATGGAGTTGAGATTGTATCTAACAGATCTGGTGACTTCATTAGATATGGAATTGTTAAAAATATTGAAGTTCAAAATGGTGGGTCTAATTTTGACCTTGTAAGTCCTCCAAATATTAATATTTCAGACTCTGTAGGTACTGGAGCAACAGCATATGCAATTATTGAAAATGGTAAGTTTGAAGGTATTGAAGTCGTATCTGCTGGATATGATATTAAAAAAACACCAAACGTTGTAATTACAGGTGGTAACGGAAATGGTGCAACTGCAGTAGCTAGACTAAAAGAATCAAAAACAACCAGAACTTTTAATGCTGAAAGTGATGTAAATATCACAATTCATGCAGTAACATTTGTCGATAGACATTTGTTTGATAATGGAGAATCAGTATATTATAAAAAAGCTGATGATTATGATCCTATTGGTGGTCTTGTAGATAATTCTTTGTATTACTTGAATGTAGTTGATGATTTTACTGTCAAATTTATGTCTTCCTATGAAGACGCTGTTGCAGGTATTAATCCAATTGTATTGACTAGTAAATCTACAGGTACCAATAGTTTACAATCCACTAAAATTAGAAAAGTTCTTGGATCTATTGTTGTCACCGATCCTGGTTCTGGTTATTCAAATAGAAGACTTGAAGTCTCTAGCTCACCATATCCATCTACAGATTATACAACTGTAGATGATATTGTTTCTGGAATCAATACAGCTAATAATTATGTCTACTTTAAACAACATGGTTTTAATGATGGTGACCTAATTGAATATCATTCTTCTGGTCCTATTTCTGGACTGTCTACCACTCAAAACTATCAAGTTTTAAAACTCGATGAAGACAGATTTAGAGTGTGTTCCGCTGGCATTGGAACTACGTCATCAAATTTAAACTACAGGAAACTTGACTATGTGAAATTTGATAATAATGGAACATCTACACATACATTTAAGTATCCTGACATACATGTAAGTGTTGAAACTATTAGTGGAGTTGCTAATACAGCCTATTCTCAACCAAGAGTAAGACCTCTTTGTCGAGGTGAAATTGTACAATGTCCACTTATTGCACCTGGAGTTGGATATGGATCCTCAGATGTAATTAATGTACATAGAAGACCAAATGTTCAGGTCTCTAATGGATCTAATGGTGTTTTAGACGTTTTTGTTGATAATGGTAAAATCGTTCAGTGTTTTATTGTAAATGCGGGTGGTGGATATGTTACTCCACCCGAAGTGATTATTAACGGAGATGGAAAATATGCAAAAATCATAACCAATATAACTGATGGTAAAATTAGTAGTGTTACTATTGTAGATACTGGTAAAGGTTATACATCCCAAAATACTACAATTTCCTTAAGATCTCCTGGATTTGGCGCAAAATTAGAAGCTAATGTAGATAAATGGGATATTGATATTTTCTCAAAATATAGAAATTCTATTAGTGAAAATGATGATGGACTTATTCTTCCCAGCCAAAATGATGATTATGGGGCAAAGTTTGTTCATGCATACGCTGGTAGAAAATTAAGATTTGATTTTAATGATAATATTCAGAATGATTTTTCGGAAAGACCTACGGTAAATCATTCTCCTATTTTGGGGTGGGCCTATGATGGATCTCCAATCTACGGACCTTATGGACATGGATTTAAAACGGGTGGTGCAATCCGAAGAATGATTCCTGGATATACACTCGTTTCAAAAGGAAACAGACCACCAGTTTCTTTATTCCCTTTAGGATATTTTATTAATGATTATATCTTTACCAATGATGGTGATCTTGATGAATTTAATGGAAGATTCTGTAAAACTCCAGAATATCCTGATGGTGTTTATGCATATTTCTGCACAATTCAAGCTACCAATAGTTCAAAATTCCCATTTGTAAACACAAGAGAACCTGCCTTCCCTTATGTTCTGAATAACTTTAAGTATAAGAAAGATTCGTTCAATCAAGATCCTTCTTCTATTCAATCTCTTCCTATTTTGAATAGTGGAGATTTGATTAGAAATACGTATAATTATAAGTTTGGATTTGCAAATTCTAATTATGATTATCTTACAACAAATCAAGTTGATGAAACTCAGTTAATTGTTCGTACCACGGTTGAATCTGGTATTTCGACAATTAATATTGTTTCTCCTGGTGAAAATTATAAAGTAAACGATAAGATAAGATTTAATAATTTAAATTCTGGTGGATCAGAATCAACTGCTAAAGTAAAGACACTTGTTGGATCAGGATTGTCTTCACTTTCTTATGAAAGAGAAGTTGTTTCTGATATCGAATTTTTATATGGTGATAGAAATGTTGTTGGAGTTGCAACTACGGCTCATAACCTATCAAATAATGATTTAGTAATTGTTGGTGGCATTGGTACAGGCGAACTTAAATTTATTCAAGGTCCAAGAACAATTGCAGTTTCTTCAATTACTGGAGTACTTCAACAAAATCTTGGACCAGTCTCTGATACTGGAATTACAACAACAATTTTACTTTCAGTACCATCTTCAGACTCAGACTCCATTGATGTTGATGATATTATTAGTATTGGTACTGATGAAAGAGTTATTGTATTAGAGAAATTGCCATTTGATGGCCGTTATAGAATCAGTAGACCACCTGGATATGCTGGTACTCACTTTAGTGGTGAACTTGTTCATGTCGATCAACGTAAATTTAGTTATGATGTTGGAATTAATACAGATTTAAAAACTCAACAAAATAGAAAAATTGTTTTTAATCCAGTATCATCAATTGGTATTGGAACAACGGTAATTGTAAAGAGTATTGCGGGTATTGGAACTACCACAGCAATTAGGGTCAAGTCTCTTAACGATATTATTCTTGAGGGTCATGAGTTACCTCCAGAAGGTTCTGATGCAGATAATACAATCAC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Genbank protein accession
AOV60675.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686206
[NCBI]
CDS location
range 52887 -> 64541
strand +
strand +
CDS
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Genome Context
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Tertiary structure
PDB ID
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Model Confidence
Very high
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High
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Low
70 > pLDDT > 50
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Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50