Protein

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Genbank accession
QSL99531.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,69
Protein sequence
MSKARDLADFISTGSILSDGTIESTEISGVTATANEINTLDGITATTEELNNVAGVNSDVQTQLDGKQAIVAGVSGTEIGYLDGVTSNLQTQLDNISVTSGSLTKSFTSGETASITLAQAISPAPVVSVTKEVSQAGISSKGAWDVNATASNYELHNTAYATTLTPSNVTDFSTISYNNAVHYTNDSTTTGVYLSSDGYHLFYIGGVTDTIRRHDLSTAFDISTTGSQVSSFSIGSQDTEPGQVWFKPDGTKMYMAGYENNSVYQYSLSTAWDLTTASYDSVSFSVASQVTLVVGMAFNDDGTKMYVCCTTNNAAYQYSLSTAWDLSTASYDSKSVSLNSTPNGIAFNDDGSIFFHITAGTDTLYWASLTTAYDISTLDNSTYQSFSMNSQDSNARDIFIVESQLKAYMAGNTNDGIFEYTYSSTDVLTLGTGSFASTDVGKRIQGNGGDVTLTSTAGAYDTTGGSAFTDSSTIASGSWTMRGLKSAGDADGIGFAGFANFYDIANASGIQTYSGTSSYMDYPSGLTLKPDGTSFYYADRDSTRRTVYEFNMSTPYDLSSAVVWNTASSVASYTNTPTDVKFSSDGTRMYVIDEYNNNILQFTLSTPWNIGTASYDRDDAAGSAPTGLFFKPDGTKFYISNSGDQISEYHMTTPWSIATAPSTPSIQYNTFLTGDSNIAFSSDGTKLFKSLYNTKVVHQFNLTTAWDISTASNSGITFDTSNDITTLAGIFFDPDGSYLYALDYTHQNINRYSVGSFSLPTSQYHIGVTNSGGQIDTALWTDINSMTADQAAGDGTVHYAVSTDDRTTWSVAKASDGVRPIVRDNSGTWQYNSDAGSLTGAYDLSTAVLNQSKDISSDTPDPYGIIFKPDGTKMFVLDDGFAAADDVLEYGLSTAWDVSTATFTQAYRLLSSEAAVQGMDFKSDGTQVYIVGSITDAVYAYDLSTAWDISTASYNSVNFSTASQTTTPFAVKFKSDGAKMYVIGSAEDTIYEYDLSTSWDVSTASYNNVSYYFNPQVAAAKNLTFNSTGTKLYLAGSGDVYEYNLSTAWDLSSISYSNVNFSVSESDGITFKPDGTKMFMCGSSNDLVVEYDIGSIGYGTATTWTNATTNDEFYALQQALGAQAFNRMDKTQLDAVADGSHFTLGDTLDLAIALRLDTASASTPKSDGVSINYDAQALNQGAVLGTDYDYDFPDSTTVRVTSNAAQNLKIRVV
Physico‐chemical
properties
protein length:1213 AA
molecular weight: 129785,43770 Da
isoelectric point:4,11471
aromaticity:0,11624
hydropathy:-0,23372

Domains

Domains [InterPro]
IPR015943
STR
127–469
IPR015943 IPR015943 IPR015943 DC_1851
SSF75011
STR
181–607
SSF75011 SSF75011
IPR051200
Unmapped
576–1003
IPR051200
SSF63829
STR
778–1006
SSF63829
QSL99531.1
1 1213
Architecture
STR
RBD
STR 127-1116 | RBD 1117-1213
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Roseobacter phage CRP-13
[NCBI] 		2813173 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Rhodobacteraceae bacterium
[NCBI] 		1904441 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Rhodobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QSL99531.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW514247 [NCBI]
CDS location
range 26053 -> 29694
strand -
CDS
ATGAGTAAGGCAAGAGATTTAGCTGATTTCATCTCCACTGGGAGTATTCTCTCTGATGGAACTATTGAGTCTACTGAGATCAGTGGTGTTACCGCTACAGCTAACGAGATCAACACGTTGGATGGCATTACTGCTACAACAGAAGAGTTGAACAACGTAGCAGGGGTTAACTCTGACGTACAGACACAGCTTGATGGTAAGCAAGCCATTGTTGCAGGCGTAAGCGGCACAGAAATTGGCTACCTTGATGGTGTTACATCTAACCTACAAACACAGCTAGACAATATTAGCGTCACCTCTGGTAGCCTTACTAAGTCTTTCACATCTGGCGAGACTGCCAGCATTACCCTTGCTCAAGCTATCAGCCCAGCGCCTGTGGTGTCTGTGACTAAGGAAGTATCACAGGCAGGTATTTCCTCTAAGGGTGCATGGGATGTAAATGCTACAGCGTCTAACTATGAACTGCATAACACTGCTTATGCTACTACGTTGACGCCTAGTAATGTTACTGATTTTTCTACTATTTCTTATAATAATGCGGTTCATTATACAAACGATTCAACTACCACTGGTGTTTACTTAAGCTCAGATGGCTATCATTTGTTTTATATTGGAGGTGTTACTGATACTATTCGTAGACACGATCTGTCTACAGCTTTTGATATATCTACAACAGGATCACAAGTATCTAGTTTTAGTATAGGCTCACAAGACACAGAACCGGGGCAGGTCTGGTTTAAACCTGACGGCACTAAAATGTATATGGCAGGTTATGAAAATAACTCTGTGTATCAATACTCATTATCAACTGCATGGGACTTAACTACTGCAAGTTACGATTCAGTGTCTTTCTCTGTGGCTAGTCAGGTAACTCTTGTTGTTGGTATGGCATTTAATGATGATGGTACAAAAATGTATGTTTGCTGTACTACAAACAATGCAGCTTACCAATACTCATTATCAACTGCATGGGATTTATCAACAGCATCTTATGATAGTAAATCCGTTTCATTAAACTCTACTCCTAATGGAATTGCGTTTAATGACGATGGCAGTATATTCTTTCATATAACGGCTGGCACAGATACTCTATATTGGGCATCTTTAACAACCGCATATGATATATCAACGCTTGATAACAGTACTTACCAATCTTTCTCTATGAATAGTCAGGACTCCAACGCAAGAGATATTTTTATTGTTGAGAGTCAGTTAAAAGCATATATGGCTGGTAATACTAATGATGGTATCTTTGAATACACTTATTCTTCAACAGATGTTCTAACCCTCGGCACAGGCTCCTTTGCTTCTACAGACGTAGGCAAGCGCATCCAAGGCAACGGCGGTGACGTAACACTAACAAGCACGGCTGGTGCGTATGACACTACAGGTGGTTCAGCCTTTACTGATAGCAGCACTATTGCGTCAGGCTCTTGGACTATGCGTGGGCTGAAGTCTGCGGGTGATGCTGATGGGATTGGTTTTGCGGGGTTTGCTAATTTTTATGATATTGCTAATGCTTCTGGTATCCAAACTTACTCAGGAACGTCATCTTATATGGATTACCCCAGTGGTCTTACTCTAAAACCAGACGGAACGAGTTTTTATTATGCTGATAGGGATAGCACTCGCAGAACGGTGTATGAGTTTAATATGTCTACTCCGTATGACCTATCATCCGCAGTAGTCTGGAACACAGCCTCTAGCGTTGCTTCTTATACTAACACACCCACTGATGTGAAGTTTAGCTCAGATGGTACTAGAATGTACGTCATAGACGAATACAATAATAATATACTTCAGTTTACTCTTTCTACTCCTTGGAATATTGGTACTGCATCATATGATCGGGATGATGCAGCGGGTAGCGCACCTACTGGTTTGTTTTTTAAACCTGACGGTACAAAATTTTATATTTCAAACTCAGGAGATCAAATAAGCGAGTACCATATGACTACGCCTTGGAGTATCGCTACTGCGCCTAGTACTCCTTCCATTCAGTATAACACCTTTTTAACAGGGGATAGTAATATTGCTTTCTCCAGTGACGGAACTAAACTCTTTAAAAGCCTTTATAATACTAAAGTAGTACATCAATTCAACTTAACTACCGCTTGGGACATAAGTACCGCCAGTAATTCGGGGATTACTTTTGATACATCAAACGACATAACCACACTTGCTGGAATTTTCTTTGATCCAGACGGATCATATTTGTATGCACTGGATTATACCCATCAAAACATCAACCGCTATAGTGTAGGTTCCTTTAGTCTTCCCACATCCCAATACCACATAGGTGTCACCAACTCAGGCGGTCAGATCGACACTGCACTCTGGACTGACATAAACAGCATGACAGCAGATCAAGCTGCGGGTGATGGCACAGTACACTATGCAGTCTCTACAGATGACCGCACTACATGGTCAGTCGCAAAGGCAAGCGATGGGGTACGTCCTATTGTGCGGGATAACAGTGGTACATGGCAGTATAATAGTGATGCGGGTAGTTTAACAGGTGCATACGATTTAAGTACGGCTGTACTCAATCAGTCTAAAGACATTTCTAGTGATACGCCCGATCCTTATGGTATTATATTTAAACCAGATGGAACTAAAATGTTTGTTCTTGATGATGGTTTTGCAGCGGCAGATGATGTTCTTGAATATGGTCTTTCTACTGCATGGGATGTATCAACGGCTACTTTTACCCAAGCGTATCGTCTACTTTCCAGTGAAGCAGCAGTTCAAGGCATGGACTTTAAGTCTGATGGCACTCAAGTATACATTGTGGGTTCTATTACGGATGCCGTTTACGCTTATGATTTATCTACAGCTTGGGATATATCAACAGCTTCATATAATAGCGTAAACTTTTCTACTGCTAGCCAAACAACTACACCTTTTGCAGTTAAATTTAAATCAGACGGTGCAAAAATGTATGTCATAGGCTCTGCGGAAGACACTATTTATGAATACGATTTATCTACTTCTTGGGATGTTTCTACTGCGTCATACAACAATGTTAGTTATTACTTTAACCCGCAAGTTGCCGCTGCTAAAAATCTAACATTTAACTCGACAGGTACAAAGTTGTATCTGGCGGGTAGTGGAGATGTTTATGAATACAATCTTTCTACTGCTTGGGACTTGTCATCTATCTCCTACAGTAATGTAAATTTCTCTGTTTCTGAATCTGACGGTATTACCTTTAAACCAGACGGTACAAAAATGTTCATGTGTGGCAGCTCAAATGACCTTGTTGTTGAGTATGACATAGGAAGTATTGGTTATGGTACTGCAACAACATGGACTAATGCCACAACTAACGATGAGTTCTACGCACTACAGCAAGCTCTAGGCGCACAGGCGTTTAACCGCATGGACAAGACGCAGCTAGACGCAGTAGCAGATGGCTCACACTTCACGTTAGGCGATACGCTGGACTTGGCTATTGCTCTGAGACTGGACACTGCGTCAGCCTCAACGCCTAAGTCAGACGGTGTAAGCATTAACTATGATGCACAGGCGCTTAACCAAGGTGCGGTACTAGGGACTGATTACGACTACGACTTCCCTGACAGTACCACGGTTCGGGTTACATCTAATGCAGCACAAAACTTGAAGATACGTGTAGTGTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
2d4833f18fd3fcae35942622a6ae003d6eb3eec32aaaec881a11da0f9d044099
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6679
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genomic characterization of two novel RCA phages reveals new insights into the diversity and evolution of marine viruses Zhao,Y. — — GenBank