Protein

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Genbank accession
QBZ71070.1 [GenBank]
Protein name
putative long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTIVLADIGGRTGAVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLVFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVLRFTSAAPIDITLPRNANNGDIISLVDLDKLNPLYHTIIKTFDDTTSIGEVGTHIVEGRTSSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATAETINLTLPTGILTGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAKGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYVEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANADLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTATFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQAETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAATRGAAGTNVYNKDTSTLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAELATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATRAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATMAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGIDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTKQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNIAFSINGTVMPININASGLMNVNGVATFGRSVTANGEFISKSANAFRAISGDYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSDGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVSGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRVIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139409,69300 Da
isoelectric point:5,34198
aromaticity:0,07359
hydropathy:-0,29334

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–139
DC_1986 DC_1209
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390 IPR048391
QBZ71070.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-139 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1277 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SSE1
[NCBI] 		2562131 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Mosigvirus
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBZ71070.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK639187 [NCBI]
CDS location
range 126964 -> 130839
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATTGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACGTTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGACACTATTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGGCAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTTCGTACAGTTTTAATGACGCGTCCGCGTTCACAACTAGTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCTACACCATATCAAGCGCAAGCAAACGATTTTATTGTTCTTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCGACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTTGATTTAGATAAATTAAACCCACTGTATCATACGATTATTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGCGAAGTCGGGACTCATATCGTCGAAGGCAGAACTTCTTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCACGTCTTCGTATTATCCGTGCAGATTCAAATATTCGCCCAAATGAAGAAGTTCTTATTTTTGGTACAAATAACGCTACAGCAGAAACTATTAACCTTACGCTTCCTACAGGAATTTTGACTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCAAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTCGCATTACTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCATATGTTGAAGACACCGATTCTGACACTCATTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACAGTAGAACGTGTTGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGCTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAGGTTAATCAGAATTCCACTGCAACATTTGTGGATGATACTATTGTTACGCCTAAAAAATTAAATGAGCGTACAGCAACCGAAACTCGTCGTGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGCTGAAACAGATGCTGGTCTTGATGACACAACAATTATTACACCTAAGAAATTGCAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTATCGGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACACCTGCCGCGACTCGTGGAGCTGCAGGCACTAATGTTTATAATAAAGACACATCCACGTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGACAATCTCAAGCAGGTTATTCTCATGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAACTTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGAGTAGCGACTCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGTGTAATTAAGGTTGCTACTCGGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCGCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTATGGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCTATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCATATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCCGCTGACGCAAATTTATTAGATGGCATAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACGAAACAAACTAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGGTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAATCCAGCACAGACGATGACTATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGATCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCATTTTTATTCTCAACGTAATAAAGATGGGAATATAGCGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAATAAACATTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTTAATGGCGTTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTCATTAGTAAGTCTGCAAATGCTTTCAGAGCAATTAGTGGTGATTACGGATTCTTTATTCGTAATGACGCTGCTAATACCTATTTTATGCTCACTGCATCAGGCGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCCGGCCAAGTAACGATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGATGGTTTGACTGTTAACTCTAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGACTTATATACTCGTGCGCCAACATCCGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCTGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGTCTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCGGAAGCACGTACCACTCGCTGGACTCGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAAGTATTTGATGGGGGTAACCCTCCTCAGCCATCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCGTTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTCGAGTGGATTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
32cae128ad1a9f2da94e693f4b26d0cdfb948d3eb1cb839cab40c632b3d10c1b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8138
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50