Protein

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Genbank accession
YP_007501288.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TF
Evidence UniProt/Swiss
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MATIKQIQFKRTKVAGSRPTAAQLAEGELAINLKDRTIFTKDDLNQIIDLGFAKGGEVSGDITQIGNYTQTGNYNLTGDATISGKTTTSTLDVGSVSDLRQTNFRPVLSTTTGSNFIISNSGGLIKPITLTVEGTATSSNTILRHSVDTTVAASGFIDSINVSLNPTDGALVTALNGTVNIGSSLKTPKLSVSGAETALGDYSISIGDNDTGFKWNSDGVFSLVTDSNSIYTYSRDRTYSNRPTNFRYTSDFDATTPALAPPGTWLASVETAIDGNAYGDGMSYLGYKDTAGYSFYFRGGGTFNVASKGGFNVDTAAAFAKTVDVSDILTCSSIIKAKGPGQVDVTSAGNIALGGTIQWVPSYMSGSPNRARDTIATAAWGDADQRINVLETSDPHGWWYYIQRAGSGSSSPTGIEGRVNGSWQASDLISDNTLRVAGAFTCTRRNSAGWGDNAGWYAGATPVVANQGNVQEMDPGVGGFYPGFAQYNYNGTGWNQAFVLGLLGQGVQRWRRGVLALRGDGPVDAGQQIARWYFSQEDGSLESEGPLKAPSVQAGQITSFGVNVTNALGSASIAIGDNDTGLRWGGDGIVQIVANNAIVGGWNSTDIFTEAGKHITSNGNLNQWGGGAIYCRDLNVSSDRRIKKDIKAFENPVDILSTIGGYTYLIEKGFNEDGSQAYEESAGLIAQEVEAVLPRLVKISNDGTKDVKRLNYNGITALNTAAINVHTKEINELKKQLKELKDIVKFLTK
Physico‐chemical
properties
protein length:749 AA
molecular weight: 79411,98310 Da
isoelectric point:5,20994
aromaticity:0,08678
hydropathy:-0,26262

Domains

Domains [InterPro]
DC_0000
STR
1–749
DC_0000
IPR030392
CHP
638–698
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
638–737
IPR030392
YP_007501288.1
1 749
Architecture
STR
STR 1-749
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage S16
[NCBI] 		1087482 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Tevenvirinae > Gelderlandvirus
Host Salmonella enterica
[NCBI] 		28901 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_007501288.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_020416 [NCBI]
CDS location
range 149546 -> 151795
strand +
CDS
ATGGCTACTATAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAAAGTAGCAGGCTCTCGTCCTACTGCCGCTCAACTCGCTGAAGGCGAACTTGCTATTAACTTAAAAGACCGCACTATTTTCACGAAAGACGATTTGAACCAAATCATTGATTTAGGTTTTGCAAAAGGCGGTGAAGTATCAGGAGATATCACGCAGATTGGTAATTATACCCAAACTGGGAACTATAATTTAACCGGCGATGCTACTATATCAGGCAAAACTACTACAAGCACACTGGATGTTGGGTCTGTTTCAGATCTAAGACAGACAAACTTTAGACCAGTATTAAGCACAACAACTGGTTCTAATTTTATTATATCAAACTCTGGCGGCTTGATTAAACCAATTACTTTGACGGTAGAAGGCACAGCTACAAGTTCAAACACTATTCTGCGCCATTCAGTTGATACTACTGTAGCAGCTTCTGGATTTATCGATTCAATTAATGTTTCTTTAAATCCGACGGACGGCGCTCTTGTTACAGCTCTCAATGGTACTGTGAATATCGGTAGTTCCCTTAAAACTCCTAAACTTTCAGTTTCTGGCGCGGAAACTGCTTTGGGAGATTATAGTATTTCAATCGGTGATAATGATACAGGATTTAAATGGAATTCTGATGGTGTATTCAGCTTAGTTACTGACAGTAATTCAATTTATACATACTCTCGTGATAGGACATATTCTAACCGTCCAACAAATTTCCGGTATACGTCTGACTTTGATGCTACGACACCTGCTTTAGCTCCGCCAGGCACATGGTTAGCTTCAGTTGAAACTGCAATAGACGGTAACGCTTACGGCGATGGAATGAGCTATCTCGGTTATAAAGATACCGCAGGTTATAGTTTTTATTTCCGCGGCGGCGGCACTTTTAACGTAGCTTCTAAAGGTGGATTTAATGTAGACACAGCTGCGGCTTTTGCCAAAACGGTTGATGTATCTGATATTCTAACATGCAGCTCTATTATTAAAGCTAAAGGCCCAGGTCAAGTTGATGTTACTAGTGCTGGTAATATCGCACTTGGTGGAACTATTCAATGGGTGCCTTCGTATATGAGCGGAAGCCCAAATAGAGCACGAGATACAATAGCTACAGCAGCTTGGGGCGATGCCGACCAACGAATTAACGTATTAGAAACATCTGACCCGCATGGTTGGTGGTATTATATACAGCGCGCAGGTTCTGGAAGTTCTTCTCCTACGGGAATAGAAGGGCGAGTCAATGGCTCTTGGCAGGCATCTGATTTAATTTCTGATAATACTCTAAGAGTAGCTGGAGCTTTCACTTGTACTAGAAGAAACTCCGCAGGATGGGGTGATAACGCTGGATGGTATGCTGGAGCAACACCAGTAGTAGCTAACCAAGGAAACGTTCAAGAAATGGACCCCGGTGTAGGCGGTTTTTATCCTGGATTTGCTCAATATAACTATAATGGCACTGGATGGAACCAAGCATTTGTTCTGGGGTTACTAGGCCAAGGTGTTCAGAGATGGCGTCGTGGTGTATTAGCTCTTAGAGGCGATGGCCCTGTTGATGCTGGACAACAAATTGCTCGTTGGTATTTTAGTCAAGAAGACGGAAGTTTGGAATCAGAAGGTCCGCTTAAAGCTCCTAGTGTTCAAGCTGGACAAATAACATCTTTTGGTGTAAACGTTACAAACGCGTTAGGCAGTGCGTCTATAGCTATTGGCGATAACGATACCGGATTGCGCTGGGGCGGCGATGGTATCGTTCAAATTGTAGCTAATAACGCTATCGTAGGCGGATGGAATTCAACAGATATTTTTACTGAAGCTGGTAAACATATAACATCCAATGGAAATTTAAATCAATGGGGCGGAGGCGCAATTTATTGTAGAGACCTTAATGTTAGTTCCGACAGAAGAATTAAGAAAGACATAAAAGCATTTGAAAATCCCGTAGATATTTTAAGCACTATAGGCGGTTATACTTATCTTATTGAAAAAGGATTTAATGAAGATGGAAGTCAGGCTTACGAAGAGTCCGCTGGATTAATTGCTCAAGAAGTAGAAGCTGTTCTTCCTCGTTTAGTTAAAATATCCAATGATGGAACAAAAGATGTTAAAAGACTTAATTATAATGGTATAACAGCTTTAAATACTGCTGCTATAAATGTACATACTAAAGAAATTAATGAGCTCAAAAAGCAATTAAAAGAGCTTAAAGACATTGTTAAGTTTTTAACTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

1 / 2
PDB ID
Source
Method
Resolution
Oligomeric State