Protein

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Genbank accession
UIS31696.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKLNANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVNNTFRGTQAILSDNEALIIKNITQGAPLYLRGQDADGTNRWYLGNDNRGTHNLVLKNVKTDVSIAISENLVTVNRTLQIAGQVQPSSFANLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFTGANTFRTMSVISNAAAITLQCASANESLYLLAKDYEGGNLWYLGKGSSGAGVTIYNYTTNTSLVLDAAGVSANKNVRITGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTIARTNATNTFSVRQVINSDGEALALKAKTATTLFIRGLAADGTAKWYVGNGDADNNNNLRLFNYKTGKGLTIGSTFEMNATLAITGQVKPSDWSNLDARYFTQSVANQKFMYAGSTGTGTEVGDSDGIAWNAKTGLYNVTGYSGGSTQLVFQMYQGASSTPSAQLKFNYRNGGFWYRSSRDGFGFEEDFTQIYTEKYKPTPSAIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTDTTGAHTHSVSGSTNNTGAHTHTVGGHYGGDSIGGKQRVQASGTAQVSSVAGDHSHTVSGTAASNGDHAHTVGIGAHSHTVSGNTGSTGSGSAFSITNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:782 AA
molecular weight: 83560,37250 Da
isoelectric point:8,64980
aromaticity:0,08824
hydropathy:-0,34706

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–264
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
G3DSA:6.20.80.10
STR
158–219
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
159–248
IPR048388 IPR048388 IPR048388 IPR051934
UIS31696.1
1 782
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-264 | STR 265-275 | ATT 276-356 | STR 357-381 | ATT 382-472 | STR 473-778 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage UAB_69
[NCBI] 		2862114 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Salmonella typhimurium
[NCBI] 		90371 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UIS31696.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OL656108 [NCBI]
CDS location
range 52486 -> 54834
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAACTTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGACTTGCTGTGAATAATACCTTTAGAGGTACTCAAGCTATCCTCTCTGACAATGAAGCACTCATTATTAAAAATATCACTCAAGGCGCACCACTCTATCTTCGTGGTCAAGATGCAGATGGCACTAACAGATGGTATCTAGGTAATGATAATAGGGGCACACATAACCTTGTATTGAAGAATGTAAAAACTGACGTTTCAATTGCTATTTCAGAAAATTTGGTGACAGTCAACAGAACTCTTCAAATTGCTGGTCAAGTTCAGCCTTCAAGTTTTGCTAACTTAGATGCTAGATACTTCACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGCAATAATACTTTTACAGGTGCTAACACATTTAGGACTATGAGTGTTATTTCAAATGCTGCTGCTATCACACTGCAATGTGCATCAGCAAACGAATCCCTGTATCTACTTGCAAAAGATTATGAAGGTGGAAACTTATGGTATCTTGGTAAAGGTAGTTCAGGTGCTGGTGTAACTATCTACAACTATACCACTAACACCTCTTTGGTCTTAGATGCTGCTGGAGTATCAGCAAATAAAAATGTCAGAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGGTATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACAATTGCAAGAACTAATGCGACCAATACATTTTCTGTGCGACAAGTTATCAACTCTGATGGTGAAGCTCTTGCGTTAAAAGCAAAAACTGCAACGACATTGTTCATTAGAGGGTTAGCTGCTGATGGGACAGCCAAGTGGTATGTTGGTAATGGCGATGCCGATAACAATAATAACTTAAGGCTGTTTAACTACAAAACAGGTAAAGGGCTTACCATCGGCTCAACATTCGAAATGAATGCAACTTTAGCAATCACTGGACAGGTTAAACCTTCAGATTGGTCTAACTTAGATGCCAGATATTTTACCCAATCAGTAGCTAATCAGAAATTTATGTATGCAGGTTCCACAGGTACTGGTACAGAGGTAGGTGATAGTGATGGCATTGCTTGGAATGCTAAAACTGGACTGTATAATGTTACAGGTTATAGTGGAGGCTCAACACAGCTTGTTTTCCAAATGTATCAGGGTGCAAGCTCTACTCCCTCTGCTCAATTAAAATTCAACTACAGGAATGGGGGTTTTTGGTATAGGTCATCAAGGGATGGTTTTGGTTTTGAAGAGGACTTCACACAAATTTATACAGAGAAGTATAAGCCAACTCCTTCAGCTATCGGTGCATACACTAAAGCAGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGGATTGTGACATGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTCCCTGGTTTAACTTGGACGTATCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGAGGTTCAGATTCTGTTACGTTAGCAGTTGGAAACTTACCTTCACACACTCATAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTGATACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGTGGTTCTACTAACAACACTGGTGCTCATACACATACAGTTGGTGGTCATTATGGTGGTGACTCTATTGGTGGTAAACAACGTGTTCAGGCCTCAGGGACTGCTCAGGTTTCCAGTGTAGCTGGTGACCACTCACACACTGTGTCTGGTACTGCTGCCTCTAACGGAGACCATGCTCACACAGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTAGTACAGGCTCTGGTTCGGCATTTAGTATTACTAACCAGTTCTACAAATTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
95faf41d4fac2167ba029910bbc43e9a0f2328041ed07db10199ad02258828e0
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7035
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of three phages infecting different serovars of Salmonella enterica Otero,J., Cortes,P. and Llagostera,M. 2018-12-20 — GenBank