Protein
- Genbank accession
- XLW52575.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRVLFTKDDQGNIIDLGFAKGGSIDGNVIHIGNYNQTGDYTLNGTFTQTGNFNLTGIARVTRDIIAAGQIMTEGGELITKSSGTSHVRFFDGNNRERGIIYAPANDGLTTQVLNIRVQDYAAGSESTYAFSGSGLFTSPEVSAWKSISSPQILTDKVITNGKKTGDYDIYSLANNTPLAESETAINHLRVMRNAVGSGIFHEVKDNDGITWYAGDGLDAYLWSFTWSGGLKAGHSVSIGLPGGSKGYSELGTASISLGDNDTGFKWHQDGYYFSVNNGTKTFLFSPSETTSLRKFVAGYSTNGTDLTTPPTENYALATVVTYHDNNAFGDGQTLLGYYQGGNYHHYFRGKGTTNINTHGGLLVTPGNIDVIGGSVNIDGRNNSSTLMFRGNTTGYSSVDNMDIKVWGNTFVDPSGGIRKNIMEISDATSWMSYIQRLTTGEVEMNVNGSFESSGVTAGDRGVHTTGEISSGAVNALRIWNADYGAIFRRSEGSLHIIPTAYGEGKHGDIGPLRPFSMALDTGKVTIPDLQSSYNTFAANGYIKFTGHGAGAGGYDIQYAQAAPIFQEIDDDAISKYYPIVKQKFLNGKAVWSLGTEISSGTFVIHHLKEDGSQGHTSRFNQDGTVNFPDNVLVDGDINMKGVMTFDAGRLGSRDYFKFNHWGDSNNARDNIIQLEDSQGAHFSTERTLATGAIKTRFFGETFTDGALYLNQMNNSSEQFHINNWGNSEVGRSAVMEVGDSKGYHFYTERRTDNSLMFDVAGAFTVHGPSGITIKNSAGARRVWFRDDSEAEKAVIWATDEGILHIRNNHGGPFSHHFKGAMIQLEGRVPYAADQGLIRGEVSGGAYVAWRDRPAGLLVDCQQSVDSAHAIWKAVDWGRNYIAAMDVHCPGDSNNTAAAVLHVQGADYQFHASGEFHATGNGNFNDVYIRSDRRLKINVEDYEENAVDKVNKLKVKTYDKVKSLSDREVIGHEIGIIAQDLQEVLPEAVSTSSVGSQDNPEEILTISNSAVNALLIKAIQEMSEEIKELKTPLFTKIARKISKYFKF
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1080 AA molecular weight: 117442,69610 Da isoelectric point: 5,70399 aromaticity: 0,09907 hydropathy: -0,37750
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_JE01 [NCBI] |
3374908 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XLW52575.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ471460.1
[NCBI]
CDS location
range 100180 -> 103422
strand -
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACTGCAGGAGCACGTCCTGCCGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGACCGCGTACTTTTTACTAAAGACGACCAAGGAAATATCATTGATCTTGGTTTTGCTAAAGGTGGTAGCATTGACGGGAATGTTATTCATATAGGAAACTATAATCAAACTGGTGATTATACTTTAAATGGCACTTTCACTCAGACAGGTAATTTTAATTTAACTGGTATTGCTCGAGTAACTCGCGATATTATTGCTGCCGGGCAGATTATGACTGAGGGTGGAGAACTTATTACAAAAAGTTCAGGTACATCACATGTTCGTTTTTTCGATGGCAATAACCGCGAACGCGGAATCATTTATGCCCCGGCTAATGATGGATTAACTACACAAGTACTTAATATCAGGGTTCAAGATTATGCTGCAGGAAGTGAAAGCACCTATGCATTTTCAGGTAGTGGCCTATTTACTTCACCTGAAGTATCAGCATGGAAATCTATTTCGTCTCCACAAATTCTGACCGATAAAGTTATTACAAATGGGAAGAAGACAGGCGATTATGATATCTATTCATTAGCAAATAACACTCCATTGGCAGAAAGCGAAACGGCTATTAACCACCTCCGTGTTATGCGAAATGCCGTAGGATCTGGTATATTCCATGAAGTTAAAGATAACGACGGGATAACCTGGTACGCTGGTGACGGGTTAGATGCCTATCTTTGGTCGTTTACCTGGTCTGGTGGATTGAAAGCAGGCCATTCTGTTTCTATAGGTCTTCCAGGTGGCTCTAAAGGATATTCTGAATTAGGGACTGCTTCAATTTCTCTTGGAGATAATGATACTGGATTTAAATGGCATCAGGATGGATATTATTTCAGCGTCAATAATGGAACGAAAACATTTTTATTTAGTCCTAGTGAAACAACTAGCCTAAGAAAATTTGTAGCTGGATATTCTACTAACGGAACCGATTTAACGACTCCTCCAACTGAAAACTATGCTCTTGCTACTGTCGTGACATATCACGATAATAACGCGTTTGGAGATGGTCAAACTCTTTTAGGATATTACCAAGGCGGTAATTATCATCACTATTTCCGTGGTAAAGGTACTACAAACATTAATACTCACGGCGGTTTGTTAGTCACTCCTGGTAATATTGACGTTATTGGTGGTTCTGTTAATATTGATGGTCGTAATAATTCTTCTACGCTGATGTTTAGAGGTAACACAACAGGATACAGCTCGGTTGATAATATGGATATTAAAGTTTGGGGTAATACGTTTGTTGATCCAAGCGGAGGTATCCGTAAAAACATTATGGAAATTTCTGATGCAACTAGCTGGATGAGCTATATTCAAAGACTTACTACTGGCGAAGTAGAAATGAACGTTAATGGTTCATTTGAATCATCTGGTGTTACTGCTGGAGATAGAGGAGTTCACACAACAGGTGAAATTTCATCTGGAGCAGTGAATGCTCTTCGTATTTGGAACGCAGATTATGGAGCCATTTTTAGACGTTCAGAAGGAAGTCTTCATATTATTCCAACTGCTTATGGTGAAGGTAAACATGGCGATATCGGTCCACTTCGCCCGTTTAGTATGGCTTTAGATACCGGTAAAGTTACTATTCCAGATTTACAATCAAGTTACAATACGTTCGCAGCAAACGGCTATATTAAATTTACTGGTCATGGCGCAGGCGCTGGTGGTTATGACATTCAATATGCTCAAGCGGCTCCTATTTTCCAGGAAATTGATGATGATGCTATAAGCAAATATTATCCTATTGTTAAACAGAAGTTTTTAAATGGTAAAGCCGTTTGGTCTTTAGGTACTGAGATTAGTTCAGGTACATTCGTTATTCATCATCTGAAAGAAGATGGTTCACAAGGCCATACGTCTCGTTTTAATCAAGACGGTACTGTTAACTTCCCGGATAATGTTCTGGTCGACGGTGATATTAACATGAAAGGCGTGATGACTTTTGACGCCGGACGTTTAGGATCACGAGATTATTTTAAATTTAACCATTGGGGTGATAGTAATAATGCTCGTGATAACATCATCCAGTTAGAAGATAGTCAAGGCGCTCATTTTTCCACTGAACGTACTTTAGCGACAGGTGCAATTAAAACTCGTTTCTTTGGCGAAACATTTACTGATGGTGCATTATACCTAAATCAGATGAATAATAGCTCTGAACAATTCCATATCAATAATTGGGGAAATTCAGAAGTTGGTCGCTCGGCAGTGATGGAAGTCGGTGATTCCAAAGGTTATCACTTCTATACTGAACGTAGGACAGATAACAGTTTGATGTTTGATGTTGCTGGCGCTTTTACTGTGCATGGACCTTCCGGGATTACTATCAAAAACTCTGCTGGTGCTCGCCGCGTCTGGTTTAGAGATGATAGCGAGGCAGAAAAGGCTGTTATCTGGGCTACAGATGAGGGTATTTTACATATTCGCAATAACCACGGTGGACCATTTAGTCATCACTTTAAGGGCGCAATGATTCAACTGGAAGGGCGTGTTCCTTATGCCGCAGATCAAGGACTTATCCGTGGTGAGGTTTCTGGTGGTGCATATGTTGCATGGAGAGACCGACCTGCTGGTTTGTTGGTTGACTGTCAACAAAGCGTTGATAGTGCTCATGCTATTTGGAAAGCGGTTGATTGGGGGCGTAACTACATCGCTGCTATGGACGTTCATTGTCCCGGTGATAGTAATAATACTGCGGCAGCGGTTCTTCATGTTCAGGGTGCTGATTATCAATTCCATGCAAGTGGAGAATTTCATGCCACTGGTAACGGAAACTTTAACGATGTTTATATTCGTTCCGATCGTCGTCTGAAAATTAATGTTGAAGATTACGAAGAAAATGCGGTGGATAAGGTAAATAAACTCAAAGTTAAAACCTATGATAAAGTTAAATCTCTTTCTGACCGCGAAGTTATCGGCCATGAGATTGGTATTATCGCACAGGATTTGCAAGAAGTATTACCGGAAGCTGTTAGCACTTCTAGTGTCGGATCTCAGGATAACCCGGAAGAAATTTTAACAATTTCTAACTCTGCTGTGAACGCGCTTTTAATTAAGGCTATTCAGGAAATGAGTGAAGAAATTAAAGAATTGAAAACGCCTCTCTTTACTAAAATTGCTCGCAAAATTAGTAAATATTTTAAATTCTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
52815b22fea4f324ecc67b458a87c342371a2ef49d9a27fbeef4fa50db4a374c
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Pharmacodynamic and Metabolic Evaluation of Phage Cocktail Therapy in Ameliorating ETEC-Induced Diarrhea in Animal Models | Wang,Z. | 2024-12-08 | — | GenBank |