Protein

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Genbank accession
AIX28375.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,77
Protein sequence
MATTQTFTSSTTYAIPSDAANVTYIIHGGKGGRGGNGFEPPSTFYSGAVGGQGQKISGTLTGVVGSTLTLTMGGNGSNHTGQTNSGANGGGGYWNGGRGGNDENTPYPAFGNSNPGGGGGGATAIRIGTTVLAGAGGGGGGGAVHEFSSISGNSIGKTSTTLVTNASTGSNGSAGQAGRSYSNGGGGGGGGGWGDPPNGDGGFAFGSGFKTSGDGGYGGGGYYNTSYNSGAATLETSSSNSSFVTISYEDQIVTEDFDWTTRSPQIGNIIGSQGSDPNNQWTTFLTNTNVGGYEPEGTTVTRSIEWKVDFNNTGRQIFNTAVDDDADVYIDNVLQFSLNTYNANTSLTTADIISAGEHTIRIEHVNNGGPYGVAMDWTGYIPPVPPTVSLTATDYSTPPNNITSIYKGQSLRLTYSATGEGITSNTFTATANGVVTNPIPSVGNSGVYFPAPTVTTTYTYTATNPYGTSTTSVTVTVLNDLPVVSLTSNDANNTILRGESVILTWSATANVAISSTTMTGVANPGLNGSVTVSPTTTTTYTFRATNPSGTTTTTITIVVNILAPTVSLSSDDPDDTIIVGDSVILTWAASGFDITNTTMTGVTNPGNLGSVAVSPTTTTTYTFTATNSTGTSTASRTITVPVKPQIVVTANASSIVSGQSVNINWNTTGDANVVNWTSGTPGITNNSINGTATVSPTNSTQYCAIASGPGGISDTQCVAINVTPPPGPATDSNTTYTSDATVIIPSYAINVTADIAAASGGKGGTDANGSAGSGGSGRRALLTFNDYTARTFTLRIGFIGGSGFGCVANSGAGSRGSSNVATGGFGGRSGPQGCSGGGGGGGGATAVYDSVKNGYVAIAGGGGGGGGASWNRNATNGGAGTGMFTGNINSISGGSTGSSCPTDGGGGGGGGGGASGGSGGAFGLDNNYGGRGGNGGRSAYDSSYCSFTNNTGTSNFGNGFVIVKWNIGAPTIDSFTINPSPIIAGEKATLTWTSTNSLFGSINNGVNAVNVPNGSIDVYPPDDRTYTLTVTGYGGLTDTATVSIVVYIPPVIIISTNKIEMMLGSVANLSWVTTGDADNIVWVSGGITNSNLSSNSNVSPTTTTSYAAYVSGLGGTSDVSSVSVVVYYFPTVEVDYPTNILYGQQGNIEVTTRYATESVTITPTYTYDFVGSTTASAANLSVNDSAESTGIENTDIYTTTIPYDDRGPLSVTYVVRATGKLGTFQEEVITIPIIIDDTPDNLNIPESVDLIKDQQPIYTPPDVEVLTDLLLIDDVDIKVEVKSDYPIQIDLNQQNEWYDIRQIGTPPYVQGSSVGGNSLPTESGVYLIKPNSDPVSIDEEFNVKSSNITAVDFAKLVTCVSVIDETNNSYYNNQSNLNNVWAGSAIIGGAVNNRRGFRTAFPYRTFYILDPQASGQGGIDVPTAYPADPNAIGPIRVNRDEGNAGNRSDWFAICNFGSLPYGTIVSIWIDISGSMRLSTVQASYNYFLTRCANAGIEIVLSLSAAGERYIEGHIVYLPPSANFTVNNTTNIVTIIQGQSVTLDWVAFGDLNTLNIAPGVLSNATTFSNFVSSAVVFPQSNTTYLLTATGPAGSTTRQVTVNVLIPPTLQISANKTTIIVGTCANISWGYTGDASTITWTTGTITNGNLTSSSQVCPTDTTTYCAFLDGVAGQSPVTCITINVKQIPTASLTVPNEVDYGNNFNIQYNTQYANTSISITPTYTYLNGTTTTGTSINRTPATGAELGDPDSQTKANGTVPITVPWSNFGPSQISFSIDVVGEGGTANDVKLTTVNIDQTPDNLNIPDSDELLKDQEPVFSPEGDILSELILIDDIDVDIEIKANYPIKVDTNQENDYKDVRQL
Physico‐chemical
properties
protein length:1861 AA
molecular weight: 191128,41110 Da
isoelectric point:4,19758
aromaticity:0,08060
hydropathy:-0,14847

Domains

Domains [InterPro]
DC_1632
STR
1–154
DC_1632 IPR037524 DC_2069 DC_2069 DC_2069
DC_2069
STR
131–614
DC_2069 PTHR40903 DC_2069
G3DSA:2.60.120.260
STR
288–382
G3DSA:2.60.120.260
AIX28375.1
1 1861
Architecture
STR
STR
STR 1-806 | STR 856-1861
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014j
[NCBI] 		1493514 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Potamoivirus > Potamoivirus tusconj
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX28375.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019089 [NCBI]
CDS location
range 34260 -> 39845
strand +
CDS
ATGGCAACCACTCAAACGTTTACATCTAGCACTACATATGCTATTCCTTCGGATGCTGCTAATGTTACATATATTATTCATGGTGGCAAAGGTGGTCGAGGTGGTAATGGATTTGAACCGCCGTCCACATTTTATAGTGGTGCGGTTGGTGGCCAAGGACAAAAAATATCTGGAACTTTAACTGGAGTTGTTGGTTCAACACTCACATTAACGATGGGTGGTAATGGATCTAACCATACAGGACAGACAAATAGTGGTGCAAATGGTGGCGGTGGATATTGGAATGGTGGACGTGGTGGTAATGATGAGAATACACCATACCCTGCTTTTGGAAATTCTAATCCTGGTGGTGGCGGCGGCGGAGCTACTGCCATTCGTATTGGTACTACTGTATTAGCTGGTGCTGGCGGCGGCGGAGGAGGTGGAGCTGTCCACGAATTTTCTAGTATATCTGGAAATTCTATAGGTAAAACTTCTACAACACTTGTCACTAATGCTAGTACAGGATCTAATGGTTCAGCTGGTCAAGCAGGACGGTCGTACTCGAACGGTGGCGGTGGCGGCGGTGGAGGTGGATGGGGTGACCCCCCTAATGGAGATGGTGGATTTGCATTTGGATCTGGATTTAAAACTTCTGGTGATGGCGGATATGGAGGCGGTGGATATTATAACACTTCGTATAATTCTGGTGCTGCTACTCTTGAAACTTCTAGTTCTAATAGTTCTTTTGTTACAATTTCATATGAGGATCAAATTGTCACAGAAGATTTTGATTGGACCACTAGATCTCCCCAAATTGGTAATATTATAGGATCTCAGGGATCTGATCCAAATAACCAGTGGACTACTTTTTTAACTAATACTAACGTAGGTGGTTATGAACCTGAAGGCACTACCGTTACTAGATCAATTGAATGGAAAGTTGATTTTAACAATACTGGAAGACAAATATTTAATACAGCTGTAGATGATGATGCTGACGTATACATTGACAATGTATTGCAATTTTCACTTAACACTTATAACGCCAATACTTCTTTAACCACAGCAGACATTATTAGTGCTGGTGAACATACTATACGGATTGAACATGTTAATAATGGTGGTCCATATGGTGTAGCAATGGATTGGACTGGATATATTCCTCCAGTACCACCAACAGTAAGTCTAACTGCAACTGATTATAGCACCCCACCAAATAATATTACTAGCATTTACAAAGGTCAAAGTCTGAGGCTTACATACTCTGCCACTGGCGAGGGTATAACTTCCAATACTTTTACTGCAACTGCTAATGGAGTTGTAACTAATCCTATTCCTAGTGTTGGAAATAGTGGTGTATATTTTCCTGCTCCTACAGTAACAACAACTTATACGTATACGGCAACTAACCCATATGGAACTTCTACTACTTCTGTAACAGTTACTGTTCTAAATGATCTTCCAGTAGTATCTCTTACCTCAAATGATGCTAATAATACTATTTTGAGAGGAGAATCTGTAATACTTACTTGGTCTGCTACTGCAAATGTTGCTATTAGCAGCACTACAATGACTGGTGTTGCTAATCCTGGACTTAACGGTAGTGTAACAGTAAGTCCTACAACTACGACAACTTATACTTTTAGAGCAACTAATCCTTCTGGAACAACTACAACAACTATAACAATTGTTGTTAATATTCTTGCCCCGACAGTAAGTCTTTCTTCAGATGATCCCGATGATACAATTATTGTTGGTGATTCTGTAATTTTAACTTGGGCTGCGTCTGGTTTTGATATAACAAACACCACGATGACCGGTGTTACTAACCCTGGTAATCTTGGTAGTGTAGCAGTAAGTCCTACAACTACGACAACTTATACTTTTACAGCAACAAATTCTACAGGAACTTCGACTGCTAGTAGAACAATTACTGTTCCTGTCAAACCACAAATTGTAGTAACTGCTAATGCATCGTCTATAGTATCGGGTCAAAGTGTTAACATAAATTGGAATACAACTGGAGATGCAAATGTTGTTAATTGGACTTCAGGAACTCCGGGAATTACTAACAATTCAATAAATGGAACAGCAACAGTTTCTCCTACAAATTCTACACAATATTGTGCTATTGCTAGTGGACCTGGAGGAATTAGTGATACTCAATGTGTTGCGATAAATGTTACCCCTCCTCCTGGTCCAGCAACTGATTCAAATACAACATATACATCAGATGCTACTGTTATTATTCCATCTTATGCTATTAATGTTACCGCAGATATAGCAGCTGCTAGTGGTGGCAAGGGTGGTACAGATGCTAATGGTAGTGCTGGATCTGGAGGTTCTGGTAGAAGAGCACTTTTGACATTTAATGATTATACGGCAAGGACATTTACATTAAGGATAGGTTTTATAGGTGGATCTGGTTTTGGTTGTGTAGCAAATAGTGGAGCAGGATCAAGAGGAAGTTCTAATGTAGCTACCGGTGGATTTGGTGGCAGAAGTGGTCCCCAAGGATGCTCTGGTGGAGGAGGAGGCGGTGGCGGCGCTACTGCTGTATATGATTCCGTTAAAAATGGATATGTTGCTATAGCCGGAGGAGGTGGCGGCGGTGGTGGTGCTTCTTGGAATAGAAATGCTACTAATGGTGGTGCTGGCACCGGAATGTTTACTGGAAATATAAACAGTATTAGTGGTGGTTCTACTGGTTCATCATGTCCCACTGACGGTGGTGGGGGAGGTGGAGGAGGCGGAGGCGCATCTGGTGGTTCTGGTGGAGCCTTTGGACTTGACAACAATTATGGCGGACGTGGTGGTAATGGTGGACGGTCTGCTTATGATAGTAGTTATTGTTCTTTTACTAATAATACAGGAACATCTAATTTTGGAAATGGATTTGTTATAGTAAAATGGAACATAGGTGCTCCAACAATTGATAGTTTTACTATTAACCCTTCGCCTATCATTGCTGGAGAAAAAGCTACATTAACGTGGACATCTACAAATTCTCTTTTTGGTAGCATTAATAATGGCGTTAATGCAGTTAATGTTCCCAATGGTTCTATTGATGTTTATCCCCCAGACGATAGAACATATACATTAACTGTTACTGGTTATGGTGGATTGACTGATACTGCTACTGTATCCATCGTAGTTTACATTCCTCCTGTTATTATTATTTCTACCAATAAGATCGAAATGATGCTTGGTAGTGTGGCTAATCTTTCTTGGGTTACAACTGGAGATGCTGATAATATTGTATGGGTTTCTGGTGGAATAACTAATTCAAATCTTAGTAGTAATAGTAATGTCAGTCCTACAACCACTACATCATATGCCGCATACGTATCGGGACTTGGCGGAACTTCAGATGTATCTTCAGTTTCTGTTGTTGTTTATTATTTTCCAACAGTGGAAGTTGATTATCCAACAAATATTTTATATGGTCAACAAGGTAATATCGAAGTTACTACAAGATATGCTACTGAGTCTGTCACAATAACACCAACTTACACGTATGATTTTGTTGGATCTACTACAGCATCTGCTGCTAATTTATCTGTTAATGATAGTGCCGAATCTACTGGCATAGAAAATACGGATATTTACACTACGACAATACCGTACGATGATCGAGGACCATTGAGTGTTACATACGTAGTTAGAGCAACTGGTAAACTGGGAACGTTCCAAGAAGAAGTAATTACTATACCGATCATTATTGATGATACTCCTGATAATTTAAACATTCCCGAGAGTGTAGATTTAATAAAAGATCAACAACCCATTTATACTCCCCCTGATGTAGAAGTTTTAACTGATTTGCTTTTAATTGATGATGTTGACATTAAAGTAGAAGTTAAAAGTGATTACCCTATTCAAATTGATCTCAATCAACAAAATGAATGGTATGATATCAGACAAATTGGCACTCCTCCTTATGTTCAGGGAAGTTCGGTTGGTGGAAACTCTTTGCCTACTGAATCTGGTGTATATCTCATAAAACCAAATAGTGATCCTGTAAGTATTGATGAAGAATTTAATGTTAAATCAAGTAATATTACAGCAGTAGATTTTGCGAAGTTAGTTACTTGTGTATCTGTCATTGATGAAACAAATAATAGTTATTATAATAATCAATCAAATTTAAATAATGTGTGGGCAGGTAGTGCTATTATTGGTGGCGCTGTAAATAATCGTAGAGGATTTAGAACAGCATTCCCATACAGAACTTTCTATATCCTAGATCCACAAGCATCAGGGCAAGGTGGTATTGATGTGCCTACAGCATATCCAGCAGATCCTAACGCAATTGGACCAATTCGTGTTAATCGCGATGAAGGAAATGCTGGTAATAGATCTGATTGGTTTGCGATTTGTAATTTTGGTTCTTTGCCATATGGAACAATTGTTTCTATCTGGATTGATATTTCCGGTTCGATGAGACTCTCTACAGTTCAGGCATCATATAATTATTTCTTGACACGTTGTGCTAATGCTGGTATTGAAATTGTATTGAGTCTTAGTGCTGCTGGTGAGAGATATATTGAGGGTCATATTGTATATCTTCCTCCTAGTGCTAATTTTACTGTAAATAATACAACAAATATCGTTACAATTATTCAGGGGCAGTCCGTCACGTTAGACTGGGTTGCGTTTGGTGATCTTAATACTCTTAATATTGCTCCAGGAGTTTTATCAAACGCTACTACGTTCAGTAATTTTGTCAGTAGTGCTGTTGTATTTCCACAATCAAATACTACATATCTTCTAACAGCAACTGGTCCTGCAGGAAGTACAACACGACAAGTTACAGTTAATGTTTTAATTCCACCAACACTTCAGATAAGTGCTAATAAAACTACTATTATTGTTGGAACATGTGCCAATATCAGTTGGGGTTATACTGGAGATGCTTCCACTATTACGTGGACTACTGGAACTATAACTAATGGAAATTTGACTAGTTCATCACAAGTTTGTCCGACAGATACTACAACATATTGTGCTTTTTTAGA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b63bc20611792bcad8062094795bca99ee2526206cc4fa170e9dc14dc95a485d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7313
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank