Protein

Genbank accession
AFH20211.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,65
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,72
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYNNRFWAATDNIPKPAGNFNRIRWKALRTDAVYTTVSSGPYQLKSGEAISVDTSVGNDIEFTLPSSPLNGETVIIQDIGGKPGINQVKINSSNQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQMVFIFNNRLWQMYIADYSREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSINGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNRTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNASTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGIDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSVLTISNTGTETHLIFEKGPQTGTNQAQTVTIRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRSINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIVKGATITSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNYWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140598,10280 Da
isoelectric point:5,54626
aromaticity:0,07370
hydropathy:-0,34825

Domains

Domains [InterPro]
AFH20211.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ACG-C40
[NCBI]
1141141 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI]
562 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFH20211.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN986846 [NCBI]
CDS location
range 148067 -> 151936
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAGCAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATAATAATCGTTTTTGGGCAGCAACGGATAATATTCCAAAACCTGCTGGAAATTTTAATAGAATTCGTTGGAAAGCATTACGTACTGATGCCGTATATACAACCGTATCATCTGGACCATATCAATTAAAATCCGGAGAAGCAATTTCAGTAGATACATCAGTTGGCAATGACATTGAGTTTACTTTACCATCTTCTCCGCTTAATGGAGAAACCGTAATAATTCAAGATATCGGTGGAAAACCTGGCATAAATCAGGTTAAAATAAATTCTTCAAATCAGAGTATTGTCAATTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTTTTAATGACTCATCCAAAGTCACAGATGGTATTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATATTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCGATTGTTACTCCATCGACTGCGTATCAAGCACAATCTAATGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAACTGAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTAACGGTTTCTTGATGTTTGACGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAATAGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTAACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATGCTTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACGCAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTGGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTAAATCAGAACACTACATTCTCTTTTGCTGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTATCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGCGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGACTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATCTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTGTACTAACTATTTCTAATACTGGAACAGAAACTCATCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCAAGCACAGACGGTGACTATTAGAGTGTGGGGTAATCAATTTAGTGGGGAATCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCTATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGTGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTTCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTGTTCGCAATGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTGCGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGTCAAAGGTGCTACTATAACTTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCGCGCACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTATTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGACATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGTAATCTTACTATTCGCGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
48ec1a742d0eccf51eb341a87f92bfd3d7455abc4ecb275548d175a04f7b6d6b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5541
Evidence 0,5541

Literature

No literature entries available.