Protein
- Genbank accession
- AFH20211.1 [GenBank]
- Protein name
- long tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TSPTF
- Protein sequence
-
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYNNRFWAATDNIPKPAGNFNRIRWKALRTDAVYTTVSSGPYQLKSGEAISVDTSVGNDIEFTLPSSPLNGETVIIQDIGGKPGINQVKINSSNQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQMVFIFNNRLWQMYIADYSREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSINGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNRTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNASTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGIDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSVLTISNTGTETHLIFEKGPQTGTNQAQTVTIRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRSINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIVKGATITSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNYWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1289 AA molecular weight: 140598,10280 Da isoelectric point: 5,54626 aromaticity: 0,07370 hydropathy: -0,34825
Domains
Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
979–1092
1
1289
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Escherichia phage vB_EcoM_ACG-C40 [NCBI] |
1141141 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Escherichia coli [NCBI] |
562 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFH20211.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN986846
[NCBI]
CDS location
range 148067 -> 151936
strand +
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAGCAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATAATAATCGTTTTTGGGCAGCAACGGATAATATTCCAAAACCTGCTGGAAATTTTAATAGAATTCGTTGGAAAGCATTACGTACTGATGCCGTATATACAACCGTATCATCTGGACCATATCAATTAAAATCCGGAGAAGCAATTTCAGTAGATACATCAGTTGGCAATGACATTGAGTTTACTTTACCATCTTCTCCGCTTAATGGAGAAACCGTAATAATTCAAGATATCGGTGGAAAACCTGGCATAAATCAGGTTAAAATAAATTCTTCAAATCAGAGTATTGTCAATTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTTTTAATGACTCATCCAAAGTCACAGATGGTATTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATATTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCGATTGTTACTCCATCGACTGCGTATCAAGCACAATCTAATGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAACTGAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTAACGGTTTCTTGATGTTTGACGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAATAGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTAACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATGCTTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACGCAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTGGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTAAATCAGAACACTACATTCTCTTTTGCTGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTATCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGCGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGACTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATCTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTGTACTAACTATTTCTAATACTGGAACAGAAACTCATCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCAAGCACAGACGGTGACTATTAGAGTGTGGGGTAATCAATTTAGTGGGGAATCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCTATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGTGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTTCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTGTTCGCAATGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTGCGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGTCAAAGGTGCTACTATAACTTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGACTTATATACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCGCGCACCACTCGCTGGACACGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTATTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGACATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGTAATCTTACTATTCGCGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
48ec1a742d0eccf51eb341a87f92bfd3d7455abc4ecb275548d175a04f7b6d6b
Literature
No literature entries available.