Protein

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Genbank accession
XPO98212.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MSLIFNPTPLYMLPNNQAVDVSKDVQFSFIFQGYELNSARLNLYRQNTSGKWVTINNDWYDFTLGGTKYNGDVVSSEFNLTNMLDYYGSNLGWRLEVYGYELTCNQDTQTPDDNSFPYNASGIETGDAFSFNVDGVRTLYYINIFSGNRMRFYTNREAALQNSNLNVVPYNKVSGKIGKAYGVSPLVPLVLIIPPLLKLNVPSSITVPNYEFVPTWQYFGATQTIVIKHWKATLYNDSGKEIDTSGDVYNGNLKYTFQTLLLSDNNYKVEYEVYDNNGYYYSTGLVDVKVFYETATSNFVPTLEVDCYDTSMKVDWSGAHNVRGVLSKGEPEYLDDYIVDGNYGLRLPKDVSLTYDVDMPQNQMPTFVWEPGSVNYDGEIVRFTSDTQELIVSYNNSTKTLYYTLNIKGTSYSYRSNISTEFSLKDKGTYLIGFYGNNGYIREVQTNQYVWFNVEGYVLQPTLAKQRSPEQMVVEGNVEKHEPTTYQAYVTPDSPLQLVSNVNPNTGNNHGALPTSETKQNLFTPWINKYAEGVSEAPTTIPCRNTEYNWFSRKGIFVNIMIDPSLGYVLGYHRFLTPIPQGEKIYVHFNAGGQPYSVRMYFTNDERTLKELYRASDDVGEVYDGSFTNSENYKYFVMDFTPQNSLNSMTISDVYVGLDEWDSEANYLPPFKDICVELATIGTTNIKVLGQANISCKDLTFSNYIETPNTEAYNQVLFTHPQITSIMYHINNEYCEYPLLSNMFENIFYASQKPKQDYPFTIAKSVKYRSLNVNALTLSFPKTFGDLDSIASYIKNNKNTNLQLIYPRKIENVEYQRTNDNKNTKDVGQTFRPSAYPSIFNVGDVVFPQNTLKIINSGRNTFDVSKHQGSSTSWDVSQQAYSHDGNAIVDMEDMWNLYKTIDKPMHLTFDAKMNVDGNLMISSGGSKEKQFVGTDVIRVGQNYQRFNVKIDKFTKRNDEGLNNGSELLFSDKDSIDVARINTPNGEENLFDYTKFNTQTLNGVTITNLNNGAFKIDGTPTSNNVAFPYWNISHDEFVKMFKPGMLILKGQTTNPSLFVQIFKSDSLIAQVVLRDGMIDTNDSIVISDAWLSDTSVTARMLFSYANTSSFKGGFTRPILYQPNSQKSSITKNLFDKNDIFKGIRVDANGLVDATNAQTSNYIEVTPNTQYYITNVIGLWIWYTGACYDKNKKFISQFNIDGTFPTSGTITTPSNCYYIVLNILAHNYLVDVNKVMMSLGSAPIDYEPFETIEVVDYEIVDDDMTYPQISMNVDGDYEQVTTQGYQLFDASKLPTKSQGGATVTNNGDGSFTISGSGNISGEFSQFYQYTHEETLKMLKVGNITLNQNGDTYPYALVQLVKVGGTGVWFRLTEVTQSANITQEMLQDGGCVLQIYIYGYNGSTIKSGTIKPMVWQEKNLFDYTKIPYKAVGDTSGGNSVTLFNNQDGSFTIAGKNLFNVNGNVNVKGYDNSQVNSNTVKDGILTCGVNRNTSHAVGQRLYGLKGKTISINAKLKSFGTGTGGYIFIYDGGGEPKRNGGIAVLDTLFAINNYTCQTDDIVIGFSTAGGTGAQFYDIMVSYGAASAGYVAFDTPVTLSETFSSDAIRWNTVASKQKLKAGTITLDALAVSKPYFEFSGSKSGSYVILMNNANDAMVSGEIEQEWINDDTTFSFIFYRASNQPSTPTVVYPIVYQPYDGTWEPFTGGEPSPSPSYAQEPKFIGDIGQNLFDASKLPTKSQGGATVTNNGDGSFTISGSGTLTSDFLNRYAYSHDETIKLLKAGNIYLKSTTSVPRAGIGIYVDGKVKYVITDIGKTTISQEDLNNPTTYLYLSLFGATNTTITPITIKPMLYQDGDGTYRPFSETPKYYLDVSTQSDNLLNGDYFYNYGLSYLIQNASGALNAISKKQYRGRNCLYVDATSSILRNCQFLKNRFKPNTRYYINITMLSYDASKPNQTGLYVRVIYTDGTRLLMGVPNEDKFNSIFVSSDPNKSISYIDLSYAYHSIGYIDLDNSFICEEAVYKKSIIDNASIDLDQPLRALPNGVRDYITQDDKVIRNVGEITYDGSSDENWVSDISYGEEYVRFYALAPNLVTSQYKVGNVICDKFPYRPYESANVQPNNEYIIAGSGYIYVLIEKSRLSESTAQGFKTWLQSNPITVWYQLATPTTNELTDEQKQQWHSLQRFSDKTHIYGNFKTSMIEYNQGLKSGALPKVSVKNISMSTDANILYEPYNAQKINVANIQLNKLYNDNELSSSGIFDSVDLEKALFTQYIKLTSFTTPTSIVSGVGVDYVVIPKPSDYSGYGNTTKGAVMGDSFRSSNLTTLIDYEEFVLYTRYNSNSFYLSIPKGMGMDLIKNYLLNRQYYYTLTNPITLNIGSKLGQQWEDFKLNAGMNTIYDDSDNGVYPYLYLTYRDSAQTS
Physico‐chemical
properties
protein length:2414 AA
molecular weight: 270929,18980 Da
isoelectric point:4,96275
aromaticity:0,12925
hydropathy:-0,38364

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XPO98212.1
1 2414
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 522 522 0,9353
Central domain 523 1212 691 0,3996
C-terminal 1213 2414 1201 0,0809
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-522
Central
523-1212
C-terminal
1213-2414

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Thomasclavelia phage TR-TP2
[NCBI] 		3385258 Viruses >
Host Thomasclavelia ramosa
[NCBI] 		1547 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Erysipelotrichia > Erysipelotrichales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPO98212.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ571310.1 [NCBI]
CDS location
range 53792 -> 61036
strand -
CDS
ATGTCTTTAATATTTAATCCAACGCCTTTATACATGTTACCGAATAACCAAGCGGTAGATGTATCTAAGGATGTGCAATTTTCATTTATATTTCAAGGCTATGAATTAAATAGCGCTAGGCTAAATCTATATCGACAAAATACTAGTGGTAAATGGGTAACAATCAATAATGATTGGTATGATTTTACGTTGGGTGGAACTAAATATAATGGCGATGTTGTATCTAGTGAATTTAATTTAACAAATATGCTAGATTATTATGGGTCTAACCTAGGTTGGAGGTTGGAGGTTTATGGATATGAATTAACTTGTAACCAAGACACACAAACCCCAGACGATAATTCATTCCCTTATAATGCAAGCGGAATTGAAACAGGAGATGCTTTTAGTTTCAATGTTGATGGGGTTAGAACATTATATTATATTAATATTTTTAGTGGTAATCGTATGAGGTTTTATACCAACCGAGAGGCAGCGTTACAAAATTCTAATTTAAACGTTGTGCCATATAATAAAGTTAGTGGTAAGATTGGAAAGGCTTATGGAGTAAGTCCGTTAGTTCCTTTGGTACTCATTATTCCGCCACTGTTAAAGCTAAATGTTCCAAGCTCTATTACTGTGCCAAACTATGAATTTGTGCCTACATGGCAATATTTTGGGGCTACACAAACGATTGTAATCAAACATTGGAAAGCAACTTTATATAATGATAGTGGTAAAGAAATTGACACAAGCGGTGATGTTTATAATGGTAATTTAAAATATACATTCCAAACATTATTATTAAGTGACAATAATTATAAGGTTGAATATGAAGTGTATGATAATAATGGATATTATTATAGTACAGGATTGGTTGATGTAAAAGTTTTTTATGAAACCGCAACATCGAATTTCGTTCCAACGTTAGAGGTTGATTGTTATGATACCTCAATGAAAGTTGATTGGAGCGGAGCGCATAATGTTAGAGGGGTTTTATCTAAGGGTGAACCCGAATACTTAGATGATTATATTGTCGATGGTAATTATGGCTTAAGATTGCCCAAAGATGTATCGTTGACATATGATGTTGATATGCCACAAAATCAAATGCCTACATTTGTTTGGGAACCTGGAAGTGTTAATTATGATGGAGAGATTGTTAGATTTACAAGTGATACACAAGAATTGATTGTAAGTTATAACAACTCTACTAAGACATTATATTATACTTTAAATATTAAAGGAACTAGTTATTCTTATAGAAGTAATATTAGTACCGAGTTTTCGTTAAAAGACAAAGGAACTTATTTAATTGGTTTCTATGGTAATAATGGATATATCAGAGAGGTTCAAACTAATCAATATGTTTGGTTTAATGTCGAGGGATATGTTTTACAACCTACTCTTGCAAAACAACGTTCTCCTGAACAAATGGTTGTTGAGGGAAATGTTGAGAAACATGAGCCTACTACTTATCAAGCGTATGTTACACCAGATAGTCCGTTGCAATTAGTGAGTAATGTTAATCCTAATACAGGCAATAATCATGGTGCTTTGCCAACAAGTGAAACTAAGCAAAACTTATTTACACCTTGGATTAATAAGTATGCCGAGGGGGTTAGCGAAGCCCCTACAACCATACCTTGTCGCAATACTGAATATAATTGGTTTAGTAGAAAAGGAATATTTGTAAATATTATGATAGACCCATCTCTTGGTTATGTTTTGGGGTATCATAGGTTTTTAACACCTATTCCACAAGGAGAGAAGATTTATGTACATTTTAATGCTGGCGGACAACCATATAGTGTAAGGATGTATTTTACAAACGATGAACGTACATTAAAAGAATTGTATAGAGCTAGTGACGATGTTGGTGAAGTTTATGATGGAAGTTTTACGAATAGTGAGAATTATAAGTATTTTGTTATGGATTTTACACCACAAAATAGTTTAAACTCTATGACAATAAGCGATGTTTATGTCGGCTTAGATGAGTGGGATAGTGAGGCTAATTACTTGCCACCTTTTAAGGATATATGTGTTGAATTAGCTACAATAGGTACAACTAATATCAAAGTATTAGGTCAAGCCAATATTTCTTGTAAAGATTTGACATTTAGTAATTATATAGAGACGCCAAATACCGAGGCTTATAATCAAGTTTTATTCACACACCCACAAATTACTAGTATAATGTATCATATTAATAATGAGTATTGTGAATATCCGTTATTAAGTAATATGTTTGAAAATATATTCTATGCTAGTCAAAAACCAAAACAAGACTATCCGTTTACGATAGCTAAGAGTGTAAAATATAGAAGTTTAAATGTTAATGCGTTGACATTGTCTTTCCCAAAGACATTTGGTGATTTAGATTCGATAGCTAGTTATATTAAAAATAACAAGAACACTAATTTACAGCTTATCTATCCAAGAAAAATTGAAAATGTGGAATACCAACGTACTAACGATAATAAAAATACAAAAGATGTGGGTCAAACATTTAGACCAAGTGCTTATCCAAGTATTTTTAATGTTGGTGATGTTGTGTTCCCACAAAATACATTAAAAATTATAAATAGTGGTAGAAATACATTTGATGTATCAAAACATCAAGGCTCTAGTACATCTTGGGATGTTAGCCAACAAGCATATTCTCACGATGGTAACGCAATTGTGGATATGGAAGATATGTGGAACTTATATAAAACCATTGACAAACCAATGCACCTTACCTTTGATGCTAAAATGAACGTTGATGGCAATCTTATGATAAGTTCAGGCGGTTCTAAAGAAAAACAATTTGTTGGAACTGATGTTATTCGTGTTGGTCAAAATTATCAAAGATTTAATGTTAAGATTGATAAATTTACAAAACGAAATGACGAGGGATTAAATAATGGCAGTGAATTGCTATTTAGTGATAAGGATAGTATTGATGTTGCTAGAATTAACACCCCTAATGGTGAAGAAAATTTATTTGATTATACTAAATTTAACACTCAAACATTAAATGGAGTGACTATTACAAATTTGAATAATGGAGCATTTAAAATCGATGGCACTCCAACATCTAATAATGTGGCTTTTCCTTATTGGAATATAAGTCATGATGAATTTGTAAAAATGTTCAAACCAGGAATGTTGATTTTAAAAGGGCAAACAACTAATCCTAGTTTATTTGTTCAAATATTTAAAAGCGATTCATTAATCGCTCAAGTGGTGTTAAGAGATGGAATGATAGATACAAATGATTCTATTGTAATATCAGACGCATGGTTGAGCGACACTAGTGTTACAGCAAGAATGTTGTTCTCTTATGCAAATACAAGCTCTTTTAAGGGTGGATTTACTAGACCTATATTATATCAACCAAATAGTCAAAAATCATCTATCACGAAGAACTTATTTGACAAGAATGATATATTTAAAGGAATAAGAGTCGATGCCAATGGATTGGTGGATGCGACAAATGCACAAACATCTAATTACATCGAAGTTACACCAAACACACAATATTATATAACTAATGTTATTGGGCTATGGATATGGTATACAGGTGCATGTTATGATAAAAATAAAAAATTTATTTCTCAATTTAATATAGATGGTACTTTCCCTACTAGCGGAACAATTACTACACCTAGTAATTGTTATTATATAGTATTGAATATTTTAGCTCATAATTATTTAGTTGATGTAAATAAAGTTATGATGTCGTTAGGTTCTGCGCCAATTGATTATGAACCATTTGAAACAATCGAAGTTGTTGACTATGAAATTGTTGATGATGACATGACCTACCCACAAATATCAATGAATGTTGATGGTGATTATGAACAAGTTACTACACAAGGTTATCAATTATTCGACGCTAGTAAACTGCCTACCAAATCACAAGGCGGTGCTACAGTAACGAATAATGGAGATGGTTCGTTTACAATTAGTGGTAGTGGGAATATAAGCGGTGAGTTTAGTCAATTCTACCAATATACACACGAAGAAACTTTAAAAATGTTAAAAGTTGGAAATATTACATTGAATCAAAATGGTGATACGTATCCATATGCGTTGGTGCAATTAGTAAAAGTTGGCGGTACAGGTGTATGGTTTCGTCTAACCGAAGTTACGCAAAGTGCAAATATAACCCAAGAAATGCTACAAGACGGTGGTTGCGTTTTGCAAATTTATATTTATGGTTATAATGGTTCAACCATTAAATCAGGCACAATCAAACCTATGGTATGGCAAGAAAAGAACTTATTTGATTACACTAAAATTCCATACAAAGCAGTTGGTGATACAAGTGGTGGAAATAGTGTTACTTTATTCAACAACCAAGACGGTTCATTTACTATTGCTGGTAAAAACTTATTCAATGTTAATGGTAATGTAAATGTTAAGGGCTATGATAATTCTCAAGTAAATTCTAATACAGTAAAAGACGGAATATTAACTTGTGGAGTAAATAGAAATACTAGCCATGCTGTTGGTCAAAGATTGTATGGGCTAAAAGGTAAAACCATATCAATTAATGCTAAGTTAAAATCCTTTGGAACTGGTACTGGCGGATATATTTTTATCTATGATGGTGGAGGAGAACCTAAAAGAAATGGTGGTATTGCAGTTCTCGACACTTTGTTTGCTATTAATAATTATACTTGCCAAACCGACGATATAGTTATTGGTTTCTCAACCGCTGGCGGTACAGGAGCGCAATTCTACGATATTATGGTAAGCTACGGTGCAGCAAGTGCTGGCTATGTTGCATTTGATACTCCAGTAACATTGAGCGAAACGTTCTCAAGCGATGCTATTAGGTGGAATACCGTTGCGTCAAAACAAAAGTTAAAAGCAGGAACTATAACTTTAGATGCTTTGGCTGTATCTAAACCTTATTTTGAATTTAGTGGTTCAAAGAGTGGTTCATACGTTATATTAATGAATAACGCCAATGATGCAATGGTAAGTGGCGAAATTGAACAAGAGTGGATAAATGATGATACAACATT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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
fb8274dfb072d564d8a603b132596c68cf0b073e0b10663ce6a0dfa9a842f55a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4337
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50