Protein
View in Explore- Genbank accession
- QBX31985.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fibers protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MADGKVTITVDLDGTSAQQGVKQLKSLLQGLGDSSSSGFNTGTKSALSFGAAIGVATKLVSAGMNAISSSISGAVSRVDTMNRFPVMMQAMGFSAQDAQGSIDDLAKGIDGLPTALDEVVGTTQQLALMTGDLGKSTKLTLALNNAFLASGSSSADASRGLQQFTQMLSSGKVDMQSWKTLMETMPLGLQKTAEAFGFAGASAKNDLYEALKKGNITFDQFSEKLIELDGGLGGFAELARINSIGIATSFKNLQTAVVRGVANMISEFDKAAKAKGLGGIAENLNKVKGAISTAFDKATPYISKFVDVIAAGVDRVKEFWNGFKGSGAISAVNNAFSHIKAAFDHVVQSLGSNKEVFKSIGDAIGDVVTQIAQFAGAVADFISQMPPETIQAIASAVVGAVLAFKGFKTVSGVLKGVSTSFDLIKAALTGNPFMVAAVAIGALVGWFIQAYTTSETFRNKVNEVVEILGEVASKVAEFLSGIDPSFLAVAGAGIATLISNFKGLNFLSKFNPFRIFKKNAKNGFDGASGSASQSKGIIEQVFSGLGTLITSIAQGISTVLQGLATALSTVAQGFGTAAAMASPAQWLSMGAAMLMVGAGVALASAGIYVLVQAAIQLASAGSGAAIALVGLGVGIAAMAGVFALLGPALTASAVGMVAFGAAVALIGAGIGMAAAGLAMLASQLPTIATYGASAASAILALSGAVVAFGAGVTVAGAGLLVLSAGLIAFGAAALVATAGGVALAAGIVVVSAAVAAFGLALQPVASAVKKMGQGAKDAGTGTKQLASGLKSITSLPLGSLVTHLGAVAIGIGKISGKGGEIASVGAGMKQLGQGLTTIATSGMMAVTAMTVIGTAITQLSTQMTTLPATLTLAAAGFTTFSSQAVAGVAGLSAINAPIAMFKSQIMTITPALMMASSGFTLFGSKAMIISTAFATIGGLITAFNTRVMTISTTMTMVSASFTVLSSGIMVVGVALAMMSSGFAQVSSSAAGASSQVINMATSTQSVIAAFNAMRGQVQSSMQAILSVITSVGNQMKSQGSQIGQQTAQNIAQGISGGIGQSTGAMQALVNAVRSVAMSGVGSMRGIGAMIGQGLAQGMLSALGTVTAAANALVSQAERAAQAKALIHSPSRLFRDNVGRFISQGMAVGILKDAYKVDDAMGDVYSQIQAFQYKAEDVLGVGKAKLSKVVQVKSDLERAIKATVEVAKEKSDSLLEKALNVAEETAKRPVEMRFDDGTLVAKTGDKFASYQAEQLRRKSRMRGITI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1265 AA molecular weight: 127256,88810 Da isoelectric point: 9,57950 aromaticity: 0,05613 hydropathy: 0,49953
Domains
Domains [InterPro]
IPR013491
TAS
73–264
TAS
73–264
IPR013491
TAS
143–221
TAS
143–221
1
1265
Architecture
TAS 73-264 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Streptococcus phage Javan88 [NCBI] |
2548312 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Streptococcus canis [NCBI] |
1329 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBX31985.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK449009.1
[NCBI]
CDS location
range 26858 -> 30655
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATGGTAAGGTAACCATCACCGTTGACCTAGACGGAACCAGTGCTCAGCAGGGGGTCAAGCAACTCAAAAGCCTCTTGCAGGGACTAGGTGATAGCTCATCTAGTGGTTTTAACACAGGCACTAAGTCCGCTCTCAGTTTTGGTGCTGCAATAGGTGTAGCAACTAAGCTAGTTAGTGCGGGTATGAATGCTATTTCAAGCTCTATTAGCGGTGCTGTGAGTCGTGTGGACACTATGAACCGTTTCCCTGTCATGATGCAGGCAATGGGATTCTCCGCCCAAGATGCTCAAGGTTCTATTGATGACCTAGCTAAGGGAATTGATGGTTTGCCTACTGCTCTTGATGAGGTTGTTGGTACAACCCAGCAACTAGCTTTGATGACAGGTGACCTAGGGAAATCAACCAAGTTAACCCTAGCATTGAATAATGCCTTTTTGGCATCGGGTTCATCTAGTGCAGATGCAAGCCGTGGTTTGCAACAGTTTACTCAGATGTTGTCATCTGGCAAGGTGGATATGCAGTCATGGAAAACCCTTATGGAAACCATGCCTCTAGGGCTCCAAAAGACAGCGGAAGCTTTTGGGTTTGCAGGAGCATCAGCTAAGAATGACCTCTATGAGGCTTTGAAAAAAGGTAATATTACCTTTGATCAGTTTTCTGAGAAATTGATTGAGCTTGATGGGGGTCTGGGTGGTTTTGCGGAACTAGCACGTATTAACTCTATTGGTATTGCGACATCGTTTAAAAACTTACAAACAGCTGTGGTACGTGGTGTTGCTAACATGATTAGCGAGTTTGACAAGGCTGCAAAAGCTAAGGGGCTTGGTGGGATTGCTGAGAACTTGAATAAGGTTAAAGGTGCAATTTCAACAGCTTTTGATAAGGCTACCCCTTATATAAGTAAATTTGTTGATGTGATTGCTGCTGGTGTTGACCGTGTCAAAGAGTTTTGGAACGGTTTCAAGGGTAGTGGTGCAATCTCGGCAGTAAATAACGCTTTTTCTCATATTAAAGCAGCTTTTGATCATGTTGTTCAGTCTCTAGGTAGTAACAAGGAGGTTTTCAAAAGTATTGGTGATGCAATTGGGGATGTTGTGACCCAGATAGCTCAGTTTGCAGGCGCTGTGGCTGATTTTATCTCTCAAATGCCTCCAGAAACTATCCAAGCAATCGCAAGTGCTGTGGTTGGCGCGGTGTTAGCTTTTAAAGGTTTTAAGACTGTATCGGGTGTTTTGAAAGGTGTATCAACATCTTTTGACTTAATCAAAGCGGCTTTAACAGGCAATCCTTTCATGGTTGCAGCTGTGGCTATCGGTGCTTTGGTTGGCTGGTTTATCCAAGCCTATACAACCAGTGAGACATTTAGAAATAAGGTTAATGAAGTCGTTGAAATATTGGGGGAAGTGGCAAGTAAGGTAGCTGAGTTCTTATCAGGAATTGACCCATCTTTTTTAGCTGTAGCTGGTGCAGGGATTGCAACCTTGATTAGTAACTTTAAAGGATTGAATTTCTTATCTAAATTTAATCCCTTTAGGATTTTCAAAAAGAATGCCAAGAATGGTTTTGATGGGGCTAGTGGGTCAGCAAGTCAGTCTAAAGGTATCATTGAGCAAGTCTTTTCTGGGCTTGGTACGTTGATAACCTCTATTGCCCAAGGCATTTCAACCGTTTTACAGGGGCTAGCAACCGCTCTATCTACTGTTGCACAGGGATTTGGTACAGCAGCGGCTATGGCAAGTCCTGCCCAATGGTTATCAATGGGGGCGGCTATGCTCATGGTTGGTGCTGGTGTTGCTTTGGCAAGTGCTGGTATCTATGTCTTGGTGCAAGCGGCAATACAGTTGGCATCTGCTGGTAGTGGTGCAGCCATCGCCCTTGTTGGTCTTGGTGTTGGCATCGCTGCTATGGCTGGTGTGTTTGCCTTACTTGGTCCAGCTCTTACCGCATCGGCTGTTGGTATGGTAGCCTTTGGTGCTGCTGTTGCCCTCATTGGTGCTGGTATAGGTATGGCGGCGGCTGGTTTGGCAATGTTAGCAAGTCAGCTACCAACCATTGCTACTTACGGTGCAAGTGCAGCTAGTGCTATTCTTGCCCTAAGTGGTGCCGTTGTTGCCTTTGGTGCTGGTGTGACGGTAGCTGGTGCAGGGCTTTTGGTCTTGTCTGCTGGCTTGATTGCTTTTGGTGCGGCCGCATTGGTTGCAACCGCTGGCGGGGTTGCTCTAGCTGCCGGTATCGTTGTGGTATCTGCTGCTGTTGCTGCTTTTGGTCTAGCCTTGCAACCCGTGGCATCAGCCGTTAAGAAAATGGGTCAAGGTGCAAAGGATGCAGGGACTGGTACAAAACAGCTTGCTAGTGGGTTGAAATCCATTACTAGTCTACCTCTAGGCAGTTTAGTTACTCATCTAGGAGCAGTTGCTATTGGTATTGGTAAAATCTCTGGGAAAGGTGGGGAGATTGCTAGTGTTGGTGCAGGTATGAAGCAGCTAGGACAGGGATTAACAACTATTGCCACATCTGGCATGATGGCAGTAACCGCTATGACTGTCATAGGCACAGCTATTACTCAATTATCAACACAGATGACCACCTTGCCAGCCACTTTGACTTTAGCAGCTGCTGGATTTACGACTTTTTCAAGTCAAGCAGTAGCTGGTGTGGCAGGATTATCAGCCATCAATGCTCCTATTGCTATGTTTAAATCTCAAATAATGACCATTACACCGGCATTAATGATGGCAAGCTCTGGCTTTACCTTATTTGGCTCAAAAGCCATGATTATTAGTACAGCTTTTGCTACTATTGGTGGTCTTATTACAGCGTTTAATACGCGTGTGATGACAATCTCAACCACAATGACAATGGTAAGCGCCTCATTTACCGTATTGAGTTCTGGAATAATGGTTGTTGGTGTAGCTCTAGCAATGATGTCATCTGGCTTTGCACAAGTATCATCAAGTGCTGCTGGCGCATCTTCCCAAGTGATAAATATGGCGACTAGCACACAATCAGTTATTGCAGCCTTTAACGCTATGCGTGGACAAGTGCAATCATCAATGCAAGCTATTTTATCTGTTATCACGTCTGTTGGTAATCAGATGAAGTCACAAGGTAGCCAAATAGGACAGCAGACAGCCCAAAATATCGCTCAAGGTATTAGTGGAGGCATTGGACAATCAACAGGAGCAATGCAGGCTCTAGTGAATGCAGTAAGGTCTGTTGCTATGTCTGGTGTGGGTTCAATGCGTGGCATTGGTGCAATGATTGGGCAAGGTCTAGCTCAAGGTATGCTGTCAGCTTTGGGAACTGTAACAGCCGCCGCAAATGCTTTGGTCTCACAAGCAGAACGAGCAGCACAGGCCAAGGCACTCATCCACTCACCGTCAAGGCTTTTCCGTGACAATGTTGGACGCTTTATCTCGCAAGGTATGGCGGTTGGTATCTTGAAAGATGCCTATAAGGTAGATGATGCCATGGGTGATGTATATAGCCAAATCCAAGCCTTTCAGTATAAGGCGGAAGATGTTCTTGGTGTTGGTAAGGCTAAGTTATCTAAAGTGGTACAGGTAAAATCAGATCTTGAAAGAGCTATCAAGGCGACGGTTGAAGTTGCAAAAGAAAAGAGCGATTCCCTACTGGAAAAAGCTCTGAATGTGGCTGAGGAGACCGCTAAACGCCCAGTTGAAATGCGATTTGATGACGGTACTCTGGTTGCTAAGACTGGTGATAAGTTTGCTAGTTATCAAGCAGAGCAGTTAAGACGAAAAAGCAGAATGAGAGGGATAACTATATGA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
b3feb724a3c0b067a777e8a3c90baffd1b09b41c2183a28110c3bff5851022e8
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Prophages and satellite prophages are widespread among Streptococcus species and may play a role in pneumococcal pathogenesis | Rezaei Javan,R., Ramos-Sevillano,E., Akter,A., Brown,J. and Brueggemann,A.B. | 2018-12-20 | — | GenBank |