Protein

Genbank accession
USL87069.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,53
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,62
Protein sequence
MSDLLKQHFRATNGLDAGGNKVINVALADRNVKTDGVSVEYVIQENTIQKYDPTRGYLTDFAVTYGRRIWIANKDIPKPAGDFNQANWTSLRVDPNWIYTVRKGEFEIQSGQFINVDSNAAGNATLLLPLAPDEGDTIVVRDIGGRPGYNGILIKAQDTGASIVFGESRLREVRLTRPYSQIMLTFSNGAWRASLTDFGDTAKMVVPNGIVPTQVQAGDNVVRRYTSNSEIFITLPLFANSNDIINFTDLDGTSPINHMTVRTFDPTISIGTPGQTEVQVRTSGNGFLVYDSIDKIWRIFENDLRTRVRIITSDVTLMPNEHISVFGTDNNTVKTINVTLPTDVAVGDTVTIAMNYMRKGQTVVIKASGGNTIASNLNLLQFPKRSEYPPDAAWVQSSSITFNGTTSYVPVLGLAYIEDKASGKSYWIVTESDPTVERVDAKDNTTRARLGVIALATQAQANAESNPEKELAITPETLNGRRSTETQTGIARIATSSEVSQPTTASYLDNVIVTPKKLNERSATENRRGLAEIATNAKMDAGTDDFTIVTPKKLLYRTTSDSRLGVIQLVKTGGAPNTTANRSSAGTGIFDHSDYKNAVTPKTLREYKATVNQSGIVWLATDSEVRNGTPASSNIPTVVTPEALHKKVATDGAIGLIQIATQTEVNAGGVTNKAVTPKTLNDRTATNDRTGIARFATPGAQGEFEAGTSSIVMVNPKLLFDKFANTDRIQVNTSSGLTITGNLWDHYTINIQEASTSQRGTTTLATAAEVRTGTDAKKIVTAATLHAKTATEGAIGLAQYATQAQVDAGTLRDRIVPPAYLKQTIQVTESWQATDSVRGTVRLSTGDGTWKGNDTNGSTLPDNGYASKGVAVSPYELNLTLKHYLPRLGKAYDTGMLGGQTPDKYARRDIAQTISGAWTFSQDTSFSNNISVKNIIYANGGEVKISPTADTGNVHVRFQNRDGSERSIIYAEPQTASAGNLKVRVKNGTGTTATSQTYTFGGNGTLDVPNEVSTKTLRSSGNAIVGGTVMVKDVQMLAVEGLNSIFGAQSQSAFIRSRDADTQIFAQDSTGSYPILTTKNYARLADGRYVKKAGDTMTGNLNLSSSAIVITGSESWYVPTNETVIRQGSWTAEIKDATKLKGLRGYMVPIRTPIDPANPSTLVVTGYEEKTAAGGVLTQVGVTTNNTYQLWTPYPPTTETADKRFAHTVWMRIYNPNLNKFDDWMRVFTSATPPTAADIGAPSSVSTQVKTLEVLEWIKLGPVKIWPDRPNQTLKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1281 AA
molecular weight: 138585,54330 Da
isoelectric point:8,50172
aromaticity:0,07182
hydropathy:-0,33794

Domains

Domains [InterPro]
USL87069.1
1 1281
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage PSE-D1
[NCBI]
2951242 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
USL87069.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON550260 [NCBI]
CDS location
range 148455 -> 152300
strand +
CDS
ATGAGCGATTTACTGAAACAACATTTCCGTGCAACGAACGGCTTGGACGCAGGCGGAAATAAAGTTATAAATGTGGCACTAGCTGACCGCAACGTTAAAACCGACGGCGTCTCCGTCGAGTACGTTATTCAAGAAAACACTATCCAAAAATATGACCCGACACGTGGGTATCTCACTGATTTTGCTGTGACTTATGGACGTCGTATCTGGATTGCAAATAAAGATATTCCAAAGCCTGCTGGAGATTTTAACCAGGCGAATTGGACTTCTTTACGTGTTGACCCGAACTGGATTTATACCGTCCGTAAAGGAGAGTTTGAAATTCAATCTGGTCAGTTCATCAACGTTGACTCTAACGCTGCAGGTAATGCTACATTACTGCTTCCGTTAGCACCAGATGAAGGCGATACCATCGTAGTTCGTGATATTGGTGGCCGTCCTGGCTATAACGGAATCTTAATTAAAGCACAAGATACTGGTGCGTCTATCGTATTTGGTGAATCGCGTCTGCGTGAGGTAAGACTTACACGTCCGTATTCACAAATTATGCTTACGTTTAGTAATGGCGCATGGCGTGCAAGTTTAACCGATTTTGGCGATACTGCTAAAATGGTAGTTCCGAACGGGATTGTTCCGACGCAAGTTCAGGCAGGTGATAACGTAGTTCGTCGTTATACTTCCAACTCAGAGATTTTTATTACTCTGCCGTTGTTCGCTAATTCAAACGATATCATCAATTTTACTGACCTTGACGGTACATCGCCAATTAACCATATGACTGTGCGTACGTTTGACCCAACTATCTCAATTGGGACTCCTGGACAAACAGAGGTTCAAGTACGTACTTCAGGTAATGGGTTTTTGGTATATGATTCTATTGACAAAATCTGGCGTATTTTTGAAAATGATTTACGCACCCGAGTAAGAATAATTACTTCTGACGTTACTTTAATGCCTAATGAGCATATTTCTGTATTTGGCACAGATAACAATACCGTTAAAACAATTAACGTTACTTTGCCTACAGACGTAGCTGTTGGGGATACTGTCACAATCGCAATGAATTATATGCGTAAAGGACAGACTGTAGTAATTAAAGCATCTGGTGGTAATACTATCGCTAGCAATTTGAATTTACTGCAATTTCCAAAACGCTCAGAGTATCCACCTGATGCAGCATGGGTGCAATCAAGCTCGATTACCTTTAACGGAACTACATCGTATGTTCCTGTTCTTGGGCTTGCATATATTGAAGATAAAGCATCCGGAAAAAGCTATTGGATTGTAACTGAATCTGACCCTACCGTAGAACGAGTTGATGCTAAAGACAACACAACTAGAGCACGATTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACGCAGGCTCAAGCTAATGCGGAGTCAAACCCAGAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACTTTAAACGGACGTCGTTCTACTGAAACCCAAACTGGTATAGCAAGAATTGCAACTTCCAGCGAAGTTAGTCAGCCAACAACAGCTTCTTACTTAGACAACGTAATTGTTACTCCTAAAAAGCTTAATGAAAGGTCTGCTACTGAAAACCGTAGAGGTTTAGCAGAGATTGCGACTAATGCTAAAATGGACGCAGGAACAGACGATTTTACAATTGTTACTCCTAAGAAGTTGCTTTATCGTACTACGTCGGATTCACGGTTAGGTGTTATTCAATTAGTAAAAACCGGCGGTGCTCCTAACACAACTGCTAATCGTTCTTCCGCTGGCACCGGTATATTCGATCATTCTGATTACAAAAATGCAGTTACTCCAAAAACTCTTCGCGAGTATAAAGCTACTGTAAACCAATCAGGAATAGTCTGGTTAGCAACTGATAGCGAAGTTAGAAACGGAACTCCGGCTTCTTCAAATATTCCTACAGTCGTTACACCGGAAGCTTTGCATAAAAAAGTTGCTACTGACGGAGCAATTGGATTAATCCAAATAGCTACACAAACTGAAGTTAATGCTGGCGGCGTGACTAATAAAGCAGTTACACCTAAAACATTAAATGACCGTACAGCAACTAACGATCGTACTGGTATTGCTCGCTTCGCGACACCTGGTGCCCAGGGTGAATTTGAAGCTGGTACTTCAAGTATAGTAATGGTAAACCCTAAATTACTGTTCGATAAATTTGCTAATACCGATCGTATCCAAGTTAATACTAGTTCTGGCTTAACTATTACTGGGAACCTCTGGGACCATTATACCATCAACATACAGGAAGCAAGTACTTCTCAAAGAGGTACAACCACTCTTGCTACTGCTGCTGAGGTTAGAACCGGCACCGACGCCAAGAAAATAGTTACTGCTGCCACGCTACATGCTAAAACAGCAACTGAAGGAGCTATCGGTCTTGCTCAGTATGCTACACAGGCACAAGTTGATGCAGGCACATTACGTGATAGAATTGTTCCTCCTGCTTACTTGAAACAGACTATTCAGGTAACAGAGTCATGGCAAGCTACAGACAGCGTTAGAGGGACCGTGAGGCTATCTACAGGCGATGGAACGTGGAAAGGTAATGATACCAATGGCTCAACTCTTCCGGATAACGGGTATGCCTCTAAGGGCGTCGCAGTGTCTCCGTATGAATTGAACCTTACACTGAAACATTACTTGCCTCGTCTCGGTAAAGCCTATGACACAGGAATGTTAGGTGGTCAAACCCCAGACAAATATGCTCGTCGCGATATAGCGCAGACTATTTCTGGAGCTTGGACATTTAGTCAGGACACTTCATTTAGCAATAATATTTCTGTCAAGAATATTATATATGCTAATGGCGGTGAAGTTAAAATTTCTCCAACTGCTGACACCGGAAACGTGCATGTTCGTTTTCAAAATAGAGATGGAAGCGAGCGTAGTATAATTTATGCTGAGCCACAAACCGCTTCAGCTGGAAACTTAAAAGTTCGTGTAAAAAATGGAACAGGAACTACTGCCACAAGCCAGACCTACACATTTGGTGGAAACGGCACGCTGGATGTTCCTAATGAAGTATCAACTAAAACTCTGAGGTCTTCTGGAAATGCAATAGTTGGCGGAACTGTTATGGTTAAGGACGTTCAGATGCTTGCTGTCGAGGGATTGAATTCAATATTCGGTGCCCAATCACAGTCCGCATTTATTCGTTCCCGTGACGCTGATACACAAATTTTTGCACAGGATTCAACTGGATCGTATCCAATTTTAACTACCAAAAACTACGCAAGATTAGCTGATGGCCGTTATGTTAAGAAAGCTGGCGACACCATGACCGGTAATCTTAACTTAAGCAGTTCTGCTATTGTCATTACGGGTTCTGAATCGTGGTATGTACCAACGAATGAAACTGTAATAAGACAAGGTTCTTGGACTGCTGAAATTAAAGACGCTACTAAACTAAAAGGTCTTCGTGGTTATATGGTTCCGATCAGAACACCGATTGACCCTGCTAACCCAAGCACTTTAGTAGTGACCGGATATGAAGAAAAGACTGCTGCTGGCGGTGTTTTAACTCAGGTTGGTGTAACTACAAACAATACTTATCAGCTTTGGACACCTTATCCTCCGACAACCGAAACTGCTGATAAGCGTTTCGCGCATACTGTGTGGATGAGGATTTATAATCCAAACCTTAATAAGTTTGATGATTGGATGCGAGTATTTACATCTGCTACTCCTCCAACTGCAGCTGATATCGGAGCTCCAAGCTCAGTATCAACTCAGGTTAAAACCCTTGAAGTTTTGGAATGGATTAAGCTTGGTCCAGTTAAAATCTGGCCAGACCGTCCAAATCAAACTCTCAAATTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
80f0e1880d84c5b128e0083e8474c9120e92f8258d03ead48876e44f9874ffdf
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5629
Evidence 0,5629

Literature

No literature entries available.