Protein

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Genbank accession
QHR70006.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNAENDARYARLEVLNTFKSRQTIVADGQALLLRSATDSPSLYVRGQDPSGTNKWYVGFNTSNVLGLSNEASGTTLTLDSAGINSNKNLNITGQVKPSDWSNLDDRYFTQTLANQRFAQLAGNNTFNGTNTFKQLSVFKKDGEAIRLQNANAAQPLYIKAIDSTGVNRWYIGNSNEGDNVALENYKTSGKITVGTSVNINKTLTVTGQVQPSDWTNIDSRYIPAATLSTLAKINAKNTFSQGQIIKADGEGIRLQGVNDTGGLFLQGYTSDGAKKWFMGTNASGNFTIREMVLGTELSLRENYIQFNKNVTITGQVQPSDWTNLDKRYYTGSASNARYMYAGKTGEGDNDAAIAWDAKTGLYNVKTGATSSNLLLQLYQGSESSTPSAQLRFKWANGGMWYRTSRDGDGFEKSWAMVYTTAQKPTPSAIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKNTNTTGAHTHSVSGSTSSAGNHSHSISWIGQNSQHYSGGGGGYIGTGPGYTDANGAHTHSVSGTAASAGNHAHSVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:777 AA
molecular weight: 83303,00050 Da
isoelectric point:8,97872
aromaticity:0,08752
hydropathy:-0,45135

Domains

Domains [InterPro]
DC_1566
STR
60–777
DC_1566
G3DSA:6.20.80.10
STR
157–217
G3DSA:6.20.80.10 G3DSA:6.20.80.10 IPR048388 IPR022246 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003 IPR005003
IPR048388
ATT
159–246
IPR048388 IPR048388 IPR051934
QHR70006.1
1 777
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR 60-158 | ATT 159-246 | STR 247-272 | ATT 273-354 | STR 355-379 | ATT 380-470 | STR 471-777
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage pinkbiff
[NCBI] 		2696440 Uroviricota > Caudoviricetes > Andersonviridae > Felixounavirus > Felixounavirus pinkbiff
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHR70006.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN850603.1 [NCBI]
CDS location
range 4380 -> 6713
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATTGATACAATTCGTTCAGATGACCTCCTCCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCATCTTTTAAACTAGAAAGGTTTGTCCAGATTGCTGGTAGCACTATGACGGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGCCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGCTGAGAATGATGCTAGATATGCTAGATTAGAAGTACTAAATACTTTTAAGTCTAGGCAGACAATTGTAGCAGATGGTCAAGCACTGTTGTTAAGAAGTGCAACTGATAGCCCTTCTCTCTATGTTAGAGGTCAAGACCCATCTGGAACTAATAAATGGTATGTTGGATTTAATACTTCAAATGTTCTTGGATTATCAAATGAAGCCTCTGGCACGACATTGACATTGGATTCAGCAGGTATTAATTCTAATAAGAATTTAAATATCACTGGTCAGGTTAAACCTTCAGACTGGTCTAACCTAGATGATAGATACTTTACCCAAACATTGGCTAATCAAAGATTTGCACAGTTGGCTGGTAATAACACTTTTAACGGCACTAATACATTCAAACAACTGAGTGTTTTCAAAAAAGATGGTGAAGCAATTAGGCTACAGAATGCCAATGCTGCACAACCATTGTACATTAAAGCAATTGATAGCACAGGTGTCAACAGATGGTACATTGGTAATAGTAACGAAGGTGATAACGTAGCTCTAGAAAACTACAAAACTAGTGGCAAGATTACTGTAGGGACAAGTGTTAATATCAATAAAACACTAACTGTAACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTGGACTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGCACTCTTGCAAAAATTAATGCTAAGAATACTTTTTCTCAAGGTCAGATTATTAAGGCTGATGGAGAGGGTATTAGGCTTCAAGGGGTAAATGATACTGGTGGTTTGTTCTTGCAAGGTTATACTTCTGATGGTGCTAAAAAGTGGTTTATGGGTACTAATGCTTCAGGAAACTTTACTATCAGGGAGATGGTGTTAGGTACTGAACTGTCTCTTAGAGAGAACTATATCCAGTTTAATAAGAATGTAACAATCACTGGGCAGGTTCAACCATCCGACTGGACTAACCTAGATAAAAGGTACTATACCGGTTCAGCATCAAACGCCAGATACATGTATGCAGGAAAAACTGGTGAAGGTGATAATGATGCTGCTATTGCTTGGGATGCTAAGACAGGGCTGTATAATGTCAAGACTGGAGCTACATCATCAAATCTTTTACTTCAGTTATATCAGGGGTCTGAGTCATCTACACCGTCTGCGCAGCTAAGATTTAAATGGGCGAATGGTGGTATGTGGTATAGGACATCAAGAGATGGTGATGGCTTTGAGAAAAGTTGGGCTATGGTGTACACAACTGCACAGAAGCCAACTCCTTCAGCTATTGGTGCATACACTAAAGCAGAGACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTGACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTGCCTGGTCTAACTTGGACGTATCTGAATAATGGTGTTGGTAGGACTATTAGAATTGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACACACGCACAGTTTTTCTGCGACTACCTCATCGTTTGACTACGGAACAAAAAACACTAACACGACTGGTGCTCACACTCACTCTGTAAGTGGTTCTACTTCATCTGCTGGTAACCACAGCCACTCTATTTCGTGGATTGGTCAGAACTCACAGCACTATTCCGGTGGTGGTGGTGGTTACATTGGTACAGGGCCGGGTTACACCGATGCTAACGGTGCTCACACCCACTCTGTAAGTGGTACTGCCGCTTCTGCTGGTAACCATGCTCACAGTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTGAGGACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0486b6d5bfb75d23774593ca32924401a1f2ac9a33afd932d5e8b06c6cf54953
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6997
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Exploring the Remarkable Diversity of Culturable Escherichia coli Phages in the Danish Wastewater Environment Olsen,N.S., Forero-Junco,L., Kot,W. and Hansen,L.H. 2020 — GenBank