Protein

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Genbank accession
WJJ53896.1 [GenBank]
Protein name
minor structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MIHVLDFNDKIIDFLSTDDPSLVRAIHKRNVNDNSEMLELLISSERAEKFRERHRVIIRDSNKQWREFIINWVQDTMDGYTEIECIASYLADITTAKPYAPGKFEKKTTSEALKDVLSDTGWEVSEQTEYDGLRTTSWTSYQTRYEVLKQLCTTYKMVLDFYIELSSNTVKGRYVVLKKKNSLFKGKEIEYGKDLVGLTRKIDMSEIKTALIAVGPENDKGKRLELVVTDDEAQSQFNLPMRYIWGIYEPQSDDQNMNETRLSSLAKTELNKRKSAVMSYEITSTDLEVTYPHEIISIGDTVRVKHRDFNPPLYVEAEVIAEEYNIISENSTYTFGQPKEFKESELREEFNKRLNLIHQKLNDNISNINTIVKDVVDGELEYFERKIHKSDTPPENPVNDTLWYDTSNPDVAVLRRYWNGRWIEATPNDVEKLGGITREKALFSELNNIFINLSIQHASLLSEATELLNSEYLVDNDLKADLQASLDAVIDVYNQIKNNLESMTPETATIGRLVDTKTLFLEYRKKLQDVYTDVEDVKIAISDRFKLLQSQYTDEKYKEALEIIATKFGLTVNEDLQLVGEPNVVKSAIEAARESTKEQLRDYVKTSDYKTDKDGIVERLDTAEAERTTLKGEIKDKVTLNEYRNGLEEQKQYTDDQLSDLSNNPEIKASIEQANQEAQEALKSYIDAQDNLKEKESQAYADGKISEEEQRAIQDAQAKLEEAKQNAELKARNAEKKANAYTDNKVKESTDAQRRTLTRYGSQIIQNGKEIKLRTTKEEFNATNRTLSNILNEIVQNVTDGTTIRYDDNGVAQALNVGPRGIRLNADKIDINGNREINLLIQNMRDKVDKTDIVNSLNLSREGLDINVNRIGIKGGNNNRYVQIQNDSIELGGIVQRTWRGKRSTDDIFTRLKDGHLRFRNNTAGGSLYMSHFGISTYIDGEGEDGGSSGTIQWWDKTYSDSGMNGITINSYGGVVALTSDNNRVVLESYASSNIKSKQAPVYLYPNTDKVPGLNRFAFTLSNADNAYSSDGYIMFGSDENYDYGAGIRFSKERNKGLVQIVNGRYATGGDTTIEAGYGKFNMLKRRDGNRYIHIQSTDLLSVGSDDAGDRIASNSIYRRTYSAAANLHITSAGTIGRSTSARKYKLSIENQYNDRDEQLEHSKAILNLPIRTWFDKAESEILARELREDRKLSEDTYKLDRYVGLIAEEVENLGLKEFVTYDDKGEIEGIAYDRLWIHLIPVIKEQQLRIKKLEESKNAG
Physico‐chemical
properties
protein length:1261 AA
molecular weight: 143731,58730 Da
isoelectric point:5,14645
aromaticity:0,07930
hydropathy:-0,69691

Domains

Domains [InterPro]
DC_0109
STR
1–639
DC_0109 Coil Coil IPR030392
IPR007119
Unmapped
25–336
IPR007119 DC_0536
IPR010572
ENZ
93–332
IPR010572
WJJ53896.1
1 1261
Architecture
STR
STR 1-1260 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage SapYZUs7
[NCBI] 		3043512 Viruses >
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WJJ53896.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ828659 [NCBI]
CDS location
range 33073 -> 36858
strand +
CDS
GTGATACATGTTTTAGATTTTAACGACAAGATTATAGATTTCCTTTCTACTGATGACCCTTCCTTAGTTAGAGCGATTCATAAACGTAATGTTAATGACAATTCAGAAATGCTTGAACTGCTCATATCATCAGAAAGAGCTGAAAAGTTCCGTGAACGACATCGTGTTATTATAAGGGATTCAAACAAACAATGGCGTGAATTTATTATTAACTGGGTTCAAGATACGATGGACGGCTACACAGAGATAGAATGTATAGCGTCTTATCTTGCTGATATAACAACAGCTAAACCGTATGCACCAGGAAAATTTGAGAAAAAGACAACTTCAGAAGCATTGAAAGATGTGTTGAGCGATACAGGTTGGGAAGTTTCTGAACAAACCGAATACGATGGCTTACGTACTACGTCATGGACTTCTTATCAAACTAGATATGAAGTTTTAAAGCAATTATGTACAACCTATAAAATGGTTTTAGATTTTTATATTGAGCTTAGCTCTAATACCGTCAAAGGTAGATATGTAGTACTCAAAAAGAAAAACAGCTTATTCAAAGGTAAAGAAATTGAATATGGTAAAGATTTAGTCGGGTTAACTAGGAAGATTGATATGTCAGAAATCAAAACAGCATTAATTGCTGTGGGACCTGAAAATGACAAAGGGAAGCGTTTAGAGCTAGTTGTGACAGATGACGAAGCGCAAAGTCAATTCAACCTACCTATGCGCTATATTTGGGGGATATATGAACCACAATCAGATGATCAAAATATGAATGAAACACGATTAAGTTCTTTAGCCAAAACAGAGTTAAATAAACGTAAGTCGGCAGTTATGTCATATGAGATTACTTCTACTGATTTGGAAGTTACGTATCCGCACGAGATTATATCAATTGGCGATACAGTCAGAGTAAAACATAGAGATTTTAACCCGCCATTGTATGTAGAGGCAGAAGTTATTGCTGAAGAATATAACATAATTTCAGAAAATAGCACATATACATTCGGTCAACCTAAAGAGTTCAAAGAATCAGAATTACGAGAAGAGTTTAACAAGCGATTAAACCTAATACACCAAAAATTAAACGACAATATTAGCAATATCAATACTATAGTAAAAGATGTTGTAGATGGTGAATTAGAATACTTTGAACGCAAAATTCATAAAAGTGATACACCGCCAGAAAATCCAGTCAATGATACGCTTTGGTATGATACAAGTAACCCTGATGTTGCTGTCTTGCGTAGATATTGGAATGGTCGATGGATTGAAGCAACACCAAATGATGTTGAAAAATTAGGTGGTATAACAAGAGAGAAAGCGCTATTCAGTGAATTAAACAATATTTTTATTAATTTATCTATACAACACGCTAGTCTTTTGTCAGAAGCTACAGAATTACTGAATAGCGAGTACTTAGTAGATAATGATTTGAAAGCGGACTTACAAGCAAGTTTAGACGCTGTGATTGATGTTTATAATCAAATTAAAAATAATTTAGAATCTATGACACCCGAAACTGCAACGATTGGTCGGTTGGTAGATACAAAAACTTTATTTCTTGAGTATAGAAAGAAATTACAAGATGTTTATACAGATGTAGAAGATGTCAAAATCGCCATTTCAGATAGATTTAAATTATTACAGTCACAATACACTGATGAAAAATATAAAGAAGCGTTGGAAATAATAGCAACAAAATTTGGTTTAACGGTGAATGAAGATTTGCAGTTAGTCGGAGAACCTAATGTTGTTAAATCAGCTATTGAAGCAGCTAGAGAATCCACAAAAGAACAATTACGTGACTATGTAAAAACATCGGACTATAAAACAGACAAAGACGGTATTGTTGAACGTTTAGATACTGCTGAAGCTGAGAGAACGACTTTAAAAGGTGAAATCAAAGATAAAGTTACGTTAAACGAATATCGAAACGGATTGGAAGAACAAAAACAATATACTGATGACCAGTTAAGTGATTTGTCCAATAATCCTGAGATTAAAGCAAGTATTGAACAAGCAAATCAAGAAGCGCAAGAAGCTTTAAAATCATACATTGATGCTCAAGATAATCTTAAAGAGAAGGAATCGCAAGCGTATGCTGATGGTAAAATTTCGGAAGAAGAGCAACGCGCTATACAAGATGCTCAAGCTAAACTTGAAGAGGCAAAACAAAACGCAGAACTAAAGGCTAGAAACGCTGAAAAGAAAGCTAATGCTTATACAGACAACAAGGTCAAAGAAAGCACAGATGCACAGAGGAGAACACTGACTCGCTATGGTTCTCAAATTATACAAAATGGTAAGGAAATCAAATTAAGAACTACTAAAGAAGAGTTTAATGCAACCAATCGTACACTTTCAAATATATTAAACGAGATTGTCCAAAACGTTACAGATGGAACAACAATCAGATATGATGATAACGGAGTGGCTCAAGCTTTAAATGTGGGGCCACGTGGTATTAGATTAAATGCTGATAAAATTGATATTAACGGTAATAGAGAAATAAACCTTCTTATCCAAAATATGCGAGATAAAGTAGATAAAACCGATATTGTCAACAGCCTTAATTTATCAAGAGAGGGTCTTGATATCAATGTTAATAGAATTGGAATTAAAGGCGGTAACAATAACAGATATGTTCAAATACAGAATGATTCTATTGAACTAGGTGGTATTGTGCAACGTACTTGGAGAGGGAAACGTTCAACAGACGATATTTTTACGCGACTGAAAGACGGTCACCTAAGATTTAGAAATAACACCGCTGGCGGTTCACTTTATATGTCACATTTTGGTATTTCGACTTATATTGATGGTGAAGGTGAAGACGGTGGTTCATCTGGTACGATTCAATGGTGGGATAAAACTTACAGTGATAGTGGCATGAATGGTATAACAATCAATTCCTATGGTGGTGTCGTTGCACTAACGTCAGATAATAATCGGGTTGTTCTGGAGTCTTACGCTTCATCGAATATCAAAAGCAAACAGGCACCGGTGTATTTATATCCAAACACAGACAAAGTGCCTGGATTAAACCGATTTGCATTCACGCTGTCTAATGCAGATAATGCTTATTCGAGTGACGGTTATATTATGTTTGGTTCTGATGAGAACTATGATTACGGTGCGGGTATCAGGTTTTCTAAAGAAAGAAATAAAGGTCTTGTTCAAATTGTTAATGGACGATATGCAACAGGTGGAGATACAACAATCGAAGCAGGGTATGGCAAATTTAATATGCTGAAACGACGTGATGGTAATAGGTATATTCATATACAGAGTACAGACCTACTGTCTGTAGGTTCAGATGATGCAGGAGATAGGATAGCTTCTAACTCAATTTATAGACGTACTTATTCGGCCGCAGCTAATTTGCATATTACTTCTGCTGGCACAATTGGGCGTTCGACATCAGCGCGTAAATACAAGTTATCTATCGAAAATCAATATAACGATAGAGATGAACAACTGGAACATTCAAAAGCTATTCTTAACTTACCTATTAGAACGTGGTTTGATAAAGCTGAGTCTGAAATTTTAGCTAGAGAGCTGAGAGAAGATAGAAAATTATCGGAAGACACCTATAAACTTGATAGATACGTAGGTTTGATTGCTGAAGAGGTGGAGAATTTAGGATTAAAAGAGTTTGTCACGTATGATGACAAAGGAGAAATTGAAGGTATAGCGTATGATCGTCTATGGATTCATCTTATCCCTGTTATCAAAGAACAACAACTAAGAATCAAGAAATTGGAGGAGTCAAAGAATGCAGGATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
74cbe1e40da19f7caf90ab89385487225e496923f991040c8ace8d024aa986d7
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3293
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50