Protein

Genbank accession
AVD99037.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MNKIYKVIWNHTTQKWDVVSELTSCRKKCKSTRLGIALSAMVLGGAIAINCNNAMADVILSPDWRPGTNNSGVGAATVSGKTEYITGPNVVQSGGSGLIWMTVEQAILNGYTTGDNLSGLIYVNTGEKTKTITVKDEVTGASQTLQVFDTDSFSQRDAGTGGNETIPGFSGTADFFNATRFVTANNGGTAILDVGSPAIGNFFKNTQLAVADGEGSSVVWNSVNDFYFQPGATMQGGGVTQKIIDSMKYAGTITDWAGKVHHINSLDDLKQYNQYLIKSLEDKTLSYKQYDAEFNKALIVTKHNYNVDMTAGGRIDSTPYKENVGLLAVLHATNNARAILGKTGKLTGVLPAYGNGGGIVATNGGTGVNEGVIDAIGTEMIAYQDSTIVNDGTLFVWDNNDKYALQAEGMVAGSNGSSAINNGVINIRPFKNAFAPEGINTAIVVSNGGMATNKGTINITADASTNDNNGKTRGVNVGAGGSFINSAFGSINVGIAEDKTATHSAVGSVAIEVQNGANKVVNEGTIFLGRGAQGNYGILAKDAGTVDVVNKGTITIDGHDSDAPALNVGMLANNSSGMKNSGIINVNGLNSTGLQVINAGQLNSDGTINVGGKGISSGFRNYGAWVEGAGSNVNVSGKISLAGTGAVGVFAKDGGSLTLSGNGAVLFGSSDQIGFYVYGKDSAIHNTGSGVMDVSTENSTLFRIASGATFQGTADASSALTASGKNSYALIATGKSDGGVASTVTSGGMTINLTGEGATATLIEGGAQGTIESNAIINMDNASAIAGIADGNGYDISGKLINPKDKTTLLTAGAQLSSTQDKVTGYIARNGATLNNTGNIIFTGKNTVGVRVEEGAVGTNSGNITVQDGGVGLIANATQDVTTINNSGNLVLKGGDNANRTTGIKASGTTTTVNMTAGTISLQGQGAIGVEASNKGTVNLDGSAVPNFAADGSGITDQIAFRIIGDGATIKTNIAPGTLLDASGERSVLFRIEDGAKQAGSLLMKTSGTGSRGIWATGKGSNVLADAGSDFQILGAQAQGLYVTGGATATLKQGASVNLVGDGAVVAEVDGNEYALDGSITQTNTGSVITNEADISSPLNNARGFITRNQGLLINNGNIDFTAGTDNIGVWVDNGRFENTGSRIAVNGVALFVEGAQSQITSTGGDIVAVDGEAAIKLGAGASLNLAGSGLGTIEGQKNAHGILLDTGAVGLVIDGAKINVNAAGAVGHGIENRAEIEGIQLTNTTEINVADGIGVRTSASLAKTNSGTINVDGSGIALAFQKADGSETDNNLDMSDSAGLVINLKGTDGTGIFANTKDGAVVKSGASVNVTQADGGSALVVNNAASEVVQSGNLISASLSHAVVDASKAQSFTNKGQIKAASTTGTAMAFDDAVNTTVLNDSGAEIQGVVVLNGGDNTFTNKGSITGTVSAKEGNNTFLFDDGSTLTGEVTAGNGNNNVTLNGKAHVDQVTAGTGKNTFTIKGEGATWNLLDGGQGDSDSLIFDNAIHTLDSVVKLQNFEHVGLKNSSLVTLKEALVLTDGGNGPGSVDIESGSELAIIPAVAGNFTFDPLLTGKGTLSARLDADTSAFEFSHNVGDQFAGTLKLGTSSFALEGLNTSGLTHAMLMSETGNITTVGSGVQQIGGLGFNGGTLIFGSVMPGDTIASNSIETSAAGTLDIRGKGTIQVTMPDEVINDIPAVDTRKNLLEQDDAQTLVTLVNAAGTVTGTGGQLQLVDENGQAISHSQTFDVT
Physico‐chemical
properties
protein length:1751 AA
molecular weight: 177171,73510 Da
isoelectric point:4,67105
aromaticity:0,04911
hydropathy:-0,04843

Domains

Domains [InterPro]
IPR024973
1–45
IPR024973 SSF88633
AVD99037.1
1 1751
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage GER2
[NCBI] 		2070178 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AVD99037.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MG710528 [NCBI]
CDS location
range 4284 -> 9539
strand +
CDS
ATGAATAAAATATATAAAGTCATTTGGAACCATACAACCCAAAAATGGGATGTTGTTTCAGAATTGACGAGTTGTAGAAAAAAATGTAAATCAACTCGCTTAGGAATTGCTTTATCAGCAATGGTTCTGGGGGGCGCTATTGCAATTAATTGCAATAACGCAATGGCAGATGTCATATTGTCACCAGACTGGCGTCCGGGTACGAATAACTCGGGTGTTGGGGCTGCAACAGTAAGTGGTAAAACCGAATACATCACTGGTCCAAATGTCGTCCAGTCTGGTGGGTCAGGTCTTATCTGGATGACTGTAGAACAGGCAATTTTAAATGGCTACACCACTGGAGATAATTTATCCGGATTGATTTACGTCAATACCGGAGAAAAAACAAAAACCATTACAGTGAAGGATGAGGTTACTGGCGCTTCTCAAACACTTCAAGTGTTTGATACTGACTCTTTCTCACAACGCGATGCGGGGACTGGGGGAAATGAAACCATTCCTGGTTTTAGTGGCACTGCGGATTTTTTCAATGCGACACGTTTTGTAACAGCCAATAATGGCGGTACAGCTATTTTGGATGTGGGTTCACCAGCAATCGGTAATTTTTTTAAAAATACACAGCTTGCTGTAGCTGATGGAGAAGGTTCCTCTGTTGTATGGAACTCGGTCAATGATTTTTATTTTCAGCCTGGTGCAACCATGCAGGGGGGCGGCGTTACTCAAAAAATCATTGACTCAATGAAATATGCTGGAACAATTACTGATTGGGCGGGAAAAGTACACCATATTAACTCTCTTGATGATTTAAAGCAATATAATCAATATTTGATAAAGTCACTAGAGGACAAAACGCTTTCTTATAAGCAGTATGATGCTGAATTTAATAAGGCCCTTATTGTCACCAAGCATAATTACAATGTGGATATGACCGCTGGGGGACGTATAGACTCAACTCCTTACAAAGAAAATGTAGGGCTGCTTGCTGTTCTCCATGCAACCAATAACGCACGAGCAATATTAGGTAAAACGGGTAAATTAACTGGAGTTCTTCCTGCCTATGGGAATGGAGGAGGGATCGTTGCAACTAATGGTGGGACCGGTGTTAATGAAGGGGTCATTGATGCCATTGGTACTGAAATGATTGCCTATCAAGACAGTACCATTGTTAACGATGGTACACTTTTTGTTTGGGATAATAATGATAAATATGCTCTCCAGGCAGAGGGGATGGTTGCCGGTAGTAATGGTTCTTCAGCCATTAATAATGGTGTTATTAATATTCGCCCATTTAAAAATGCTTTCGCTCCAGAGGGGATTAACACCGCAATTGTTGTTAGTAATGGGGGCATGGCAACAAATAAAGGCACAATAAATATTACTGCCGATGCATCAACTAATGATAATAATGGCAAAACACGAGGTGTAAATGTTGGAGCTGGAGGCTCTTTTATTAACTCGGCCTTCGGGAGCATCAATGTAGGTATTGCGGAGGATAAAACTGCGACTCATTCGGCTGTGGGTTCTGTTGCGATTGAAGTACAAAATGGTGCAAACAAAGTCGTTAATGAAGGTACTATTTTTTTGGGCAGGGGGGCTCAGGGGAACTACGGAATCCTGGCAAAGGATGCCGGGACTGTTGATGTGGTAAATAAAGGGACTATCACTATTGACGGTCATGACAGTGATGCACCTGCACTGAATGTTGGCATGCTGGCAAATAATAGCTCCGGGATGAAAAACTCCGGGATTATCAATGTTAATGGTCTGAACAGCACCGGGCTACAGGTAATCAATGCAGGACAGTTGAATTCTGACGGTACGATAAATGTTGGCGGCAAGGGTATCAGTAGTGGTTTCCGTAACTATGGTGCCTGGGTGGAAGGTGCCGGAAGCAATGTTAATGTATCCGGAAAAATCAGTCTTGCCGGTACGGGGGCTGTGGGGGTTTTTGCTAAAGATGGCGGCAGTCTGACCCTGTCAGGCAATGGTGCCGTGCTATTTGGCAGCAGCGATCAGATAGGCTTTTATGTCTATGGAAAGGACTCTGCCATTCATAATACCGGAAGCGGTGTTATGGATGTGTCCACTGAAAACTCAACATTATTCCGTATTGCCAGCGGTGCGACATTCCAGGGAACTGCAGATGCTTCTTCTGCACTTACGGCGTCTGGTAAGAACTCTTATGCACTTATTGCCACGGGGAAATCGGATGGCGGTGTGGCCTCGACAGTAACGTCTGGAGGAATGACCATCAACCTGACGGGTGAGGGGGCTACAGCGACTTTAATTGAAGGGGGAGCGCAGGGCACAATTGAAAGTAATGCCATTATCAATATGGATAATGCCAGTGCGATAGCCGGTATTGCGGATGGCAATGGCTATGATATTTCCGGCAAACTCATTAATCCGAAGGACAAGACCACACTATTAACGGCGGGGGCTCAGTTAAGTTCCACCCAGGATAAAGTGACCGGGTATATCGCCCGTAATGGGGCCACTCTAAATAATACCGGTAATATCATCTTTACTGGAAAGAATACAGTGGGCGTCCGGGTTGAGGAGGGGGCTGTTGGTACCAACAGCGGAAATATTACAGTTCAGGATGGTGGTGTGGGACTAATTGCTAATGCCACACAAGATGTTACAACGATTAATAACTCGGGAAATCTCGTTCTCAAGGGAGGAGATAATGCTAACCGTACAACGGGTATAAAAGCATCTGGTACAACAACAACGGTTAATATGACCGCGGGTACTATATCTTTGCAGGGACAGGGGGCGATTGGTGTTGAGGCCAGCAATAAAGGAACTGTTAACCTTGATGGTTCGGCAGTACCGAACTTTGCTGCTGACGGCTCTGGTATTACCGATCAGATTGCTTTTCGTATTATCGGAGATGGTGCAACCATTAAGACGAATATTGCACCGGGAACTCTGCTGGATGCCAGTGGAGAACGTTCTGTACTTTTCCGTATTGAAGATGGGGCAAAACAGGCCGGCTCTCTGCTGATGAAAACCTCTGGGACAGGCAGCCGTGGTATCTGGGCCACAGGGAAAGGGAGCAATGTCCTGGCTGATGCTGGCAGTGATTTCCAGATCCTGGGCGCTCAGGCTCAGGGATTATATGTAACTGGTGGTGCGACAGCGACGCTGAAACAGGGGGCATCAGTTAACCTTGTAGGGGATGGCGCTGTTGTCGCGGAAGTTGACGGAAATGAATACGCTCTGGATGGCAGTATTACACAAACGAATACTGGCTCGGTCATTACCAATGAGGCAGATATCTCTTCGCCGCTGAATAATGCCAGGGGCTTTATTACGCGTAATCAGGGACTGTTGATTAACAACGGCAACATTGATTTCACTGCCGGTACCGATAATATCGGCGTCTGGGTTGATAACGGCCGCTTTGAAAATACAGGAAGCCGTATTGCGGTCAATGGCGTTGCATTATTTGTTGAAGGTGCACAGTCTCAGATTACCAGCACAGGAGGGGATATCGTCGCTGTGGATGGTGAGGCTGCCATTAAGCTGGGGGCGGGCGCGTCACTGAACCTGGCAGGGAGTGGCTTGGGTACGATCGAAGGTCAGAAAAATGCGCATGGCATCCTGCTGGATACAGGGGCTGTGGGGCTGGTTATTGATGGTGCGAAAATCAATGTTAATGCTGCAGGTGCGGTCGGTCACGGGATTGAGAACCGCGCAGAAATTGAAGGCATTCAGTTAACCAATACGACTGAAATTAATGTGGCTGATGGCATTGGTGTACGTACTTCTGCCTCCCTGGCCAAGACCAACAGCGGCACTATTAATGTAGACGGCAGTGGAATTGCACTGGCGTTCCAGAAAGCTGACGGAAGTGAAACCGATAATAACCTGGATATGTCTGACTCCGCTGGATTGGTCATTAACCTGAAGGGTACGGACGGCACGGGTATTTTCGCCAACACTAAAGATGGTGCTGTCGTGAAAAGCGGTGCAAGTGTCAATGTTACACAGGCCGATGGCGGTTCCGCTCTGGTGGTTAACAATGCAGCCAGTGAAGTGGTTCAGAGCGGTAATCTCATCTCTGCTTCTCTGAGTCATGCCGTAGTGGATGCTTCAAAAGCACAATCCTTTACCAATAAAGGTCAGATTAAAGCTGCGTCCACCACCGGGACTGCAATGGCGTTTGATGACGCCGTGAATACCACCGTACTGAATGACAGCGGTGCTGAAATTCAGGGGGTTGTGGTTCTGAACGGCGGTGATAACACATTCACCAATAAAGGCAGTATTACCGGAACCGTCAGTGCGAAAGAGGGTAACAATACATTTTTATTTGATGATGGCAGCACACTGACAGGAGAAGTGACTGCAGGAAATGGCAATAATAATGTAACACTCAATGGTAAGGCTCATGTTGATCAGGTTACTGCCGGTACCGGGAAGAACACCTTCACCATTAAAGGCGAAGGGGCAACCTGGAACCTGCTGGATGGCGGGCAGGGAGATTCTGATTCCCTGATTTTTGATAACGCCATTCATACGCTGGATTCTGTTGTAAAACTACAGAATTTTGAACATGTCGGGCTGAAGAACAGTTCACTTGTCACTCTGAAGGAAGCTCTTGTGCTGACCGATGGGGGGAACGGTCCGGGTTCCGTCGATATTGAATCGGGCAGCGAACTGGCCATTATTCCCGCAGTTGCAGGCAACTTTACCTTTGATCCACTGTTAACAGGCAAAGGAACACTGTCTGCCCGTCTTGATGCCGACACATCTGCTTTTGAATTCAGCCATAACGTCGGGGATCAATTTGCCGGAACTCTGAAGCTGGGTACCAGTAGCTTTGCTCTGGAAGGGCTGAATACGAGCGGGTTAACCCATGCAATGCTGATGTCTGAAACCGGGAATATCACAACGGTTGGCTCCGGTGTTCAGCAGATTGGCGGTCTTGGGTTCAATGGCGGAACGCTGATTTTTGGTTCCGTTATGCCGGGCGATACCATTGCCAGCAA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
9d8c1b7e23be8ca2fbe8ec68b52d980d218de969fb0025585543fccdebf3a9f5
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8696
Evidence 0,8696
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
An outbreak of a rare STEC serotype (O117:H7) among men who have sex with men Baker,K.S., Dallman,T.J., Thomson,N.R. and Jenkins,C. 2018-07-01 — GenBank