Protein

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Genbank accession
AMO43279.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPLTRLDNLYSSKTGKYLYVSPDDFNATDELDNRGNSPLRPFKTIQRAFIEVSRYSYLPGANNDRFDQFSIMLMPGNHYIDNRPGLVTETAVEARYFDAGNLLEGNRQEVIDRSVAQVSVQHPDFYYPGDPQTGAWSRFKDAYRLIQKNRDFLIDRATAQIPVDHEDFVYPGDPTVGEWSRYKDAYRLIQKNKDLIAQDAFDLMNANPPSPLPDGYASKCIRDIKILIDSLSLDVHEGGGNKYTRKYIQNYFLDDGTDWVNGGLRGEETQSLVAFAEAARLMKLAITNNYTSTSSPGNEYQDLTVVIGAPNYETDSANDVPNTDPTACSDVQTFIDNLYAIVNTTFSDSDLAANNGNFDLTNVLPAETVSDKISAGHAKCKRDTGFVLDALSLDVHEGGGNRYTRKLLQNYFDSTGNNWVVNGLQGETAESLTAFGQLFTEMKRALTNQLYFKDLTITPGDAIFGNTNSPQENLPSGNPAACADIQTQIDTLGAIVTQIINDENLTNLPDETLSDVISAGLAKCKRDSGYIVDGLINDLRTEGNANTITNAKAYFDRFGNPIANGVLGEEAESITAFNGIATFAKQAVTNQLFFKDLTISPGPAYANANTPEIPNLASGNAATCVDVQATIDTLIKILTDVIEVGNLDELAAIKVTGVLPSFNYNRALEEWQDNSIVDLANPDNVLYKFNAADGGCIVPRGCSLIGYDLRRTVVRPLYVPDPADTSQPRTSIFNLTGGCYIWQFTIKDGDLSAQSPLYDASAGVGKVYYKKGSTDLAIPEYSHHKICIMEYADSKDLDNYYEKVGKSFQQFQPTIDDGGLEALVQENRIVGPLSDSRTIESIRIDDSATFTGNASNSTILNNVTNAESLEVGYEITSPDVSVVISPNTRIESISGTTVTLNQSISGSGNVSFLASFGYANITIQTKIDHGYFEGQYVAIINSGLSDEINGTWKVTKIDGVNPKIFEYEVYNNTAASLGLVSGQTYLSGEVGGVSTNAVVLAEIDSVESASPYVFNCSIRSTWGQCGMWADGSKATGFKSMVVAQYTGVSLQKDDRAFIRYDALTNTWNQASLTDAFATIPYHTKGDAYWKDDWRNFHIRASDDSFVQCVSVFAVGFFDHFLMESGGDMSITNSNSNFGNTSLHSVGFKGFSFNQDKGGYITDIVPPEIVSTSNEVINQWYTLDVPASNSRTNHTRLYLAGDDIENPDDRPASSINGYRIGAKSGETLSVDLARYAIEPTGPIEFSQTLEPNGFKSYTVGIETLTPNSANVDNYAQDSANQIEDNKALIQAEGYQYIIAKYPELLTKPNITIGKCERDIGYFVDAVVNDLRIGGNINSIQAAEGYYIAGEVAYIAGELNETIDSLDYVKNIMIAAMRNFDYLVRDAETFSGSAIVNVPSTQGLMIGMRVVEYDPSDFTNGLLNIANTPIYTNIPQNAFIKNIISDTQIELGIPGAKLNQGSTRNATGSVSGAFLYFTLENPAWASISPAVDPTITQDAQLDGNGNPLPECQNIATTIEGYFNEIFLVLNTGYTALGGREVDAYNAIIDNKRFIAAEAVYRIANDAAYAGTKLGQGLLASTGETIQDACVDDVENVLSQIAYNVKFGGNNRIYDAAELYLTGAHVQGEEAESIAVFNLARDLAINAMRQETITVQGNHGLTQTINSQVLPEYDQNGQLVTPPCADVALTISTLTALVTTAINGGSIGNKTLPAFSAVTRVEPTSDLTGLSARATLFTLATGGFGGNPNPHDLETGTPVRLVPRPKVGTNPDKRVIRLPKGFDTNTKYYVIAPGRNLYPENFSISNSVITVTEAAGTSFSTANATRATVAGIYRSLVAQPKIDTDGTALARGTGLRYNLTVNADGSIEFGNAVNNLDGIANGGSRYEIGDIVVISDGQLGGSGAPDLEIEITAVSPAEYPGVFDGTETNKLMLATSPENAAAGIYMYSSETDSVDSEVEIVINRFVLDTKYDLHKYKSNVVGASEIETNVAHIFDVPAPNTTPQIVFVRLADDIQGSTLPQLSGSASSISTQTEYFVRYVSNKRVTLHLTAADAESGDRALTFVSGTGSNFYIYANKRPSPLRFDPTYSTASNQTGLWYLNVADESSNGTANYNRYSILSRFHGGNELANDYQTKTDPTLDTRYTRIEDKREKEERVYRMRYVVPSYLETVRDPLNGFVIKTRTDDKRRLIPQRVLLKPIAGNPNNVASFYNPVGANEQIGLNKDELIADQIRTIDPSVVDLLPEQQNLYDPYLAPKVVEFDSKIAATVQSARKVIPAGESDEFIELTLFDHTIVNQSVKNEIFTVVRTNFLQGGFLQPNATQSNENNKITWETVSGNAASSGSAYLQAWFNDVNTAQITLVLKDVQGDIYYDPAGNVTFTQSNGANVQLTDVPNSFGEISPTPRDKSLRDNYLYRVEGSNVYTICPGDTITDDTGQNTYYVHTIEDQGDFDDCFYIFDIDTLQKRIPNQQDGIYYLTCLRGNISPFPTGSGVGENFRNFKFSQPISQLYPINYKNDPLWFQVDGTTGVRDTSIVDVPQTFSAADNYVHGLVTVNDAKGSETKEMVKDIISNTALDQYSYTNSTTDASSGDIIDNRIQAQEGNATSGSEDRLIPISGDSKFPTERKLYIELRRPSIARSGNHTFEYLGFGPGNYSTGFPLRQEVVLTDKQDFYAQAKREDGGIVFYTGLNSNGDLYIGNKKVNAITGEETFLESAALVDSEDEDEDIGTLVTTFDSPVTFNSTITVAGKSTLNGPVEINVEANEGDALRVFSNIGAGDDPTLFNGSWRTQSDGDVVISKNQIKAAVFYLNARPKPGAQYGQSYTWRTNYLAGEPSNIVPWQETNYFYASQTVSYGGNDPEAGDIIYKGSSIGQSGSIGWILTNQFKSAETSVQTITADGTQNLTITWIATETNDSIGIKGNSTIRISNFSNPVVNGTWEIVGWDETTSPGQQTLKFRISTPIENGTIYNWADQNTGADLQFSVSNWKETGVLGAETLRTYTEQRGDFRLGINTVARAAHSVVLTANVDDFTTPRATLDVVGTTFISGKTLVEYNAAGDVSDNRYDDNNLNSDQREGLNGAPLLTQGFIPQDNALLVGGDSNDLEQRATLRVATTDAATVDQGIGYQTGGRLGINTTLGLQARDELDRNLVVVGDGRITGNWLMEQDITVDGGDINTTSETFNLINNNANIINFAGDAQLIDMFSNTTNDQTITIGSNANFQTVRIGNNSGRSIFSVHALSANALVDIASVADDATNASQVFIGGAWANTDSKVALGSAQTLAAGNLEIGYKVAAGTGVSRLFTQTGKARLFDDDRTQVIEAFTKANDITIASLGGSTTIRNSLKVQASATVDSNIILDGGTTAGIIEIVRARFSTPLNLHNLGSLDVPNLDFYKYSTTGRFLDTEGNRFWGGSQDQAGGGRIGAFDNLQAAPDPLRVSGQYTFRFADGGTGSGAAFDVGVAFDGTVTVELVAAGSGYADNQTLTIRDSQLGGGGAPNITFDINGVTDASEVFILPITTPAASDFDIGDLILLDRGNAASPDAVTPQGGTSVTNLRDQQYSEIMRVVGLDNLTNPNDPQGFRLSVTRAQEGTGDPATGDGWTNHPDGCVIAKLDKQPAASYITGKDVGSFADPNVPDGILDEPRSGIDGTSGNVRIGVAEFGGVLTTLDLMRIDQSEIVAIADVISTDIQSLIVTDGGDPAVTNFKVESTTGNTVIAGNVGIGLGFNQFTIAGGSGNTNIAGTLTVEDTITLNGSTIPSTEFFTITNGGPSFESDGVTVNTPLRTTFQVDSATGNLLMNGGNINIFGVDGTTPRLTFNNSSGDFTTYGSFSALGDGMSSFGGPVTMAGDLTVNGGDLTVNQNGVEVFAVDDDGSLNIGGISNYFSSTGGRKWVVSNTNIINAEANVNYFVDVSGTALFKLPANAQMGDMIRIIDIGGILSYDKSLVVRAPNLVRIQGSVSNTGTTVTGNTLGENFSLTHDGGELVVQTPNAAFGLVFAGTSDADGGPGANPNKAGWYLMDV
Physico‐chemical
properties
protein length:4017 AA
molecular weight: 432911,05480 Da
isoelectric point:4,44546
aromaticity:0,08788
hydropathy:-0,26346

Domains

Domains [InterPro]
DC_0231
STR
1–324
DC_0231 DC_0231
DC_0231
STR
318–583
DC_0231 IPR009050
AMO43279.1
1 4017
Architecture
STR
STR
STR 1-583 | STR 821-4017
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM44
[NCBI] 		1278485 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Vellamovirus > Vellamovirus rhodeisland44
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO43279.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594607.1 [NCBI]
CDS location
range 22987 -> 35040
strand +
CDS
ATGCCGCTAACAAGACTTGATAATCTGTATTCAAGTAAGACTGGTAAGTATCTTTACGTATCACCAGATGACTTTAATGCAACTGATGAACTAGACAATAGAGGTAACTCACCTTTACGTCCATTCAAGACAATCCAGAGGGCATTTATTGAAGTATCGAGATATTCATATCTCCCTGGTGCCAACAACGACAGATTCGACCAGTTCAGCATCATGCTGATGCCTGGTAACCACTATATTGATAACCGTCCTGGTCTTGTAACAGAGACTGCTGTTGAGGCACGTTATTTTGATGCTGGAAATCTTCTTGAGGGTAACCGTCAGGAAGTTATCGATCGTTCTGTAGCACAAGTATCTGTTCAGCATCCTGATTTCTATTATCCTGGTGATCCTCAGACTGGTGCATGGTCTCGCTTCAAAGATGCATACCGTCTGATTCAGAAGAACAGAGATTTTCTGATCGATAGAGCAACAGCACAGATTCCTGTTGATCATGAAGATTTCGTTTATCCTGGTGACCCAACTGTAGGTGAGTGGTCACGTTATAAGGATGCATATCGTCTAATCCAAAAAAATAAAGATCTTATTGCACAAGATGCGTTCGATTTGATGAACGCAAATCCACCATCTCCTCTACCTGATGGTTATGCTAGTAAGTGTATTCGTGACATCAAGATCCTGATTGATTCACTTTCTCTTGATGTTCATGAAGGTGGTGGTAACAAATATACTAGAAAGTATATCCAAAATTATTTCCTTGATGATGGCACAGATTGGGTAAATGGTGGTCTTCGTGGTGAAGAGACTCAATCTTTAGTTGCATTTGCTGAAGCAGCTAGATTAATGAAGTTGGCAATCACCAACAACTACACTTCCACATCTTCTCCTGGTAACGAGTATCAGGATCTGACAGTTGTTATCGGTGCTCCTAACTATGAGACCGATTCTGCAAACGACGTTCCTAACACCGATCCTACAGCATGTTCTGACGTTCAGACTTTCATTGATAACCTGTATGCAATCGTAAACACTACCTTTAGTGATTCTGACCTTGCTGCAAATAATGGTAACTTTGATCTAACTAATGTTCTCCCTGCTGAAACTGTATCTGATAAGATCTCTGCAGGTCATGCTAAGTGTAAGCGTGACACAGGATTTGTTCTAGATGCACTTTCACTAGACGTTCATGAAGGTGGTGGTAACCGCTACACCAGAAAACTACTCCAGAACTATTTCGACTCTACAGGTAACAACTGGGTAGTCAATGGTTTACAAGGAGAAACTGCAGAATCTCTAACTGCATTTGGTCAACTCTTCACTGAGATGAAGAGAGCACTTACAAACCAACTGTATTTTAAAGATTTAACAATCACCCCTGGTGATGCAATCTTTGGTAACACCAACAGTCCACAGGAGAATCTACCTTCTGGTAACCCTGCTGCGTGTGCTGACATTCAAACCCAGATTGATACTCTAGGTGCAATCGTTACGCAAATCATTAACGATGAGAACCTAACCAATTTACCTGACGAAACTCTATCTGATGTTATCTCTGCTGGTCTTGCTAAGTGCAAGCGTGACTCTGGTTACATTGTTGATGGTCTGATCAATGACCTTCGCACCGAAGGTAACGCAAACACCATCACTAATGCAAAGGCATACTTCGATCGCTTCGGCAATCCTATTGCTAACGGTGTTTTAGGCGAAGAAGCAGAATCTATCACTGCATTCAACGGCATTGCAACATTTGCTAAGCAAGCAGTTACTAACCAACTGTTCTTTAAGGATCTGACTATCTCTCCTGGTCCTGCATATGCCAATGCAAATACACCTGAGATTCCAAATCTAGCATCAGGTAATGCTGCTACTTGTGTAGATGTTCAGGCAACAATTGATACTCTCATCAAAATTCTGACTGATGTTATCGAAGTTGGTAATTTAGATGAATTAGCAGCAATCAAAGTTACAGGTGTTCTTCCTTCATTCAACTACAATAGAGCACTCGAAGAGTGGCAGGATAACTCTATTGTTGATCTAGCAAACCCTGACAACGTTCTTTACAAATTCAATGCTGCTGATGGTGGTTGTATTGTTCCTAGAGGTTGTTCACTGATTGGTTACGACCTGAGAAGAACAGTTGTTCGTCCTCTGTATGTTCCTGATCCTGCTGATACTTCGCAACCAAGAACTTCTATCTTTAACCTGACTGGTGGTTGTTACATCTGGCAGTTCACTATTAAAGATGGTGACCTATCTGCACAATCTCCTCTATATGATGCCTCTGCTGGTGTTGGTAAAGTTTACTATAAGAAAGGTTCAACTGATCTTGCAATTCCTGAGTATTCTCACCACAAGATCTGCATCATGGAGTATGCAGATTCTAAAGATCTTGACAACTACTATGAAAAAGTAGGAAAATCATTCCAACAGTTCCAACCAACTATCGATGATGGTGGACTGGAAGCACTGGTTCAGGAAAACAGAATTGTTGGTCCTCTGTCTGACAGCAGAACTATCGAAAGTATCAGAATTGATGACTCTGCAACCTTCACTGGTAATGCATCTAACAGCACAATTCTGAATAATGTTACTAATGCTGAGAGTCTTGAAGTTGGATATGAGATTACATCACCTGATGTCAGTGTTGTTATCTCTCCAAACACTAGAATTGAGAGCATCTCTGGCACTACAGTTACGCTGAACCAATCGATTTCAGGATCTGGTAATGTATCATTCCTTGCATCCTTTGGTTATGCTAACATCACAATTCAGACAAAAATTGATCATGGATACTTTGAAGGTCAGTATGTTGCTATTATTAACTCTGGACTGTCTGATGAGATCAACGGAACCTGGAAGGTTACCAAGATTGATGGCGTAAATCCCAAAATCTTTGAGTATGAAGTATACAATAATACTGCAGCATCCCTTGGATTGGTATCTGGACAGACCTATCTGTCAGGTGAAGTCGGTGGAGTTAGCACAAACGCGGTAGTTCTTGCGGAAATTGACTCTGTTGAGTCCGCATCTCCGTATGTTTTCAACTGCTCGATTCGTTCTACCTGGGGTCAGTGCGGCATGTGGGCGGATGGATCCAAGGCCACTGGATTCAAGTCAATGGTCGTGGCTCAATATACTGGAGTTTCACTTCAGAAAGATGATAGAGCATTCATCCGTTATGATGCACTAACTAATACTTGGAACCAAGCATCACTTACTGATGCATTTGCTACCATTCCTTACCATACTAAGGGTGATGCATACTGGAAAGATGACTGGAGAAACTTCCACATCCGTGCTTCGGATGACTCTTTCGTTCAGTGCGTCTCGGTCTTTGCTGTTGGTTTCTTCGATCACTTCCTGATGGAAAGTGGTGGAGATATGTCCATCACGAACTCCAACTCTAACTTCGGTAATACATCACTTCACTCTGTTGGTTTCAAAGGATTCTCCTTTAACCAAGATAAGGGTGGTTACATCACTGACATTGTTCCTCCCGAGATTGTATCTACAAGCAACGAAGTTATCAATCAGTGGTATACTCTAGATGTTCCTGCATCTAACTCAAGAACTAACCACACCAGACTGTATCTTGCTGGTGATGACATTGAAAATCCAGATGATCGTCCAGCATCTTCTATCAATGGATACAGAATTGGTGCTAAGTCTGGTGAAACTCTATCTGTTGACCTTGCACGTTATGCAATTGAACCAACTGGTCCTATTGAGTTCTCTCAGACTTTGGAACCAAATGGATTCAAATCCTATACAGTTGGCATTGAGACACTGACACCTAACAGTGCAAATGTTGACAACTATGCACAGGATTCTGCTAATCAGATTGAAGATAACAAGGCACTAATTCAAGCAGAAGGTTATCAGTATATCATTGCTAAGTATCCTGAGCTACTCACCAAACCAAACATCACGATTGGTAAGTGCGAAAGAGACATCGGATATTTTGTTGATGCTGTTGTCAATGACTTGAGAATCGGTGGTAACATCAACTCTATTCAAGCAGCAGAAGGTTATTACATCGCTGGTGAAGTTGCATACATTGCTGGTGAACTAAACGAAACGATTGATTCTCTTGATTATGTCAAGAATATCATGATCGCAGCAATGCGTAACTTTGATTATCTGGTTAGAGATGCTGAGACATTTAGCGGTTCTGCAATTGTCAATGTTCCCTCTACTCAGGGTCTGATGATTGGTATGAGAGTTGTTGAGTATGATCCTAGCGATTTTACCAACGGTCTTCTCAACATTGCCAATACACCAATCTACACCAACATTCCTCAGAATGCATTCATTAAGAACATCATTAGTGATACTCAGATTGAACTTGGTATCCCTGGTGCTAAACTAAATCAAGGTTCTACTAGAAACGCTACTGGTAGTGTTAGTGGTGCATTCCTCTACTTTACTCTAGAGAATCCTGCATGGGCAAGTATCTCACCTGCTGTTGATCCTACTATCACTCAGGATGCTCAACTTGATGGTAATGGTAATCCTTTACCTGAGTGTCAGAACATTGCAACCACAATCGAAGGTTACTTCAATGAAATCTTCCTGGTTCTGAACACTGGTTACACTGCACTTGGTGGTAGAGAAGTTGATGCATACAATGCTATCATCGATAACAAGCGTTTCATTGCTGCAGAAGCAGTTTACAGAATTGCTAACGATGCTGCATATGCTGGCACTAAACTGGGTCAAGGTCTACTAGCATCGACTGGTGAGACCATTCAGGATGCTTGTGTAGACGACGTTGAGAACGTTCTTAGTCAGATTGCTTACAACGTCAAGTTTGGCGGCAACAACAGAATCTACGACGCAGCAGAACTGTATCTGACTGGTGCTCATGTTCAAGGTGAAGAAGCAGAATCTATTGCTGTATTCAACTTGGCAAGAGACTTGGCAATCAATGCAATGCGCCAGGAAACAATTACAGTTCAAGGTAATCATGGTTTAACTCAGACAATTAATAGTCAAGTTCT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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
784fbe6a690a37387c4c147260aa27cf59142bff8ebe893beee5160a9c5e8679
AlphaFold3
Source AlphaFold3
Method AlphaFold3
Resolution 0,8484
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The genomic content and context of auxiliary metabolic genes in marine cyanophages Marston,M.F., Martiny,J.B.H. and Crummett,L.T. 2016-12 — GenBank