Protein

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Genbank accession
YP_010097861.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MPNYISGRVPANDPTGVSSDRYEFLGLADAEPNLGVADAENSLVGTGTTGSRILTDTPTVGGINATGIITAASGIITTVNAEVVDASSNLYAQVGVITSLDSTDFVSAGGTITTFNSTDSTITTANVTTVNAETVDAGTVLYATTGIITAATLTDTVGTAGTFTNLTATHFTPTDTVGTAATFTKATIYTGIITTLTTTDSIGVAATFTDLTTDRFNPEDIVGTAATFITLNVTSEATISRLTPTDTVGTAGTFTDLDVTRLAPTDTVGTAATFTDLDASRFTPTDTVGTAATFTTVVVNGDATITRLTPTDTVGTAGTFTDLNATRFTPTDTVGTGATFTDLDATHLTATDTVGTGATFTTVVVNGDVTVTRLAPTDTVGTGATFTDLDATNLTVTNTVGTGATFTNLVSTRIDTTDFVGTGGTFTDLKIATLQASAGSLDIDATSVDAENLYAATGIITTLTSTDVTVGGGVTVSAASTFSGDVTFYAGIRDRDGEIGAAGQVLQSTGTQVNWVNFGDAGFTVKDEGNIVGTAGSISSLDFVGLGVLATASGIGATITVGALDVANGDDTQVQYNDGGTLGGAVGLVYIDGTERTGIGSTNPNRKLAVSGDVTVHENIYARRFYGTASTPVDSLEMANKAYVDSVQAGIVIKAAVSAGSTQAISGLSYTNGLSGVGAKLFADANGSIQGLLDGVTGLQVQDRILIKDQGVGGVGNTAHNGFYEVTRIGSGSTSWELQRVTDYDEPGEVVAGAFTFVLNGAINEGNGFVQLTKEPVAIGTSAIEYTQFTAPGQVTAGDGLVKTANTLDVVTEDPNRIVVNPDSIDLATTSANLSYVSTGSTVFVQGITFDNYGRITGIVTENTITRATDVTHGVVRVRDDAQLNISGGDISLTDYPEFINLNVTGITSSSTGIITSVQTESLQVTGITTLTDNLKLGENDVIQIGAGSDLEILHDGSHSIIKDTGTESLKILSNNFALKNSADNETHIQASNNAGVDLYYDNSKKFETTGYGASLTGTFRSNGLINTGITSFQANVYLGDNDTIHFGNDSDLQIYHNGSNSYIRDVGTGNLIIEGTNVLIYQNETELAIQATQNGSVDLYYDNSKKFETTGFGATVIGTLNVNGFVNSGVSTFQANAHFGDNDKLRLGDGNDLEIYHSGSHSYIKDSGQGNLYVTSNRVEFRNAADTESIAHFIENGSVQLYFDNSKKFETTGYGATVFGTFRSNGLINAGVTTFQANVNLGDNDRLRLGDGNDLQIYHDASNSYITNATSDLRIRSQYLKLQGNNGENMLVGNQNSNVEIYYDNAKKFETTGFGATVTGTFRSQAVLVGGATTIAGTLELDSYLEDRYGQVGAATSVLIGDASGVKWESIATAALQGPKGEKGQKGQKGEIGPKGDKGQKGDKGQKGELGPTGEKGQKGELGEKGQKGAQGPAGPTGPTGPTGPAGPTGPTGPTGPKGQKGEQGATGPKGEKGQKGQTGATGPTGPTGPVGPTGPTGPTGAKGQKGQKGAQGATGPTGPQGPTGPTGPTGPKGQKGARGPTGPTGPVGPPGPNTTPSVTITGSGNDVLNFSANTSNDNRGISFNNRTAVTADYNDGWVRINNQNEFGNGCYTPERFRGDTGLFVNSSQGISNSSGNYGTIRTTGGGDGGWEGYSIDNRYVFMAADNDNAGLYNDIDNEWCVYFQRNNYTKLYYNGGERLATTSNGVSVNGTVTANSDRRLKDNIQPLDGSLDKVLKMRGVSFEWKDPKMGEGENLGFIAQEMQEVEPRLVTEGLREITGEQYLTVAYSSLTAHLVEAIKEQNVVINNLKDRLDRLENQNGTE
Physico‐chemical
properties
protein length:1824 AA
molecular weight: 188834,22170 Da
isoelectric point:4,48547
aromaticity:0,06798
hydropathy:-0,26014

Domains

Domains [InterPro]
DC_0955
STR
747–1033
DC_0955 DC_0955 IPR050149 IPR030392 Coil
DC_0955
STR
1020–1133
DC_0955 DC_0955 DC_1460 DC_1985
IPR008160
STR
1379–1437
IPR008160 IPR030392
DC_0620
STR
1424–1505
DC_0620
YP_010097861.1
1 1824
Architecture
STR
RBD
STR 747-1534 | RBD 1553-1824
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus virus S-PRM1
[NCBI] 		2100130 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Makelovirus > Makelovirus prm1
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010097861.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055761 [NCBI]
CDS location
range 122963 -> 128437
strand +
CDS
ATGCCTAATTACATTTCTGGTCGCGTCCCAGCTAACGACCCAACAGGAGTTAGTTCAGACAGGTATGAATTCCTGGGTTTGGCTGATGCTGAACCTAACCTTGGAGTTGCGGATGCGGAAAATTCTCTAGTAGGAACTGGTACAACTGGTTCCAGAATTCTTACCGATACTCCAACTGTAGGTGGAATTAATGCGACTGGAATTATTACAGCGGCTAGTGGTATCATTACAACAGTTAATGCTGAAGTTGTAGATGCCAGTTCTAATCTTTATGCCCAGGTTGGTGTTATAACGAGTCTTGACTCTACAGATTTTGTGAGTGCTGGTGGTACTATTACTACCTTCAACTCTACAGACTCAACAATCACCACAGCAAATGTCACGACAGTAAACGCTGAAACTGTTGATGCTGGTACAGTTTTATATGCAACTACGGGTATTATTACTGCAGCTACACTTACAGATACTGTAGGTACTGCTGGTACTTTTACTAACCTTACGGCAACGCACTTTACACCTACCGATACTGTAGGTACTGCTGCGACTTTTACAAAAGCCACAATTTATACTGGCATCATCACTACTCTGACAACTACAGATAGTATAGGTGTTGCTGCTACATTTACTGATCTTACTACTGACAGATTTAATCCAGAAGATATTGTAGGTACTGCAGCCACATTTATCACTTTAAATGTAACTAGTGAAGCCACAATATCAAGATTAACTCCAACAGATACTGTTGGTACTGCTGGTACATTTACTGATCTTGATGTAACTAGATTAGCTCCAACAGACACTGTTGGTACTGCTGCTACATTTACCGATCTCGACGCAAGTAGATTTACACCCACCGACACTGTAGGTACTGCTGCCACATTTACTACTGTTGTTGTAAATGGAGATGCTACGATAACCAGACTTACACCCACCGATACTGTGGGTACTGCTGGTACATTTACTGACCTTAATGCAACTAGATTTACACCCACCGACACTGTTGGTACAGGTGCTACATTTACTGATCTTGATGCGACTCATTTAACTGCAACAGATACTGTTGGTACTGGTGCTACATTTACTACTGTTGTTGTAAATGGAGATGTTACGGTAACCAGATTAGCTCCAACAGATACTGTTGGTACTGGTGCTACATTTACTGATCTTGATGCGACTAATTTAACTGTAACAAATACTGTTGGTACTGGTGCTACATTTACGAATCTTGTATCGACTCGTATTGATACAACTGATTTTGTAGGTACTGGTGGCACATTTACTGATTTAAAAATTGCTACTCTTCAAGCCAGCGCTGGTAGTCTTGATATTGACGCTACAAGTGTTGATGCAGAAAATCTTTATGCTGCAACTGGTATTATTACCACTCTCACATCCACCGATGTAACTGTCGGTGGTGGAGTTACTGTATCTGCAGCTTCTACTTTCTCTGGTGACGTTACTTTTTACGCTGGGATTAGAGATCGAGATGGTGAAATTGGTGCTGCAGGTCAGGTCCTTCAATCGACTGGAACACAGGTAAACTGGGTAAACTTTGGTGATGCTGGATTTACTGTTAAGGATGAAGGAAATATTGTAGGTACTGCGGGTAGTATTTCATCTCTTGATTTTGTTGGTCTTGGTGTACTTGCAACTGCAAGTGGTATTGGTGCTACAATTACCGTTGGTGCATTAGACGTTGCTAATGGTGATGATACCCAAGTTCAGTATAATGATGGTGGTACTCTGGGTGGTGCAGTTGGATTAGTTTATATTGATGGTACAGAAAGAACTGGTATTGGTAGTACAAATCCAAATAGAAAACTGGCGGTCAGTGGTGATGTAACCGTCCATGAAAATATCTACGCAAGAAGATTCTACGGTACAGCTTCTACGCCTGTTGATTCTCTTGAAATGGCCAACAAGGCATACGTTGATAGTGTCCAGGCAGGTATTGTTATTAAAGCTGCTGTTTCTGCAGGTTCGACACAAGCAATATCGGGTCTTTCTTATACAAATGGACTTTCTGGTGTTGGTGCTAAATTATTTGCTGATGCGAATGGAAGTATTCAAGGTTTACTTGATGGTGTAACTGGACTTCAAGTTCAAGATCGTATTCTTATTAAAGACCAGGGTGTTGGTGGAGTAGGAAATACTGCACACAATGGTTTTTATGAAGTTACAAGAATTGGTAGTGGATCTACATCTTGGGAACTTCAAAGGGTTACTGATTATGATGAACCAGGTGAAGTCGTCGCTGGTGCATTTACATTCGTTCTGAATGGTGCAATCAACGAAGGTAATGGTTTCGTTCAGTTGACGAAGGAACCTGTTGCGATTGGTACATCTGCGATTGAATACACGCAGTTTACTGCGCCTGGTCAGGTAACTGCTGGTGATGGTCTTGTTAAGACTGCTAATACTCTGGACGTTGTAACTGAAGACCCTAATAGAATTGTCGTCAATCCAGATAGTATCGATCTGGCTACAACATCCGCTAACTTAAGTTATGTTTCTACTGGATCTACAGTATTTGTACAAGGAATAACGTTTGATAATTATGGTCGAATAACAGGAATTGTAACTGAAAACACGATCACACGAGCTACAGATGTAACTCATGGTGTTGTGAGAGTTCGAGACGACGCTCAACTTAATATTTCTGGTGGTGATATCAGTCTTACTGATTATCCAGAGTTTATTAATCTAAACGTCACTGGAATCACATCATCTTCTACTGGTATTATTACCAGTGTTCAAACAGAATCTCTACAAGTAACTGGTATTACCACCTTAACCGATAATCTGAAACTTGGTGAGAACGATGTAATTCAAATTGGTGCAGGTAGTGATCTTGAAATTCTTCATGATGGATCTCACAGTATCATCAAAGATACCGGCACAGAAAGTTTAAAGATTTTATCAAATAATTTTGCACTGAAGAATAGTGCAGACAATGAGACTCATATCCAGGCTTCCAATAATGCTGGAGTGGATCTCTACTACGACAACTCTAAGAAATTTGAAACCACTGGTTATGGTGCATCTTTAACTGGAACCTTTAGATCTAATGGTCTGATTAACACTGGTATTACTTCATTCCAAGCCAATGTATATCTTGGTGACAATGACACAATACATTTTGGTAATGATTCCGACTTGCAGATTTATCACAATGGATCTAACAGTTACATTAGAGATGTTGGAACAGGGAATTTAATTATTGAAGGAACTAATGTTCTTATCTACCAAAATGAAACTGAACTTGCTATTCAAGCAACACAAAATGGTTCTGTAGATCTTTATTATGACAACTCCAAGAAATTTGAAACTACAGGATTTGGCGCAACTGTAATAGGAACACTCAACGTTAATGGTTTTGTTAACTCTGGTGTTTCTACATTCCAAGCTAATGCCCATTTTGGTGACAATGACAAATTAAGACTTGGTGATGGTAATGATTTAGAGATCTATCATTCTGGTTCTCATAGTTACATAAAAGACTCTGGCCAGGGTAACCTGTATGTTACATCAAATAGAGTTGAATTTAGAAATGCTGCCGATACTGAATCTATTGCTCACTTTATTGAAAATGGATCAGTACAACTCTATTTCGACAACTCCAAGAAATTTGAAACCACTGGTTATGGTGCAACAGTTTTTGGAACCTTTAGATCCAATGGTTTAATCAATGCTGGTGTTACTACCTTCCAAGCTAATGTAAATCTTGGTGATAATGATAGATTGAGACTTGGTGATGGTAATGATTTGCAGATTTATCATGATGCGTCTAATAGTTATATAACAAACGCAACATCTGATTTAAGAATACGAAGTCAGTATCTAAAATTACAAGGTAATAATGGCGAGAATATGCTCGTTGGTAATCAAAACTCAAATGTGGAGATATACTACGACAACGCCAAGAAATTTGAAACTACAGGATTTGGTGCAACTGTAACGGGAACATTCAGGTCTCAGGCTGTATTAGTTGGTGGTGCAACAACAATTGCTGGTACATTAGAACTTGATTCTTATCTGGAAGACAGATATGGTCAGGTTGGTGCTGCAACATCTGTTCTGATTGGTGATGCCTCTGGCGTCAAGTGGGAATCAATTGCAACTGCTGCACTCCAAGGTCCCAAAGGTGAGAAAGGACAAAAGGGACAAAAAGGAGAAATCGGTCCAAAAGGTGATAAAGGTCAGAAGGGCGATAAAGGTCAAAAAGGTGAACTTGGCCCTACTGGTGAAAAAGGTCAGAAGGGTGAACTTGGTGAAAAAGGTCAGAAGGGTGCTCAAGGTCCTGCAGGTCCTACTGGTCCTACCGGCCCAACTGGTCCTGCAGGTCCCACTGGTCCCACAGGCCCAACTGGTCCAAAAGGTCAGAAGGGTGAACAGGGTGCAACAGGTCCTAAGGGTGAGAAGGGACAAAAGGGTCAAACTGGCGCAACAGGTCCTACAGGACCCACAGGTCCCGTCGGCCCAACTGGACCTACAGGTCCCACAGGTGCGAAGGGTCAGAAGGGTCAGAAAGGTGCCCAAGGCGCAACAGGTCCCACAGGTCCACAAGGTCCCACTGGTCCCACCGGCCCAACTGGTCCTAAGGGTCAGAAGGGTGCCAGAGGTCCCACAGGTCCCACAGGTCCCGTCGGCCCACCAGGACCTAACACCACTCCATCAGTAACAATTACTGGTTCTGGTAATGATGTTCTGAACTTCAGTGCTAACACCTCTAATGACAACAGAGGTATTTCGTTCAACAACAGAACGGCTGTTACCGCTGACTATAATGATGGTTGGGTGAGAATCAACAACCAGAATGAATTTGGCAATGGTTGTTACACACCAGAAAGATTCCGTGGTGATACGGGTCTGTTCGTTAATAGTTCTCAGGGTATTTCAAACTCTAGTGGTAACTATGGAACCATTAGAACCACTGGTGGTGGTGATGGTGGTTGGGAAGGTTATTCAATTGATAACCGTTATGTATTCATGGCGGCTGACAATGATAACGCTGGTCTTTATAATGATATTGATAATGAATGGTGTGTTTATTTCCAACGCAACAACTACACCAAACTGTATTATAATGGTGGAGAAAGACTTGCAACTACAAGTAATGGCGTCAGTGTCAATGGTACAGTTACTGCAAACTCTGACCGTAGATTGAAGGATAACATTCAACCTCTTGATGGATCACTTGATAAAGTTCTGAAGATGCGTGGTGTATCTTTTGAATGGAAAGATCCCAAGATGGGTGAAGGTGAGAACCTTGGTTTTATTGCACAAGAAATGCAAGAAGTTGAACCAAGACTGGTTACTGAAGGTCTTCGAGAAATAACTGGTGAACAGTATCTGACTGTTGCATATTCTTCTTTGACTGCACACCTGGTTGAAGCTATTAAGGAACAAAACGTCGTCATAAATAATTTGAAAGATAGACTCGACAGACTGGAGAATCAGAATGGCACTGAGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7f9732e86a7125019111f18693af410c0402207c3196775942950717edf6b5db
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5545
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of the cyanophage S-PRM1 isolated from Singapore coastal waters Chenard,C., Kolundzija,S. and Lauro,F.M. 2017-12 — GenBank