Protein

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Genbank accession
AYD85686.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,88
Protein sequence
MDNLDNGLELLSGRLVVLFLTYDLALKASANFPAGTKVKVTNDPNPDLNGEYTWDGTKLVKTTNNTLEKAKEEAEKIVNDKIDNTLTKDKILDLISGEITESDLDQNLRQRIDEIESISPIIDKLKKDVKKSKEEVDEKVFFLNVDYQNLKEEVQNIQLQVDLDFQAIQDRIDQIQAEVDAKWLEVDQIRDDLTKEINDRVAAVREETEQRIEDVRKLNDGLTQEIIDRKDGDQKLYENIENYKVSNDDALANVREEVRVAVDTANASAEKVDSMDARVKVAEDNAGTALENSAAAVSKANAASDLASATAGRVDSMQADVVKALDDSGTALTNSATAIEQSQVAVDKANAAAESVTVLESKLNSKNATYRQDTAPTKDTHPNLTEGDLWINPSANNEQKRWNGTDWVDISDVRVGQNATAISELKTSVKEQDDKITAVSEKVTSLEATIGDMATSEALEQLKGTVTEQGDKIDANTEKLVALETTVGKNQEANAKALQDLTTRIEKDEDDIKANTSAITALDSTVNASLNAINITADMNLENDLIYYNSSSQNVVKSISESGTTRRVLTIGDNSSDDMAWMYPKAMLPYDPDVMYKVRAKLRRLSGDGAVYLGLVVKNSDKTQFVTSNNILSDNVSSSSYFADGVIPPLNEWVEYEWYIKGRASSSALLPPTYGGLGNPIQMQNATGYITPVFIANYSGLSGVVELAYMVLERAEAYKVISANANALTSLKTDVQKNTDGIQAMGEAITNVEASITNMDIGGQNHWTIWPIEPTQSDADNPYLSVQWLTESQEWIRTTLTKDVNSYHHSFDGLLIDLSYPIVIGELYTLTFEMRASKAITIAATTINFGTNVTYTDNSLTTDTEWKTYTITFPTKGTLTSKANQAFGLTLLKGHGWTTNDWYELRRIQMQKGNKATRYQKAQAGLVEGIKANSQAFNGLKATVEQQGEDIKSQGQAITGLKQEIADKASSQALSELKSTVEQQGESIRINTEAITSLKGVVDGKADADALNSLKITVQEQGETLLTQGQAITSVRATADLALNGKKTLIDLTALDPNLYYPVFIPVSTTGISEIEISPKLGDFQAPWSTHYSGSYSLGVRWTTRGHGWGAEAIDRVIEKFGYLWADQSPAMEINQRGEDSKEYIYLRGGTIYPFVTNQFADTPYLESNPVGVAFDQSKVPQSVNARVGANASAISSLDSKINIVGDKVDVNAQAITGLQAEIKDKASSEALNQLSVTVRDQGQLIDTQGQAITKVESKVDNLKVGTGNLLRNSSFSESLDQWAWNGQVESADFIAEYGIPSGQSKYLKMRVSTGGSGYYQGVPFVKQGEEVIFSIWARGETGNEVLRLLWEGHEAFADHQLTTSWARYTLKTKPVINAPNVVIYTVNAGTFHISSAQYERGNIVSDWHPNSEDMASARAVSLLNTKIDNVDNKVNIQAQAITDLRSDLNNKANAQALNELSTTVQEQGETIQSQGKVLTSVEATANRTSSQLGTTVSYMLYTFRNGASSITKTGLYKADGTRLEGVSRGLNVYLFAANGDFVSLRFFDTYGDIDNACNNMVAYLSDLPQNSFIAIAGCDNLGAVSWPSGPPKALRDHLRDVWGVAQSSVDKWQYNDIPIVICRKWGPKNSAIDKLYTSSINGDWYSLGITFIDGIPNDWGGDTSKTNIEANASAISTMNADVIKNRDDIRVNAEAITGLSGRIDGKADAQALSQLQITVKEQGETISSQGQAITQVQASADMALNGKKYVVDLTALDPNLYYPVFIPVSSGSGISEISVTASLDEYKAPWSSHGSGTYSLNVRWRVRGSGWGANSIEREILRFGYAWCGDQSPVIEISQQGEQSREYIYLRGGTQYPFYVNQYAGQPFTDLGNYGGVPYRTDLMPVTINAATQANASAVSTLNAKVDIVDGKATSVAESVTKLQTSSSAATYQLLRGSNRIGEKPVGSNPYPFWSQPIDKPLTAGKTYTLVYEAEFQSGGANSYFRPYFNGIQDISQTNQSFGRQVKVDKAVLWFAETTAIDFYIVGSQPDQNNSYAKVYWACLYEEDQPNPIKVWMPNTRENSAKLEVQGQSIDGLMTKWSVKADVNGYVSGVAMNNNGREANFIIRADTFAIAPPVGSGGGDVPKYGFVYQASAKTLPNGTVIPAGLYVDNLMLGEINAEKINANSLSAISANLGTFTSSNAKGTMTISGTDISVKDTNGVERIFIGL
Physico‐chemical
properties
protein length:2211 AA
molecular weight: 241211,53530 Da
isoelectric point:4,76472
aromaticity:0,07644
hydropathy:-0,37644

Domains

Domains [InterPro]
DC_0308
STR
21–953
DC_0308 DC_0338 DC_1746 IPR039477 DC_0338
Coil
Unmapped
60–84
Coil Coil Coil PTHR34491 DC_0839
G3DSA:2.60.120.260
STR
800–922
G3DSA:2.60.120.260 G3DSA:2.60.120.260
IPR008979
STR
800–878
IPR008979
AYD85686.1
1 2211
Architecture
STR
STR
STR
STR
STR 21-953 | STR 963-1527 | STR 1529-1582 | STR 1601-2210 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage vB_AbaM_B09_Aci02-2
[NCBI] 		2315467 Uroviricota > Caudoviricetes > Saclayvirus >
Host Acinetobacter baumannii
[NCBI] 		470 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AYD85686.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH800199 [NCBI]
CDS location
range 19021 -> 25656
strand +
CDS
ATGGATAATTTAGACAACGGTTTAGAGTTATTATCAGGTAGATTAGTAGTCTTATTTTTAACTTATGATTTGGCTTTGAAAGCTTCTGCTAATTTTCCAGCTGGAACCAAAGTCAAAGTAACCAATGACCCAAACCCTGATTTAAATGGTGAATATACTTGGGATGGAACAAAGTTAGTAAAAACTACAAATAACACACTTGAGAAGGCTAAAGAGGAAGCTGAAAAGATTGTCAATGATAAAATAGACAATACTTTAACTAAAGATAAGATTTTAGACCTTATCTCTGGTGAAATTACAGAAAGTGACTTAGATCAAAACTTAAGACAACGTATAGATGAGATTGAAAGTATTTCACCGATCATCGATAAGTTGAAGAAAGATGTGAAAAAATCTAAGGAAGAGGTGGATGAGAAAGTTTTCTTCTTAAATGTTGACTATCAGAATTTGAAAGAAGAAGTTCAAAATATTCAACTCCAAGTAGATTTAGATTTCCAAGCGATTCAAGATCGTATTGATCAGATTCAAGCTGAAGTTGACGCTAAATGGCTTGAAGTTGACCAAATTAGAGATGATTTAACAAAAGAAATTAATGATCGTGTTGCTGCTGTCCGTGAGGAAACAGAACAACGTATCGAAGATGTAAGAAAATTAAATGATGGTTTAACTCAAGAGATCATTGATCGTAAAGATGGTGATCAGAAGTTATATGAAAACATCGAAAACTATAAAGTGTCAAATGATGATGCTCTTGCTAACGTAAGAGAGGAAGTCAGAGTTGCCGTAGATACTGCCAATGCTTCTGCTGAAAAAGTAGATTCTATGGATGCCAGAGTTAAGGTTGCAGAGGACAATGCTGGAACTGCTTTAGAAAACTCTGCTGCTGCTGTTAGTAAAGCCAATGCTGCTTCTGATTTAGCTAGTGCAACTGCTGGTCGTGTCGATAGTATGCAAGCTGATGTAGTCAAAGCTCTTGACGACTCTGGTACAGCTCTTACAAACTCTGCTACAGCTATTGAGCAATCACAGGTTGCTGTTGATAAAGCTAATGCTGCTGCTGAGTCTGTTACTGTACTTGAATCGAAGCTTAACAGCAAGAATGCTACATACAGACAAGATACTGCACCAACAAAAGACACACACCCAAATTTAACTGAAGGTGATCTATGGATTAACCCTTCGGCTAACAATGAACAAAAACGCTGGAATGGTACTGACTGGGTTGACATCTCAGATGTTCGTGTAGGTCAGAATGCTACAGCTATCTCAGAGTTGAAAACCTCTGTAAAAGAGCAAGATGATAAAATCACTGCCGTTTCTGAGAAAGTAACGAGCCTTGAGGCAACGATAGGTGATATGGCTACCTCAGAGGCCCTTGAACAATTAAAGGGTACTGTAACTGAACAGGGTGACAAAATCGATGCCAATACAGAAAAGCTTGTAGCTCTTGAGACAACTGTAGGGAAGAATCAAGAAGCAAATGCTAAGGCTCTTCAAGATTTAACTACTCGAATCGAGAAAGATGAAGATGATATTAAGGCAAACACCTCAGCTATCACAGCATTGGATTCAACAGTAAATGCATCATTGAATGCAATCAACATCACAGCTGATATGAACCTTGAAAATGACTTGATATACTACAATAGTTCATCACAAAATGTTGTTAAGTCAATCTCTGAATCAGGTACAACAAGAAGGGTTTTAACTATTGGAGACAATAGTAGTGATGATATGGCTTGGATGTATCCAAAAGCCATGTTACCTTATGATCCAGATGTTATGTACAAGGTAAGAGCTAAATTAAGACGCTTATCTGGAGATGGTGCTGTTTACCTTGGATTAGTTGTTAAGAATAGTGATAAAACCCAATTTGTTACTTCTAACAACATATTATCAGATAATGTTTCTAGTTCATCTTATTTTGCTGATGGAGTCATTCCTCCATTAAATGAGTGGGTTGAATATGAGTGGTATATTAAAGGTAGAGCTTCTTCTAGCGCTCTTCTTCCACCTACATACGGTGGCTTAGGAAACCCTATCCAAATGCAGAACGCTACTGGATACATCACCCCTGTTTTTATTGCTAACTATTCAGGCTTATCTGGTGTTGTTGAACTTGCTTATATGGTATTAGAGAGAGCTGAAGCATACAAAGTTATTTCAGCAAATGCTAATGCGCTGACAAGTCTTAAAACAGATGTCCAGAAAAATACTGATGGCATTCAAGCAATGGGTGAGGCTATCACTAATGTTGAAGCTTCTATCACAAATATGGATATTGGTGGACAAAACCATTGGACTATTTGGCCTATTGAACCAACACAATCTGATGCTGATAATCCTTACCTTTCTGTACAATGGTTAACCGAGAGTCAGGAATGGATTAGGACTACACTCACAAAGGATGTAAATTCTTACCATCACTCTTTTGATGGTTTGCTGATTGATCTGAGCTATCCTATCGTTATTGGTGAGTTATACACACTGACATTTGAGATGAGAGCTTCTAAGGCAATCACTATTGCAGCTACCACAATCAACTTTGGTACTAATGTCACTTATACAGATAATAGCTTAACAACTGATACTGAATGGAAGACATACACAATCACATTCCCAACGAAAGGGACATTGACATCTAAGGCCAATCAAGCATTTGGTTTAACATTGCTTAAAGGTCATGGATGGACTACAAATGATTGGTATGAATTAAGACGTATCCAAATGCAAAAGGGTAACAAAGCTACTCGATACCAAAAAGCTCAAGCTGGACTGGTTGAAGGAATCAAAGCTAACTCTCAGGCATTTAATGGCTTAAAAGCTACTGTTGAACAGCAAGGTGAGGATATCAAGTCTCAAGGTCAAGCTATCACAGGGCTTAAGCAAGAAATTGCTGACAAAGCAAGTTCTCAAGCATTGTCAGAATTAAAGTCTACTGTCGAACAGCAAGGTGAGAGTATTCGTATTAATACCGAAGCAATTACATCATTAAAAGGTGTAGTTGATGGTAAAGCCGATGCAGATGCCTTGAATAGTTTAAAAATCACAGTTCAAGAGCAAGGTGAAACACTTTTAACTCAAGGTCAGGCGATTACTTCTGTTAGGGCGACAGCCGATCTTGCACTGAATGGTAAGAAAACTTTAATTGACTTAACAGCACTTGACCCTAATCTTTACTACCCCGTATTTATTCCTGTAAGTACAACAGGTATCTCAGAGATTGAGATTTCCCCAAAACTTGGAGATTTTCAAGCTCCTTGGTCCACACACTACAGTGGCTCATATTCACTTGGTGTTCGATGGACAACTCGTGGACATGGGTGGGGTGCAGAGGCAATTGATAGGGTTATTGAAAAATTTGGATATCTTTGGGCAGATCAGTCTCCAGCAATGGAAATTAACCAACGTGGTGAGGATTCGAAAGAATACATCTACTTACGTGGTGGTACAATTTACCCATTCGTGACAAACCAATTTGCTGATACTCCATATTTAGAAAGTAATCCTGTAGGTGTCGCTTTTGATCAAAGTAAGGTCCCACAATCAGTTAATGCTAGAGTAGGCGCAAATGCATCAGCTATTAGTAGTCTTGATTCTAAGATTAATATCGTAGGAGATAAGGTTGATGTTAATGCACAAGCTATCACAGGGTTACAAGCTGAGATAAAGGACAAAGCAAGTTCAGAAGCTTTAAATCAACTATCTGTAACAGTTAGAGATCAAGGTCAATTAATTGATACACAAGGTCAGGCGATTACAAAGGTTGAGTCTAAAGTTGATAATTTGAAGGTTGGTACAGGAAACTTACTTAGAAACTCATCTTTCTCTGAAAGTTTAGATCAATGGGCTTGGAATGGACAAGTTGAATCAGCTGATTTTATTGCAGAGTATGGTATTCCCTCTGGACAATCTAAGTACTTGAAAATGAGAGTTTCTACTGGAGGTTCTGGCTACTACCAAGGTGTTCCATTTGTCAAGCAAGGAGAAGAGGTTATCTTTTCTATTTGGGCAAGGGGTGAAACAGGTAATGAAGTTCTTAGATTACTTTGGGAAGGTCATGAAGCGTTTGCTGACCACCAACTTACAACAAGTTGGGCTAGGTATACGTTAAAGACTAAACCTGTAATCAATGCACCGAACGTTGTTATCTACACTGTTAATGCTGGTACTTTCCATATTTCAAGTGCTCAATATGAGCGAGGGAATATTGTCTCTGATTGGCACCCAAACAGTGAGGATATGGCATCGGCTAGAGCCGTTTCTCTGTTAAATACCAAGATTGATAATGTTGACAATAAAGTTAACATTCAAGCTCAAGCTATCACAGACTTGAGGTCTGACCTTAATAATAAGGCAAATGCTCAAGCTCTTAATGAGCTTAGTACCACAGTCCAAGAGCAAGGTGAGACAATTCAATCTCAAGGTAAAGTCTTGACATCTGTTGAGGCTACAGCGAATAGGACCTCAAGTCAACTTGGAACTACAGTTTCTTACATGCTATACACATTTAGGAATGGTGCTTCGTCAATTACCAAAACTGGTTTATACAAAGCTGATGGAACACGACTGGAAGGTGTTTCTCGTGGACTCAACGTCTATTTGTTTGCTGCTAATGGTGATTTTGTAAGTTTGAGATTCTTCGATACCTATGGTGATATAGATAATGCATGTAACAATATGGTTGCCTACTTATCTGACTTACCTCAGAACTCATTTATTGCAATTGCAGGGTGTGATAACCTTGGGGCAGTAAGCTGGCCTTCAGGTCCTCCAAAAGCATTAAGGGATCACCTTAGAGACGTATGGGGTGTTGCACAAAGCTCAGTAGATAAATGGCAATATAACGATATTCCAATAGTTATTTGTCGTAAATGGGGTCCTAAAAACTCTGCTATTGACAAGCTGTATACATCTAGTATTAATGGAGACTGGTACTCTTTGGGTATTACCTTCATTGATGGCATCCCTAATGATTGGGGTGGAGACACGTCAAAGACTAACATTGAAGCTAATGCTTCAGCCATCTCTACTATGAATGCCGATGTTATTAAAAACAGAGACGATATTAGAGTTAACGCTGAAGCAATTACAGGGTTGAGTGGTAGGATTGATGGTAAAGCAGATGCTCAAGCTTTAAGTCAATTACAAATCACAGTAAAAGAACAAGGTGAAACTATCTCATCTCAAGGTCAAGCTATCACTCAAGTTCAAGCCTCTGCTGACATGGCATTGAATGGTAAAAAATACGTCGTAGACTTAACTGCTCTTGACCCTAACCTTTACTATCCAGTGTTCATTCCAGTCTCATCTGGTAGTGGTATTTCAGAGATTTCGGTCACAGCTTCATTGGATGAATACAAAGCACCTTGGTCATCACATGGTTCAGGTACTTACTCACTAAACGTTAGGTGGAGAGTTAGAGGTAGTGGTTGGGGAGCAAACTCAATAGAAAGGGAAATCCTAAGATTTGGTTATGCTTGGTGTGGTGATCAGTCACCTGTAATCGAGATTAGCCAACAAGGAGAACAATCACGAGAGTATATTTACTTACGTGGTGGTACACAATACCCATTCTACGTTAACCAGTATGCTGGACAGCCATTCACTGACTTAGGAAATTATGGTGGTGTCCCATACCGTACTGACTTGATGCCAGTTACTATCAATGCTGCAACACAAGCTAATGCTTCTGCTGTTAGTACGTTGAACGCTAAGGTTGACATTGTAGACGGTAAAGCAACAAGCGTAGCTGAGTCTGTGACTAAACTTCAGACCTCAAGCTCTGCTGCTACATACCAACTGTTGCGTGGTTCAAATAGGATTGGTGAAAAGCCTGTAGGCTCAAACCCATACCCATTCTGGTCTCAGCCTATCGACAAGCCATTAACAGCTGGTAAAACATATACCTTAGTGTATGAGGCAGAGTTTCAGTCAGGTGGTGCAAACAGCTACTTTAGGCCATATTTCAATGGTATTCAAGATATCAGCCAAACCAACCAGAGTTTTGGAAGACAGGTTAAAGTTGATAAAGCTGTGTTATGGTTTGCTGAAACTACTGCCATTGATTTCTATATCGTTGGTAGTCAACCTGATCAAAACAACTCTTATGCGAAAGTATATTGGGCTTGTTTATATGAGGAAGATCAACCAAACCCAATTAAGGTGTGGATGCCTAACACCAGAGAGAACTCAGCTAAGCTTGAAGTTCAAGGCCAAAGTATTGATGGTTTGATGACTAAATGGTCTGTCAAAGCTGATGTGAATGGTTATGTCTCTGGTGTAGCAATGAACAACAATGGTAGAGAAGCTAACTTCATTATCAGAGCTGATACATTTGCTATTGCACCTCCTGTTGGTTCTGGCGGTGGTGATGTTCCTAAGTATGGGTTCGTATATCAAGCTAGTGCGAAGACATTACCTAACGGTACTGTTATTCCAGCTGGATTGTATGTTGACAACTTAATGCTTGGAGAGATTAACGCTGAGAAGATTAATGCTAATAGCTTAAGTGCTATCAGTGCTAACTTAGGTACATTCACAAGTTCAAACGCTAAAGGTACTATGACAATCTCTGGTACTGATATCTCAGTCAAGGATACAAATGGGGTTGAGCGTATTTTCATTGGATTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
11e7cc215bb4f0bcef54816ab41e53310f7a7beb89630cc409bf3a1828fa8a78
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5777
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete genome sequence of five Acinetobacter baumannii phages from Abidjan, Cote d'Ivoire Essoh,C., Vernadet,J.-P., Vergnaud,G., Resch,G. and Pourcel,C. 2019-01-03 — GenBank