Protein

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Genbank accession
QGK89851.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDIDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSNSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAARAGNMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFIPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGEAIKELTEYIKRQYNIGADGRMASTNENFARRQEISTLFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYGGWGNDNPFDRYSDTPPSDGGPGQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVSLATDYVRDNVPNQFSELRRNINIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQFNGYSDIVNQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDINTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYLPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNQIITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNVADASNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTIGLGKDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTTAGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQIPELINSDGSKHTAAKNKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNNSDEETTESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYSADDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQMKEKELLDKYSSTEKTPAAPKATSSSFKESATDVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSTIGKAIKAVSPVESIRKMVTTVVDTIIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDIEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPVFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRLQIANAIMGATDDEGVSIWKAPSIFNIVGDMDSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRSFASRIIDNVKSAFNSATTKVTNWMENTSARVSQVIGRAQEGITDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAAAAKQKDMATDKELIGGAADTSMTDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSAADVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADMLNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
Physico‐chemical
properties
protein length:2236 AA
molecular weight: 245476,79510 Da
isoelectric point:8,72452
aromaticity:0,07603
hydropathy:-0,45774

Domains

Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–899
DC_0124 G3DSA:1.10.530.10 DC_0228
Coil
Unmapped
149–173
Coil Coil DC_0124
IPR023346
STR
1882–2014
IPR023346
IPR008258
ENZ
1884–1977
IPR008258
QGK89851.1
1 2236
Architecture
STR
RBD
STR 1-2069 | RBD 2070-2236
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage vB_PA32_GUMS
[NCBI] 		2656516 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pseudomonas aeruginosa
[NCBI] 		287 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGK89851.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN563784.1 [NCBI]
CDS location
range 39634 -> 46344
strand +
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAAGCCGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATATCGATGATATTTTTGGTGATACACCGAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATTCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCCGCTATAGACCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAAGGCGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGCGATAAGGTATCGGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAGTTTCGTTCTATGTTGCATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATTCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCAGCTCAACGGGTATCGAATAGTTTTGTTGACAACGCTATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCGAATGAAAATATCCGTAACTTTGCCGATGCAGCTCGCGCTGGAAACATGTTTGGCGCGGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCTGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCGGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCCGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGCGGTAGACATAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAACTACCAAAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCTCCATTTATTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGTGATGATATTACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGTTCATTCATGTCTGTAGAGGATTCAGCTGCAAACACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGAGGTGTGAGCGGTGCTCTTACCGATGTTCTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCGCTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGACCCCGAAGCATATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGTGAGGCGATTAAAGAATTAACCGAATATATTAAACGGCAATACAACATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCGAGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTACATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGATCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGTATTATCATAACTGAGCAGGGCATTGATCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTGATGAGTTCAGAAGTAAAATACGGAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGATGGTGGTCCAGGGCAACTCTCCCCACTAGGCGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGCCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGGCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCTTCTAAGCTGGCCCAAGAACAAGCTAATAAAGGTTATGATTATGCGCAACAAAAAGTATCACTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGTGAATTACGCAGGAATATAAACATACCAGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGAGATCAACTGTACGGTCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGGGCTGTTAACTATAGTAATCAGTTCAATGGATATTCTGATATAGTCAATCAGTCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACTCCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGATATTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAAATATCTGATATCACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGTATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTTTATAATCAACGTGGTGATTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCGGCACAGATCGCTGGTGATGCTAGAGAACGGTTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATTTACCTGGCCGTGAAGAAGCCGTTATTCTTGGACGTGATCTACTAGCCGGTGAGTATATCGATACAGCAACTAATCAAATTATAACCAATTTGAAAGATGCCAAAGGTACTATTATTAACAGGGCTGGTGATGTAGTCGTAACTGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGGTCAGATGGTTTTAATCTGCGAAGGAATGTAGCAGATGCATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTTGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTATTGGATTAGGTAAGGATATTCTAAGTAATCGGGATGCATATTTACCTGGTATGTTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGTGAGTATTATACAACTGCTGGTAACCTATTAAAATCATTCGATGAGATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATTGTTGTTGATGAAGAACAAATACCTGAACTTATTAACTCTGATGGGTCTAAGCATACTGCTGCTAAGAATAAGGGTTTATTCCGAACTGGTTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCTAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGTTAGGTAAGAAATCTGTAGATACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTACTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTTAGTGCATTTACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACCACCACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTGCGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGCCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACTTTAAATGGTAAAAATAACAGTGATGAAGAAACCACTGAATCAAAAGGTCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCTTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCCCGCCAAATACTTGGTAGAGGTGCTTTAGCTATTGGCGGTGGAGCATTATCGACAGCTGCTGCATATGCTAGTTTTGGTGGTACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACTAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGACTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTATGGTGCCACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTAGCTACACGTGGTGGAGATGCGTCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATAGTGCTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTTAGGTTTAAACCGATCTTTGAGGCATGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTAGACATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCAGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTCCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTTGCTTCTATACAGATGAAAGAAAAGGAATTATTGGATAAGTATAGTTCCACAGAGAAAACACCTGCCGCACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTGCTACCGATGTAATAAATGATACCATTACTACGATTAAGTCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAACTATTGGAAAAGCAATTAAAGCGGTTAGTCCAGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACAGTAGTAGACACAATTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCATTGCAAGCGCTACGTGTACACGCTTATGGGATGCAAGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGATTACTATCGATTGAAAGTCTTGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGTAAAGCTACTTATACAGGTGATATAGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACGACTAGCGATGG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
471671bf83af4a003aac8088e97c6533f38b13e12f8f2f793d523a9d84a7665b
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5137
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Improving the Inhibitory Effect of Phages against Pseudomonas aeruginosa Isolated from a Burn Patient Using a Combination of Phages and Antibiotics Aghaee,B.L., Khan Mirzaei,M., Alikhani,M.Y., Mojtahedi,A. and Maurice,C.F. 2021 — GenBank