Protein

Genbank accession
QDH50551.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,82
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MAIDKDFVVKNGLQVNENLIFADSDNDKVGLGTTTPNRKLVVIGNAEVSSDLAVGTTITAQRGAFTGIITANDGIDVGVGGTFVSINKLDAKIGIGSTSPVYTLDLYGPVSTGTTAAYIFGDVEVTGTIKGNRLEGQISAGGTVGFTNVTVDNVLDANNAEVYTKFNIEEVTSDTFRFLVAGDPPGIGFTQNTDNPEIYVSRGQKYEFHLDSGGFPFYLKTQPTADLNNQYSDGVTNNGAQVGVVTFKVPFNSPNILYYQASNVAGMGGTIYVDNDNKTYTVGVLTVSQFLDSNTQADFEQIYVSGIGTINNLKGPDFSVSSGILTVRQDQTALIGVSTGADRVSLQEKSDNVAYQVPFSDTLGIGSNYQNLYVDSEDGQMSYNPSTNRLTVNRVIGNLSGIATGADNINIDSSSANTKFQVTFSNPGSADYQRQLIDSDSDRLTYNPSTNTLSSTNITATTVTAGLAGTATNADNINVDKKSNNTTYQVLFSDNQGAGYQRPYIDSQSGQFTYNPSTNTLTAANIAGAGDNLTNLDGSNISQGTINADRIPDASTTAQGVVQLYDTFPPNSSSTTRAATANLVTDVYDEVRTAVIPAGTTMLFYQASAPSGWTKLTTQNNKALRVVSGSGGGTGGNNTFTSTFATRSVPLLRHNHTASSGNQSANHSHGVTVESGGSHTHGISDPGHNHDYSAPSGNKEFGNRSANAAASTRANFVSGNRLTGISINSGGSHNHGTSVGINNANHTHGITVDNEGTSGASMDFRVQYIDVIIASKDAYP
Physico‐chemical
properties
protein length:780 AA
molecular weight: 81913,14840 Da
isoelectric point:4,76836
aromaticity:0,07692
hydropathy:-0,32833

Domains

Domains [InterPro]
IPR005068
555–594
IPR005068
QDH50551.1
1 780
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-B43
[NCBI] 		2484638 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QDH50551.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN018232.1 [NCBI]
CDS location
range 86372 -> 88714
strand +
CDS
ATGGCGATAGATAAGGATTTTGTCGTTAAAAATGGTTTACAGGTCAACGAAAATTTAATTTTTGCTGATTCTGACAATGATAAAGTTGGTCTAGGTACTACCACCCCCAATAGAAAATTAGTTGTAATTGGTAACGCTGAGGTAAGTTCAGACCTTGCAGTAGGTACCACAATTACAGCTCAAAGAGGTGCCTTTACTGGTATCATTACTGCCAATGACGGTATTGATGTTGGTGTAGGTGGTACTTTTGTATCGATTAACAAACTCGACGCTAAGATTGGTATCGGTTCAACCTCACCAGTTTATACTTTAGACCTTTATGGTCCCGTATCCACTGGTACAACAGCAGCATATATTTTTGGTGATGTAGAAGTCACTGGTACGATTAAGGGTAATCGACTCGAAGGTCAGATTTCTGCTGGTGGTACAGTTGGCTTTACTAATGTCACTGTAGATAATGTACTTGATGCAAATAATGCAGAGGTATATACTAAGTTTAATATTGAAGAAGTCACTAGTGATACCTTTAGATTCTTAGTTGCGGGTGACCCACCTGGTATTGGTTTCACTCAGAACACTGACAATCCAGAAATTTATGTTTCAAGAGGTCAGAAATATGAGTTCCACCTTGACTCTGGTGGTTTCCCATTCTACCTTAAGACACAACCAACTGCTGACCTGAATAATCAGTATTCAGATGGTGTCACTAACAATGGTGCTCAGGTTGGTGTTGTTACCTTCAAGGTTCCATTCAATTCACCTAACATCCTGTACTATCAAGCATCAAATGTTGCTGGTATGGGTGGTACGATTTATGTCGATAATGATAATAAAACCTATACTGTTGGTGTTCTGACAGTATCTCAGTTCTTAGATAGTAACACTCAAGCAGACTTTGAACAGATTTATGTCTCAGGTATTGGTACTATCAATAATCTGAAAGGTCCAGACTTCAGTGTCAGTTCTGGTATTCTGACTGTCAGACAAGACCAGACTGCTCTGATTGGAGTTTCAACTGGTGCTGATAGAGTCAGTCTTCAAGAGAAGAGTGATAATGTAGCATATCAAGTTCCATTTAGTGATACTTTAGGTATTGGTTCAAACTATCAAAACTTGTATGTTGATAGTGAAGATGGACAGATGTCCTACAACCCATCAACCAATCGACTGACTGTCAATAGAGTTATTGGTAACTTGTCTGGTATCGCAACAGGTGCTGACAATATTAATATTGACTCAAGCAGTGCAAATACTAAATTCCAAGTTACATTTAGTAACCCAGGAAGTGCAGACTATCAGAGACAATTGATTGATAGTGATAGTGATAGATTAACTTATAATCCTTCTACAAATACACTGTCATCAACCAATATCACAGCCACAACGGTTACTGCTGGTTTGGCTGGTACTGCAACCAATGCAGACAATATTAATGTAGATAAAAAATCTAATAATACAACTTATCAGGTATTATTCAGTGACAATCAAGGAGCTGGTTATCAAAGACCTTATATTGACTCTCAATCAGGTCAATTCACATATAATCCATCTACTAACACTCTGACTGCAGCAAATATTGCTGGTGCTGGTGATAATCTTACAAACCTTGATGGTTCAAACATTTCACAAGGTACTATCAATGCAGATAGAATTCCTGATGCATCAACAACCGCTCAGGGTGTAGTACAACTTTATGATACTTTCCCACCTAACAGTTCATCAACTACCAGAGCAGCAACAGCAAATCTTGTCACCGATGTTTATGATGAAGTAAGAACTGCAGTGATACCTGCAGGAACGACTATGTTGTTCTATCAGGCATCTGCACCATCAGGTTGGACTAAACTAACAACTCAGAATAATAAGGCACTTAGAGTTGTGTCTGGTAGTGGTGGTGGTACGGGTGGTAACAATACGTTTACCTCAACTTTTGCAACAAGAAGTGTTCCACTACTGAGACACAATCACACTGCTTCATCTGGTAATCAGAGTGCTAATCACAGCCATGGTGTTACAGTTGAAAGTGGTGGTTCACACACTCACGGTATTTCTGATCCTGGCCACAACCACGATTATTCCGCACCTAGTGGAAATAAGGAGTTTGGTAATAGAAGTGCTAATGCTGCAGCATCTACCCGTGCTAATTTTGTTAGTGGCAATAGACTAACTGGAATCTCAATTAACAGTGGTGGAAGTCATAATCATGGAACCAGTGTAGGTATTAATAATGCAAACCACACTCACGGTATTACCGTTGACAATGAAGGTACCTCTGGAGCTTCAATGGACTTCAGAGTTCAATATATTGACGTAATCATTGCATCTAAGGATGCCTATCCTTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
587c05ba6ead720b9b6d7f4135688273b7d6eb85476cca9754b453660b4ff72d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5607
Evidence 0,5607
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Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation, characterization and genome sequencing of the novel cyanophage S-B43 from the Bohai Sea, China Wang,M. 2020-10 — GenBank