Protein

Genbank accession
ADO99462.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain-containing structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESVTNTANTLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTAARLASTRQIQLSGDVQATGVFDGSTNLNLNTTVSLVSTLPHYDGTGDSSGTYRSVTVDAKGRVTNATNPTTLAGYGLDGNVEGSSAQPYDLDLQALANLTSTGIIARTSGGAMATRTVLGSATRIAITNGNGVAGNPVIDLITTAVTAAEYNTESLTSAAGSETVNATKFTVDAYGRLTDSNTVPIATATEGSKYASYNAGTTYARYDIIANASKVYQAYQAITAGSGAPTHTSGDNGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPNIDLDGAVDQVINKDGSGHFTISHTQNVATPRNLNILATNTGSGTSNIVIRAEDTVTINATEATGKVHVEDLRIQDNFLASTGQLNLDPGDDRAATGLVRIYGDLQIDGTTTTVNSTELTVDDVTILLGGDTAPTSDDNLDRGVQFRYYDSQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNNSEVFTGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNMVLQGASKTLQLNNGSGTTKVEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTTVAGTLGVTGDTTLTGALDANSTLNVAGDVYLESTNDITVAKNSGTGVWEIQSNDYGALRLDGGFYTAGDALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRNSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKFTVASSSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEIFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSDVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDVGGDVTAESNLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPSTNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFVTDATNSSEVLAGTDGALRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIVSQVTSGAALVIPTTTKINNLNADLLDSMTTASAATPTTVVARDSSGDFSANQITAASGVGAAAGFLGNASSADILKTARVITIDGVVNGNVSFDGSQAVTITTTYDDADITALAAQSGTGYMVRTAANTYAHRTFAVTASSGITLTNPDGISGNTTINVASASTNAANNLVLRDASGGFSAEDVNVATLDATGNSTIGGTLGVTGVVTLSGQLNANSGILVDTNKFTVDGQNGSVSTQGTLNADGATTLGSTLTVTGATEFNSTVDVDGNFAVRTNLGVDKFTVLGASGNTSISGTLGVTGATTLSDTLAVTGTSAFTGAITASGGVIGNVTGTVSSIANHDTDALSEGSTNLYFTNERVDDRIDALFIASTGITKVYDDTAGTYTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGELSVTQVDIDTDNVTEGSTNIFYTEARFDSSLAAKTTDDVTEGSANLYYTDARADARIAAADTDALSEGSANLYYTDARAEASFDTKIAAATTDDLSEGSTNVYYTDARAEASFDTKIAAASTTNLSEGNNLYYTEARVQTKLDDAFAQLQAMLNNLATTTTLTLALSGDPTPGAVVTTAVDNGGGGGFTAGTAVATSGGTGSGLTVDTTVVGGVITAAAVNAGGSDYLISDTVTITNPNAGKVLSFNLATLTGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITAVAGAITNVTINDGGTGYAADETITIVQPTGADGSNPATGGTVDIATVATNATLSMTDITTMEVGAIVTGATSGTVGTITALGTNQITVDNVDGFFKVGEVVSANDVTTLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2162 AA
molecular weight: 220617,46460 Da
isoelectric point:4,16405
aromaticity:0,05920
hydropathy:-0,11957

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–242
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
ADO99462.1
1 2162
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Syn19
[NCBI] 		445684 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 8109
[NCBI] 		166314 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99462.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071106 [NCBI]
CDS location
range 88955 -> 95443
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCCTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGCTTTAAGATCGGTGATGGTGTTTCCGCATGGAACACGTTGAGGTATGAAAGACCTGTTGAATCCGTCACCAATACGGCGAATACGCTCGTACAGAGAGATGCTGATGGTAATTTTAGTGCTGGCACAGTCACTGCAACATTAATCGGTAATGCTTCAACCGCCGCTCGTCTTGCTTCGACTCGTCAGATTCAACTTTCAGGTGACGTTCAGGCAACAGGTGTCTTTGATGGTTCTACCAACCTGAACCTGAATACAACAGTTAGTCTTGTTTCAACCTTACCTCATTATGACGGCACAGGAGATTCATCAGGAACTTATCGTTCAGTAACTGTTGATGCAAAAGGTCGTGTTACTAATGCGACTAATCCTACAACTCTTGCTGGATACGGATTGGATGGTAATGTTGAGGGTTCTTCAGCACAACCATATGACCTTGACCTTCAAGCATTAGCAAACCTTACTTCTACTGGTATTATTGCCAGAACTTCTGGTGGTGCAATGGCAACCAGAACTGTTCTGGGTTCTGCTACCAGAATTGCTATTACTAATGGTAACGGTGTTGCAGGCAACCCTGTTATCGACTTAATTACAACTGCTGTAACTGCAGCAGAATATAACACCGAATCACTCACGTCTGCTGCTGGTAGTGAGACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTTGATGCATACGGTAGATTAACAGACTCTAATACTGTGCCTATCGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTACGCTAGCTATAATGCAGGCACGACATATGCTCGCTATGACATCATTGCTAATGCATCGAAGGTTTACCAGGCATATCAAGCAATTACTGCTGGTTCTGGTGCTCCTACTCATACCAGCGGCGATAATGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATCGCCGCACTAGGCGTAGATAATACACAATTACAAAATAATAGAGTCTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGACTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTTAAAGTTAACGATACGAGCGGTAATCTTTTGTTTGGGGCTAACAATACAGGGGATTCTGGCGCTGGCGAGATTGATGTCAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCCAATATCGATCTGGATGGCGCTGTCGATCAGGTCATTAATAAGGATGGATCTGGTCATTTCACCATAAGTCATACTCAGAATGTTGCAACACCTAGAAATCTCAACATTCTTGCAACAAACACTGGATCAGGAACTTCTAATATCGTAATTCGTGCAGAAGATACTGTTACAATTAACGCAACTGAAGCAACTGGTAAGGTTCATGTAGAAGATCTTAGAATTCAAGACAACTTCCTTGCTTCTACTGGTCAATTAAATCTTGACCCTGGTGATGACCGTGCTGCTACTGGTCTGGTTCGTATCTACGGTGACCTTCAGATTGATGGCACAACTACCACAGTTAATTCAACTGAACTGACAGTTGATGATGTTACTATCCTTCTCGGTGGTGACACTGCTCCTACATCTGATGACAACCTTGACCGTGGTGTTCAGTTCCGCTATTACGATAGTCAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCACGCTGCTACAAATAATTCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACAACTAATACTAACTCTACTTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAAGACGTTAATATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGATGGCACATTCCGTGCTAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTTCTGCAGGGTGCATCTAAGACTCTGCAACTGAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGGTTGAGTTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATCCTCGATGTAACTGGTAATTTCAACGTTAATACGAATAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAATACAACCGTTGCTGGTACTCTTGGAGTTACTGGTGATACAACACTGACTGGTGCTTTGGATGCAAACAGCACTTTAAATGTTGCTGGTGATGTTTATCTTGAAAGCACTAATGACATCACAGTTGCTAAGAACTCTGGCACTGGTGTTTGGGAAATTCAGTCTAACGACTATGGTGCTCTTAGACTTGACGGTGGTTTCTATACCGCTGGCGATGCTCTGATTGATGGAACACTACACGTCAACGGTGCTATTGAAGTTAAAGATAGTGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACTACAACCATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTGCACGTTGGTGGCACGGGTTCTGGCGAAGGTCTGTTCGTTGGTAAGAGAAACTCTGGCGATACTGTTAAGTTCTCTGTCTTGGGTGCATCTGGTAACACCGATATTCAAGGCACACTCGATGTTGCTGGCAACTCTGAGTTCAACGGCACTGTCGATGTTGATGCAGATTTCGCTGTTAGAAACGGTACAACCGACAAGTTCTTCGTTGATAACGTAACTGGTAACACCGATATCCAAGGCACTTTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAACACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGATCAGACACTTCTGGTCCAAGGCAACTCCGAGTTTAACGGCACAGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCCGTTAGAAGTGGTAGCACAGATAAGTTTACTGTTGCTTCTTCCTCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAATCTTCTCTATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAACGGTAATACAAACATCATCGGCACACTAACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTGGGTGTCTCTGATGTTGTAACCTTCACAAGAAACACTCAGCAAACCCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAACCTTGCTGTTGGCGAAGGTTTGAGAGTTTATGGTGGCACAGAACTAACTGGTGCTCTTGATCTCAATAACTCTGCAGATATCTCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATAATGTTACTATCACTGCAGATAACAAAACATTTGCTATTCAAAATGCATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGCAATACAGATATTCGTGGAACCCTGGATGTTGGTGGTGATGTAACTGCCGAATCTAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTGTTAATGGCACAACCACTACTGTCAATAGCACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCCTCGACTAACGATGGTAAGGATCGCGGTGTTGAATTCCGTTATTATGACGGCTCTGCTAAAATTGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCGCCAACCAATTCGCGTTCGTAACTGATGCAACTAACTCCTCTGAAGTTCTTGCTGGTACAGATGGCGCTCTTCGTGCTGGTTCTCTTAATCTTACTGGGTCTGGAACATCTCTTGATGTTGATGCCAATGCTAACATTGATGGCACCCTGACTGTTGATGGACAGATTGTTTCTCAAGTTACATCTGGTGCAGCACTGGTCATTCCTACCACCACCAAAATTAATAATTTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCTGCGACACCGACTACTGTCGTTGCTCGTGATTCTAGCGGTGACTTCTCTGCTAATCAAATCACTGCTGCTAGTGGTGTAGGTGCTGCTGCAGGTTTCTTAGGTAATGCTTCGAGTGCAGATATCCTTAAGACTGCAAGAGTTATCACCATTGATGGTGTTGTCAACGGCAATGTTTCCTTTGATGGATCTCAAGCAGTAACCATTACTACCACATATGATGATGCTGACATTACTGCTTTGGCAGCACAGTCTGGCACTGGTTATATGGTCAGAACTGCTGCTAACACCTATGCACACCGCACGTTTGCTGTTACAGCATCTTCTGGTATTACTCTGACCAATCCTGATGGCATCTCTGGTAATACTACAATTAACGTTGCTTCTGCATCCACTAACGCAGCAAACAACCTGGTTCTGCGTGATGCCAGCGGCGGTTTCTCCGCAGAAGACGTAAATGTTGCAACACTGGATGCTACAGGAAACTCCACCATCGGTGGAACACTTGGTGTAACGGGTGTAGTTACCCTTTCGGGTCAGTTGAACGCTAACAGTGGTATTTTAGTTGATACTAATAAATTCACTGTTGATGGACAGAACGGTTCTGTTTCTACTCAAGGCACACTGAATGCCGATGGTGCTACAACTCTTGGTAGCACACTGACAGTTACTGGTGCAACCGAATTTAATAGTACGGTTGATGTAGATGGTAACTTTGCAGTTAGAACTAATCTTGGTGTAGATAAATTTACCGTTCTGGGTGCATCGGGTAACACTAGTATTTCTGGTACTCTTGGAGTCACAGGTGCTACAACCTTGTCTGACACCCTGGCAGTAACTGGAACATCTGCATTCACTGGTGCAATCACCGCAAGTGGCGGCGTTATCGGTAA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
c55adf865da33b2053333ed7c92df3efc64a848f12e36a0527a878a8a24386d0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4793
Evidence 0,4793
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage Syn19 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank