Protein

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Genbank accession
ADO99462.1 [GenBank]
Protein name
YadA domain-containing structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESVTNTANTLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTAARLASTRQIQLSGDVQATGVFDGSTNLNLNTTVSLVSTLPHYDGTGDSSGTYRSVTVDAKGRVTNATNPTTLAGYGLDGNVEGSSAQPYDLDLQALANLTSTGIIARTSGGAMATRTVLGSATRIAITNGNGVAGNPVIDLITTAVTAAEYNTESLTSAAGSETVNATKFTVDAYGRLTDSNTVPIATATEGSKYASYNAGTTYARYDIIANASKVYQAYQAITAGSGAPTHTSGDNGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPNIDLDGAVDQVINKDGSGHFTISHTQNVATPRNLNILATNTGSGTSNIVIRAEDTVTINATEATGKVHVEDLRIQDNFLASTGQLNLDPGDDRAATGLVRIYGDLQIDGTTTTVNSTELTVDDVTILLGGDTAPTSDDNLDRGVQFRYYDSQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNNSEVFTGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNMVLQGASKTLQLNNGSGTTKVEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTTVAGTLGVTGDTTLTGALDANSTLNVAGDVYLESTNDITVAKNSGTGVWEIQSNDYGALRLDGGFYTAGDALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRNSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKFTVASSSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEIFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSDVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDVGGDVTAESNLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPSTNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFVTDATNSSEVLAGTDGALRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIVSQVTSGAALVIPTTTKINNLNADLLDSMTTASAATPTTVVARDSSGDFSANQITAASGVGAAAGFLGNASSADILKTARVITIDGVVNGNVSFDGSQAVTITTTYDDADITALAAQSGTGYMVRTAANTYAHRTFAVTASSGITLTNPDGISGNTTINVASASTNAANNLVLRDASGGFSAEDVNVATLDATGNSTIGGTLGVTGVVTLSGQLNANSGILVDTNKFTVDGQNGSVSTQGTLNADGATTLGSTLTVTGATEFNSTVDVDGNFAVRTNLGVDKFTVLGASGNTSISGTLGVTGATTLSDTLAVTGTSAFTGAITASGGVIGNVTGTVSSIANHDTDALSEGSTNLYFTNERVDDRIDALFIASTGITKVYDDTAGTYTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGELSVTQVDIDTDNVTEGSTNIFYTEARFDSSLAAKTTDDVTEGSANLYYTDARADARIAAADTDALSEGSANLYYTDARAEASFDTKIAAATTDDLSEGSTNVYYTDARAEASFDTKIAAASTTNLSEGNNLYYTEARVQTKLDDAFAQLQAMLNNLATTTTLTLALSGDPTPGAVVTTAVDNGGGGGFTAGTAVATSGGTGSGLTVDTTVVGGVITAAAVNAGGSDYLISDTVTITNPNAGKVLSFNLATLTGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITAVAGAITNVTINDGGTGYAADETITIVQPTGADGSNPATGGTVDIATVATNATLSMTDITTMEVGAIVTGATSGTVGTITALGTNQITVDNVDGFFKVGEVVSANDVTTLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2162 AA
molecular weight: 220617,46460 Da
isoelectric point:4,16405
aromaticity:0,05920
hydropathy:-0,11957

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607 DC_0029
ADO99462.1
1 2162
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-242 | STR 322-1512 | RBD 1761-2162
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Syn19
[NCBI] 		445684 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Pontusvirus > Pontusvirus syn19
Host Synechococcus sp. WH 8109
[NCBI] 		166314 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99462.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071106 [NCBI]
CDS location
range 88955 -> 95443
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCCTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGCTTTAAGATCGGTGATGGTGTTTCCGCATGGAACACGTTGAGGTATGAAAGACCTGTTGAATCCGTCACCAATACGGCGAATACGCTCGTACAGAGAGATGCTGATGGTAATTTTAGTGCTGGCACAGTCACTGCAACATTAATCGGTAATGCTTCAACCGCCGCTCGTCTTGCTTCGACTCGTCAGATTCAACTTTCAGGTGACGTTCAGGCAACAGGTGTCTTTGATGGTTCTACCAACCTGAACCTGAATACAACAGTTAGTCTTGTTTCAACCTTACCTCATTATGACGGCACAGGAGATTCATCAGGAACTTATCGTTCAGTAACTGTTGATGCAAAAGGTCGTGTTACTAATGCGACTAATCCTACAACTCTTGCTGGATACGGATTGGATGGTAATGTTGAGGGTTCTTCAGCACAACCATATGACCTTGACCTTCAAGCATTAGCAAACCTTACTTCTACTGGTATTATTGCCAGAACTTCTGGTGGTGCAATGGCAACCAGAACTGTTCTGGGTTCTGCTACCAGAATTGCTATTACTAATGGTAACGGTGTTGCAGGCAACCCTGTTATCGACTTAATTACAACTGCTGTAACTGCAGCAGAATATAACACCGAATCACTCACGTCTGCTGCTGGTAGTGAGACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTTGATGCATACGGTAGATTAACAGACTCTAATACTGTGCCTATCGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTACGCTAGCTATAATGCAGGCACGACATATGCTCGCTATGACATCATTGCTAATGCATCGAAGGTTTACCAGGCATATCAAGCAATTACTGCTGGTTCTGGTGCTCCTACTCATACCAGCGGCGATAATGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATCGCCGCACTAGGCGTAGATAATACACAATTACAAAATAATAGAGTCTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGACTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTTAAAGTTAACGATACGAGCGGTAATCTTTTGTTTGGGGCTAACAATACAGGGGATTCTGGCGCTGGCGAGATTGATGTCAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCCAATATCGATCTGGATGGCGCTGTCGATCAGGTCATTAATAAGGATGGATCTGGTCATTTCACCATAAGTCATACTCAGAATGTTGCAACACCTAGAAATCTCAACATTCTTGCAACAAACACTGGATCAGGAACTTCTAATATCGTAATTCGTGCAGAAGATACTGTTACAATTAACGCAACTGAAGCAACTGGTAAGGTTCATGTAGAAGATCTTAGAATTCAAGACAACTTCCTTGCTTCTACTGGTCAATTAAATCTTGACCCTGGTGATGACCGTGCTGCTACTGGTCTGGTTCGTATCTACGGTGACCTTCAGATTGATGGCACAACTACCACAGTTAATTCAACTGAACTGACAGTTGATGATGTTACTATCCTTCTCGGTGGTGACACTGCTCCTACATCTGATGACAACCTTGACCGTGGTGTTCAGTTCCGCTATTACGATAGTCAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCACGCTGCTACAAATAATTCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACAACTAATACTAACTCTACTTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATTGGTCAAGACGTTAATATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGATGGCACATTCCGTGCTAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTTCTGCAGGGTGCATCTAAGACTCTGCAACTGAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGGTTGAGTTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATCCTCGATGTAACTGGTAATTTCAACGTTAATACGAATAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAATACAACCGTTGCTGGTACTCTTGGAGTTACTGGTGATACAACACTGACTGGTGCTTTGGATGCAAACAGCACTTTAAATGTTGCTGGTGATGTTTATCTTGAAAGCACTAATGACATCACAGTTGCTAAGAACTCTGGCACTGGTGTTTGGGAAATTCAGTCTAACGACTATGGTGCTCTTAGACTTGACGGTGGTTTCTATACCGCTGGCGATGCTCTGATTGATGGAACACTACACGTCAACGGTGCTATTGAAGTTAAAGATAGTGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACTACAACCATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTGCACGTTGGTGGCACGGGTTCTGGCGAAGGTCTGTTCGTTGGTAAGAGAAACTCTGGCGATACTGTTAAGTTCTCTGTCTTGGGTGCATCTGGTAACACCGATATTCAAGGCACACTCGATGTTGCTGGCAACTCTGAGTTCAACGGCACTGTCGATGTTGATGCAGATTTCGCTGTTAGAAACGGTACAACCGACAAGTTCTTCGTTGATAACGTAACTGGTAACACCGATATCCAAGGCACTTTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAACACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGATCAGACACTTCTGGTCCAAGGCAACTCCGAGTTTAACGGCACAGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCCGTTAGAAGTGGTAGCACAGATAAGTTTACTGTTGCTTCTTCCTCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAATCTTCTCTATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAACGGTAATACAAACATCATCGGCACACTAACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTGGGTGTCTCTGATGTTGTAACCTTCACAAGAAACACTCAGCAAACCCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAACCTTGCTGTTGGCGAAGGTTTGAGAGTTTATGGTGGCACAGAACTAACTGGTGCTCTTGATCTCAATAACTCTGCAGATATCTCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATAATGTTACTATCACTGCAGATAACAAAACATTTGCTATTCAAAATGCATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGCAATACAGATATTCGTGGAACCCTGGATGTTGGTGGTGATGTAACTGCCGAATCTAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTGTTAATGGCACAACCACTACTGTCAATAGCACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCCTCGACTAACGATGGTAAGGATCGCGGTGTTGAATTCCGTTATTATGACGGCTCTGCTAAAATTGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCGCCAACCAATTCGCGTTCGTAACTGATGCAACTAACTCCTCTGAAGTTCTTGCTGGTACAGATGGCGCTCTTCGTGCTGGTTCTCTTAATCTTACTGGGTCTGGAACATCTCTTGATGTTGATGCCAATGCTAACATTGATGGCACCCTGACTGTTGATGGACAGATTGTTTCTCAAGTTACATCTGGTGCAGCACTGGTCATTCCTACCACCACCAAAATTAATAATTTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCTGCGACACCGACTACTGTCGTTGCTCGTGATTCTAGCGGTGACTTCTCTGCTAATCAAATCACTGCTGCTAGTGGTGTAGGTGCTGCTGCAGGTTTCTTAGGTAATGCTTCGAGTGCAGATATCCTTAAGACTGCAAGAGTTATCACCATTGATGGTGTTGTCAACGGCAATGTTTCCTTTGATGGATCTCAAGCAGTAACCATTACTACCACATATGATGATGCTGACATTACTGCTTTGGCAGCACAGTCTGGCACTGGTTATATGGTCAGAACTGCTGCTAACACCTATGCACACCGCACGTTTGCTGTTACAGCATCTTCTGGTATTACTCTGACCAATCCTGATGGCATCTCTGGTAATACTACAATTAACGTTGCTTCTGCATCCACTAACGCAGCAAACAACCTGGTTCTGCGTGATGCCAGCGGCGGTTTCTCCGCAGAAGACGTAAATGTTGCAACACTGGATGCTACAGGAAACTCCACCATCGGTGGAACACTTGGTGTAACGGGTGTAGTTACCCTTTCGGGTCAGTTGAACGCTAACAGTGGTATTTTAGTTGATACTAATAAATTCACTGTTGATGGACAGAACGGTTCTGTTTCTACTCAAGGCACACTGAATGCCGATGGTGCTACAACTCTTGGTAGCACACTGACAGTTACTGGTGCAACCGAATTTAATAGTACGGTTGATGTAGATGGTAACTTTGCAGTTAGAACTAATCTTGGTGTAGATAAATTTACCGTTCTGGGTGCATCGGGTAACACTAGTATTTCTGGTACTCTTGGAGTCACAGGTGCTACAACCTTGTCTGACACCCTGGCAGTAACTGGAACATCTGCATTCACTGGTGCAATCACCGCAAGTGGCGGCGTTATCGGTAA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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
c55adf865da33b2053333ed7c92df3efc64a848f12e36a0527a878a8a24386d0
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4822
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage Syn19 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Erlich,R., Young,S.K., Koehrsen,M., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Borenstein,D., Chen,Z., Engels,R., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heiman,D., Hepburn,T., Howarth,C., Jen,D., Larson,L., Lewis,B., Mehta,T., Park,D., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., Walk,T., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C., Galagan,J. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank