Protein

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Genbank accession
BBI90158.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MPHLKAYDKYGNILAIGYNVELHEEVGSVIIPNLAPHTHYPQGEFYVSWEAEKYETDKVVVPGFTTLESSFKEITLYFKDHILVNAKSAYDVAVDNGFVGSEEEWVKSIKGEKGEEGEQGKQGLSAYEVAVNNGFTGSATDWLKTGKSPYVYSNEYIKQKDDTSDVQRLRRAIKDTSEGNTLHIPSSESPIKIDDTLIIDKNINIVSDAKIVYNGSKDKPAIKLDSLSYSNVTIKGIYDDSSYPTYGGGYHGFKSQNYIGLELVNCRNVNTNINEIIGFTVGNKHKATGGKGHWFNNTIINFFINNETHIELNTDGIGSNGEQSWMNSNYFYKSAFSYSGTEFNKHPNTYYNIKQTLTNANTYGGNSNVFDSLKFETASTTSENYVMVYLKKAVGFIFKNYRFEFNNKATFAIIDLETQDMTKSYVTHSKDIKFIPEFVLGNGHKLTFKNINTAKIPRSSIAKIVDEYKTTLLYKNNDFSKDYRRLGGNYHTVKNVFRKPLQSTSLTDEVSYDYSTTPSLVDDKGLLTFTGSYPMALYVNNVSVGDELIINKLSFIGNSSGIFIKCFDKDGNILDKVSNNYDTILLDGYYNDKYKAFTFNNAQKDTFTVNSEDVKSIVILISGTMQGLLVDSTNPSNIIKSSNDSSKNKTDVFYSHVKPSSVEDFKYDEKVYNNGTTQVYGWVLKGNDWKELGKDTNSKSKVIVNIEDYPRINDEDNDYPRFQRALDYLTSTKGGILIVPKGTEDYLFKTKTPTVQNPSRVKVTGSNIHIKGEGNPTFIMSGITKNYLDSIDDISSSGRDMFTGFSFINCDNILVEGLTFKGEWDSKGEFRYASPRSIGVAFKGSRNCKAYNVHGYNIMGNVVNAVNTMQAVDGVYGYSDNITIDSCSATQCLENGFNFMGGTKNGYYVNNISTGNGSSGFESGTENVIISNNIHTNNKYSGLSISGTNYTITNNVIYGNSNKGELSNKPSNGIAITGGSKGIISNNNVSGNEGYELYLYPGVNNIDIQNNVLKQDTTSLKTSIIYASGTTSKPVSEINFKNNTLRSTNTALDKAMFLNFVMDSTITNNDIKTDKGNDSLSVQGSCSNLFVLNNNMNKNLSISSNAFNVISKDNIAYNLPKVLNGTAIPTTGSWRLGDIIVNTSRTLTSGSPEKWRCTSDGVATNMKWTSNTDYTQGQIVYNGNYVYKAVASGTSGGTQPTHNNGVISDGSILWEFISTKANFEVIRQIGVTESISNIPLYKGQIAIIGSSVYVAKGTSSNTDWIILN
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 140273,38570 Da
isoelectric point:6,16273
aromaticity:0,10883
hydropathy:-0,45521

Domains

Domains [InterPro]
DC_0876
STR
6–1038
DC_0876 IPR006626 G3DSA:2.10.10.20
IPR006626
Unmapped
545–566
IPR006626 IPR011050
IPR012334
STR
704–1059
IPR012334 DC_0276
IPR006626
Unmapped
810–844
IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626 IPR006626
IPR039448
ENZ
925–1049
IPR039448
BBI90158.1
1 1268
Architecture
STR
RBD
ATT
RBD
STR 6-1097 | RBD 1098-1165 | ATT 1166-1224 | RBD 1225-1268
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
BBI90158.1
1 1268
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 166 166 0,9856
Central domain 167 492 327 0,9748
C-terminal 493 1268 775 0,2511
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-166
Central
167-492
C-terminal
493-1268

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Staphylococcus phage MR003
[NCBI] 		2496589 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Staphylococcus aureus
[NCBI] 		1280 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BBI90158.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
AP019522 [NCBI]
CDS location
range 17188 -> 20994
strand -
CDS
ATGCCTCATTTAAAAGCATATGATAAATACGGTAATATATTGGCAATAGGTTACAATGTAGAGTTACATGAAGAAGTAGGGTCTGTAATCATACCTAACTTAGCTCCTCATACCCATTACCCTCAAGGTGAGTTCTATGTATCATGGGAAGCTGAAAAATATGAAACCGATAAAGTAGTAGTTCCTGGTTTTACAACCCTAGAATCATCATTCAAAGAAATAACATTATATTTTAAAGACCATATACTTGTAAATGCTAAATCTGCTTATGATGTAGCGGTAGATAATGGTTTTGTCGGTTCTGAAGAAGAATGGGTTAAGTCTATTAAAGGAGAAAAAGGGGAGGAAGGGGAACAAGGTAAGCAAGGTTTAAGTGCTTATGAAGTAGCTGTAAATAACGGTTTTACAGGTTCAGCTACAGATTGGCTTAAAACAGGTAAAAGTCCTTATGTATACTCTAACGAGTATATAAAGCAAAAAGATGATACTTCGGATGTTCAAAGGTTAAGACGTGCTATTAAAGATACAAGTGAAGGTAATACCCTACACATTCCTTCTAGTGAATCACCTATTAAAATAGATGATACTTTGATAATAGATAAGAATATTAATATTGTATCTGATGCTAAGATTGTTTATAATGGTAGTAAGGATAAACCAGCTATTAAACTAGATAGTTTATCATATTCTAATGTTACAATTAAAGGTATTTATGATGATAGTTCTTATCCAACTTATGGTGGAGGCTATCATGGTTTTAAGAGTCAAAACTATATAGGACTAGAATTAGTTAACTGTAGAAATGTTAATACTAATATTAATGAAATTATTGGTTTTACAGTCGGTAATAAACATAAAGCTACTGGTGGTAAAGGTCATTGGTTTAATAATACTATTATTAATTTCTTTATTAATAATGAAACACATATAGAATTAAATACAGATGGTATAGGTTCTAATGGTGAGCAATCTTGGATGAATAGTAATTACTTCTATAAATCAGCTTTTTCATATAGTGGCACTGAGTTTAATAAACACCCTAACACATACTATAACATCAAACAAACTCTAACAAATGCTAATACCTATGGAGGAAATAGCAATGTATTCGATTCACTTAAATTTGAAACTGCTTCCACAACATCTGAAAATTATGTTATGGTGTATCTTAAAAAAGCAGTAGGATTTATATTTAAGAATTACAGATTTGAATTTAATAACAAAGCTACCTTTGCTATTATAGATTTAGAAACACAAGACATGACAAAATCTTATGTAACACATAGTAAAGATATTAAGTTTATTCCTGAATTTGTTTTAGGTAATGGACATAAACTAACGTTTAAAAATATTAATACTGCTAAAATACCTAGAAGTAGTATTGCTAAAATAGTAGACGAATACAAAACAACATTATTGTATAAAAATAATGATTTTAGCAAAGACTATAGAAGATTAGGAGGTAACTATCACACAGTCAAAAATGTATTTAGAAAACCATTACAGTCAACTTCTCTGACAGATGAAGTATCTTATGACTATAGTACTACACCTAGTTTAGTAGATGATAAAGGACTACTTACCTTTACAGGCTCGTACCCTATGGCTTTATATGTTAATAATGTTAGTGTTGGTGACGAGCTAATTATTAACAAGTTATCATTTATAGGTAATTCTAGTGGTATATTTATTAAATGTTTTGATAAAGACGGTAATATATTAGACAAAGTATCTAATAATTATGATACAATATTACTAGATGGTTATTATAATGATAAATATAAAGCGTTCACTTTCAATAACGCCCAAAAAGATACTTTTACTGTTAATAGTGAAGATGTTAAGTCTATCGTTATTTTAATATCTGGAACTATGCAAGGTTTACTTGTAGATTCAACTAATCCATCCAATATTATTAAGTCTTCAAACGATAGTAGCAAGAATAAAACTGATGTTTTTTATTCTCATGTTAAACCTTCTAGTGTTGAAGATTTTAAATATGATGAAAAAGTATACAACAATGGTACAACACAAGTATATGGTTGGGTACTAAAAGGTAATGATTGGAAAGAACTAGGTAAAGACACTAATTCTAAGAGTAAAGTAATAGTTAATATAGAAGATTACCCAAGAATTAATGATGAAGATAATGACTACCCTAGATTCCAAAGAGCTTTAGATTATTTAACAAGTACTAAAGGTGGTATTCTTATAGTACCTAAAGGAACAGAGGACTATTTATTCAAAACTAAGACACCTACTGTACAAAACCCATCACGTGTAAAAGTAACAGGAAGTAATATACACATTAAAGGTGAAGGTAATCCTACATTTATTATGTCAGGAATCACTAAAAACTATTTAGACTCTATAGATGATATTTCTTCTAGTGGTAGAGATATGTTTACAGGATTCTCATTTATCAACTGTGATAACATTCTTGTAGAAGGATTAACATTTAAAGGGGAATGGGATAGTAAAGGTGAATTTAGATATGCGTCACCTCGTTCTATTGGAGTAGCGTTTAAAGGAAGTAGAAACTGTAAAGCATATAATGTACATGGCTATAATATCATGGGTAATGTTGTAAATGCAGTAAACACTATGCAAGCAGTAGATGGTGTTTATGGTTACTCAGACAACATTACTATAGATAGTTGCTCAGCTACACAATGTTTAGAGAATGGTTTTAACTTTATGGGTGGTACTAAAAATGGATATTATGTTAATAATATATCTACAGGAAATGGTTCAAGTGGATTTGAATCAGGAACAGAAAATGTTATTATAAGTAATAATATACACACAAATAATAAGTACTCAGGTTTAAGTATATCTGGCACTAATTACACAATTACTAATAACGTAATTTATGGTAATAGTAATAAAGGAGAGTTAAGTAATAAACCATCTAATGGTATTGCTATTACAGGAGGTAGTAAAGGAATTATTAGTAACAATAATGTATCAGGTAATGAGGGTTACGAGTTGTACCTTTATCCAGGAGTTAATAACATAGATATACAAAATAATGTATTAAAACAAGATACAACAAGTTTAAAAACAAGTATTATTTATGCCTCAGGAACAACTAGTAAACCTGTGTCAGAAATTAACTTTAAAAATAATACATTAAGAAGTACAAATACTGCTTTGGATAAAGCTATGTTCTTAAATTTTGTTATGGATAGTACAATTACTAATAATGATATAAAAACAGATAAAGGTAATGATTCATTAAGTGTTCAAGGTTCTTGTAGTAATCTATTCGTATTAAATAACAATATGAATAAAAACTTAAGTATTTCTAGTAATGCATTTAATGTTATAAGTAAGGATAACATAGCTTATAATTTACCTAAAGTACTGAACGGTACTGCAATACCAACTACAGGGAGTTGGAGATTGGGAGATATTATTGTTAATACTAGTAGAACCCTAACATCAGGTAGTCCTGAGAAATGGAGATGTACTAGTGATGGAGTTGCTACTAATATGAAGTGGACATCTAACACGGATTACACACAAGGTCAAATTGTTTATAATGGGAATTATGTATATAAAGCAGTAGCTTCAGGTACAAGTGGTGGAACACAACCTACTCATAATAACGGCGTTATATCAGATGGCTCTATACTGTGGGAATTTATATCCACAAAAGCTAATTTTGAAGTCATAAGACAAATAGGTGTAACTGAAAGCATTAGTAATATACCTTTATACAAAGGTCAAATTGCTATAATAGGTTCATCTGTATATGTAGCTAAAGGTACATCAAGCAATACTGATTGGATAATTTTAAATTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8bcefac3b1d8752dec20e9b3a0e6d8855cac9cc90ae8f33cb0f44e8d66282519
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6570
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Whole genome analysis of Staphylococcal phage phiMR003 Peng,C., Tomoko,H., Azam,A.H., Cierra,L., Ung,P., Takeaki,M., Miyanaga,K. and Tanji,Y. 2022-06-21 — GenBank