Protein

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Genbank accession
WNO30043.1 [GenBank]
Protein name
glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,62
Protein sequence
MIQVKFMTDRKSWYVDVLPSYTTSKHKKTYGKLRANKAEFEISNLDSLFVWDLGLKSFMCLVDGEYTPIPFDTEVKIYIDGVLDFTGYIDTPEEKFDTGVINFVAYDFYKYIEESVCTEKPYLDVSFDFILRDILNQCGYSGSYDKIFTISDNIDYYYVDKETKAEDVLKELVESVAGNLWVDKFGDLVFDGGYRSYQTPKTYTPLFTISEDDVRNVKFKQSKKEYDQINVKANPYKKNNEQEWIYIGATPDEPITMGTSTNKEFTIEFDDLTYYAVPYNSQATWVSNLFDTSSKEFVFHSTDASKVSLDQATYESNFHNISTGILKNPNSMRMKLNTSGDWIGVEVTEFRFMGKKILPVRYDTILGDAPPDKEPSVLEIENQIIQSAEWSEDLATWYKQLLKEKIDVKFELLDYTVGSSIDIDSCIEIILPQFQISGLFEINSIYYVHEKSIFEVEASLVKSEFQPSPEYRNTNILQKGVAPSSSAYFYPSASLFKDLSADGKLTAVEKLQFQPAMDAITQEVPIIKANAQTYGISTSNFDQKYLYLKTYIDGIDLYNNKTSDIDRDTFNNLFEDYYNSRETLLKDISIEAEIRIQGVEETIGTISDDSIVTPLEKRTLVVVKNNIDQEYVDIVSLANLYGVSTSTFISRYNTLNNYLIGLHLDTNTSEVIDRNVFNNNFDNYFIARRTINQNIEDVSKNLIDENKEKLLEFASDNKLTPPEKKSIKTIYEDLKKEYNQVLDSAQLFGVDTNLLVQAETDLFLYLNPMLSDLNTTSTIDRTVFNNKFNTYYDLRSIVVEDINSASESRISGTEAKLEDIASDGKLTPVEKLIVKQEWENIQEEYQKMLTTATSYGLSSANLTTAYNALQVYVSPLLANMTSTSTIVRSTFNEKFNTYYEQVRIIMADTSLKSDEDMTDKVVRYGTNIFRLGKNAIPTGGGNTKDGLWIGDGGGILIGESVDADKRLYYDGANLEIYGGTLKLKSDDDSIQFLNSGFFMLDTSNRPEEWFGDNSLSIYSGNPSSNLYNYSLFQIRRNSWDASTYKGTRYEHNITSNTLLNSTGKYLWQVDRDIQYNVTMDNVIQQVNTNIIDIDQVLNIDKKIDIFHTGEEISYTTRYNDAGQIQSQSYIHSIVNSINSANLYHFTKEGTEQTSSYFSGLYIQDNIFGQTSINEGFLGLNVDVGIDGNSLYNSTLYLGHEKNNVLWNGLIIDQNYVKRRFCADDQYHSTLTGYVSTYIEIDMDTNYTDTSKVLKDLNTGRSSGRSTHVYPIGTLSKVKYRFEDGAGIITNEYGIYIKTENTGGWIRVSIYK
Physico‐chemical
properties
protein length:1311 AA
molecular weight: 149603,03260 Da
isoelectric point:4,63968
aromaticity:0,12128
hydropathy:-0,42555

Domains

Domains [InterPro]
SSF69279
STR
64–190
SSF69279 DC_0015 DC_0015
DC_0015
STR
587–712
DC_0015 DC_0015
WNO30043.1
1 1311
Architecture
STR
STR
STR 64-190 | STR 193-1310 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Oceanotoga phage vB_OteS-UFV02
[NCBI] 		3144840 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WNO30043.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OR420712 [NCBI]
CDS location
range 22344 -> 26279
strand -
CDS
ATGATACAAGTGAAATTCATGACAGATAGAAAAAGTTGGTATGTTGATGTTTTGCCTTCTTATACTACTTCTAAGCATAAAAAAACTTATGGAAAACTTCGTGCTAACAAAGCTGAGTTTGAAATAAGTAATTTAGATAGTTTATTTGTGTGGGATTTAGGTTTAAAATCCTTCATGTGTCTTGTAGATGGAGAATATACACCTATCCCTTTTGATACAGAAGTAAAGATTTATATTGATGGAGTTTTAGACTTTACAGGATATATAGATACTCCAGAGGAAAAATTTGATACAGGGGTTATAAATTTTGTAGCTTATGATTTTTATAAATATATAGAGGAATCAGTTTGTACTGAAAAGCCATACCTAGATGTATCTTTTGACTTTATATTAAGAGATATTTTAAATCAATGTGGATATTCAGGGTCATATGATAAAATTTTCACTATATCCGACAACATAGATTATTATTATGTGGATAAAGAAACTAAAGCTGAGGACGTATTGAAAGAATTAGTGGAATCTGTTGCAGGAAATTTATGGGTAGATAAATTTGGAGATTTAGTCTTTGATGGTGGATATAGAAGTTATCAGACTCCTAAAACATATACTCCTTTATTTACTATCTCAGAAGATGATGTTAGAAATGTGAAATTTAAACAAAGTAAAAAAGAATATGATCAAATAAATGTAAAAGCAAACCCATATAAAAAAAATAATGAACAAGAATGGATTTATATAGGTGCAACTCCAGATGAACCTATAACTATGGGGACTTCAACTAATAAGGAGTTTACTATAGAGTTTGATGACTTGACATACTATGCAGTACCTTATAACTCACAAGCTACATGGGTTAGTAATTTATTTGATACAAGTTCAAAAGAATTTGTATTTCACTCTACAGATGCTAGCAAAGTGAGTTTAGACCAAGCTACTTATGAGTCAAATTTTCATAACATATCTACAGGGATATTGAAAAACCCTAATTCCATGAGAATGAAACTTAATACCTCTGGTGACTGGATAGGAGTAGAGGTTACAGAATTTAGATTTATGGGTAAGAAGATTTTGCCTGTAAGATATGACACAATTTTAGGTGACGCTCCCCCAGATAAAGAACCTTCTGTACTAGAAATTGAAAATCAGATTATTCAATCTGCCGAATGGTCCGAAGACTTAGCTACTTGGTATAAACAATTATTGAAAGAAAAGATAGATGTTAAATTTGAATTACTAGACTATACAGTGGGCAGTAGTATAGATATAGATTCATGTATTGAAATTATTTTGCCACAATTTCAAATATCAGGATTATTTGAAATTAATTCTATATATTATGTGCATGAAAAATCTATATTTGAAGTGGAAGCAAGCTTAGTAAAATCTGAATTTCAGCCTTCACCTGAGTATAGAAATACTAACATTTTACAAAAGGGTGTAGCCCCTTCCAGTAGTGCATATTTTTATCCTTCTGCTTCATTGTTTAAGGATTTAAGTGCTGATGGAAAATTAACAGCTGTTGAAAAATTGCAATTTCAACCAGCTATGGACGCTATTACTCAAGAAGTACCTATTATAAAGGCTAATGCTCAGACTTATGGTATTTCTACTTCTAATTTTGACCAAAAATATCTATATTTAAAAACGTATATAGATGGTATTGATTTGTATAATAATAAAACTTCTGATATAGATAGAGATACATTTAATAATTTATTTGAGGATTATTATAATAGTAGAGAGACGTTGCTAAAAGATATCTCTATTGAAGCTGAAATTAGGATTCAAGGAGTAGAAGAAACTATTGGAACAATATCGGATGACTCTATTGTGACGCCTCTTGAAAAGCGTACTCTTGTAGTAGTTAAAAATAATATAGACCAAGAATATGTGGACATTGTTAGTCTAGCTAATTTATATGGAGTATCTACCTCAACTTTTATATCTAGGTATAATACTTTAAATAATTATTTAATAGGTTTACATTTAGATACTAATACTTCGGAAGTTATAGATAGAAATGTTTTTAATAATAACTTTGATAACTATTTTATAGCTAGAAGAACTATTAATCAAAATATAGAAGATGTCTCTAAAAATTTAATAGATGAAAATAAAGAAAAACTTTTGGAGTTTGCAAGTGATAATAAACTAACACCACCAGAAAAAAAATCAATAAAAACCATATATGAAGATTTAAAAAAAGAGTATAATCAAGTACTTGACTCTGCACAATTATTTGGTGTGGATACTAATTTATTAGTACAAGCAGAAACTGATTTATTTTTATATTTAAATCCTATGCTTTCAGATTTGAATACTACTTCTACAATAGATAGAACTGTGTTTAATAATAAATTCAATACTTATTATGACTTACGCTCTATCGTGGTAGAAGATATAAATTCAGCCAGCGAAAGTAGAATAAGTGGAACAGAAGCTAAGCTAGAAGACATTGCTAGTGATGGTAAGTTAACTCCTGTTGAGAAACTAATAGTTAAGCAAGAATGGGAGAACATACAGGAAGAATATCAAAAAATGTTGACTACCGCTACATCCTACGGGCTATCTTCTGCTAATTTAACTACAGCTTATAATGCATTACAAGTATACGTTTCCCCATTATTAGCTAATATGACTTCTACATCTACTATTGTTAGAAGCACTTTTAATGAAAAATTTAACACTTATTATGAGCAAGTAAGAATAATAATGGCGGATACCTCATTAAAAAGTGATGAGGATATGACAGATAAAGTAGTAAGATATGGAACAAATATTTTTCGTTTAGGAAAAAATGCAATTCCCACCGGTGGTGGGAATACCAAAGACGGATTATGGATAGGTGATGGTGGAGGAATATTAATAGGAGAATCGGTTGATGCTGATAAACGTTTATATTATGATGGGGCTAATCTAGAAATTTATGGAGGCACTCTTAAACTAAAGAGTGATGATGACTCAATACAATTTTTAAATTCAGGGTTCTTTATGCTAGATACTTCTAATAGACCTGAGGAATGGTTTGGCGATAATTCTTTATCTATTTATTCCGGGAATCCTTCTTCTAATTTGTATAATTATTCTCTTTTTCAAATAAGAAGAAATAGCTGGGATGCAAGTACATATAAAGGAACTCGTTATGAGCATAACATAACTAGTAATACACTATTAAATAGTACTGGTAAATATTTATGGCAGGTAGACAGAGATATACAGTATAATGTAACAATGGATAACGTTATTCAACAAGTTAATACAAATATAATAGACATAGATCAAGTATTAAATATAGATAAAAAAATAGACATATTTCATACAGGAGAAGAAATAAGTTATACTACTAGATACAACGACGCTGGTCAAATTCAATCTCAATCATATATACATTCTATAGTTAATTCTATAAATTCTGCTAACTTATATCACTTTACAAAAGAAGGGACTGAACAGACATCAAGTTATTTTTCTGGTTTGTATATTCAAGATAATATTTTTGGGCAAACTAGTATTAATGAAGGTTTTTTAGGGCTAAATGTAGATGTTGGTATAGACGGGAACTCTTTATATAATAGTACATTATATTTAGGCCATGAAAAAAATAATGTTCTGTGGAATGGATTAATTATAGACCAGAATTATGTAAAGAGAAGATTTTGTGCTGATGATCAATATCATAGCACTCTGACAGGGTATGTGTCAACATATATAGAAATAGATATGGATACTAATTATACAGATACTTCAAAAGTACTAAAGGATTTAAATACTGGTAGAAGTTCTGGTCGTAGTACTCATGTATACCCTATTGGCACATTGAGTAAGGTAAAATATAGATTCGAGGACGGTGCAGGTATAATAACTAATGAATACGGAATATATATTAAAACAGAAAATACAGGCGGTTGGATAAGAGTATCAATTTATAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
20df6c5115dc363497dd49ccf419278d6f2ae5c4254e155738b0e6eebe25f8a5
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4407
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterization of bacteriophage vB_OteS-UFV01 against Oceanotoga teriensis aiming to control microbiologically induced corrosion in oil exploration facilities Santos,A.J.C., Ayupe,B.A.L., Dias,R.S., Silva,M.J.F., Kropinski,A.M., Silva,C.H.M. and de Paula,S.O. 2025-07-02 — GenBank