Protein

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Genbank accession
QGZ17939.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
Protein sequence
MAGYKRQSNISNGNVIDATLFNDEYNKLADAFTNTGGHKHDGSLEEGPVIGLIGDANLATPLNKILVDTTNDHLEFYVDVSGSTVQQLRIQDGAIVPITDNDIDLGTSSLEFKDAFFDGTVTLDGLVIGSATSITDVDTDLTSVSGSDDTLASAKAIKTYVDAQVATIPVGDITSVVAGTGMTGGGTSGDVTLNVIGGTGIDANANDIAIDATVATLTGSQILTNKTIDVDNNTVSNIEVDNLKSGVLDTDLTSVASGDTTLASAKAIKSYVDTQVATIPTGDITAVVAGTGLSGGATSGSATLNIDTATTVDVSTSQTLTNKILTSPVLNTSISGTAFKDEDNMSSNSATAVASQQSIKAYVDAQVATVPTGDITEVVAGTGLSGGGTTGAVTLNAEVSASSTNTFTNKTIDADGTGNSITNIDNANIKAAAAIDATKIADGSVTSTEFQFINTLSSNAQTQLDAKQATIDTSNRLNANLIHDGSVDNTEFGYLNGVSSAIQTQIDTANTNISGKASNGFAVAMAIAL
Physico‐chemical
properties
protein length:529 AA
molecular weight: 53529,88080 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,03592
hydropathy:0,01059

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC103P
[NCBI] 		2686458 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Candidatus Pelagibacter sp. HTCC7211
[NCBI] 		439493 Pseudomonadota > Alphaproteobacteria > Candidatus Pelagibacterales > Candidatus Pelagibacteraceae > Candidatus Pelagibacter >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGZ17939.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN698242.1 [NCBI]
CDS location
range 39768 -> 41357
strand -
CDS
ATGGCAGGATATAAAAGACAAAGTAATATTTCAAATGGAAATGTAATTGATGCTACTTTATTTAATGATGAATATAATAAATTAGCAGATGCCTTTACTAATACAGGTGGTCATAAACATGATGGCAGTCTAGAAGAAGGTCCAGTAATAGGATTAATTGGTGATGCAAATTTAGCAACTCCATTAAATAAAATTTTAGTAGATACAACTAATGACCATTTAGAATTTTATGTAGATGTATCTGGAAGTACAGTACAACAATTAAGAATTCAAGATGGTGCTATTGTACCTATAACAGATAATGATATAGATTTAGGTACATCAAGTTTAGAATTTAAAGATGCTTTCTTTGATGGTACTGTAACATTAGATGGTTTAGTAATTGGAAGTGCTACAAGTATTACAGATGTTGATACAGATTTAACATCTGTTTCAGGAAGTGATGATACACTAGCTAGTGCTAAAGCAATTAAAACATATGTTGATGCACAAGTAGCAACAATTCCTGTAGGAGATATTACTTCAGTAGTTGCTGGTACTGGTATGACTGGTGGTGGAACATCAGGTGATGTAACATTAAATGTTATAGGTGGTACAGGTATTGATGCTAATGCAAATGATATAGCAATTGATGCTACAGTTGCAACATTAACAGGTTCTCAAATATTAACAAATAAAACTATTGATGTAGATAATAATACAGTATCTAACATTGAAGTTGATAATTTAAAATCTGGAGTATTAGATACAGATTTAACTTCAGTTGCTTCAGGTGATACTACACTTGCTTCTGCAAAAGCTATTAAATCTTATGTAGATACTCAAGTTGCAACAATACCAACTGGTGATATAACAGCAGTTGTAGCAGGTACAGGTTTATCTGGAGGAGCAACTTCTGGTTCAGCAACTCTTAATATAGATACTGCAACTACAGTTGATGTATCTACATCACAAACTTTAACAAACAAAATTTTAACAAGTCCAGTATTAAATACTTCTATTAGTGGTACAGCATTTAAAGATGAAGATAATATGTCATCTAATTCTGCTACAGCAGTAGCTTCTCAACAATCTATTAAAGCTTATGTTGATGCTCAAGTAGCTACAGTTCCAACTGGAGATATTACTGAAGTTGTAGCTGGTACAGGTTTATCAGGTGGTGGTACAACTGGTGCAGTAACTTTAAATGCAGAAGTTTCAGCATCAAGTACAAATACATTTACTAATAAAACTATAGATGCAGATGGTACTGGTAACTCAATTACTAATATTGATAATGCTAATATTAAAGCTGCAGCAGCTATTGATGCTACTAAAATAGCAGATGGTAGTGTAACAAGTACAGAATTTCAATTTATTAATACTTTATCATCTAATGCTCAAACACAGTTAGATGCTAAACAAGCAACTATTGATACATCTAATAGATTAAATGCTAATCTAATACATGATGGTTCAGTAGATAATACAGAATTTGGATATTTGAATGGTGTATCAAGTGCTATTCAAACTCAAATAGACACAGCTAATACTAATATTAGTGGAAAAGCTAGTAATGGTTTTGCAGTAGCAATGGCTATTGCATTATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7fc16673b20631e40e9c6fe5211d98ad6efcb2884569cbc5a3bb4d343723d49b
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,6527
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Novel pelagiphages prevail in the ocean Zhang,Z., Qin,F., Chen,F., Chu,X., Luo,H., Zhang,R., Du,S., Tian,Z. and Zhao,Y. 2019 — GenBank