Protein

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Genbank accession
YP_009795948.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,87
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,83
Protein sequence
MSRSSFVEVNITNPTKLAQDSQDTANTAVKGVTDLNDPNLMSVIEKQNNVVQFAGLTSQYNVLVQNAKDEGINTDSLTTAYNNLNKFMIDVLTDPDHASDVDRKTYKNYQDAYNSELAKIQTALKNNTDGKFTSAASATSQAASTASQAASQAQSAVDYTNSQIASQASAVSEASKSASEASSQANSALDTATSATAEITKLKGGSTLTIAELESGLGTKVSNDKFTTYQTQTTSQFAETVKEADFQTYQTQTSKLIEAKVDNGTYQTDKTQTANDIASKVSSSDFQTYRTQTDGMIASKVSKKDANNVNLIPYSSNFSDSLEGWQLMAWGATDKKLLVTTHTFYQNGTGKLLYLNTAQNATSAAGSLRFSVLPNTKYTFQFKAFASSNVVGANVFFLSRSYGSTSDYDTVHGLFKNLVTSPSHIDQYTVTFTTGANDNEGYIRVDNIGSNNGASSGLFFTELKMEPGDTATNYIYGGQDSMISQTINDVLIKVSKDDLIDEINLQAGNTLISSSGQLTLSGKNVFLDSVDPVIMKSANIDTLLVGKKLTAADIAANTFTTNNGTFTVDSNGLVTATSLIIRGSTNLVYNSSLSGGNGSYIPGWNMNGEGYYSNTVLYDGLPALAWASTATAWDNYATTYYQPVTQTGIPYSASGTFRDYGSASGMMFQCTLAFFTDKASGARISGYKSFNHVATGGDSGSIYFTIDNVVAPSNAKYVALQFWAYNGKGHAAWSQPMLTQTAHSTGYQPDAGNVVSAGTVLGTTISGSTINATTLNGGDVLSDANNTSKFYPFTIESNGKASTTIFNSMDALRTEMSGGGITTKYRATNSSGTTYEAYDGVFDGNMISLNSGFTNGKDMSFSQAVSGNNLTGQVTLSPLTGINLWGSTQAIHFSGLQMNGTGISLNSYGNIVGDNGSTWFRIVDSGGNQTANFGTAPGNNITFPKPIFVNEVSGFDSTNGSALFLHGLGNGTGQILLRSDGKAQVVSSSVYNRTYSSGSTVTVTSYGTMGRITSASKYKLAIAREPQVEPADRLLTIDPSSWVDLEAAKAVAENKSDGKVLLEHEQSLDRHHGLIAEDLRDAGLGEFVIYGMDGEIEGIQYDRLWTILIPKIKQLNERLNELERKSI
Physico‐chemical
properties
protein length:1127 AA
molecular weight: 120249,00700 Da
isoelectric point:4,97855
aromaticity:0,08962
hydropathy:-0,31012

Domains

Domains [InterPro]
DC_1418
STR
3–591
DC_1418 DC_0469
IPR030392
CHP
1014–1126
IPR030392
YP_009795948.1
1 1127
Architecture
STR
RBD
CHP
STR 3-591 | RBD 750-1108 | CHP 1109-1126 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage Lenus
[NCBI] 		2053682 Uroviricota > Caudoviricetes > Tybeckvirinae > Lenusvirus lenus >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009795948.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_047897.1 [NCBI]
CDS location
range 48503 -> 51886
strand -
CDS
ATGTCAAGAAGTTCATTTGTCGAGGTTAATATTACCAATCCGACAAAGCTTGCACAGGACTCCCAAGACACGGCAAACACTGCCGTAAAAGGAGTTACGGATTTAAACGATCCTAACTTGATGTCTGTGATTGAAAAACAAAATAACGTCGTACAATTTGCGGGATTGACGTCACAATACAATGTGCTTGTTCAAAATGCAAAGGATGAAGGAATCAATACAGATTCTTTAACCACCGCATATAATAATTTAAACAAATTCATGATTGATGTCTTGACAGACCCAGATCACGCCAGTGATGTAGATCGGAAGACTTATAAGAATTATCAAGACGCCTATAATTCCGAACTTGCAAAGATACAAACAGCCCTAAAGAATAATACAGACGGTAAGTTTACAAGTGCAGCTAGTGCCACTAGCCAAGCGGCCTCAACAGCAAGTCAGGCGGCCAGTCAAGCACAATCTGCTGTTGATTACACCAACAGTCAGATTGCTTCACAAGCAAGTGCTGTTTCAGAAGCTTCTAAGAGCGCTTCCGAAGCTTCATCGCAAGCTAATAGCGCTCTTGACACTGCCACTAGCGCCACTGCTGAAATCACAAAACTAAAAGGTGGTTCAACCTTAACCATTGCAGAATTAGAGAGTGGTTTGGGTACGAAGGTTTCTAATGATAAATTCACGACGTATCAGACACAAACCACTAGTCAGTTTGCAGAGACAGTTAAAGAAGCTGATTTTCAAACTTACCAAACTCAAACAAGCAAATTGATTGAGGCAAAAGTTGATAATGGAACTTATCAAACAGACAAAACACAGACGGCTAATGATATCGCTTCAAAGGTCTCTTCTAGTGACTTTCAAACCTATCGAACGCAAACAGATGGTATGATTGCCAGCAAGGTTTCTAAGAAAGACGCCAACAACGTTAACTTAATACCTTACTCTAGCAACTTTTCAGATTCTTTAGAAGGTTGGCAATTAATGGCATGGGGAGCAACTGATAAAAAACTATTAGTAACCACCCACACTTTCTATCAAAATGGTACTGGAAAGCTATTATATCTCAACACAGCGCAGAACGCAACTTCTGCCGCTGGTTCATTGCGATTTTCAGTGTTACCAAATACCAAATATACGTTCCAATTTAAGGCGTTTGCTTCATCTAACGTTGTTGGAGCCAATGTGTTTTTCCTGTCACGTTCTTATGGCTCCACTAGTGATTATGATACAGTCCATGGTTTATTCAAGAATCTGGTGACTTCTCCGTCACATATAGACCAGTATACAGTTACGTTTACGACTGGTGCTAATGACAATGAGGGTTATATCAGAGTTGATAATATCGGTTCTAACAATGGAGCTTCTTCTGGCTTATTCTTTACTGAGCTAAAGATGGAACCAGGTGACACTGCGACAAACTATATTTATGGTGGTCAAGACTCCATGATTTCACAGACAATTAACGACGTGTTAATTAAGGTGTCAAAAGACGACCTAATTGACGAAATCAACTTACAAGCTGGTAATACTTTGATTTCATCTAGTGGTCAATTGACGCTATCTGGAAAAAATGTTTTTCTTGACAGTGTCGACCCTGTTATTATGAAGAGTGCGAATATCGACACGCTCCTTGTTGGTAAGAAATTGACAGCGGCTGACATCGCGGCCAATACCTTTACGACTAACAATGGGACTTTCACAGTAGACTCTAACGGTCTTGTCACCGCCACAAGTTTAATCATTCGTGGTTCAACGAACCTAGTTTATAACTCATCATTATCTGGTGGTAATGGTTCATATATTCCCGGGTGGAATATGAATGGCGAAGGCTACTATTCCAATACCGTTTTATACGATGGTTTACCAGCTCTAGCTTGGGCCAGCACAGCGACAGCTTGGGACAATTACGCAACGACCTATTACCAGCCTGTAACACAAACTGGCATTCCGTATAGTGCTTCTGGAACTTTCAGAGACTATGGTTCTGCTAGTGGAATGATGTTTCAATGTACCTTAGCGTTTTTTACTGATAAAGCTTCAGGCGCACGTATTAGTGGTTACAAATCGTTTAACCACGTTGCAACTGGTGGGGATAGTGGTAGCATTTATTTCACTATTGATAATGTAGTTGCGCCAAGTAATGCTAAGTACGTGGCCTTGCAATTCTGGGCTTATAACGGTAAGGGACACGCCGCGTGGAGTCAACCAATGCTGACGCAGACTGCTCATTCAACTGGTTATCAACCAGACGCTGGTAACGTTGTTAGTGCCGGTACCGTTTTGGGTACAACTATCAGTGGATCTACCATTAACGCGACAACGCTTAACGGTGGGGATGTTCTTAGTGATGCCAATAACACAAGCAAATTTTATCCGTTCACAATCGAATCAAACGGGAAAGCATCGACAACGATATTTAATTCCATGGATGCTCTTAGAACTGAGATGTCTGGTGGTGGTATTACTACAAAATATCGTGCAACTAATTCTTCTGGGACAACTTATGAGGCTTATGATGGGGTTTTTGATGGCAATATGATTTCCTTAAACTCAGGCTTTACAAACGGAAAAGATATGTCGTTTTCACAAGCCGTTTCTGGTAATAATCTGACTGGTCAAGTAACGTTAAGTCCGCTTACAGGTATTAATTTGTGGGGATCTACCCAAGCTATTCATTTCAGTGGTCTTCAAATGAACGGCACTGGTATTTCTCTCAATAGTTATGGCAACATCGTTGGTGATAATGGTTCAACGTGGTTTAGAATTGTTGACTCTGGTGGTAATCAAACAGCAAACTTTGGTACTGCTCCTGGGAACAACATAACTTTTCCAAAACCGATATTTGTCAATGAAGTTAGTGGATTTGATAGTACAAACGGTAGCGCTTTGTTCTTGCATGGGTTAGGAAATGGTACTGGTCAGATACTTCTACGTTCTGATGGTAAAGCACAAGTTGTTTCTTCTAGTGTTTATAACAGAACTTATTCTAGTGGTTCAACGGTAACTGTAACTAGCTATGGTACCATGGGACGCATCACGTCCGCAAGCAAGTATAAGTTAGCAATTGCAAGAGAACCACAAGTAGAACCGGCAGATAGGTTATTAACAATAGACCCATCTTCTTGGGTTGACTTAGAAGCGGCGAAAGCGGTCGCTGAAAACAAATCAGATGGAAAAGTATTATTGGAACACGAACAATCTCTTGATCGTCACCATGGATTAATCGCTGAAGACTTGCGAGATGCGGGATTAGGTGAATTTGTGATATATGGTATGGATGGAGAGATTGAAGGTATTCAATATGACCGCCTATGGACGATACTAATTCCTAAAATTAAGCAACTCAACGAACGTTTAAATGAGCTTGAAAGGAAGTCTATTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
bba21530cfbf1b804217e6c1b1e4b70ddb549e3d37512e2aead8abe66a82b262
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5885
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Isolation and characterisation of Lactobacillus bacteriophages that infect wine-derived L. plantarum strains Kyrkou,I. and Hestbjerg Hansen,L. 2020-05-29 — GenBank