Protein

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Genbank accession
XTB82753.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
Protein sequence
MFVDPDKPLPPAGVKDDTLGSVLDAIINISNARSEVQKDAVEFEKVTTQALIDANKKIDRFDTEVQTALAAHTNKKGAVHGETKETVGLEKKENWRPATLNEHEAGQSKNTFVVPIGLHMLVKKFLTIDPTNYLRSRIFPIASGGQLGNVPQWPFNWKEGEVVESFEDPMTFFTDTPWEFSSDQGVRIYPAMNGSDVLTQHVADPGRVKRAVTPWGGTDVRVYNNTLDIRRTRPGVLRGESNDEPFGELIKGSSHLFDRHSVFYAENGKIGTRAFNKVRLPFDKLNRENFNDNWSGIIEAREETIYNIYTSFKKGNIGGHGEGIYLVVEMDLFNYTQNGIVVKDGPGRPAETIATVQDRFNTFSWQMQNAKFKVMDRGPGTPTGFCMNIKDILSFTDSQREEFWNGLERNQVTKIAFTWSNRLNGDFSIRIPMGFYNKNRTAYNNFYMDLGFHVLENKPGLSATISVRPLRDIDTNIQTLDANFDVKPTGRFITYGPNVANNVFHPLVFNGVFESNGGHIKTYTFYNRQYVGFYQHDVKGVGDWIAKGEAIQPNLVKYYYGQMSTLNNDGMYGDHLRHIPLGMEGDTVYYLTHSRDWNQQYRNSIAHTQLDTAPIMLSDLGHPYGPWRNDLTWINPNNSRIPDFLVVNSETAVGFETNCMVFNSQNLFRGYTGYKYEPNNPNSTVTGENEVQLDDLILSHLARVGGGWSVNHKQLFYYKNRLYFFTQCLSENDWPADDYDCYYGWYNSAYIETDQYGRNTIKLNGTAESKVTIKKMKVNTKASATRVWNDVQGRDGFNHTDVYMMLMNRTGNASKFQLMVNLAPHNNFYFEFELSIDEGLGTTDVIPNPNAIDPVFPYGPDGFKVDYDTVIAYGTKTPQRLHINFQSPVMLKKSMWSYRRTPGHYGVFAQSIGTEVVNGGLMNAVEGTDIYPVGSAVTIGGSNIIVKKPVSASERQFKGNDELFVRMNGLDLEMYGLRNNPNGYEVEPNSGVAPCGFLKNSTFTHYDQDGWRNALLPVMDGYRMNFYGYGSSFPAFMGIYGSGVPINRFFLTDRPTTLSYDTAVGRVINVGNSPTVKIYVNNTLQSYDGSGSFTIPTSYTGVVDVSITSLISLAWSKGLTRIKAIGNTVQSLNFAGSDTFAVDADLPVRITSLVGLFEGSRGVTYPGIENWNTSRVTDMTNIFKDAVNFNQDISAWNIGKVTQLEGAFYGARAFNKPIGTWDTKNVITMSMMFKNAMTFNQDLSSWDTYSVVNMSMMFQGANKFKGNVSTWNVSSVNNFSSMFDMATEFNGNLSNWDVRSATNMYFMFARCEAFNSPLASWNVSNVVTFEGMFLQSPVFNKDISAWNVSRATNTQGMFSGATAFGSTGGFTLSSWNMSNVIKASSMFYKSGFNLPIDNWSFGENAILESMFSNCEFFNQNVSSWDMRNVKSIKSMFTSTKAFNKNITGWELDSCTNIDFFLHASNFAGDLSGWKFNTTLPVTAVSTFGRMPNFVGNGLETWDVSGFVEMGSMCYQSPVFNPDISGWNVGKVKSFIVMFSSSHAFNQDISGWDVSSATYFSKMFENCESFNQNLNDWDMSNATTVNSMFAGTKNFDGLISAWNVGNVTRFENMFDGAEKWNGDISDWDVSKGENFTGMFANTPMFNQDIGRWVTTSATNMDEMFKNASVFNADLSTWDVSKVTTHKDFDTNTPAWVLPRPPFNP
Physico‐chemical
properties
protein length:1703 AA
molecular weight: 191333,04020 Da
isoelectric point:5,57968
aromaticity:0,13153
hydropathy:-0,37592

Domains

Domains [InterPro]
DC_0481
STR
1–1249
DC_0481 DC_0103 DC_1384
IPR005046
STR
1152–1271
IPR005046 IPR005046 DC_0103
IPR011889
Unmapped
1168–1181
IPR011889 DC_1935 IPR005046
XTB82753.1
1 1703
Architecture
STR
RBD
STR
RBD
STR 1-1473 | RBD 1474-1485 | STR 1486-1601 | RBD 1602-1699 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XTB82753.1
1 1703
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 148 148 0,9644
Central domain 149 516 369 0,9654
C-terminal 517 1703 1186 0,0801
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-148
Central
149-516
C-terminal
517-1703

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shewanella phage SXP01
[NCBI] 		3420196 Viruses > unclassified bacterial viruses >
Host Shewanella xiamenensis
[NCBI] 		332186 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Alteromonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XTB82753.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV593634 [NCBI]
CDS location
range 137551 -> 142662
strand +
CDS
ATGTTTGTAGATCCAGACAAACCCCTACCGCCTGCGGGTGTCAAAGACGACACACTAGGTTCGGTACTGGACGCGATTATTAATATATCTAATGCTCGTTCTGAAGTTCAGAAAGATGCTGTTGAGTTTGAGAAGGTTACAACTCAAGCATTGATCGATGCTAATAAGAAGATCGACCGATTCGATACCGAAGTTCAAACCGCTTTAGCAGCTCACACCAATAAGAAAGGTGCGGTGCATGGCGAAACAAAAGAAACAGTAGGTCTTGAGAAGAAAGAGAACTGGAGACCGGCAACACTTAACGAACACGAAGCTGGACAATCGAAGAACACATTCGTAGTTCCTATTGGTTTGCATATGCTGGTTAAGAAGTTCTTGACTATCGATCCAACCAACTATCTTCGTTCACGTATCTTTCCTATCGCTTCTGGCGGACAGTTAGGTAACGTTCCTCAATGGCCATTTAACTGGAAAGAAGGTGAAGTAGTTGAGTCCTTCGAAGACCCAATGACTTTCTTTACTGATACTCCTTGGGAGTTCTCCAGCGATCAGGGTGTACGTATTTATCCTGCGATGAACGGTTCTGACGTCCTTACTCAGCATGTCGCCGATCCTGGCCGTGTTAAGCGCGCTGTAACCCCTTGGGGCGGTACTGACGTTCGTGTCTATAATAACACCCTTGATATCCGTAGAACCCGTCCTGGCGTCTTACGTGGCGAATCTAACGATGAACCATTTGGCGAATTGATTAAAGGTTCTTCTCACTTATTTGACCGTCACTCTGTTTTCTATGCTGAGAACGGGAAGATCGGTACTCGTGCATTTAACAAAGTGCGTTTACCGTTTGATAAGTTAAACCGTGAGAACTTCAATGATAACTGGAGTGGGATTATCGAAGCACGTGAGGAAACGATTTATAACATCTATACATCGTTCAAGAAAGGAAACATCGGTGGACATGGTGAAGGGATTTACTTAGTCGTTGAAATGGATCTGTTCAACTACACCCAAAACGGTATCGTTGTTAAAGACGGTCCTGGTCGCCCTGCTGAAACTATTGCCACGGTTCAAGATCGTTTCAATACCTTTAGTTGGCAGATGCAAAACGCTAAGTTCAAAGTGATGGATCGTGGTCCAGGAACACCAACTGGTTTCTGTATGAACATTAAGGATATCCTGTCGTTCACCGATTCCCAGCGTGAAGAATTCTGGAATGGACTGGAACGCAATCAGGTAACTAAGATCGCGTTCACCTGGTCTAACCGTTTGAATGGTGATTTCAGTATCCGTATACCGATGGGGTTCTATAATAAGAACCGCACGGCATATAACAACTTCTACATGGACTTAGGTTTCCACGTATTGGAAAACAAACCAGGGCTGAGCGCAACCATCTCAGTTCGTCCTCTGCGTGATATCGATACCAACATTCAAACGCTGGATGCTAACTTCGATGTTAAGCCAACAGGTCGCTTCATTACCTATGGTCCGAACGTTGCCAATAACGTATTCCACCCACTCGTGTTTAACGGTGTGTTCGAATCGAATGGCGGTCACATCAAAACCTATACCTTCTATAACCGTCAGTATGTTGGTTTCTATCAGCATGACGTTAAGGGTGTTGGGGATTGGATTGCCAAAGGTGAAGCTATTCAACCTAACCTGGTTAAGTATTACTATGGACAAATGTCAACCCTGAATAATGATGGGATGTACGGTGACCACCTTCGTCACATTCCTTTAGGGATGGAAGGAGATACGGTTTATTACTTAACCCATAGTCGTGACTGGAACCAACAGTATCGTAACTCCATTGCGCATACTCAGTTGGATACAGCTCCAATCATGTTAAGTGACTTGGGACACCCATATGGTCCATGGCGTAACGACCTGACTTGGATTAATCCGAACAACTCACGCATCCCTGACTTCCTGGTTGTAAACTCCGAGACCGCAGTTGGATTCGAAACTAACTGTATGGTATTTAACTCCCAGAACCTGTTCAGAGGTTACACCGGTTATAAGTACGAACCGAATAACCCTAACTCTACAGTGACGGGTGAAAACGAAGTTCAACTTGATGACTTGATTCTTTCCCACCTGGCTCGCGTTGGTGGCGGTTGGTCTGTTAACCACAAGCAACTGTTCTATTACAAGAACCGTCTGTACTTCTTCACACAGTGTCTGTCCGAAAACGATTGGCCTGCTGATGATTACGATTGTTACTATGGTTGGTATAATTCTGCTTATATTGAAACAGATCAATATGGTCGTAACACAATCAAGTTGAATGGAACAGCTGAATCTAAAGTCACCATCAAGAAGATGAAGGTGAACACCAAAGCTTCAGCCACTCGGGTCTGGAACGATGTACAAGGTCGTGATGGGTTTAACCATACCGATGTTTACATGATGTTAATGAACCGTACAGGTAACGCTTCTAAATTCCAGCTGATGGTTAACCTTGCACCTCATAACAACTTCTACTTCGAGTTCGAGTTGTCTATTGATGAAGGGCTTGGAACAACGGATGTGATCCCTAACCCTAACGCTATCGATCCGGTATTCCCTTACGGTCCAGATGGCTTCAAAGTTGATTACGATACTGTCATCGCTTATGGTACTAAGACACCGCAACGTCTGCACATAAACTTCCAGTCTCCGGTTATGCTTAAGAAGTCCATGTGGAGCTACAGGAGGACCCCTGGACATTATGGTGTCTTTGCTCAATCTATCGGTACAGAAGTCGTTAACGGCGGTCTGATGAACGCTGTAGAGGGAACCGACATCTATCCTGTAGGATCTGCTGTTACCATTGGCGGTTCTAACATTATTGTTAAGAAACCGGTAAGCGCTTCAGAACGGCAGTTCAAAGGTAACGATGAGCTGTTTGTAAGGATGAACGGTCTTGATCTGGAAATGTACGGATTGAGAAACAACCCTAACGGTTATGAGGTTGAGCCTAACTCAGGTGTTGCTCCTTGTGGATTCCTGAAAAACTCTACATTTACTCACTATGATCAGGATGGCTGGCGTAATGCACTGTTGCCAGTAATGGATGGATACCGTATGAACTTTTACGGTTATGGATCCTCCTTCCCTGCATTTATGGGCATCTACGGTTCAGGTGTTCCTATTAACCGATTCTTCCTGACTGACCGTCCAACTACTTTGTCATACGACACAGCTGTTGGTAGGGTGATTAACGTTGGTAACTCACCGACTGTTAAGATTTACGTCAATAACACGCTACAGTCTTACGACGGTTCTGGTTCTTTCACAATACCTACCTCGTACACAGGAGTGGTGGATGTTTCAATCACATCACTGATCTCTTTAGCTTGGTCTAAAGGTCTGACACGCATTAAAGCAATCGGCAATACTGTTCAGAGTCTTAACTTTGCAGGTTCCGATACGTTTGCTGTCGATGCAGATCTTCCTGTACGTATTACTTCGTTGGTTGGTTTGTTTGAAGGTTCAAGAGGTGTTACTTATCCGGGTATCGAGAACTGGAATACCTCGAGAGTAACCGACATGACCAATATCTTTAAGGATGCGGTTAACTTCAACCAGGACATCTCTGCTTGGAACATCGGCAAGGTGACTCAACTTGAAGGCGCTTTCTATGGGGCGCGCGCATTCAACAAACCTATTGGTACTTGGGATACGAAGAACGTTATAACAATGTCCATGATGTTTAAGAACGCCATGACATTTAACCAAGACCTTAGTTCTTGGGATACGTACTCTGTAGTTAACATGTCCATGATGTTCCAGGGAGCAAATAAGTTTAAAGGCAACGTCTCTACATGGAATGTTAGCTCTGTTAATAACTTCTCTAGCATGTTCGATATGGCTACGGAGTTTAACGGCAACTTGTCTAACTGGGATGTACGGTCGGCAACAAACATGTACTTTATGTTCGCTCGCTGTGAAGCGTTCAACTCACCATTGGCTAGTTGGAACGTGAGTAACGTAGTTACCTTCGAAGGAATGTTCTTGCAGTCTCCAGTATTTAACAAGGACATCTCTGCTTGGAACGTATCAAGGGCTACTAACACCCAAGGTATGTTTAGCGGAGCTACTGCGTTTGGTTCTACAGGAGGGTTTACACTTTCTTCCTGGAATATGTCCAACGTAATTAAAGCCTCCAGCATGTTCTATAAGTCTGGGTTTAACTTACCTATCGATAACTGGTCGTTTGGTGAAAACGCAATTCTGGAATCCATGTTCAGTAATTGCGAATTCTTTAACCAAAACGTCTCCAGTTGGGACATGCGTAACGTTAAAAGCATTAAGTCTATGTTCACCAGCACTAAAGCGTTCAACAAGAACATTACGGGTTGGGAACTTGACAGCTGTACCAACATCGATTTCTTCCTTCATGCATCAAACTTTGCTGGTGACCTTAGTGGTTGGAAGTTCAACACTACCTTACCTGTTACCGCTGTCTCCACATTTGGTCGTATGCCGAATTTTGTCGGTAATGGATTGGAGACCTGGGATGTTAGTGGGTTTGTTGAAATGGGCTCGATGTGTTATCAGTCTCCTGTCTTTAACCCAGACATTAGTGGATGGAATGTTGGCAAGGTTAAATCGTTTATTGTCATGTTCTCTTCCTCTCACGCGTTCAACCAAGATATTAGCGGTTGGGATGTGAGTTCTGCAACTTACTTCTCTAAGATGTTCGAGAATTGTGAATCCTTTAACCAGAACCTGAACGACTGGGATATGAGTAACGCAACGACAGTGAATAGCATGTTTGCTGGAACTAAGAACTTCGATGGCTTAATCTCGGCTTGGAACGTAGGAAACGTTACACGCTTCGAGAACATGTTCGATGGTGCTGAGAAGTGGAATGGTGATATCTCTGATTGGGATGTGAGCAAAGGTGAGAACTTCACTGGTATGTTCGCCAATACCCCGATGTTCAATCAGGATATTGGTAGGTGGGTTACTACATCGGCCACCAACATGGATGAGATGTTTAAGAATGCTTCGGTGTTCAACGCAGACCTTTCCACTTGGGATGTGTCTAAAGTAACAACTCATAAAGATTTCGATACCAATACTCCAGCTTGGGTATTACCTCGTCCTCCTTTTAATCCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3774cd1c9ec90b5aa69acb250fa83b00d10b576ef7a61833ac2c9236730ade15
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7119
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50